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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000114_pilon:822976..828687+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13992.3.p1 ID=MSTRG.13992.3.p1|Name=MSTRG.13992.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5712bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:822976..828687+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTACAAAAACCTTATTTAAGCCATTTTTGGCATGGTGCATGATTTGTAC
CATTTAAATGACAGTGTCATAATcggcaaaatttttgttttattttagta
tCTGTGATGAttagaaatttattgaaaatgttataagatcttttaaaaat
caTGTCTGAAATGCAGCAAATACCTCGTTTAATAAACTACCCCACCCATG
AGCATCCTTTGGAACTGACAGAAGGGATAAAAATCTATCCACAATACAAT
GGATCTTGGAAATGTGATAATTGTGAGTTGGATAAAACAAACGGTGAGAA
ACCATATCATTGTCAACCCTGTCAATTTGATCTTTGCATTAATTGTGCAC
TCCCTATAAGACATTTAAGACACCCTTCACATCAGTTGTATAGGGCGAAC
ATGAAAAATGTATACCCTCAGTACCATGGACAATGGCGCTGTGATGGTTG
TGATGTAACCAGAGGACCAGAATTGGCATATCATTGTTTCCATGATCAAT
TTGATATTTGTGATCGGTGTGTCCAAGGGCAGAATCTTCCTATCCATCAA
CATCCATTGAAACCTGTTGATGCCGCAAAACTTTATGATAATGCACCGGG
CTGGTGGGCTTGTGATTGCTGTAAACGACATGGAACTGAAATTGGATCGT
AAGTTTTTGGTTTCTGATTAGGACTGAAAGGTTCAGTGTTGATCTCTCTT
ACTATTTCATTTTGTCTTCAACCATCACCACACCTAAGGgctcaatctca
aaattatcaaagttgtgtccaatttttgagatttagatTACAaccatttt
ctttttattgaatgCTTTATAGCAGCGCTTTATTACAATACTTTTCATAC
ATTTTCtaagacacttattttgagattgaacccaCAGTCAATAATTAATA
AATAATattaatttaaaaatgttttccctTGAAATTGAGTTTAGTTCTTT
TTAAGAGTACAAAAACAAATACACTTTTCTGGTTAGTAAGCTATTTTGGT
tgtgtgaaatatttttctgtttcaGGAAATTCTCATGGCACTGTGCACTT
TGTAAATTTGACTGCTGATCTGATTGTCATTGTGAGTGTTATTAAAAGTT
AATGAAAgacaatttatttttcattttcaggagatTCTCTTGGCATTGTG
CTCTTTGTGAGTTTGACTGCTGTGTTGATTGTTTAGCGGAACGGAAAACT
CCTCAACATGAACATCCAGTTCATTTAACAGATCCAATGAAAGTCTATGG
ACAAAATGGTAGTTGGAGCTGTCGTGAATGCAGAAAACAATTTACTACAG
AAAACCCTGAACCAAATAGGGGAAGACCTTACCATTGTTTTGATTGTGGT
TATGATATTTGTCATGAGTGTATATCTCCGGCCCTACATAATGGTCAGTT
GAATTaccttataaaaacattttatcttATTTGCCCACTCTTTGTGTCAC
AATTATTCTGTTGTTAgacaaatacaaaaataattttttcaaacagcTAA
CACAACTTCTTGACATTCTTAAATGCAGGCTTAGCAAATTTGCCACTGCT
GTGATCTTTTGTTGGTCAATAGTAATTGAAACAATCCAAATATAGCAATG
CCTTGCGTTGAAAGGACCTCAAAGTAATCAAGATAACCACTAGATGCTGT
TTTGCAATACTTTGCCAGTTCAGTTTCTTATAATGTGATTGTTGTTTTTT
AGATGGTGGAGATATTCCAATGGATCCAGGACTGAGAGCAACCTATGCAC
ATAATACACCATCTGCTAGAGTTACTTCTAGACCTCATCAGCCCCCAACT
GGTAACTCGCTTAAGTTCTTATGTAGTTGTCCCTATGTTGATGGTATTTt
taatttaagatttaaaaaagtgTTCCTTTTTCTCTGTTGGGGAAAAATTA
Gccccagactcaaaatttcagaaaaaaaagtcttaccttaacataaaatt
ttagagtctggtgcaactaaaacaGTATGGTACAGTTTGAATGACACAAT
CTgcgagtgaacccttgttgacagaatctcaaaactttggaaacccagcc
agacacacataattacttaccataaatcctcttttacaaactcaaaagcc
tttcaaaactactttaaactacatccaaacttcagccacattcataaagg
ctcctttccatcagccattttgttttagaaatgaacctgtgttttcattt
tcatttgtttatctttttttgcaatgtcagctttttccataaatcgaaaa
attctgctcagtgactagGCGAGTAGAGAGTAGACTTTTAAATCAAGACA
AGGGGAGGGAAAAAGTTAGATGCTATAGAATATATCAAGGTGAGAAATGA
ATTTAGACTTCACTGGTGAAAATTCAACTCAAAAGAACTTGGAATCCTTG
ttttgaaggggggggggtacagatAGACTTTTGACCTACTCTTTTGGATG
TTTATCAATCTTATTGATAATTTTGTGTAGTTGAGCAATTTTAGCCAAAT
ATATTACTCAAATCATTCAAATTTCTTGTTTAACTTTAGGCccctttatt
tcaaaattctcaataaattaCTAACCAGCTAGCTGAACTGAAATTGTGGA
aactattatattatatttcaagTCATTATTATCATTTTGTGGAACTCTGA
ATGCTTTGCCTAGCATAGCTGAGCATAGAGAGGTAAATGCTCAAATTGTT
AATAAAACATAATTTGATTTAGAGATTTTGgttgacgatgatgatgatgt
cAACATTGAAAATCTTGATGAATCAGAAAGATGTGTCATTTGTTGTTCCA
GACGTAAAAATGCAACCATTGTTCACGGAAACACTGGTCATGTTTGCTGT
TGTATATCATGTGCTAACACTATGCAACAGAGAGGCGACAACTGTCCCAT
TTGCAGGGCACCAATTGATCTTGTAATTAAGCAATTTAATTCTTGAATGG
GAATTGTCAAGATTGTATACAATGGTGCACTATCTCTATCTATCCAAAAT
GTAATATGATGCAATTCtccaaaaaaaggaaaattcagaTGCAGGTTGAT
TTTAATATGGCGGAATACAGGGCTTAGATTTTTTCCATGTGCTcaaataa
aacttaaattaaatcTAATGATTTGAggtccttttctattttcttattaG
AATGTTAGGAGAATGAAAGGGCCATCTCCTATCAATAATTTAATTGATAA
AGAGCAGATTTGGCCTTTTGCTTGCAAACAGGAGATTTATTTCAGGAGTA
ACTCCTTTAAATATTTTGCGATAACAGTGATGATGTCAATGCGATAACAG
TAATGATGTCAATGCTCAAAAAAGATTGTAGCTAAATGGTGACataatga
ttttttgttttttagcaGTTGAGATATCAGGGATTAGAATCAAGCCTTAA
AAACAAAGGatttattgttaaaaatgaaCATAATCTCAAGCATGATATTA
GCCTCACTTAGGGGGAGGCCACTGACTGGCTTAGGTAAAAAACATTACAA
ACAATACATTGTTTAAATCGtaacttcaaatttcaaatattttttagttc
AAACCTTTTACCCCCTGAACTGATTATAATAGACAAAACAATAAGAGTTA
ACTGAGAAGAGATACCATGAATATGTTTTTGTCTATCTTGCATTTGTGAT
GTGtgccgtaagttggtctaatgttgacatccctcttctaattttgacat
ccttctttagaaataggaataataagaaggtctgACTCACTGATGGACTT
CTCAACTGATTGCTaatcaaagaaaattagtttcagtcagcgattccgac
tttcctattattcctatctctaaagaagggtgacgaaattagaagaggga
tgttgacattataCAGGGCCGCGCCAccgggggggccgggggggccatgg
cccctccacttttttgcaaagcaaaataaaaaatttctcttcacctaata
atctttttcttttctgtgcgcgtgccaataaaaacgttagaACCTTTCTA
AGAGGGGACAGATGGACACTTAAATAAGTCTAATTatactatttttttta
aaaaaaacaaacttaacagttttctttcagaaaatctgaacaaaaaggaa
gctgttttagccaaataagacaggtcaaaatcgaaaattttccggaccgt
cggcgcaaaccatggttgcgcctccttagtcactatatttttgttggccc
cctcactttcaaaattgtgGCGCGGGCCCTGACTGTAAGTTGGTATATAT
ACCAACTTACAGTATGGTAAAGTATATTTTTAATACCCTTCTTATAAGTA
CTTAATTGTCTTTAGCATTTGTATATGAATTTAAAAGACAAGTTGAATCA
GTGTAATTAGTGTTTCTAACTTAAAATTGTAAGATGGTTGACCTTTTCTT
GCAGTAGAGAAGGCTCCAATCTCTAAATCATTagcaaagtaaaagaaaat
tagttttctgagacacttattttgagattggaccttttgcctCAACGGCA
GCAAAATGTGAGATACCTTCTGTGCACTCACAAAACACTTAAAGCCATCT
GATATATTGATgtttaattaaatatttcattttctttagctTTTAAAAGT
TACAACCATCTttttatgctttccctaatctGGAAAGTTTTTTAAGTAAA
ATCTGGTAAAATATGCATTTGTATTTCTGCCGTGATCTGACAAAAGTCGC
TTACTTCTTTTTATAGCCTGAAAAATGAATATTGCTTGCAATATTTTGCA
gtttattttctgacaaaaagaagtaactttaaaatttttagcttgaaata
gcTTGAGTAGAGTAAAACTTGtgtagatttttctaaaatcaagaTGTTTT
TAAACTCCTTTTAACTCCTTCCTTTTAAATATTATAAACTATTCTAGGGT
TTGGTCTTTCACAATCAGCAAAAGTTTTGATCTTAAAACAATACTTTTAA
TCTTGAATAAGGTCAACTCGTTTATGTAATTatctcaaaataagaaaaat
gcagttacttccttttgtcagatcaAGGCAGATTTGCAATATGGTTAGTT
ATAAGAAATAATGAAGTTTGTACGATACAAAAATcctcgttttttttctt
tgtcttctctTGTAACTTTCAGTCATGGGGtttaaattttatgtgtttaa
ttttatttacatttattcattttttatttcaattttttaaaacatttttg
taagGCATTAGTATTAAGCACTATGCTCAGATTGTTTAATACACAGTAAA
GTAAATTCAAtgattcaaatttgaaaaaattgaatgttctgagttgaagt
aaaattttaatatgatttttctttcaTGTTTTCGAACAACAATCATTTGA
GTAGTAGCTTCATTTTCAATATTCTGGAtgccttaaaatattttattttt
aaaacaagCATCATGGCACAAtttttttGTAACATAAGCATGGCGTTGTA
ATTTCTATATGTTTATTAATTATACATTGTTATATTGTTATATTCATAAT
CTATTGCTTTTTAAATCTTATCTTTACCTAGTGCTTTGGGCTTTCCAACT
TTGTTGCTTTTAGAAAACTTTAATGCTTATTcttagaaaattaattttta
agattCCTTACTGCGGAGTATTTTAGGGTACCTGATTTCGAAAACCTTCT
CCTACTCCCATCAGGGCTACTACAATGGTTGTCTCTCAGATCCCTTTCAA
GATGGTGCCATT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000114_pilon:822976..828687+ >MSTRG.13992.3.p1 ID=MSTRG.13992.3.p1|Name=MSTRG.13992.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3480bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:822976..828687+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGTCTGAAATGCAGCAAATACCTCGTTTAATAAACTACCCCACCCATGA
GCATCCTTTGGAACTGACAGAAGGGATAAAAATCTATCCACAATACAATG
GATCTTGGAAATGTGATAATTGTGAGTTGGATAAAACAAACGGTGAGAAA
CCATATCATTGTCAACCCTGTCAATTTGATCTTTGCATTAATTGTGCACT
CCCTATAAGACATTTAAGACACCCTTCACATCAGTTGTATAGGGCGAACA
TGAAAAATGTATACCCTCAGTACCATGGACAATGGCGCTGTGATGGTTGT
GATGTAACCAGAGGACCAGAATTGGCATATCATTGTTTCCATGATCAATT
TGATATTTGTGATCGGTGTGTCCAAGGGCAGAATCTTCCTATCCATCAAC
ATCCATTGAAACCTGTTGATGCCGCAAAACTTTATGATAATGCACCGGGC
TGGTGGGCTTGTGATTGCTGTAAACGACATGGAACTGAAATTGGATCgag
atTCTCTTGGCATTGTGCTCTTTGTGAGTTTGACTGCTGTGTTGATTGTT
TAGCGGAACGGAAAACTCCTCAACATGAACATCCAGTTCATTTAACAGAT
CCAATGAAAGTCTATGGACAAAATGGTAGTTGGAGCTGTCGTGAATGCAG
AAAACAATTTACTACAGAAAACCCTGAACCAAATAGGGGAAGACCTTACC
ATTGTTTTGATTGTGGTTATGATATTTGTCATGAGTGTATATCTCCGGCC
CTACATAATGATGGTGGAGATATTCCAATGGATCCAGGACTGAGAGCAAC
CTATGCACATAATACACCATCTGCTAGAGTTACTTCTAGACCTCATCAGC
CCCCAACTGATTTTGgttgaaTGTCTGAAATGCAGCAAATACCTCGTTTA
ATAAACTACCCCACCCATGAGCATCCTTTGGAACTGACAGAAGGGATAAA
AATCTATCCACAATACAATGGATCTTGGAAATGTGATAATTGTGAGTTGG
ATAAAACAAACGGTGAGAAACCATATCATTGTCAACCCTGTCAATTTGAT
CTTTGCATTAATTGTGCACTCCCTATAAGACATTTAAGACACCCTTCACA
TCAGTTGTATAGGGCGAACATGAAAAATGTATACCCTCAGTACCATGGAC
AATGGCGCTGTGATGGTTGTGATGTAACCAGAGGACCAGAATTGGCATAT
CATTGTTTCCATGATCAATTTGATATTTGTGATCGGTGTGTCCAAGGGCA
GAATCTTCCTATCCATCAACATCCATTGAAACCTGTTGATGCCGCAAAAC
TTTATGATAATGCACCGGGCTGGTGGGCTTGTGATTGCTGTAAACGACAT
GGAACTGAAATTGGATCgagatTCTCTTGGCATTGTGCTCTTTGTGAGTT
TGACTGCTGTGTTGATTGTTTAGCGGAACGGAAAACTCCTCAACATGAAC
ATCCAGTTCATTTAACAGATCCAATGAAAGTCTATGGACAAAATGGTAGT
TGGAGCTGTCGTGAATGCAGAAAACAATTTACTACAGAAAACCCTGAACC
AAATAGGGGAAGACCTTACCATTGTTTTGATTGTGGTTATGATATTTGTC
ATGAGTGTATATCTCCGGCCCTACATAATGATGGTGGAGATATTCCAATG
GATCCAGGACTGAGAGCAACCTATGCACATAATACACCATCTGCTAGAGT
TACTTCTAGACCTCATCAGCCCCCAACTGATTTTGgttgaaTGTCTGAAA
TGCAGCAAATACCTCGTTTAATAAACTACCCCACCCATGAGCATCCTTTG
GAACTGACAGAAGGGATAAAAATCTATCCACAATACAATGGATCTTGGAA
ATGTGATAATTGTGAGTTGGATAAAACAAACGGTGAGAAACCATATCATT
GTCAACCCTGTCAATTTGATCTTTGCATTAATTGTGCACTCCCTATAAGA
CATTTAAGACACCCTTCACATCAGTTGTATAGGGCGAACATGAAAAATGT
ATACCCTCAGTACCATGGACAATGGCGCTGTGATGGTTGTGATGTAACCA
GAGGACCAGAATTGGCATATCATTGTTTCCATGATCAATTTGATATTTGT
GATCGGTGTGTCCAAGGGCAGAATCTTCCTATCCATCAACATCCATTGAA
ACCTGTTGATGCCGCAAAACTTTATGATAATGCACCGGGCTGGTGGGCTT
GTGATTGCTGTAAACGACATGGAACTGAAATTGGATCgagatTCTCTTGG
CATTGTGCTCTTTGTGAGTTTGACTGCTGTGTTGATTGTTTAGCGGAACG
GAAAACTCCTCAACATGAACATCCAGTTCATTTAACAGATCCAATGAAAG
TCTATGGACAAAATGGTAGTTGGAGCTGTCGTGAATGCAGAAAACAATTT
ACTACAGAAAACCCTGAACCAAATAGGGGAAGACCTTACCATTGTTTTGA
TTGTGGTTATGATATTTGTCATGAGTGTATATCTCCGGCCCTACATAATG
ATGGTGGAGATATTCCAATGGATCCAGGACTGAGAGCAACCTATGCACAT
AATACACCATCTGCTAGAGTTACTTCTAGACCTCATCAGCCCCCAACTGA
TTTTGgttgaaTGTCTGAAATGCAGCAAATACCTCGTTTAATAAACTACC
CCACCCATGAGCATCCTTTGGAACTGACAGAAGGGATAAAAATCTATCCA
CAATACAATGGATCTTGGAAATGTGATAATTGTGAGTTGGATAAAACAAA
CGGTGAGAAACCATATCATTGTCAACCCTGTCAATTTGATCTTTGCATTA
ATTGTGCACTCCCTATAAGACATTTAAGACACCCTTCACATCAGTTGTAT
AGGGCGAACATGAAAAATGTATACCCTCAGTACCATGGACAATGGCGCTG
TGATGGTTGTGATGTAACCAGAGGACCAGAATTGGCATATCATTGTTTCC
ATGATCAATTTGATATTTGTGATCGGTGTGTCCAAGGGCAGAATCTTCCT
ATCCATCAACATCCATTGAAACCTGTTGATGCCGCAAAACTTTATGATAA
TGCACCGGGCTGGTGGGCTTGTGATTGCTGTAAACGACATGGAACTGAAA
TTGGATCgagatTCTCTTGGCATTGTGCTCTTTGTGAGTTTGACTGCTGT
GTTGATTGTTTAGCGGAACGGAAAACTCCTCAACATGAACATCCAGTTCA
TTTAACAGATCCAATGAAAGTCTATGGACAAAATGGTAGTTGGAGCTGTC
GTGAATGCAGAAAACAATTTACTACAGAAAACCCTGAACCAAATAGGGGA
AGACCTTACCATTGTTTTGATTGTGGTTATGATATTTGTCATGAGTGTAT
ATCTCCGGCCCTACATAATGATGGTGGAGATATTCCAATGGATCCAGGAC
TGAGAGCAACCTATGCACATAATACACCATCTGCTAGAGTTACTTCTAGA
CCTCATCAGCCCCCAACTGATTTTGgttga
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000114_pilon | genome | sc0000114_pilon:822976..828687 + |
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