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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000114_pilon:822976..828687+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13992.2.p1 ID=MSTRG.13992.2.p1|Name=MSTRG.13992.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5712bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:822976..828687+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTACAAAAACCTTATTTAAGCCATTTTTGGCATGGTGCATGATTTGTAC
CATTTAAATGACAGTGTCATAATcggcaaaatttttgttttattttagta
tCTGTGATGAttagaaatttattgaaaatgttataagatcttttaaaaat
caTGTCTGAAATGCAGCAAATACCTCGTTTAATAAACTACCCCACCCATG
AGCATCCTTTGGAACTGACAGAAGGGATAAAAATCTATCCACAATACAAT
GGATCTTGGAAATGTGATAATTGTGAGTTGGATAAAACAAACGGTGAGAA
ACCATATCATTGTCAACCCTGTCAATTTGATCTTTGCATTAATTGTGCAC
TCCCTATAAGACATTTAAGACACCCTTCACATCAGTTGTATAGGGCGAAC
ATGAAAAATGTATACCCTCAGTACCATGGACAATGGCGCTGTGATGGTTG
TGATGTAACCAGAGGACCAGAATTGGCATATCATTGTTTCCATGATCAAT
TTGATATTTGTGATCGGTGTGTCCAAGGGCAGAATCTTCCTATCCATCAA
CATCCATTGAAACCTGTTGATGCCGCAAAACTTTATGATAATGCACCGGG
CTGGTGGGCTTGTGATTGCTGTAAACGACATGGAACTGAAATTGGATCGT
AAGTTTTTGGTTTCTGATTAGGACTGAAAGGTTCAGTGTTGATCTCTCTT
ACTATTTCATTTTGTCTTCAACCATCACCACACCTAAGGgctcaatctca
aaattatcaaagttgtgtccaatttttgagatttagatTACAaccatttt
ctttttattgaatgCTTTATAGCAGCGCTTTATTACAATACTTTTCATAC
ATTTTCtaagacacttattttgagattgaacccaCAGTCAATAATTAATA
AATAATattaatttaaaaatgttttccctTGAAATTGAGTTTAGTTCTTT
TTAAGAGTACAAAAACAAATACACTTTTCTGGTTAGTAAGCTATTTTGGT
tgtgtgaaatatttttctgtttcaGGAAATTCTCATGGCACTGTGCACTT
TGTAAATTTGACTGCTGATCTGATTGTCATTGTGAGTGTTATTAAAAGTT
AATGAAAgacaatttatttttcattttcaggagatTCTCTTGGCATTGTG
CTCTTTGTGAGTTTGACTGCTGTGTTGATTGTTTAGCGGAACGGAAAACT
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AAAACCCTGAACCAAATAGGGGAAGACCTTACCATTGTTTTGATTGTGGT
TATGATATTTGTCATGAGTGTATATCTCCGGCCCTACATAATGGTCAGTT
GAATTaccttataaaaacattttatcttATTTGCCCACTCTTTGTGTCAC
AATTATTCTGTTGTTAgacaaatacaaaaataattttttcaaacagcTAA
CACAACTTCTTGACATTCTTAAATGCAGGCTTAGCAAATTTGCCACTGCT
GTGATCTTTTGTTGGTCAATAGTAATTGAAACAATCCAAATATAGCAATG
CCTTGCGTTGAAAGGACCTCAAAGTAATCAAGATAACCACTAGATGCTGT
TTTGCAATACTTTGCCAGTTCAGTTTCTTATAATGTGATTGTTGTTTTTT
AGATGGTGGAGATATTCCAATGGATCCAGGACTGAGAGCAACCTATGCAC
ATAATACACCATCTGCTAGAGTTACTTCTAGACCTCATCAGCCCCCAACT
GGTAACTCGCTTAAGTTCTTATGTAGTTGTCCCTATGTTGATGGTATTTt
taatttaagatttaaaaaagtgTTCCTTTTTCTCTGTTGGGGAAAAATTA
Gccccagactcaaaatttcagaaaaaaaagtcttaccttaacataaaatt
ttagagtctggtgcaactaaaacaGTATGGTACAGTTTGAATGACACAAT
CTgcgagtgaacccttgttgacagaatctcaaaactttggaaacccagcc
agacacacataattacttaccataaatcctcttttacaaactcaaaagcc
tttcaaaactactttaaactacatccaaacttcagccacattcataaagg
ctcctttccatcagccattttgttttagaaatgaacctgtgttttcattt
tcatttgtttatctttttttgcaatgtcagctttttccataaatcgaaaa
attctgctcagtgactagGCGAGTAGAGAGTAGACTTTTAAATCAAGACA
AGGGGAGGGAAAAAGTTAGATGCTATAGAATATATCAAGGTGAGAAATGA
ATTTAGACTTCACTGGTGAAAATTCAACTCAAAAGAACTTGGAATCCTTG
ttttgaaggggggggggtacagatAGACTTTTGACCTACTCTTTTGGATG
TTTATCAATCTTATTGATAATTTTGTGTAGTTGAGCAATTTTAGCCAAAT
ATATTACTCAAATCATTCAAATTTCTTGTTTAACTTTAGGCccctttatt
tcaaaattctcaataaattaCTAACCAGCTAGCTGAACTGAAATTGTGGA
aactattatattatatttcaagTCATTATTATCATTTTGTGGAACTCTGA
ATGCTTTGCCTAGCATAGCTGAGCATAGAGAGGTAAATGCTCAAATTGTT
AATAAAACATAATTTGATTTAGAGATTTTGgttgacgatgatgatgatgt
cAACATTGAAAATCTTGATGAATCAGAAAGATGTGTCATTTGTTGTTCCA
GACGTAAAAATGCAACCATTGTTCACGGAAACACTGGTCATGTTTGCTGT
TGTATATCATGTGCTAACACTATGCAACAGAGAGGCGACAACTGTCCCAT
TTGCAGGGCACCAATTGATCTTGTAATTAAGCAATTTAATTCTTGAATGG
GAATTGTCAAGATTGTATACAATGGTGCACTATCTCTATCTATCCAAAAT
GTAATATGATGCAATTCtccaaaaaaaggaaaattcagaTGCAGGTTGAT
TTTAATATGGCGGAATACAGGGCTTAGATTTTTTCCATGTGCTcaaataa
aacttaaattaaatcTAATGATTTGAggtccttttctattttcttattaG
AATGTTAGGAGAATGAAAGGGCCATCTCCTATCAATAATTTAATTGATAA
AGAGCAGATTTGGCCTTTTGCTTGCAAACAGGAGATTTATTTCAGGAGTA
ACTCCTTTAAATATTTTGCGATAACAGTGATGATGTCAATGCGATAACAG
TAATGATGTCAATGCTCAAAAAAGATTGTAGCTAAATGGTGACataatga
ttttttgttttttagcaGTTGAGATATCAGGGATTAGAATCAAGCCTTAA
AAACAAAGGatttattgttaaaaatgaaCATAATCTCAAGCATGATATTA
GCCTCACTTAGGGGGAGGCCACTGACTGGCTTAGGTAAAAAACATTACAA
ACAATACATTGTTTAAATCGtaacttcaaatttcaaatattttttagttc
AAACCTTTTACCCCCTGAACTGATTATAATAGACAAAACAATAAGAGTTA
ACTGAGAAGAGATACCATGAATATGTTTTTGTCTATCTTGCATTTGTGAT
GTGtgccgtaagttggtctaatgttgacatccctcttctaattttgacat
ccttctttagaaataggaataataagaaggtctgACTCACTGATGGACTT
CTCAACTGATTGCTaatcaaagaaaattagtttcagtcagcgattccgac
tttcctattattcctatctctaaagaagggtgacgaaattagaagaggga
tgttgacattataCAGGGCCGCGCCAccgggggggccgggggggccatgg
cccctccacttttttgcaaagcaaaataaaaaatttctcttcacctaata
atctttttcttttctgtgcgcgtgccaataaaaacgttagaACCTTTCTA
AGAGGGGACAGATGGACACTTAAATAAGTCTAATTatactatttttttta
aaaaaaacaaacttaacagttttctttcagaaaatctgaacaaaaaggaa
gctgttttagccaaataagacaggtcaaaatcgaaaattttccggaccgt
cggcgcaaaccatggttgcgcctccttagtcactatatttttgttggccc
cctcactttcaaaattgtgGCGCGGGCCCTGACTGTAAGTTGGTATATAT
ACCAACTTACAGTATGGTAAAGTATATTTTTAATACCCTTCTTATAAGTA
CTTAATTGTCTTTAGCATTTGTATATGAATTTAAAAGACAAGTTGAATCA
GTGTAATTAGTGTTTCTAACTTAAAATTGTAAGATGGTTGACCTTTTCTT
GCAGTAGAGAAGGCTCCAATCTCTAAATCATTagcaaagtaaaagaaaat
tagttttctgagacacttattttgagattggaccttttgcctCAACGGCA
GCAAAATGTGAGATACCTTCTGTGCACTCACAAAACACTTAAAGCCATCT
GATATATTGATgtttaattaaatatttcattttctttagctTTTAAAAGT
TACAACCATCTttttatgctttccctaatctGGAAAGTTTTTTAAGTAAA
ATCTGGTAAAATATGCATTTGTATTTCTGCCGTGATCTGACAAAAGTCGC
TTACTTCTTTTTATAGCCTGAAAAATGAATATTGCTTGCAATATTTTGCA
gtttattttctgacaaaaagaagtaactttaaaatttttagcttgaaata
gcTTGAGTAGAGTAAAACTTGtgtagatttttctaaaatcaagaTGTTTT
TAAACTCCTTTTAACTCCTTCCTTTTAAATATTATAAACTATTCTAGGGT
TTGGTCTTTCACAATCAGCAAAAGTTTTGATCTTAAAACAATACTTTTAA
TCTTGAATAAGGTCAACTCGTTTATGTAATTatctcaaaataagaaaaat
gcagttacttccttttgtcagatcaAGGCAGATTTGCAATATGGTTAGTT
ATAAGAAATAATGAAGTTTGTACGATACAAAAATcctcgttttttttctt
tgtcttctctTGTAACTTTCAGTCATGGGGtttaaattttatgtgtttaa
ttttatttacatttattcattttttatttcaattttttaaaacatttttg
taagGCATTAGTATTAAGCACTATGCTCAGATTGTTTAATACACAGTAAA
GTAAATTCAAtgattcaaatttgaaaaaattgaatgttctgagttgaagt
aaaattttaatatgatttttctttcaTGTTTTCGAACAACAATCATTTGA
GTAGTAGCTTCATTTTCAATATTCTGGAtgccttaaaatattttattttt
aaaacaagCATCATGGCACAAtttttttGTAACATAAGCATGGCGTTGTA
ATTTCTATATGTTTATTAATTATACATTGTTATATTGTTATATTCATAAT
CTATTGCTTTTTAAATCTTATCTTTACCTAGTGCTTTGGGCTTTCCAACT
TTGTTGCTTTTAGAAAACTTTAATGCTTATTcttagaaaattaattttta
agattCCTTACTGCGGAGTATTTTAGGGTACCTGATTTCGAAAACCTTCT
CCTACTCCCATCAGGGCTACTACAATGGTTGTCTCTCAGATCCCTTTCAA
GATGGTGCCATT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000114_pilon:822976..828687+ >MSTRG.13992.2.p1 ID=MSTRG.13992.2.p1|Name=MSTRG.13992.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4332bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:822976..828687+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGTCTGAAATGCAGCAAATACCTCGTTTAATAAACTACCCCACCCATGA
GCATCCTTTGGAACTGACAGAAGGGATAAAAATCTATCCACAATACAATG
GATCTTGGAAATGTGATAATTGTGAGTTGGATAAAACAAACGGTGAGAAA
CCATATCATTGTCAACCCTGTCAATTTGATCTTTGCATTAATTGTGCACT
CCCTATAAGACATTTAAGACACCCTTCACATCAGTTGTATAGGGCGAACA
TGAAAAATGTATACCCTCAGTACCATGGACAATGGCGCTGTGATGGTTGT
GATGTAACCAGAGGACCAGAATTGGCATATCATTGTTTCCATGATCAATT
TGATATTTGTGATCGGTGTGTCCAAGGGCAGAATCTTCCTATCCATCAAC
ATCCATTGAAACCTGTTGATGCCGCAAAACTTTATGATAATGCACCGGGC
TGGTGGGCTTGTGATTGCTGTAAACGACATGGAACTGAAATTGGATCgag
atTCTCTTGGCATTGTGCTCTTTGTGAGTTTGACTGCTGTGTTGATTGTT
TAGCGGAACGGAAAACTCCTCAACATGAACATCCAGTTCATTTAACAGAT
CCAATGAAAGTCTATGGACAAAATGGTAGTTGGAGCTGTCGTGAATGCAG
AAAACAATTTACTACAGAAAACCCTGAACCAAATAGGGGAAGACCTTACC
ATTGTTTTGATTGTGGTTATGATATTTGTCATGAGTGTATATCTCCGGCC
CTACATAATGATGGTGGAGATATTCCAATGGATCCAGGACTGAGAGCAAC
CTATGCACATAATACACCATCTGCTAGAGTTACTTCTAGACCTCATCAGC
CCCCAACTGAGATTTTGgttgacgatgatgatgatgtcAACATTGAAAAT
CTTGATGAATCAGAAAGATGTGTCATTTGTTGTTCCAGACGTAAAAATGC
AACCATTGTTCACGGAAACACTGGTCATGTTTGCTGTTGTATATCATGTG
CTAACACTATGCAACAGAGAGGCGACAACTGTCCCATTTGCAGGGCACCA
ATTGATCTTGTAATTAAGCAATTTAATTCTTGAaTGTCTGAAATGCAGCA
AATACCTCGTTTAATAAACTACCCCACCCATGAGCATCCTTTGGAACTGA
CAGAAGGGATAAAAATCTATCCACAATACAATGGATCTTGGAAATGTGAT
AATTGTGAGTTGGATAAAACAAACGGTGAGAAACCATATCATTGTCAACC
CTGTCAATTTGATCTTTGCATTAATTGTGCACTCCCTATAAGACATTTAA
GACACCCTTCACATCAGTTGTATAGGGCGAACATGAAAAATGTATACCCT
CAGTACCATGGACAATGGCGCTGTGATGGTTGTGATGTAACCAGAGGACC
AGAATTGGCATATCATTGTTTCCATGATCAATTTGATATTTGTGATCGGT
GTGTCCAAGGGCAGAATCTTCCTATCCATCAACATCCATTGAAACCTGTT
GATGCCGCAAAACTTTATGATAATGCACCGGGCTGGTGGGCTTGTGATTG
CTGTAAACGACATGGAACTGAAATTGGATCgagatTCTCTTGGCATTGTG
CTCTTTGTGAGTTTGACTGCTGTGTTGATTGTTTAGCGGAACGGAAAACT
CCTCAACATGAACATCCAGTTCATTTAACAGATCCAATGAAAGTCTATGG
ACAAAATGGTAGTTGGAGCTGTCGTGAATGCAGAAAACAATTTACTACAG
AAAACCCTGAACCAAATAGGGGAAGACCTTACCATTGTTTTGATTGTGGT
TATGATATTTGTCATGAGTGTATATCTCCGGCCCTACATAATGATGGTGG
AGATATTCCAATGGATCCAGGACTGAGAGCAACCTATGCACATAATACAC
CATCTGCTAGAGTTACTTCTAGACCTCATCAGCCCCCAACTGAGATTTTG
gttgacgatgatgatgatgtcAACATTGAAAATCTTGATGAATCAGAAAG
ATGTGTCATTTGTTGTTCCAGACGTAAAAATGCAACCATTGTTCACGGAA
ACACTGGTCATGTTTGCTGTTGTATATCATGTGCTAACACTATGCAACAG
AGAGGCGACAACTGTCCCATTTGCAGGGCACCAATTGATCTTGTAATTAA
GCAATTTAATTCTTGAaTGTCTGAAATGCAGCAAATACCTCGTTTAATAA
ACTACCCCACCCATGAGCATCCTTTGGAACTGACAGAAGGGATAAAAATC
TATCCACAATACAATGGATCTTGGAAATGTGATAATTGTGAGTTGGATAA
AACAAACGGTGAGAAACCATATCATTGTCAACCCTGTCAATTTGATCTTT
GCATTAATTGTGCACTCCCTATAAGACATTTAAGACACCCTTCACATCAG
TTGTATAGGGCGAACATGAAAAATGTATACCCTCAGTACCATGGACAATG
GCGCTGTGATGGTTGTGATGTAACCAGAGGACCAGAATTGGCATATCATT
GTTTCCATGATCAATTTGATATTTGTGATCGGTGTGTCCAAGGGCAGAAT
CTTCCTATCCATCAACATCCATTGAAACCTGTTGATGCCGCAAAACTTTA
TGATAATGCACCGGGCTGGTGGGCTTGTGATTGCTGTAAACGACATGGAA
CTGAAATTGGATCgagatTCTCTTGGCATTGTGCTCTTTGTGAGTTTGAC
TGCTGTGTTGATTGTTTAGCGGAACGGAAAACTCCTCAACATGAACATCC
AGTTCATTTAACAGATCCAATGAAAGTCTATGGACAAAATGGTAGTTGGA
GCTGTCGTGAATGCAGAAAACAATTTACTACAGAAAACCCTGAACCAAAT
AGGGGAAGACCTTACCATTGTTTTGATTGTGGTTATGATATTTGTCATGA
GTGTATATCTCCGGCCCTACATAATGATGGTGGAGATATTCCAATGGATC
CAGGACTGAGAGCAACCTATGCACATAATACACCATCTGCTAGAGTTACT
TCTAGACCTCATCAGCCCCCAACTGAGATTTTGgttgacgatgatgatga
tgtcAACATTGAAAATCTTGATGAATCAGAAAGATGTGTCATTTGTTGTT
CCAGACGTAAAAATGCAACCATTGTTCACGGAAACACTGGTCATGTTTGC
TGTTGTATATCATGTGCTAACACTATGCAACAGAGAGGCGACAACTGTCC
CATTTGCAGGGCACCAATTGATCTTGTAATTAAGCAATTTAATTCTTGAa
TGTCTGAAATGCAGCAAATACCTCGTTTAATAAACTACCCCACCCATGAG
CATCCTTTGGAACTGACAGAAGGGATAAAAATCTATCCACAATACAATGG
ATCTTGGAAATGTGATAATTGTGAGTTGGATAAAACAAACGGTGAGAAAC
CATATCATTGTCAACCCTGTCAATTTGATCTTTGCATTAATTGTGCACTC
CCTATAAGACATTTAAGACACCCTTCACATCAGTTGTATAGGGCGAACAT
GAAAAATGTATACCCTCAGTACCATGGACAATGGCGCTGTGATGGTTGTG
ATGTAACCAGAGGACCAGAATTGGCATATCATTGTTTCCATGATCAATTT
GATATTTGTGATCGGTGTGTCCAAGGGCAGAATCTTCCTATCCATCAACA
TCCATTGAAACCTGTTGATGCCGCAAAACTTTATGATAATGCACCGGGCT
GGTGGGCTTGTGATTGCTGTAAACGACATGGAACTGAAATTGGATCgaga
tTCTCTTGGCATTGTGCTCTTTGTGAGTTTGACTGCTGTGTTGATTGTTT
AGCGGAACGGAAAACTCCTCAACATGAACATCCAGTTCATTTAACAGATC
CAATGAAAGTCTATGGACAAAATGGTAGTTGGAGCTGTCGTGAATGCAGA
AAACAATTTACTACAGAAAACCCTGAACCAAATAGGGGAAGACCTTACCA
TTGTTTTGATTGTGGTTATGATATTTGTCATGAGTGTATATCTCCGGCCC
TACATAATGATGGTGGAGATATTCCAATGGATCCAGGACTGAGAGCAACC
TATGCACATAATACACCATCTGCTAGAGTTACTTCTAGACCTCATCAGCC
CCCAACTGAGATTTTGgttgacgatgatgatgatgtcAACATTGAAAATC
TTGATGAATCAGAAAGATGTGTCATTTGTTGTTCCAGACGTAAAAATGCA
ACCATTGTTCACGGAAACACTGGTCATGTTTGCTGTTGTATATCATGTGC
TAACACTATGCAACAGAGAGGCGACAACTGTCCCATTTGCAGGGCACCAA
TTGATCTTGTAATTAAGCAATTTAATTCTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000114_pilon | genome | sc0000114_pilon:822976..828687 + |
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