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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000114_pilon:703913..720942+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13979.4.p1 ID=MSTRG.13979.4.p1|Name=MSTRG.13979.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17030bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:703913..720942+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gtACCATCAAGTACAACAGtatataaaaaatcttaaacAGAAAATATTAG
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CCTAATGTgtacataaaaaaaattgtatgcGCGTGTAGaaaatgctacca
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AGGTACAgtttatcattaaaaaaacttaaatcaTGAGAATATTGTTTATT
TGATGTTACTGATGAGTTCAAAATCTCTACTTCTGCAACAGTTACAGACG
GACAATAActctacattttttaaataggtGAAACAACAATCTCTCTCTCA
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AAATAACTCAATTATCACTTTTTCCCTAAAGGGAGTGGTAATACAAAACG
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GGTGTTGAACAAAGTGTCAGATTTAATATCAATTTGTCAACCGTTTCACC
AAACAAAACTTGACTCTAAAcatatatacaaaaaaattgtttgaaagttG
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AGGATGACACACTAtgaatgaatttcaaaaaaaatacatttgagTGAATT
TGGagagattttcgaataaaaaactAATCTTGAAGAAAAGGAATAAATCT
CCAGTGTCCGGCAAAGTTCTGAAAACAGTACTGGAGCTTTCAAAGCAACA
AGGCATCTTAGACTTTTAAAGAAGACCATTCTACTCGTGTTTGCTAGAGT
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TTAGAGAAACAAAAACTTAAAGGCTatgtttgtttctttttttagcCTGC
AGTATCGCCACCACCGGAGAAGAAAGGAATCAAGATGATCCGGACTTGTC
AATTGTTCTTGGTTCTCGTCCATAGAACATTCTTATTTGCAGCTGTTCTC
ATTGGAGGAACCTACGCCATCAGAGCTATCGAGAACCACTATCGAGAATC
GATTTCTCATATGGAGCTGAAAGATGCAGCTGAATATTGCTATACCATTC
TAACGACCATAGGTAAGtcttaatttaaaatttgaatgttaAAGAATGTT
AATCATGACAGTAGAGCCATCGCTTTAATCAAGTTGGAGAATAAAAGAAG
TTACTGAAACAACATAAGAGTTTTGTAAGGAAAACAGTATTCACTACaaa
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CGTTCAATTATTTCAGGTTACGGCCGTGAGAAAACCCTCCCTACATCAGA
CTGGGGCAAAGTGTTCACCATTGTCTACGCAATCATTGGTATACCAGTCG
CCATTTTCACTGTCGGAGCATACGGAGCATTCCTGAAGCATTGTGTGTTG
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GAAAATGAATCTCAAAGTGCTTATTATATTGATTCTCCTTTTCATTGcag
agttcttttgttttggagtCTACGTTTGCTGGTTGGAAGACAACAACCAA
TGGAattatttagattctgtttacAGTTGGTTTCTCACCATGACAACCAT
TGGATTTAAACAACACAACCCGTACCCAGACCACTTGGATCTGTTACACG
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CAGCATCTGCGCCATGTTGTTTTGTTGTTATAGCAACAATAAGAAAGATG
CATACCCAATGGATAAATACAATTCGAATCATAGTATGCGATATGCAGAA
TATCCTCATGAATAAACAGACCATTAAAGCACTTATGTTGAGAAAATATT
AACCAAAATATTTATGGATGGTTGGCTGGAGATTTCTGGAAGtgaataat
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ATATAACAAATTTAAACAAGGAAAACATGGAAGGTTATTCATATTTAATG
ACATAAAGGGATAAACCAGCCACACTAAAATTTAGTCAAATTCTTAGGAC
AAAAACACATTCATTTAAATCCAAAAAGCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000114_pilon:703913..720942+ >MSTRG.13979.4.p1 ID=MSTRG.13979.4.p1|Name=MSTRG.13979.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3576bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:703913..720942+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTATGAAAACTGGACCCTAGAGGATGAGAATGTGGTGACAAACGAACG
AAGGCCTCCATCATACCTCAAACATAGTcCTGCAGTATCGCCACCACCGG
AGAAGAAAGGAATCAAGATGATCCGGACTTGTCAATTGTTCTTGGTTCTC
GTCCATAGAACATTCTTATTTGCAGCTGTTCTCATTGGAGGAACCTACGC
CATCAGAGCTATCGAGAACCACTATCGAGAATCGATTTCTCATATGGAGC
TGAAAGATGCAGCTGAATATTGCTATACCATTCTAACGACCATAGGTTAC
GGCCGTGAGAAAACCCTCCCTACATCAGACTGGGGCAAAGTGTTCACCAT
TGTCTACGCAATCATTGGTATACCAGTCGCCATTTTCACTGTCGGAGCAT
ACGGAGCATTCCTGAAGCATTGTGTGTTGAAGTTAATCATTGGTTTAGAG
CACTGTTGTTGCTCATGCTGGCAAGGCAAGAAAATGAATCTCAAAGTGCT
TATTATATTGATTCTCCTTTTCATTGcagagttcttttgttttggagtCT
ACGTTTGCTGGTTGGAAGACAACAACCAATGGAattatttagattctgtt
tacAGTTGGTTTCTCACCATGACAACCATTGGATTTAAACAACACAACCC
GTACCCAGACCACTTGGATCTGTTACACGCCTTGGCCTACCTGGTTACCA
GTCTATTCAGCATCATAACTCTGGCCGCCATCTTTCAAACCGTTCAACAA
ATGATTGACGCTGTCCACAACCAAGATCGCAGCATCTGCGCCATGTTGTT
TTGTTGTTATAGCAACAATAAGAAAGATGCATACCCAATGGATAAATACA
ATTCGAATCATAGTATGCGATATGCAGAATATCCTCATGAATAAATGTAT
GAAAACTGGACCCTAGAGGATGAGAATGTGGTGACAAACGAACGAAGGCC
TCCATCATACCTCAAACATAGTcCTGCAGTATCGCCACCACCGGAGAAGA
AAGGAATCAAGATGATCCGGACTTGTCAATTGTTCTTGGTTCTCGTCCAT
AGAACATTCTTATTTGCAGCTGTTCTCATTGGAGGAACCTACGCCATCAG
AGCTATCGAGAACCACTATCGAGAATCGATTTCTCATATGGAGCTGAAAG
ATGCAGCTGAATATTGCTATACCATTCTAACGACCATAGGTTACGGCCGT
GAGAAAACCCTCCCTACATCAGACTGGGGCAAAGTGTTCACCATTGTCTA
CGCAATCATTGGTATACCAGTCGCCATTTTCACTGTCGGAGCATACGGAG
CATTCCTGAAGCATTGTGTGTTGAAGTTAATCATTGGTTTAGAGCACTGT
TGTTGCTCATGCTGGCAAGGCAAGAAAATGAATCTCAAAGTGCTTATTAT
ATTGATTCTCCTTTTCATTGcagagttcttttgttttggagtCTACGTTT
GCTGGTTGGAAGACAACAACCAATGGAattatttagattctgtttacAGT
TGGTTTCTCACCATGACAACCATTGGATTTAAACAACACAACCCGTACCC
AGACCACTTGGATCTGTTACACGCCTTGGCCTACCTGGTTACCAGTCTAT
TCAGCATCATAACTCTGGCCGCCATCTTTCAAACCGTTCAACAAATGATT
GACGCTGTCCACAACCAAGATCGCAGCATCTGCGCCATGTTGTTTTGTTG
TTATAGCAACAATAAGAAAGATGCATACCCAATGGATAAATACAATTCGA
ATCATAGTATGCGATATGCAGAATATCCTCATGAATAAATGTATGAAAAC
TGGACCCTAGAGGATGAGAATGTGGTGACAAACGAACGAAGGCCTCCATC
ATACCTCAAACATAGTcCTGCAGTATCGCCACCACCGGAGAAGAAAGGAA
TCAAGATGATCCGGACTTGTCAATTGTTCTTGGTTCTCGTCCATAGAACA
TTCTTATTTGCAGCTGTTCTCATTGGAGGAACCTACGCCATCAGAGCTAT
CGAGAACCACTATCGAGAATCGATTTCTCATATGGAGCTGAAAGATGCAG
CTGAATATTGCTATACCATTCTAACGACCATAGGTTACGGCCGTGAGAAA
ACCCTCCCTACATCAGACTGGGGCAAAGTGTTCACCATTGTCTACGCAAT
CATTGGTATACCAGTCGCCATTTTCACTGTCGGAGCATACGGAGCATTCC
TGAAGCATTGTGTGTTGAAGTTAATCATTGGTTTAGAGCACTGTTGTTGC
TCATGCTGGCAAGGCAAGAAAATGAATCTCAAAGTGCTTATTATATTGAT
TCTCCTTTTCATTGcagagttcttttgttttggagtCTACGTTTGCTGGT
TGGAAGACAACAACCAATGGAattatttagattctgtttacAGTTGGTTT
CTCACCATGACAACCATTGGATTTAAACAACACAACCCGTACCCAGACCA
CTTGGATCTGTTACACGCCTTGGCCTACCTGGTTACCAGTCTATTCAGCA
TCATAACTCTGGCCGCCATCTTTCAAACCGTTCAACAAATGATTGACGCT
GTCCACAACCAAGATCGCAGCATCTGCGCCATGTTGTTTTGTTGTTATAG
CAACAATAAGAAAGATGCATACCCAATGGATAAATACAATTCGAATCATA
GTATGCGATATGCAGAATATCCTCATGAATAAATGTATGAAAACTGGACC
CTAGAGGATGAGAATGTGGTGACAAACGAACGAAGGCCTCCATCATACCT
CAAACATAGTcCTGCAGTATCGCCACCACCGGAGAAGAAAGGAATCAAGA
TGATCCGGACTTGTCAATTGTTCTTGGTTCTCGTCCATAGAACATTCTTA
TTTGCAGCTGTTCTCATTGGAGGAACCTACGCCATCAGAGCTATCGAGAA
CCACTATCGAGAATCGATTTCTCATATGGAGCTGAAAGATGCAGCTGAAT
ATTGCTATACCATTCTAACGACCATAGGTTACGGCCGTGAGAAAACCCTC
CCTACATCAGACTGGGGCAAAGTGTTCACCATTGTCTACGCAATCATTGG
TATACCAGTCGCCATTTTCACTGTCGGAGCATACGGAGCATTCCTGAAGC
ATTGTGTGTTGAAGTTAATCATTGGTTTAGAGCACTGTTGTTGCTCATGC
TGGCAAGGCAAGAAAATGAATCTCAAAGTGCTTATTATATTGATTCTCCT
TTTCATTGcagagttcttttgttttggagtCTACGTTTGCTGGTTGGAAG
ACAACAACCAATGGAattatttagattctgtttacAGTTGGTTTCTCACC
ATGACAACCATTGGATTTAAACAACACAACCCGTACCCAGACCACTTGGA
TCTGTTACACGCCTTGGCCTACCTGGTTACCAGTCTATTCAGCATCATAA
CTCTGGCCGCCATCTTTCAAACCGTTCAACAAATGATTGACGCTGTCCAC
AACCAAGATCGCAGCATCTGCGCCATGTTGTTTTGTTGTTATAGCAACAA
TAAGAAAGATGCATACCCAATGGATAAATACAATTCGAATCATAGTATGC
GATATGCAGAATATCCTCATGAATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000114_pilon | genome | sc0000114_pilon:703913..720942 + |
|
