MSTRG.13978.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13978.2.p2
Unique NameMSTRG.13978.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000114_pilon:677863..696759-

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
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>MSTRG.13978.2.p2 ID=MSTRG.13978.2.p2|Name=MSTRG.13978.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18897bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:677863..696759- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GGCCATCGAAGCCTTACGTTCTTACTTAGTTTAATTGTTAATATAATTTA ATTTGTGTAAAAGATCGCCTCTACAGATTCGAACGTTTGCTTCCATCATA ATGGTGAGAATTACGTAAAACATGAAAAATCTCTTCTACATAACATGTCA AAGTGTGAATAATATCTCAAATATCAAGTCTTTTTGCCCAGTATCTTCCT TTACCAGACCAACACGAGTTTTCTCTCCTTCGACGATGTACCCTGTAAAA GCATATTTTTGGAATGTCGGCCTCTCTAAGGTTCCACGTTAATTGTAGAT CCTCACAGGGAATTGATAGTAGGGGATAGAAAGGCAAAAGTAAAATAAGA AGAAAATCAAAATGGGAAGTTTTTGAAAACACAGGTATCAATTTAGTACC ACCAACGAAATTGCTGCCTTCGTTGAAATTTGAATCCTAATCTAACTCTT AACCCCCCCCCCCGAATTATTAGTTGTTATTGTTTCAGATTTTGGTATTT AAATTTTTTTGTATATTTTGTCTTTACATTTGTCTTTATATTTTGAAAAA TTAAATGTTTTTTAGATAGGATAGGTAGTATTATTCTTCATATAAGCCAG AACCCGTGGTACTATTTATTTATTATAAGGAGAAAAAAATTTTGGATGGC ATTTTTAATAAAACTTTGTTTTAGTAAACTTTTTTATTCAGCTGACTCAA GCCTTAATCTTGATTTTTTTGTTTGTTTTATTTGGTGAATATATTTTTCC TTTGTATAATATTAGATTATTAGATATTTGGTAACGATTCTTTTGTATTT TTTATTTTGTATTGTATATGTTATATTTGTTTTTATCTATCTTTTGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000114_pilon:677863..696759-

>MSTRG.13978.2.p2 ID=MSTRG.13978.2.p2|Name=MSTRG.13978.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2115bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:677863..696759- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGAATAGCTTGAACGCACAAACATTCCAATCAAAAAGTGGGAGATGGCGG
ATGAAGAAGCGGGAAAGGGTTGGACTTCGCAAGCAAGATGCATCCATCAA
TCTTGGAGAAGCTCACTTGTTTTGTGGATGTAGATACAAAGAAAAAGATT
TCTTGTATAGGTTGAGATGTACTTTCGACGTCCGACAAATTTCCGCTTTC
CGGAAGACCCATCTCGTCCGCTGATCATGATCGGTCCGGGAACTGGCGTG
GCCCCTTTCATTGGATTTCTTGATCATCGTTTCTTGTACATTTCAGGTAT
GGGCTTTGCACGAATTACTTGGACAAGCTTACACAATCATTTCAGCAGCA
GTTGCATCAAGAATCACAAAAACAAAATGTCGAGAAAATGGTTCATGATC
TCTCCATCAAGGACAAACCAAAGTGAATAGCTTGAACGCACAAACATTCC
AATCAAAAAGTGGGAGATGGCGGATGAAGAAGCGGGAAAGGGTTGGACTT
CGCAAGCAAGATGCATCCATCAATCTTGGAGAAGCTCACTTGTTTTGTGG
ATGTAGATACAAAGAAAAAGATTTCTTGTATAGGTTGAGATGTACTTTCG
ACGTCCGACAAATTTCCGCTTTCCGGAAGACCCATCTCGTCCGCTGATCA
TGATCGGTCCGGGAACTGGCGTGGCCCCTTTCATTGGATTTCTTGATCAT
CGTTTCTTGTACATTTCAGGTATGGGCTTTGCACGAATTACTTGGACAAG
CTTACACAATCATTTCAGCAGCAGTTGCATCAAGAATCACAAAAACAAAA
TGTCGAGAAAATGGTTCATGATCTCTCCATCAAGGACAAACCAAAGTGAA
TAGCTTGAACGCACAAACATTCCAATCAAAAAGTGGGAGATGGCGGATGA
AGAAGCGGGAAAGGGTTGGACTTCGCAAGCAAGATGCATCCATCAATCTT
GGAGAAGCTCACTTGTTTTGTGGATGTAGATACAAAGAAAAAGATTTCTT
GTATAGGTTGAGATGTACTTTCGACGTCCGACAAATTTCCGCTTTCCGGA
AGACCCATCTCGTCCGCTGATCATGATCGGTCCGGGAACTGGCGTGGCCC
CTTTCATTGGATTTCTTGATCATCGTTTCTTGTACATTTCAGGTATGGGC
TTTGCACGAATTACTTGGACAAGCTTACACAATCATTTCAGCAGCAGTTG
CATCAAGAATCACAAAAACAAAATGTCGAGAAAATGGTTCATGATCTCTC
CATCAAGGACAAACCAAAGTGAATAGCTTGAACGCACAAACATTCCAATC
AAAAAGTGGGAGATGGCGGATGAAGAAGCGGGAAAGGGTTGGACTTCGCA
AGCAAGATGCATCCATCAATCTTGGAGAAGCTCACTTGTTTTGTGGATGT
AGATACAAAGAAAAAGATTTCTTGTATAGGTTGAGATGTACTTTCGACGT
CCGACAAATTTCCGCTTTCCGGAAGACCCATCTCGTCCGCTGATCATGAT
CGGTCCGGGAACTGGCGTGGCCCCTTTCATTGGATTTCTTGATCATCGTT
TCTTGTACATTTCAGGTATGGGCTTTGCACGAATTACTTGGACAAGCTTA
CACAATCATTTCAGCAGCAGTTGCATCAAGAATCACAAAAACAAAATGTC
GAGAAAATGGTTCATGATCTCTCCATCAAGGACAAACCAAAGTGAATAGC
TTGAACGCACAAACATTCCAATCAAAAAGTGGGAGATGGCGGATGAAGAA
GCGGGAAAGGGTTGGACTTCGCAAGCAAGATGCATCCATCAATCTTGGAG
AAGCTCACTTGTTTTGTGGATGTAGATACAAAGAAAAAGATTTCTTGTAT
AGGTTGAGATGTACTTTCGACGTCCGACAAATTTCCGCTTTCCGGAAGAC
CCATCTCGTCCGCTGATCATGATCGGTCCGGGAACTGGCGTGGCCCCTTT
CATTGGATTTCTTGATCATCGTTTCTTGTACATTTCAGGTATGGGCTTTG
CACGAATTACTTGGACAAGCTTACACAATCATTTCAGCAGCAGTTGCATC
AAGAATCACAAAAACAAAATGTCGAGAAAATGGTTCATGATCTCTCCATC
AAGGACAAACCAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13978MSTRG.13978Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13978.2.p2MSTRG.13978.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13978.2.p2.exon8MSTRG.13978.2.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13978.2.p2.exon7MSTRG.13978.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13978.2.p2.exon6MSTRG.13978.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13978.2.p2.exon5MSTRG.13978.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13978.2.p2.exon4MSTRG.13978.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13978.2.p2.exon3MSTRG.13978.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13978.2.p2.exon2MSTRG.13978.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13978.2.p2.exon1MSTRG.13978.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000114_pilongenomesc0000114_pilon:677863..696759 -