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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000114_pilon:495456..501961- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13962.1.p1 ID=MSTRG.13962.1.p1|Name=MSTRG.13962.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6506bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:495456..501961- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AGATAAAAATACATAATGAGCTACAAAAAAATCAAAGACAACAGAGTAAC
GATGCTTAATTTTTTTCAATGTCACGAAAAATATGGAAAATTACATCCAG
TGGCAGCTGAATATTGCTACAAGAAAGTCTTTAACCTGGAAGATGCACCT
AATGAGATTCAAAAATCACAATTCATGGCCGAATATATAAACTTGAGTTC
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GTAATAGTTGTGGAAAAAAACTTGTGATTTGTGATCCGAAAGAAATTGTC
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ACAGCTTTCAGACGTGAATTCCTCGAAACATTTGAATGGGAGCTATTACT
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CTAGTCCCCAGGCCCCAAAAATCAAAAATTTTGAAAAATGAAAAAAAGAC
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GTGGAAAAAGTCATCGTTGAATTCCAGATAGAAATATCAGAAACAATAAC
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TCTTGAAAAAATGGGCAAGTAAGTAATTTCTCATCTGTCTCAACTTCTCC
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TGACACTACTGGTGTTCAGTCACGTTCTTTGCATCCCGGTGATATTTCAA
AATAGTGGATTTTATGTGCCTTAAAACTTTTTTTAAGCATAATATGCTGT
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ATCAAAAGAGAACCTTAAATCTAACCAATGGATTTTACGAAACAAAATGA
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TTTAGATCATTCGTGCGAGTTACCAGGATGTAAGGATGTTCTTGTTCTTG
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AGAGTTCTATTCAAAACAATTGGAGGACATGTTTTAACAGGTTTGTAGTA
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CCCCCCCCCCTACTGTTGGTTTTTAATTTCTCTAAACCTTTATGTTTTCA
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TCAGAGTTATGTTATGGGTTGACTACAACTCTAGAACTAAGAATTCCCAA
AAATGTTTTAATTCTGAAATATTAGTCAAAAATTTAAATCAAAATTGGCT
ATCAACACACTTACAAGACTTCTATTGATATTGATATTAACAAAATGTAG
GTGGTATGTGTGGTATTTGAAGCGTTAATTTGCCTTATAAGGAAACACCT
CTAAAAATATAATACTTTCAATTTTTCTCATTCAATCAGGTTGTATGAAT
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ACCGCAACAACTGATGAAGACGGACTGAACGATAATGACTCTGATCCTGC
TCAGATTACAACGAAAAAGGAGAAAAATGGTATTTATCAAGGAGTGATCA
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ATACAGTCAGCAAATTATAAGAATGATAAATAAAAAGGCACAATTTAACT
TGTCAAGTAACTTGTCAAATGAGTTTTATCATCAACGGTGCTTTTATTCG
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ATAAAAAAAATATGTGTGTGATAATTGGCACAGAGGTCCCTCCTCCATCA
GAATAAAGTGGAGACGATTGGAAAAGTTTTGAGCCATTTATTAATGACGT
CACTTTTCAGTACAAACTCTCTAAACATTATCCTCAAAAAGTTCTTAAAA
TGAAAACTTTTACTGCTTCATTTTGAATATTATAGAGAACAGATGAATAC
AATGGGGCTTTTGAATATAGGGTTTTGATGTCTATATTTCGAGATGTTCG
AAAACGGACTGTTTTTGTTAAATCAGCACATTTTGCAGCATATTAAAAGT
AACAGTCAAATTTCTGTTTCTGGGGTTTCTAGTGGACAAGAAAATCACAT
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GGTTGCCCACTGTGGGGGTTTGGTACAGGCTAATCTTAAGTTTATCATGG
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TGCCAAGAATAAGAAAACAGCAGGTACAAAGTGTTTTTTTTTATATATTA
TCTCCTATAATAGTAGATCCTGATTGTTCAAGGCAATCGATATTAGGCTT
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ATTTTTAAAACATTTGTAGAGAAATGTATCATCCTTATATCCCTATAATA
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GGCGAAACCATGTGGTATCGTTGTCAACATAAAGGAGCTGTTCAATTGTG
AATCCATATCTCAAGTTTATGGCCATTTGCACGACCTCTTAAGCCAAGAC
GAATATCAATCAATCAGTAAGTAATTTGACGATCAGTTTAGTATCTGATT
CTTAACAAGAACTTAAATTATAAAAAAACAACCTTAGAGAGATTTGATGA
ACGTTTTTTAGACTTAACAATAATTTTAAATCTGAAATTAAAAATAATTA
ATAAAGATGTTTTAAAAGCATACAACGCTTTCATTTTTTAACCATAGCGT
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TTAACTCATTTCTGTTTTTAGATTGTATCGTATACGACGATGCTTGTCAT
CTTTTGAAGTATTCAAAAAATCCTGTCCGGAAGGATGACACTAACACCAG
CAAGCGTATTGCTACATTGGAAATGAAAATTGATCGATTCCACTATCGTA
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TACAACGGAGCCATTCTCTGAGGCAAAATATTTTGTTACCTATTCAAAGC
TACCATATTTTCATGGTAAGGCCCAGGATTATTCGGTTTGTTTAGATTAT
TTTCGACTATCTTCGTAACGTATATAATACAGATAAAACATAAAAATCAT
CGAGGGATAAAACTTTCCCTTTAAATTTTTTAGGTCAACACAGAAACATG
CGAGCAGCTCTTTTCTTGGTTTTCAAAATATGCACCGATGACCAAACATA
TGAATAGACAAAGATTCATATTTTTGACGCTATACTTATTGCATTTTCAC
AACAAAAAGAAACTTTCGATGAAGTATTAGAACTATCCTTATTATTAAAA
GGAGGATGTATCAATGTATCAATGAGCGAACGATTTTGGTACTTTCGTGG
TGCCTAGCATCATTTTTTTGCATTTTGTATGGAATTAACATGAAAATTGA
TGTATTATGAAACTTGCAAATCAACCTTAAAAAAAACTTTCTTTGTTTGT
TTAACATTTACTTTGACGATACCTTCGAAAGGTTGATTGTTTTTTAGATT
TTTCTATAGGTCTTATTAAAATACACGTTTTTTTTATAAGGAACCTTAAT
ATAGCTCCGAGCCTGGAGTTCCTTATTTTGCCAGAGAGTTTCAGCCTCAA
AGTTCCTTATCGAGTTCCTTAGTTACTTAGCTGTTAAGTTTGGATTCGCT
AAGTGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000114_pilon:495456..501961- >MSTRG.13962.1.p1 ID=MSTRG.13962.1.p1|Name=MSTRG.13962.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=17496bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:495456..501961- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTCAACACAGAAACATGCGAGCAGCTCTTTTCTTGGTTTTCAAAATATGC ACCGATGACCAAACATATGAATAGACAAAGATTCATATTTTTGACGCTAT ACTTATTGCATTTTCACAACAAAAAGAAACTTTCGATGAAGTATTAGATT GTATCGTATACGACGATGCTTGTCATCTTTTGAAGTATTCAAAAAATCCT GTCCGGAAGGATGACACTAACACCAGCAAGCGTATTGCTACATTGGAAAT GAAAATTGATCGATTCCACTATCGTAATCATGTGGATCCATGGTGTCGCA GAGTTTGTAATCCTAAAACCTCAGATCACTTAGCCGGAGTGTTTTGGTAA TGGCGAAACCATGTGGTATCGTTGTCAACATAAAGGAGCTGTTCAATTGT GAATCCATATCTCAAGTTTATGGCCATTTGCACGACCTCTTAAGCCAAGA CGAATATCAATCAATCAGGAAGAAACTCCAGATCCTTCAAGTTTAAAATG CGGAACGGATAAATCGAAACATATTGCCAAGAATAAGAAAACAGCAGGTT TTATGGCATACTGGCCAAAAAACCTGGGTACGGGATGAGAAATTACCTCA ACACCTAAGAAATGCCAATAACAAAATTGTTGTACAAGATGTGACGTCAC TTGGTCAACCAAGGCAAATTTTGGGATTCACAAGAAATGACAACGGAGAT AGTGTTGACCTACCCGTCCCAGAAAAAAAGTTGTATGAATACACCAAAAC TTGGCTTGAGAGTGTGTCAAGACCACGAAGACACAACAGCAAGATTTAGT GATCATTACCAGAAACAAAAACAAAACAATGCTGCTATTGCCGATGATAA AGATGAAGTAGATGAAGAATCTTTAAACGAAGACAACGAGACCGCAACAA CTGATGAAGACGGACTGAACGATAATGACTCTGATCCTGCTCAGATTACA ACGAAAAAGGAGAAAAATGGTATTTATCAAGGAGTGATCAGAATTTGCAA CACGAAGGAAACCAGAACATCAACACTTTACGAAATCATTCGTGCGAGTT ACCAGGATGTAAGGATGTTCTTGTTCTTGACGGAAACATGAAGACATGCA GGACTGTCTGTTCAGTCAATAAAGTTCAAAGAGTTCTATTCAAAACAATT GGAGGACATGTTTTAACAGGGTTACCGAAAATATCAACAAGGATAGAAGT TATTTGGATCGAAGACGATTTGAAGATGGCTTCCTCCTATATTTAGTGGA AAAAGTCATCGTTGAATTCCAGATAGAAATATCAGAAACAATAACGAATC GCAATGCTCTTTTGGATTATTTGAATGAAAGATTCTATGACGGATTCTTG AAAAAATGGGCAAATGAGCTACAAAAAAATCAAAGACAACAGAGTAACGA TGCTTAATTTTTTTCAATGTCACGAAAAATATGGAAAATTACATCCAGTG GCAGCTGAATATTGCTACAAGAAAGTCTTTAACCTGGAAGATGCACCTAA TGAGATTCAAAAATCACAATTCATGGCCGAATATATAAACTTGAGTTCTG AGGTACAAAAGATACCTCTAGAAGACATGATTCTTCCAAATGAATTTTGT AATAGTTGTGGAAAAAAACTTGTGATTTGTGATCCGAAAGAAATTGTCAT ATATGGAAGAGATGGAACGGTGATTGGAAAACGTTATTCTGGTCGATGCC GAACTTGTGCCATCACAGACTTTTTGACATTTTATTCAAAGGCAGGTAAA AGACACCTGAATCACAACAACTCAGTGATTTTTATAAGTACAGAAGACAC AGCTTTCAGACGTGAATTCCTCGAAACATTTGAATGGGAGCTATTACTTG GTTGTATGTCGTTTAGACAAAAATGTGCAATATACAACTGTACACATGGA TACATGTTCAAGATCAGCACCACTATTCCAAATAAGAGAGCAAGGTCAAC ACAGAAACATGCGAGCAGCTCTTTTCTTGGTTTTCAAAATATGCACCGAT GACCAAACATATGAATAGACAAAGATTCATATTTTTGACGCTATACTTAT TGCATTTTCACAACAAAAAGAAACTTTCGATGAAGTATTAGATTGTATCG TATACGACGATGCTTGTCATCTTTTGAAGTATTCAAAAAATCCTGTCCGG AAGGATGACACTAACACCAGCAAGCGTATTGCTACATTGGAAATGAAAAT TGATCGATTCCACTATCGTAATCATGTGGATCCATGGTGTCGCAGAGTTT GTAATCCTAAAACCTCAGATCACTTAGCCGGAGTGTTTTGGTAATGGCGA AACCATGTGGTATCGTTGTCAACATAAAGGAGCTGTTCAATTGTGAATCC ATATCTCAAGTTTATGGCCATTTGCACGACCTCTTAAGCCAAGACGAATA TCAATCAATCAGGAAGAAACTCCAGATCCTTCAAGTTTAAAATGCGGAAC GGATAAATCGAAACATATTGCCAAGAATAAGAAAACAGCAGGTTTTATGG CATACTGGCCAAAAAACCTGGGTACGGGATGAGAAATTACCTCAACACCT AAGAAATGCCAATAACAAAATTGTTGTACAAGATGTGACGTCACTTGGTC AACCAAGGCAAATTTTGGGATTCACAAGAAATGACAACGGAGATAGTGTT GACCTACCCGTCCCAGAAAAAAAGTTGTATGAATACACCAAAACTTGGCT TGAGAGTGTGTCAAGACCACGAAGACACAACAGCAAGATTTAGTGATCAT TACCAGAAACAAAAACAAAACAATGCTGCTATTGCCGATGATAAAGATGA AGTAGATGAAGAATCTTTAAACGAAGACAACGAGACCGCAACAACTGATG AAGACGGACTGAACGATAATGACTCTGATCCTGCTCAGATTACAACGAAA AAGGAGAAAAATGGTATTTATCAAGGAGTGATCAGAATTTGCAACACGAA GGAAACCAGAACATCAACACTTTACGAAATCATTCGTGCGAGTTACCAGG ATGTAAGGATGTTCTTGTTCTTGACGGAAACATGAAGACATGCAGGACTG TCTGTTCAGTCAATAAAGTTCAAAGAGTTCTATTCAAAACAATTGGAGGA CATGTTTTAACAGGGTTACCGAAAATATCAACAAGGATAGAAGTTATTTG GATCGAAGACGATTTGAAGATGGCTTCCTCCTATATTTAGTGGAAAAAGT CATCGTTGAATTCCAGATAGAAATATCAGAAACAATAACGAATCGCAATG CTCTTTTGGATTATTTGAATGAAAGATTCTATGACGGATTCTTGAAAAAA TGGGCAAATGAGCTACAAAAAAATCAAAGACAACAGAGTAACGATGCTTA ATTTTTTTCAATGTCACGAAAAATATGGAAAATTACATCCAGTGGCAGCT GAATATTGCTACAAGAAAGTCTTTAACCTGGAAGATGCACCTAATGAGAT TCAAAAATCACAATTCATGGCCGAATATATAAACTTGAGTTCTGAGGTAC AAAAGATACCTCTAGAAGACATGATTCTTCCAAATGAATTTTGTAATAGT TGTGGAAAAAAACTTGTGATTTGTGATCCGAAAGAAATTGTCATATATGG AAGAGATGGAACGGTGATTGGAAAACGTTATTCTGGTCGATGCCGAACTT GTGCCATCACAGACTTTTTGACATTTTATTCAAAGGCAGGTAAAAGACAC CTGAATCACAACAACTCAGTGATTTTTATAAGTACAGAAGACACAGCTTT CAGACGTGAATTCCTCGAAACATTTGAATGGGAGCTATTACTTGGTTGTA TGTCGTTTAGACAAAAATGTGCAATATACAACTGTACACATGGATACATG TTCAAGATCAGCACCACTATTCCAAATAAGAGAGCAAGGTCAACACAGAA ACATGCGAGCAGCTCTTTTCTTGGTTTTCAAAATATGCACCGATGACCAA ACATATGAATAGACAAAGATTCATATTTTTGACGCTATACTTATTGCATT TTCACAACAAAAAGAAACTTTCGATGAAGTATTAGATTGTATCGTATACG ACGATGCTTGTCATCTTTTGAAGTATTCAAAAAATCCTGTCCGGAAGGAT GACACTAACACCAGCAAGCGTATTGCTACATTGGAAATGAAAATTGATCG ATTCCACTATCGTAATCATGTGGATCCATGGTGTCGCAGAGTTTGTAATC CTAAAACCTCAGATCACTTAGCCGGAGTGTTTTGGTAATGGCGAAACCAT GTGGTATCGTTGTCAACATAAAGGAGCTGTTCAATTGTGAATCCATATCT CAAGTTTATGGCCATTTGCACGACCTCTTAAGCCAAGACGAATATCAATC AATCAGGAAGAAACTCCAGATCCTTCAAGTTTAAAATGCGGAACGGATAA ATCGAAACATATTGCCAAGAATAAGAAAACAGCAGGTTTTATGGCATACT GGCCAAAAAACCTGGGTACGGGATGAGAAATTACCTCAACACCTAAGAAA TGCCAATAACAAAATTGTTGTACAAGATGTGACGTCACTTGGTCAACCAA GGCAAATTTTGGGATTCACAAGAAATGACAACGGAGATAGTGTTGACCTA CCCGTCCCAGAAAAAAAGTTGTATGAATACACCAAAACTTGGCTTGAGAG TGTGTCAAGACCACGAAGACACAACAGCAAGATTTAGTGATCATTACCAG AAACAAAAACAAAACAATGCTGCTATTGCCGATGATAAAGATGAAGTAGA TGAAGAATCTTTAAACGAAGACAACGAGACCGCAACAACTGATGAAGACG GACTGAACGATAATGACTCTGATCCTGCTCAGATTACAACGAAAAAGGAG AAAAATGGTATTTATCAAGGAGTGATCAGAATTTGCAACACGAAGGAAAC CAGAACATCAACACTTTACGAAATCATTCGTGCGAGTTACCAGGATGTAA GGATGTTCTTGTTCTTGACGGAAACATGAAGACATGCAGGACTGTCTGTT CAGTCAATAAAGTTCAAAGAGTTCTATTCAAAACAATTGGAGGACATGTT TTAACAGGGTTACCGAAAATATCAACAAGGATAGAAGTTATTTGGATCGA AGACGATTTGAAGATGGCTTCCTCCTATATTTAGTGGAAAAAGTCATCGT TGAATTCCAGATAGAAATATCAGAAACAATAACGAATCGCAATGCTCTTT TGGATTATTTGAATGAAAGATTCTATGACGGATTCTTGAAAAAATGGGCA AATGAGCTACAAAAAAATCAAAGACAACAGAGTAACGATGCTTAATTTTT TTCAATGTCACGAAAAATATGGAAAATTACATCCAGTGGCAGCTGAATAT TGCTACAAGAAAGTCTTTAACCTGGAAGATGCACCTAATGAGATTCAAAA 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000114_pilon | genome | sc0000114_pilon:495456..501961 - |
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