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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000114_pilon:799261..804868+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13988.2.p1 ID=MSTRG.13988.2.p1|Name=MSTRG.13988.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5608bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:799261..804868+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTAGAAAATAAACATAATATAAAACACCAAAATGGTTTCCATCAAGACAT
CTTTGTTGTTGATTGTCGTATTCTGTTTGACATGGTTCGTACAAGATACT
ATAGGTAAGTATTACTTGGTTAAAATATTTGATCATACTTCTGCTAGTTT
CAAATTATATTTAGCTACGGCTTTCTATAGAATACAAGGCTGACTAGGTA
CAATAAAGTACAAGCTAGAAGACCTCCGTTGGTCCCTTTTTCTTATCATG
CAGTAAATAGGCTTCAATTCCGAGTTTGATTATATTTTACACTTGTATAA
ATGCCCAAGTACGGAGTTCTGAGAATCTAGGTTTTCAGGAAAGGCCAATT
TTATTGCCctgtaaaagattttcaaagatcgaaatattttgattgttttc
ttcaGGAGCATCGTGTGAGTTCAAGAAATCGAGTAATGGAACAGTTTCAG
GATCTTGTGGTGAATGTGTCGGCTATGATATCGAGGTatactattttctt
ttgtaataGTATATATCTCTTTCATTGCAAATTGATGATCTGTAAAGTTC
GCTAAGCTTGCTAAGTTAATGTTCACAATATTTGATTAAGGAATAAATCA
TTACCACCCCCTGTTTTAGTATTCCGTTCAGGAATTATTTAgctgatgaa
aataaaattacagAGAAAATTCTCAATATAGATAGGAACTCGAATATTTT
TACgcttaaattttaaatttgtaaTGTCTTTTCAAATGGAGATAAGTTTC
CATTTGTAGTTTTCTAATGGGGACCAAATTTTATGCTAATAATGTATATA
GTGGAGTGTCCATAACTCAGACACGCACGGAGAACAcaatttttttcgag
ttatggagacttgtTTATTAGGGTTTCTTAACTAAAGAGATCAGAAAATT
TGTTCTAGTTAAGGAAACATTCCAGTAATAGAGGTTCAAGCTccgggttc
gagttatggagactccattgtattATTACTTATATCCTTTATTTTCTCGT
TTCGCAGTGCTTCTATTGCGATTCAACGAAGAAATGTGAAAAGCGTACGT
CCGTGATCGTTAATAAAGACCAATGCTCAGGCAAATGGTATACCTACAGT
CAATGCACAAGTATGTGTTTAAATTCTATGTACTGTTCAGATCTTTTCTT
CGGTGATATCTTGTATTGTTATAGGCAAGTTGTGGGAAAATACAAAGTCG
TCATATAGCTGTTGAGAAGAAATTTAAGTGGTGGTGTTGAGCTTCTCAAG
AATTTTCTAGCCCGTGCGGACAAATCCCCCGTCCgacttttatttaattt
tccctGCGAAACCGTTTATTATAGGCTATAATATTATCTACTATATCTAC
TATTAACTCATCTTAATTCTTTCACTTTTAGTTCCTGGTGTTGTGTTGAT
TGTGATCGCACCACTGGCAGCAGTTCTTCTCCTGGTCTTCCTCTGTTGTT
GTGTGTATTGTATTTGTTGCCGCGATTGTTGTCGTGAACGAAGCCAAAGA
AAGTAAGTATCCTCAAAGGTAGAAGAGGAGAAGCGGTCAGAAatataaca
cccctgtatcagtgacccggtaGCGTTAGAACTCACCGGGGTAActatga
aaatagtaaaatttcgCCAGGTGATTTTGAGgtcttgaaatttcattttt
ggtgagaattttctcatcaattttcacatcgattttcaCCGGGTCAAGGA
CAGTGAgatttttcaattgaaaaaaattatatatagtaatttttgatgat
ttttgacaGGGTTGACCTACCTACATAATGTTATTAATGTCCTGGGCATA
AATTTAAATTTCCAAAGCAGAGTCAGAGGCAGAGTTAGAAAATTTCGGTT
AATTTTGAACCGGGCTCACTCATTATCCCACTGGGGCTTAAAATTAGACC
ATTTTTGGCAATTCTTTTCATCGGGTCACTGATGAACAGGGCCCgattgt
tcaaaagtggattagcgGCCGATTAGCTTAAGTCTGGATTAAATCACGAT
TAGCGCcgattaacgaaaatttgtctGTTGTTCAAAAAATATCACGATTA
AAAAAGCGATTAACTTAGACTTAAACACCCCAAAACTTAATCCTGCTCGG
GAGGTGGATTAAGGAAAGATTAAGCTTAAAACAAAGTGAGAAATGGCCGC
CATGAACATGATTTTATATGGAAATTTGCAAAGAAGACGTCCAAGAACAT
ACagacatagtgtcctcctgggttggttccccccactaaaaatcaaaatt
tttctccattcccccctcttttatttcccccaccatatttcaaaattttt
cggttcccccctcttttttgaattcccccagctatttgaagattttgcgg
ttccccatatggttaacataaaaatgccttaaatcaagtttgaaattttg
gaaagcttgaaaaaatagccttgaaagtgctggaaaaatgaaattgtatt
gaaaagttggtttatcccaaaagatttgctgattttattgcttaaacagg
ttttgcaacaagatcaccttgagatcagtgaagttcccccagtcaaaatc
tcctaaatttatggttttcccccctctttattttcccccagcaaatttca
aatttttcattttcccccatactttaaaaaaagggccaaaatcagaatcc
ccccccctttataaaggggggggggaggacactatgacaGATTGAAAGAT
TTTATGAATGACAACACTTTTTGATGAGGACATTCGAATGCGCTTTCGCT
TTTCATGACAAGGCATTGTGTTTTTAACCAATCTTCTCAGACAAGATCTG
CAAAGACCTACACAGGGGTGTACAAACTAtactttgttaagtttcttGAT
TATTTTAGCACAAAGCAAATAGCTAAACTGTCTGAAGCTCAAATCTGTTT
TTGTTGAAGAAAATACACAGTaatgaattttaaataaataggATTTGGAT
TTTAAACTCCACTTTCTTGTTTCATCTTTTGTGCAGATGGGCCAAAGAAG
ATTCGAAACGTGAAAACAGGAAGAACGAGAGAGATGCCAAACATGCTGCA
AGGTAAGACAATGgtcaaaaatggtaaaattagtAAAATTCAGATTGTGT
ataccattgcaatgtcttctgacaatACGTCATTTTTTAGAAAGGCTGAT
TGATGCATTGAATAGaaaaaaaGTAGGAAGGATACATATTTTTGTTACAA
TGGTGCACATTTATGTGCATTTCTCGGCATAGTATCATCCCACAAACACT
ATTTGTTCTTTCAAAGCTGGTTCACCACGTAGTTTTAACGTCTATCTAAC
GTTCAAAACGATAcacaaacgttgaaacaatgatATAAATCAGCTGGGTT
ATTAGTTATAACTGCTAGATACCGGCACTAAAAGGACACGTAAGGGTAGT
TGGGAAACTTTTCCAGAGAATAAGCCTGTTGGGTAGCTTTGTTTTAAGTG
AAGACCCTCATAATACCATTCAAAATCTGTAATACTGTCTCTACTTTTCG
TTTTCCAGAGATGAAGAGCGTAAATTGAAACACGACCAGATTCGTGCAAA
ATATGGTAAGTCTTTTATTCTTTCTTTAAGTATATCTTGAAAACTGCCCA
AATCGCCAGATTTGCTAGATTCCAGATTTTTCGTTGATTTTTGTGCTAGA
ATGTTAAGtcgattaaatttcgcgtgCATTAATTTTCAATCCACTTAGTT
ATTGTGCACGAATAATGCTTGTTTTAAATATACTAATGACATCATCATTA
ACGCATACGTTAATTTCTTTTAATCCTCAGGTCTCTTTAAAGACGATTCa
aacaaatatcaaaagttCGATACTGATCCATAAAGCAGCCTCGTTTGCAT
GCGCTGACAGtatattataattatttttctcactATTTTTTATAATCACG
CATCACATGCACGTATTTTGGGGAGtttttttGTCGTAAATTATTCCGCT
TCTTTGTATACTGGGATgtctatacacgttttttttataagaacatccaa
aatttgcatgtaactttttgaattttaagcctaaaaatgttcttaacatg
ttcttattttagccattttttgagtctttttgtccattttcttcagaaat
tgggtgttttagagtccgcgaagccttaaaatgttcttaactttttctta
gcattttggcaaTCAAAGCCTTGtgttatagtttgttcttataaaaaata
acgtgTATTCGATATATCCTTCAATGTATCTAATGCTTTGAAGAAAATCA
TCAATTGATagtcatgacgtaatcttttagacggtcgtttttgtgttttt
ccatGCAAAAGATAGTATCATGTTACAATTAAGACGTCATTTTATATGAC
TAATACCTTTTTCCTTATGCTTAGAAAAACCTCAAACTGTCGCTCAATTA
TGATTTCTCTTGTCAATAGAATTCCATTTAATCAATGATATACATTATTG
TAATGTCTTCAACATCACaccatggacccaacagctgattggttgtggAG
Tgggacgtaaaatcagtcaatacatcacttgcaactaatcagctgttggg
tccgtgatgtaatgttagaagacattacaatggtgcatatcatatagcgc
ccatttttctttcaaaacctAATACATAAAATTACTTTAGGAGTACGATG
AAGTCTTTCTTGGAATATCCATGCctcttttcagctttttttggGCCTTA
CTGTATTAAATATTATTGAAGTCTTCatctaaaaacaattatatattttg
tttattGTTCAGGTTTATATAATGATTGATTGGTATTTTTTAATTGTTCA
CACGTTCGGTACGATCTATTTAGCACGCATCATTAGTTAGTAGTAGTAGT
ATATTATTATCTtgctcttatttttaaaaaaatattcgagaatcattttt
cattatatttttgtGCATCGGGAGTCTacgatgtttttttttgtcgtcgA
TTTTAGACTTGCTTTCAGGAAAAATCCATTCATGGGGTGGACGATTTATA
GACatatatatttcaatttgtCAACCCCTTGACACGAATCAAATCTACCC
TGGACATTTTTCAGAATTCTTTCGTTATCTTTCACACTCTATCAATGTTT
TTCTTGAAGAGTGCTTTTTCTGTCACctttgacttcaaaaatgaaaaaat
aaaccctagcttaaattctttgaaaaaagtcttttctttgtttcattGTG
TATTATACggaatattatatatttttgtaaaactttttcTAATGATGTAT
AATCTGtttttttGTTACTCAACGATGGTATTTTAGGGAATGATTTTctt
cgaaatatttttgattgttCATGATTTTCGTTAAATCGTATATCTTGTTT
AATTTAATCAGAGAGCCTTTCACCTACATCTAATCCACAATCGGAATATT
TTTGAGTACACCTACAATGCTGCTAGGATGATCAACATCAAACGACCAAA
GTAAACACTAGCCCGGGGGCCACtcatagctttttgatagacttgcTGAT
GAGTGGTGTGTTTAGTAAAGtgtcataaattttgatggggctgtcattgt
tttggtgtttttatgtaatttttgaaagcaaaagtaaatttttgattgtt
catgattt Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000114_pilon:799261..804868+ >MSTRG.13988.2.p1 ID=MSTRG.13988.2.p1|Name=MSTRG.13988.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3549bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:799261..804868+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTCCATCAAGACATCTTTGTTGTTGATTGTCGTATTCTGTTTGAC
ATGGTTCGTACAAGATACTATAGGAGCATCGTGTGAGTTCAAGAAATCGA
GTAATGGAACAGTTTCAGGATCTTGTGGTGAATGTGTCGGCTATGATATC
GAGTGCTTCTATTGCGATTCAACGAAGAAATGTGAAAAGCGTACGTCCGT
GATCGTTAATAAAGACCAATGCTCAGGCAAATGGTATACCTACAGTCAAT
GCACAATTCCTGGTGTTGTGTTGATTGTGATCGCACCACTGGCAGCAGTT
CTTCTCCTGGTCTTCCTCTGTTGTTGTGTGTATTGTATTTGTTGCCGCGA
TTGTTGTCGTGAACGAAGCCAAAGAAAATGGGCCAAAGAAGATTCGAAAC
GTGAAAACAGGAAGAACGAGAGAGATGCCAAACATGCTGCAAGAGATGAA
GAGCGTAAATTGAAACACGACCAGATTCGTGCAAAATATGGTTTATATAA
TGATTGAATGGTTTCCATCAAGACATCTTTGTTGTTGATTGTCGTATTCT
GTTTGACATGGTTCGTACAAGATACTATAGGAGCATCGTGTGAGTTCAAG
AAATCGAGTAATGGAACAGTTTCAGGATCTTGTGGTGAATGTGTCGGCTA
TGATATCGAGTGCTTCTATTGCGATTCAACGAAGAAATGTGAAAAGCGTA
CGTCCGTGATCGTTAATAAAGACCAATGCTCAGGCAAATGGTATACCTAC
AGTCAATGCACAATTCCTGGTGTTGTGTTGATTGTGATCGCACCACTGGC
AGCAGTTCTTCTCCTGGTCTTCCTCTGTTGTTGTGTGTATTGTATTTGTT
GCCGCGATTGTTGTCGTGAACGAAGCCAAAGAAAATGGGCCAAAGAAGAT
TCGAAACGTGAAAACAGGAAGAACGAGAGAGATGCCAAACATGCTGCAAG
AGATGAAGAGCGTAAATTGAAACACGACCAGATTCGTGCAAAATATGGTT
TATATAATGATTGAATGGTTTCCATCAAGACATCTTTGTTGTTGATTGTC
GTATTCTGTTTGACATGGTTCGTACAAGATACTATAGGAGCATCGTGTGA
GTTCAAGAAATCGAGTAATGGAACAGTTTCAGGATCTTGTGGTGAATGTG
TCGGCTATGATATCGAGTGCTTCTATTGCGATTCAACGAAGAAATGTGAA
AAGCGTACGTCCGTGATCGTTAATAAAGACCAATGCTCAGGCAAATGGTA
TACCTACAGTCAATGCACAATTCCTGGTGTTGTGTTGATTGTGATCGCAC
CACTGGCAGCAGTTCTTCTCCTGGTCTTCCTCTGTTGTTGTGTGTATTGT
ATTTGTTGCCGCGATTGTTGTCGTGAACGAAGCCAAAGAAAATGGGCCAA
AGAAGATTCGAAACGTGAAAACAGGAAGAACGAGAGAGATGCCAAACATG
CTGCAAGAGATGAAGAGCGTAAATTGAAACACGACCAGATTCGTGCAAAA
TATGGTTTATATAATGATTGAATGGTTTCCATCAAGACATCTTTGTTGTT
GATTGTCGTATTCTGTTTGACATGGTTCGTACAAGATACTATAGGAGCAT
CGTGTGAGTTCAAGAAATCGAGTAATGGAACAGTTTCAGGATCTTGTGGT
GAATGTGTCGGCTATGATATCGAGTGCTTCTATTGCGATTCAACGAAGAA
ATGTGAAAAGCGTACGTCCGTGATCGTTAATAAAGACCAATGCTCAGGCA
AATGGTATACCTACAGTCAATGCACAATTCCTGGTGTTGTGTTGATTGTG
ATCGCACCACTGGCAGCAGTTCTTCTCCTGGTCTTCCTCTGTTGTTGTGT
GTATTGTATTTGTTGCCGCGATTGTTGTCGTGAACGAAGCCAAAGAAAAT
GGGCCAAAGAAGATTCGAAACGTGAAAACAGGAAGAACGAGAGAGATGCC
AAACATGCTGCAAGAGATGAAGAGCGTAAATTGAAACACGACCAGATTCG
TGCAAAATATGGTTTATATAATGATTGAATGGTTTCCATCAAGACATCTT
TGTTGTTGATTGTCGTATTCTGTTTGACATGGTTCGTACAAGATACTATA
GGAGCATCGTGTGAGTTCAAGAAATCGAGTAATGGAACAGTTTCAGGATC
TTGTGGTGAATGTGTCGGCTATGATATCGAGTGCTTCTATTGCGATTCAA
CGAAGAAATGTGAAAAGCGTACGTCCGTGATCGTTAATAAAGACCAATGC
TCAGGCAAATGGTATACCTACAGTCAATGCACAATTCCTGGTGTTGTGTT
GATTGTGATCGCACCACTGGCAGCAGTTCTTCTCCTGGTCTTCCTCTGTT
GTTGTGTGTATTGTATTTGTTGCCGCGATTGTTGTCGTGAACGAAGCCAA
AGAAAATGGGCCAAAGAAGATTCGAAACGTGAAAACAGGAAGAACGAGAG
AGATGCCAAACATGCTGCAAGAGATGAAGAGCGTAAATTGAAACACGACC
AGATTCGTGCAAAATATGGTTTATATAATGATTGAATGGTTTCCATCAAG
ACATCTTTGTTGTTGATTGTCGTATTCTGTTTGACATGGTTCGTACAAGA
TACTATAGGAGCATCGTGTGAGTTCAAGAAATCGAGTAATGGAACAGTTT
CAGGATCTTGTGGTGAATGTGTCGGCTATGATATCGAGTGCTTCTATTGC
GATTCAACGAAGAAATGTGAAAAGCGTACGTCCGTGATCGTTAATAAAGA
CCAATGCTCAGGCAAATGGTATACCTACAGTCAATGCACAATTCCTGGTG
TTGTGTTGATTGTGATCGCACCACTGGCAGCAGTTCTTCTCCTGGTCTTC
CTCTGTTGTTGTGTGTATTGTATTTGTTGCCGCGATTGTTGTCGTGAACG
AAGCCAAAGAAAATGGGCCAAAGAAGATTCGAAACGTGAAAACAGGAAGA
ACGAGAGAGATGCCAAACATGCTGCAAGAGATGAAGAGCGTAAATTGAAA
CACGACCAGATTCGTGCAAAATATGGTTTATATAATGATTGAATGGTTTC
CATCAAGACATCTTTGTTGTTGATTGTCGTATTCTGTTTGACATGGTTCG
TACAAGATACTATAGGAGCATCGTGTGAGTTCAAGAAATCGAGTAATGGA
ACAGTTTCAGGATCTTGTGGTGAATGTGTCGGCTATGATATCGAGTGCTT
CTATTGCGATTCAACGAAGAAATGTGAAAAGCGTACGTCCGTGATCGTTA
ATAAAGACCAATGCTCAGGCAAATGGTATACCTACAGTCAATGCACAATT
CCTGGTGTTGTGTTGATTGTGATCGCACCACTGGCAGCAGTTCTTCTCCT
GGTCTTCCTCTGTTGTTGTGTGTATTGTATTTGTTGCCGCGATTGTTGTC
GTGAACGAAGCCAAAGAAAATGGGCCAAAGAAGATTCGAAACGTGAAAAC
AGGAAGAACGAGAGAGATGCCAAACATGCTGCAAGAGATGAAGAGCGTAA
ATTGAAACACGACCAGATTCGTGCAAAATATGGTTTATATAATGATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000114_pilon | genome | sc0000114_pilon:799261..804868 + |
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