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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000115_pilon:25698..34837+ Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14019.4.p1 ID=MSTRG.14019.4.p1|Name=MSTRG.14019.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9140bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:25698..34837+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTCAGCTTTTGAAGCACGACGACAGATTTGTCATTGGGtttaaagaaat
attgaaaagttGTTTCTACACAATGGGCTCGAACCCTGTCCTCTCTTTAT
TTATGTGGACCGTCATTGGTGAACTGAACCTTGGTACAAGTGAAGGTACT
GCtggaacttttatttttttttgaaattctgttttCTTTGAGTATATTTA
CTGCTTCCATAATCCTATCACAAAGTTTCTGATTTTAATGATTTAATGAT
CTCGAATTGAAATCATCATATAGCTGTCGATGTTCAAACAGAATATACTA
TCATCGACCAAGATTTTAAATTCCAGCAGAATTACaatctattatttttt
ttaagataaagAAAGTTTCGAAGATGCTTTACTTTCAATACAAGAGACAG
ATAATGGGAGGTAATTCTAAATTCTCCTTCTGGTTTGAATGTTGATTTAT
GcatgaaataaaaaactaaaatcaccGAAAGTATGATAATTGagtatgat
gacatttctgacagtaaggtcgtcacaaaaattgacacttttccaataca
aatttatttttaatgtcaaatatatcaaaTACATCGttaccgtaatttat
tgaatatttaggataaaataagcattttaaactcaggcaacttttttcta
aagcctttgttagaataaaatagctatttataagaacaaaggaaattttc
ggtttttgctcactttgagcatgatgagtgacgtcatcaaaaaatttttt
ttgtcaagagTTACCTTATGTGCCATGGAtcagacccactagatcaaaaa
gttgaggggtggtacaggaaatgcccccccccctagttctgaaccgcccc
taaaagcctaggttaaTGGAATGAATAGGGTtaatggaactaattttcgc
gggaactaatatCCGCGGTCGAAGGTATACCCAAAGAAACTCACTCGCTA
AAAGTCTGATTTTTGTCAAGCGTTTCATTTCAATGAATTGGATATATGAA
ACTACAttctttgttattgttttcttcATTCTGAAGGGTACGTTTTGAAG
CATGGTTTCAAatcaatttgaatttcgataaaattgaaGAGCTATTGCTG
ACCATCTTTCAAGTTGATAATAAGGTAAGTCTATTTGTTATCAAATTTGT
ATTTGGTTTTGAGGTTAGGTCTGAAACATTTGTGTCAGACGAAAAATAAT
AACGTAAAAGTAAGTAAATAAGTCTGCGACCCTAAGgtctcctctttcga
tagctatctacccgaaggtaggagagggcgccactctttcctctggattt
ctccacttacccttgatccttctctcaagcagagaggcatcaagtaccat
ctttgatatgacccggctgggggttgaacccacaactttGTGCACCGTAG
ccgatgctctaccactgcactacggttcGCGGTTAACGTAAAGAGGACAC
CAAGCGAAATCTGTTTCGATATTTAAACtgtaaacaaaatataaaaatat
tttttctacaatCACAAAACTGCAATCTTATTCGAATGATACTctttgga
ttaattttcacaaGACTTGGTTTTGCGttgttttttttgcgaaaacaAAC
CTCGGCTAAATCCCGCCAAATTGCTGACTTATGAAATTAGATTAAGTTCA
TATTTTTGGCTAAATAGATTTTCAAGGTCATTTTCAACTGGTTTTGTCTG
ATTTGCAAAATCAAATCATcgcaaaacatttaaaaaggcTAACTGGTGAA
tataaatccaaaaattttgtaatttttctttcggaTCGCGAAATTAGCGA
AAAGTAACCAGACTAAACTATCGAATCTGCGAAGACTTTTTCCTGACGTG
ATCTATCCCTTTTTTAGGGTGCAATAATTTTTAGGTGTTTGATTAGAATG
ATGCTGCTTGAGTGCTTTagttaaagtttttttgcttgattgttgATGTA
ATACTATGGCTGGCTGTCACTACAAGGGAAGTCTTAAAAGGAAATgcacc
gtagtgcagtggtagagcatctggctacgtttcgcaaggttgtgggttca
acccccagtcgggtcataccaaagattcccaaaatggtacttgatgcctc
tctgcttgatgctcagcaattaagagaaggatcaagggtaagtggtaagt
ggagcaatccagagagaaagagtggcgccctcccctaccttcgagCAGAT
CATCATCATCTTTTGACCGCGGTCGAGATGATGGATTCTACCCTCTGGCG
CCAAGAATCGCGGTCGCGCATGGCAGTCTCCAGGTCACTATAAAGAAGCC
CAGTTTCCCTGCTAACTGCGTCAGTAAAAGTTAACTTTCTCGATCTTTGA
ACCAGCCGCTTGGGTTTCCAGAGTAGGAGAGAGGAGATGACTTCCGTGGA
TGCACGAAGGCAATGACCAGCAAACTGAACATGCTTAGCCTTTAAGATGT
TTGAGATAGGCTTAATCGAACCATAGATGGTGTTTTTGGTGGGATGATCG
CGCCAGGAAAGATTTTTAACTCTTCTTAGAAGGTGTGTGTATGTTCCATC
GAGTTGTTTTTCTAATTTACGTGTGAAGGACCACGTTTCCGAACCATAAA
GAAGGATAGGTTCTAAGGTTAAAAACCCTGAGGCAGATTTAaatgacatt
aaatttcttatttacaaaaactgaTAAATAGGTAATTAAATCATGATAAA
CAAATGATTCTAAACTTTTCTCCGACAATATATATCGTATTACAGTCTTG
ACTAATTCCAGAAGGCTGGTGTAAatttttccaagtcataatctcaaatt
atatcaggacgtcaagtgaaaaatTGCAAGCCATGATAACACATTTCAGT
AACAGTCTCAATTTATATCAGGACGTCGGtaaaatattccaagtcataat
ctcaaattgtaccaggacgtcaagtgaaataagtcataatctcaaattga
aCCAGGACGCgaagtgaaatattgcaagttataatctcaaattgtaccag
gacgtcaagtgaaatattccaagtcataatctcaaattgtaccaggacgt
caaatgaaatattccaagtcataatctcaaattgtaccaggacgtcaagt
taAATATTGCAAGTTatatataatctcaaattataccCAGGACGTCGTGA
AATATTGCAAGTCTTAATCTCAATAATAAACCAGGAtgctgtgccaaata
tttcgttTCAGTATATTGTGCTCTCTGCAAATTACTGCCACACATATTCT
CATTATATTCCCATGCATCCAATTTCTGAATTTCTGATTCTTTAtaccta
gaaaatttagaatgataatctgataatttttacaGGTACAACTAGGTAAC
TGAACTTCTCGACaatgcaaatcaaaatgagaaaatgtgaaagttttcga
aaaagaaGTACATATTAAAAGCAGTCTTTTAAAGTCCACAATTGAGAATA
AGTactttgtttgacatttttcaaagttgtcaaagaactgctaacactag
atgaaaaatttttttaagagtgGAGATATGAGGATATTCACATATCTAAT
GAAACACTGCTTGTGATTCATAGGATTCATAAGAAATATACTGTTGATGG
AGAGAGAGTGCTCCATCGTTATGAACATTTGATTGGCCGTGTTGTTAATG
TTTCTGTGTTTTAATTAGTATTCCCTGTAGATTCTTTTAGTTTTCATGTG
TCTCTCGAGTCCTCTTTTGTTTAGTGTCCCTTTTGTTTTAAGTGTCTTTT
GTATCCCCAAATTGCGTTTTATACGTTTTATATATCATTTGTAATTCCTC
TAGGGAAATTAGGATATGTTTATTAACTGTAAATTTTGTAGATAGGAATT
AGTTCAACACTGAGAGACGTGAGTGAGTGTCTTGTGTGGGAGAGGTGCgt
tttactaaagtttaatttactgtcgttttatttcggttctttttggtttt
gttacattttaagttggtttaAGTTCAAGAATTGGTGTTtgcattttaca
ttttctgtTCTCCATTTTCTGTTTGGTTTCCTTAGGTTAGGTTCCTTTTC
TGTCCATTAAGGCTGAGATATTTCGACcagtcaaattattcaaaacatct
TCGTTCTCTCCACTCACAAGTAAATTAAACTAGTATCTGTATTTCTGTTT
CCATCTGCATTTCTGTCTCCTATTCATATGTTTGAGTAGTGCGTGTGTGA
AAGTGTTGAACTCCTCTTGCGTGTGCTAgagtgttttgaatttttttttt
gattttctgattttgattttttgtttttctcatatgtttgagactttctt
ttgactttagatttttttgaattttgtttccagattgttcgcttgccgtt
tttgagatattttgcattttttgtcgagattttttgatttttatttcttt
gaacttcctgtcacttttttgagctgagttttgaGTCCGTATACTAACGT
GGTATCGTTGTCCGCACACTAGACGTAGTGTCGTTTGTTCCGTGCAATAG
ACGTGTTGCCGTGGGGTTTCCATTGGTTGGAAACTATTGTGAAGTCTTGT
CTTTAGCACAAGCATTTTGTGGCCAAATTATTCTTCAGAGAGCGAGAATT
GCTTTGTTCCTGTGTGAACACGCGTTGTAACTCAGTAAAGCGACTTTGGT
TTGTTCGagatttttgtttcgttttttttttttgattttttaatttttat
tcattttgcattttGGTATCGGTCTGATCTTCGctagaaaagaaatttga
agtttgatcattttttgcattttttggtctGTTACCAACtagaattttga
ttgttcattGTTTAGTCTCCCCATAGGGAGAgtgttttgaaattgttttg
tctCTTCTgagatttgttttattggtttttaTTATAGCTATTTCTCCTTT
TTCTCATCCTGAGAAGAGTTTTATGTTAATTATCTTTTAGTTCGCACGGT
TTTGAGTGTTGATTGCCATATAGTTGTCATAACATAACTTTTATTAAGAA
TTTTGGATGTTAATCACTTAAGTGTGAAAATCCACCTAGATTTTATATTG
AACATCAtatataataacaataatacaaTTTTGGTTTCTGGATGTTAATC
ACTTAAGTGTTGAAAATCCAGCTAGGTTAGGTTTTCGCCTGAAATTTTGT
CAtcgtttataagaacattatacCATCCTTGTTCCACAAATTTTTATCTG
TCATGTCTGCCCATGGAAAATTTCATGCTGAAATATTTGGCAAGATTAAA
TCACTTGAAAGGTTGTTATGTCATGTGTCATCTGAGttgaaagctttgaa
aaatatttatgttaATTCTGCTTATAACCATAGTACCAATTTTCCATCTT
GTTTTAAATCTCCGCAAAAATCAGTATTTGTTCCTAAGCCACCATCTGCA
TCTAAGCCAAAGCATGTTAGAAAATCTGTTTTTGTAAAGCCTAGTTCTGG
AAAATCTGACATTGGTTCGAGACCTTCTGTTTTTGACTtggaaaaatctt
cattttataagaacaaaacttTGAGGCAAAAGTACAATTTTATCATGAGG
GAAAGGTTATGTTTTGGTTGTCTTCAGAAAGGTCATGTGTCTGTTGATTG
TAAGAGCTCGAAAGTTTGTGATATATGTAATTTGAGTCATCCTACATCAC
TTCATGAATTTAGTGTGAAAAGATCATTAATTGTTGAGAAGTCAATCTTT
GTTGAACGTGATTCTGAAAAGGAGTCTGAAAGTTCGAtcgattttgttga
aaatgaaTCTGTTTGTATTACGCCTGATTCTGATCGCCAGTCGCACGTTC
AAAAAGATTGTATGAAATCTGAAACGCCATTTGTTAATGTTTTGAAAGTA
AGTGAAGTATCGTCCTATTCAAAGAAGAGAAGCTGGTCGTCCCAAACCTG
GCAACATCGCATTGACGATCCATCCGATATTAATACAGATCCAGACCCTG
ATGTCCCACCCTGGCCAATTGATCCGCCCTGACGAAGTGACGTAACACCC
AATGTTCGAAAGTTTGTGATCAAATCGAGAAAGATCAACCAAGTATGGTA
AAAGATTCCCCACCGAAGAGCCAACGAAATTATAGATCAAGATTTGGAAA
ATCTTGAGGGGAGCCATATGTTGATGGAGAGAGAGTGCTCCATCGTTATG
AACATTTGATTGGCCGTGTTGTTAATGTTGTGTTTTAATTAGTATTCCCT
GTAGATTCTTTTAGTTTTCATGTGTCTCTCGAGTCCTCTTTTGTTTAGTG
TCCCTTTTGTTTTAAGTGTCTTTTGTATCCCCAAATTGCGTTTTATACGT
TTTATATATCATTTGTAATTCCTCTAGGGAAATTAGGATATGTTTATTAA
CTGTAAATTTTGTAGATAGGAATTAGTTCAACACTGAGAGACGTGAGTGA
GTGTCTTGTGTGGGAGAGGTGCgttttactaaagtttaatttactgtcgt
tttatttcggttctttttggttttgttacattttaagttggtttaAGTTC
AAGAATTGGTGTTtgcattttacattttctgtTCTCCATTTTCTGTTTGG
TTTCCTTAGGTTAGGTTCCTTTTCTGTCCATTAAGGCTGAGATATTTCGA
CcagtcaaattattcaaaacatctTCGTTCTCTCCACTCACATATACAAA
CTGACTTACCTACTTAGTTTCTCTGTGTCTTTTTGCTGTATGTAGACTTc
agttgaaaaatcattttaaaacagaTTCTACAGAAGAATACTTGAGGAAT
AAGTACTCCTTAAACTAAGTTATCTTGTagtctcaataaaacaaatgaac
caagaagaaaaaatgagctggattttcacagaaaaaccaCAGATCCATCT
TGTCCTTGTGTCTTCTTCCCAGTTACCAGCGTGTTTTTGATCGTTTGAAC
CAAGCTCGGCCTTTAAACTTAGGCGGTTTTCACCACGGAGCGACTAACCA
GTCTCACTGGTTAGTCCAAGCAAAACCGCAAACCACAATGTGAGATTTTA
TCAACAGAAATACGCATGATGTAATCtacaactaaaataaaaagaaacag
ggCGAGGGTATCACCTTGCAAGATACCTGCTAAGATGGGAAAAGTATCAG
TCTCGCCGTCTGTAGTCTGGATTTGGTGTCTGTATAAAGAAGCTTGATGG
CATTAATGATTTTCGTGGGAATGCCATATAGTAAGAGGATATCAAACATT
TTATCTCGATCAACTGAatcgaaaacttttttaaagtcaacaaaTACAAG
TATAGCGTCGAGATTGAAATTCCTGGCTTCTTCAAGTATGCGATGAAGGG
ATAGGATTTGTGTTAGTGTGGAGCGCCcactacgaaaaccattttggttt
ttacGAAGAATGGGTTCCACTTTAGACCGAATCCTATTAAGTAAAAGTTT
GTTGTAAATCTTGGCTGCTATTGGAAGAAGAGATATACCACGATAGTCAG
TAGCAAGAGTGAGGTCTCCCTTTTTCGGAACAGGAATGATATGAGATTTT
AGCCAATGATTTGTGCAAACATTTTCTTCGAACGCGATATTACAAAGATT
AAGAAGGAAACCGTGGAAGTTTTCATCTTTCCAGATAATAGGTGGAATGT
TATCTGGACCGAAAGCTTTACAAGATTTAGTTTGGGAAAGGACCTTTGTT
AATTCTTTTAAAGTGAAAGGAGAAAGAGGAATGTCCAAAGGCGGATATAT
TTGTTCCCTAGGTAGAGAATTATTTTCAGAGAGAATTGGCTTTTTGccaa
gaagatttttaaaatgattgagCCAATTATCTAGACGTTTCGCAGTGGAT
CCGCCCTTTAGTTGAATGGGGGGTTTCGAATTTTTTCCACTAAGTTCATT
GACTAGGCTCCAGCCATTACGATGAGAGTTATGCGAGAAATTTTCAGACA
TGGAGTTTATCTGGCCATTTATAAAGGATACTTCGGCTTCTAGGTAGGCC
TCGTCAAGTTTAGCTTTACAAGAGTCTAAATTTGCCTTTCGCCTGCACGT
AGGGGCATTTTTGTAAAGAGATGCTGCAAGTTTGAGATTTTCTCTTGCTG
CAATGGCGACGGGATGTCTTTCGAGTTTgagatgttttgttttcttttca
taggGAGCTGCTCTAGAGCTatttttcagtggtttcaatCAAACTGGAAT
AAGCATCTTCAATGTTGTCTTTATTTAGATCCTCGATGAAAAGATGAGAA
AAGCGGTTATATACTTCAACAGTAAATCTGTTGCGGATTTCGGGATTGAG
AGAAGATTCAGTGTTTTTTCTTCAGAGGGTGTGGCTTCGAGTGTTTTGAT
GCACGGAGGCTCAATTTGATATTTGAAGAAACAATACGGTGGTCAGAGCT
AACAGTGTAGAATGAGGAATATGCCCTTGAGTCTTTAATACTATTCCTCC
ATTTTTTACGAAAGAGAATATAGTCAATTTGAGCTTTATCACCATTTGGA
TATCGGAATGTCCAAAGGTGATTGGCACATTTCATGAAATAGTTATCAGA
TCTATAAGAGGTATTCGCCATTGCGATTAGTGTGCTTATTAAAGGAGAAA
GAGACATCGGGACATGCGAGCTTCGCATTAAAATCACCagcaatgtttac
aaaatgatGTTATGGAATATCGTCGAGTACATTTTTAAGTTCCAAATAAA
ATTCCTCAACTTCCTCTTTTGGGGCGCTATTGTGTGGACTATAGACACAA
ACAACTGATAAAACTGGATTGCTTGAGAACTCAGCAATCAAAATTCTAGG
CGTGATAGATTCTACCTTAATGAAGTTATTTTTTAGCTttggaagaaaga
agaagacctACTCCTCCAACCGTACCATTAACAGAGTTTTTGGTTGCCGA
AGATGTAATAAGTTGAAGAGAAGAGTTTGAAGAATACATAAGGTTATCAG
CAGGATGGAAAATGCATGTTCTTGGATTGTAATCATGTCTATGGAATTTT
CAGACATTGAACGCACGAGCTCGTTTAATTCAAGGTTTGAACATTGAAAG
TACTAATAATAGCAGATAGCAGATAGCTATCGAACGagaagccttcgggt
cgcctccgactgcggtcgcagacttacttacttacttaaaggAAATTGGA
TGTTATTGAATGTTAAAGATTAATTCTCTTTTCACCTCAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000115_pilon:25698..34837+ >MSTRG.14019.4.p1 ID=MSTRG.14019.4.p1|Name=MSTRG.14019.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1332bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:25698..34837+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTCAGCTTTTGAAGCACGACGACAGATTTGTCATTGGGtttaaagaaat
attgaaaagttGTTTCTACACAATGGGCTCGAACCCTGTCCTCTCTTTAT
TTATGTGGACCGTCATTGGTGAACTGAACCTTGGTACAAGTGAAGataaa
gAAAGTTTCGAAGATGCTTTACTTTCAATACAAGAGACAGATAATGGGAG
GGTACGTTTTGAAGCATGGTTTCAAatcaatttgaatttcgataaaattg
aaGAGCTATTGCTGACCATCTTTCAAGTTGATAATAAGCTttggaagaaa
gaagaagacctACTCCTCCAACCGTACCATTAATTTCAGCTTTTGAAGCA
CGACGACAGATTTGTCATTGGGtttaaagaaatattgaaaagttGTTTCT
ACACAATGGGCTCGAACCCTGTCCTCTCTTTATTTATGTGGACCGTCATT
GGTGAACTGAACCTTGGTACAAGTGAAGataaagAAAGTTTCGAAGATGC
TTTACTTTCAATACAAGAGACAGATAATGGGAGGGTACGTTTTGAAGCAT
GGTTTCAAatcaatttgaatttcgataaaattgaaGAGCTATTGCTGACC
ATCTTTCAAGTTGATAATAAGCTttggaagaaagaagaagacctACTCCT
CCAACCGTACCATTAATTTCAGCTTTTGAAGCACGACGACAGATTTGTCA
TTGGGtttaaagaaatattgaaaagttGTTTCTACACAATGGGCTCGAAC
CCTGTCCTCTCTTTATTTATGTGGACCGTCATTGGTGAACTGAACCTTGG
TACAAGTGAAGataaagAAAGTTTCGAAGATGCTTTACTTTCAATACAAG
AGACAGATAATGGGAGGGTACGTTTTGAAGCATGGTTTCAAatcaatttg
aatttcgataaaattgaaGAGCTATTGCTGACCATCTTTCAAGTTGATAA
TAAGCTttggaagaaagaagaagacctACTCCTCCAACCGTACCATTAAT
TTCAGCTTTTGAAGCACGACGACAGATTTGTCATTGGGtttaaagaaata
ttgaaaagttGTTTCTACACAATGGGCTCGAACCCTGTCCTCTCTTTATT
TATGTGGACCGTCATTGGTGAACTGAACCTTGGTACAAGTGAAGataaag
AAAGTTTCGAAGATGCTTTACTTTCAATACAAGAGACAGATAATGGGAGG
GTACGTTTTGAAGCATGGTTTCAAatcaatttgaatttcgataaaattga
aGAGCTATTGCTGACCATCTTTCAAGTTGATAATAAGCTttggaagaaag
aagaagacctACTCCTCCAACCGTACCATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000115_pilon | genome | sc0000115_pilon:25698..34837 + |
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