MSTRG.13976.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13976.1.p1
Unique NameMSTRG.13976.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000114_pilon:654235..675989+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13976.1.p1 ID=MSTRG.13976.1.p1|Name=MSTRG.13976.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21755bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:654235..675989+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CGAGAGATTAGATAACAACACAGACAGTTGCACACCAATGCCAAGACCTT
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CAAACACTTTGACAGCTCCGGTTTACTACAACTGCTCGTGTGGTGATGGT
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TGTCTCCTCGTCAATGATATTGCCAAGCACTTCAGTGATCAGTCAATTAG
CCACTCCTACGACCAGTTTTGTTGAGCAGCCTGGCCCCCAAACAACTGTC
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AAGTTGTTCAGCCACCAGTGACCCAGACAGAGGTCGTGCAACCTTCAGTT
AGCCAGACAGAAGTCGTACAACCGACAGAAACAAAGACAACACCGATAGT
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AGTCGTGCAACCGACAGACACACAGACGACATTAGGAGCTACAACAAACG
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CCAGTGACCCAGACAGAAGTCGTGCAACCGACAGAAACAAAGACAACACC
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TCGTGCAACCGACAGACACACAGACGACATTAGGAGCTACAACAAACGTT
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GACACCAACAAGCTCAGCTGTCGTCGTAGGTTGGTCACAATGGAGTGAAT
ATGGATCTTGTAGTGTGACATGTGGTGAAGGTCAAGAAGTGAGCACAAGA
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GCCGCTTGCGTGTGTAAAGATGGCTTCTATTTGGATTTTAAAGACCGTTG
TAAAACATCaccaatcattttcaaattacgTATAAGATTTACAATGCCAT
TCCTTGCGTACTTGACCGATCTACTGAACGACTTAACCGTGAACTTTTTA
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TATTGTCGTCATTGTCAGATTTGTTCCTGGTAGCACAATCGTCGATTTCA
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TAACCCAACACCTCCAGATATCAACACTGCTATCATGAACATTAACGCTA
CTGATGTTTGCGACATTGGGACATCAGATTGTGATCCTAACCGATCAATG
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TAATGGATATTTAAGCAACTCCACAACACAGTGTTTGGATTACTGTGAAA
AGGGCGTCGATGATTGTGATAAAACATCTACTAACTGTACGGCAACTCCA
GGCATATTACCACATTATAAATGTGAATGTAAGCTTGGTTATAATAGGAA
AGACAATACTACGTGTGTGTTGCCACCGACTGGAGAACCAACTACTGGCA
CGACTGATGatGACGATATCATAATCATCGTAGTTGTCGTGTGTTCACTT
ACCTTGTTCTTCCTACTCATCCTGGCTATCTTCTTACGATATCAACGCGA
TCGCGACGATGAGGTAGGCCAAGACATCGGTGGTGGCGCCGCATCATCGT
ACAGAATCAAGAATCCTAACGAATCGCCGAACCCAGGGATGTATAGAAAA
TCAGTCAAGTATGACGATATCGATATAGGACATGAAGGACCATCTGCTGG
CGGATCGCGACAGGAACTTGGCGACATACCTGATTATTAAATGAAATTGG
CCCTATCTATTTGTTTTCTTGTGGCCaccataatttcaaaatGTCACGGC
ATCGATTTATTTTGTACACCAGACTCAATGACAATCACTTTGGAAATGAA
TATCGATCCAAAAGTATATAGCACCTCAATCGTCAAATTCGAAAATACTA
ATTGTACGGCAACAACAAATGGAACACATTTCTTTATTACGTCACAATTC
AACGAATGTAACACACAAATCGGGGAAACAGTAGATGATATCGTGTTCTC
CAATCGGGTTATTGTGGATCCGAATAATTTAAAACCGGACGCGATTATTC
AGCGGTTGGAACATACTGAACATATTTATCCAGTCAATTGCTTGTTGAGG
AAGGAAAACGTCGTAGTAACAAATACAGGATATAACCTTACAGGTGATGG
ATGGGAAGAATGGGGAGCGTGGTCAGAATGCACCAAAACTTGTGGAGGAG
GAACAACAACTAGGAAGAGAGATTGCCGTGTATCGCGTAGAGATGATCTA
AATTGTCCAGGATTGGAGGTCGAAGTTGCACATTGTAATAATGTCACTTG
TCCGTTGACATGCGACGATATagaatgtgattttttcaatcaTGAAGAAT
GCGAACCACATTATATCTTTCAAAATGCAACGTGTGAATGCATGAAAGGC
TGGTATGAACTGGATGACGGTACATGTGACACAGAAGAGAAAATAGTTGG
AGTACAAATTACCTTAGGATCTGATTTTCAAGAGGAATTTGTGTCATTTA
AATCGAACATCACATCAGACTTTAAATCGAGAATCGAAACACAATTTACC
CTACAACTGGGGCTTGTACCACCAGAACGTTTTATGGTTACCGAATTTTC
CGCGGGTAGTGTGATCGTGGACGGCCTGGTCATTCTTCCTCGAAACACaa
cagaaaacaaaacaacaattcaagaaaaactgGTGACTGAGTTACAAACG
AATACGACCGGTTTATTGGAAGAATTTAATGTCACTAAAATTAATAAAGT
CAATGaaacCTACATTTGCGAGCTTGAATCAGACACATGCAACCGAACGC
GATCAAACTGCACTGATACACCAGACCTCTTAACTCATTATCAATGTGAT
TGTTTTGAAGGCTACATCAACAAAACCGTGTATATCTGTCAAGATTATTG
TGAATATGGTATCGACACGTGTAACAATATATCAACTGTGTGTAGAGGAA
CACCAGGGGTCGGTCGCCATTATGAATGTGATTGTGCTTTTGGTTTCGAG
CGGTTAGATAATAGTACTGATACATGTACACCAATGCCTCGACCATGTGA
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GTAAACATGGATTTGAGAGACTCGATAACAACACGGACTCATGTACACCG
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TCATCCAACTGTACAAACAGCTTCGAAGCTCCTTTCTACTACAATTGTAC
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AAGATACTTGCAATAAAACTTCATCCAACTGTACAAACAGCTTCGAAGCT
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CTCCTTGGATCAATGTCATGAGTATTGTCGTATTGAGGCTGATACCTGCA
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GCTACAACTGAAGTTGTTCAGCCACCAGTGACCCAGACAGAAGTCGTGCA
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ATCGTAGTTGTCGTGTGTTCACTTACCTTGTTCTTCCTACTCATCCTGGC
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TCGGTGGTGGCGCCGCATCATCGTACAGAATCAAGAATCCTAACGAATCG
CCGAACCCAGGGATGTATAGAAAATCAGTCAAGTATGACGATATCGATAT
AGGACATGAAGGACCATCTGCTGGCGGATCGCGACAGGAACTTGGCGACA
TACCTGATTATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13976MSTRG.13976Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13976.1.p1.exon1MSTRG.13976.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13976.1.p1.exon2MSTRG.13976.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13976.1.p1.exon3MSTRG.13976.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13976.1.p1.exon4MSTRG.13976.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13976.1.p1.exon5MSTRG.13976.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13976.1.p1.exon6MSTRG.13976.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13976.1.p1.exon7MSTRG.13976.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13976.1.p1.exon8MSTRG.13976.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13976.1.p1.exon9MSTRG.13976.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13976.1.p1.exon10MSTRG.13976.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13976.1.p1.exon11MSTRG.13976.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13976.1.p1MSTRG.13976.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000114_pilongenomesc0000114_pilon:654235..675989 +