MSTRG.1396.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1396.4.p1
Unique NameMSTRG.1396.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:2812109..2840354-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1396.4.p1 ID=MSTRG.1396.4.p1|Name=MSTRG.1396.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=28246bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2812109..2840354- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:2812109..2840354-

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CCACTCAAGGTTATGATAACTTGCTTGATATGCTAAACGATAATAATGTT
ATTGATTGCATTTATTCACTCATGACTTTATCGGTGAAAACGTACATGCA
AAACCAGGTGCTATTTTCTGAAGAGGAGGTTCGTCAATTGAACTGTCCCG
TACATCTTGAGCAAACGGGTCTTATCGTCAAATACAATCGTGGCGAAATG
AGAGAACCGATTTACCATTACAAGCACCTAGTTCTTCAGGAATTCCTGAC
AGGACTTTATTTGTGCGTTACGAAAGGGATGTCCCCGTATTTAACAAACC
GCGAACTTTCAAGTTGTGCACCAGTTATATTTGGCATTGGACGTCTTCTG
AAAGAGAATGACTTCTTCATTAAATTCTTCCAACGACTCTCTAATTTACA
TACAACAAAGTCGACCTTTTTCAGAAGAATATTCCAGCCCTATAGAACAT
GGGTATTCAATAAGTATCTCACCAGGAACACCCTTGAAATCCCTGATTGT
ATGGTCGGTCCAAACAGCTTGCTGATTGATTCAACAATCCCAGAATGCCA
AGAGTTTATGACATCACTCTATGAAGGACGATTGAAGATAGAATGTCCTT
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GATGTTGGGTACGAACCATCTCATTATCGACACTACGCTTAAAGAATGTG
AGCAATGGACCAAAGTTTTAATGAAGTCAAATTCAATAATAGTGGATTGC
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CCTATTTCTTGTTCAACGTTTAAATCTGACATTGAAATTACCAAATTTAA
TGAGTGATCATGATACTTTGATCATTTATGGATTAGATGTCGAATGTGCT
CGATTCATGGAAATTGTCTATAGAACGGAGGCTAAAGTTGAATGCCCATT
TTCTGAAGTGGAAATATATGAAATGGCTGATGAAAGTCAATTGGTTGATC
AGATATCGTTTTTTATTGAACATTTGCATTTAATATTAAAAGTTCCTAAT
TGTATGATTGGCTCTGACACTATAATCATCAACACTGATTTTCCAGAATG
CAAAGCTTATATAAAGGCTATTTTTGAGCTGAAATTACAACCTGTTTATC
AAGCAGCATCGTCAATTGAAATTCACTGTGATGTGAGCTATGAATATGTT
GGATTAGTAACATATATCATCAAATCCTCCAATCTAGAGCTCAAAATCCC
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CCTGCAGAAGTTTTGTAGACTTTATTGCCAAATCAAAATGTCCAGTTGAA
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CGATCCCAATGCTTGGTAACAAGTCACTAATTGTAGACTCCAATGTGGGC
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AAATTATATCCGTTATTGGGACTACTATTTATCAGAAGTGGCCACTTTTC
TTGAAAGTATGGACCTCAAACTCAAACTCAAAATCCCGAGTTGTATGAAA
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TTCTAACGTAAAGCTAAGAGAAAGGCTTACAGGCCCAAAAACACAATTTG
AAAAAGTTGAGATAAAGTCTGATTTACAGCCTGATGATTTAGATACCGTT
ATTTTCTTGCTTGAACAAAACAGTGTAAAAGTTATTAAACTACCTCATTG
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GAGTCGAGTTAAAGCTGAAAATACCGTCTCAAATGCTCGGTCCTCGTTCA
TTCATTATCGATATTGACAAACGGCAATGCAGACGGTTTTTATGGTTCTT
CCATCAGTCAAAAACAAAACCGATGTGCCGATGTGATTTACCTTTCAACG
GAGTTGAGATTCAAAGCGAGCCATTGGATTCAATATCGTCGTTTCTTCCT
GAAAGGCGGAAAGAACTCATCGATCAAATCAAATTATTTATAACGCGTTT
CGCTTTAAAGTTGCGGATCCCTGACTGTATGTTAGGAACCAAAGGTTTGG
TTATTGACAGGAGCAACCGAGAATGTACGAACTTTATTAGACATGTCAAT
TCGTTACAATTAAAAGTGAACTGTCCGTTCTCTACAGTTGAGCAAATTTA
TGGTAAGAATGATGACCTCAACATGCAACAAGTACAATCATTTACTGATC
GTTCAAATTTGGAACTTGATTTATAAAACCTGGTACTTTCTGTAACTCTG
AAGCTCTGGAAATTATTTCCAACAATATTGGCCAACAGAAAGATCAATTA
CTCACAAGACTTGGTTTATCTCTAAATGACGATCAAAAAAAGTTAACAGA
ACAACTCAAAACAGTCGAATGGGCACGGTTATCATCGGAGTTGGAAAGAT
TGGAACGAGTGGATTTGGTCAGCGATATCAAGAAAAAAACACCAGTTACT
GAAGATGTCATCCTACGTTACTGTAGCTCAAGCCATTCAAGAAATTGAAA
ACTGGCTGAGATTGGCTACTCTGCTTCACGAACCCTTAAAAGAAGCACTG
CTTGCTAACTTACACAACGATTATAAACATAATTATTATGTTGGTCTGCC
AAGGAATCCTACCGCTCTTAATACCGAGATTCGAAAGCAGCAGAATACCA
TTAACCGCTTGGTAAAGAAGGGGGTATTGAAGCAAGATCAAGTAGATACT
CTATTACCTCCGAACTCAACTCAGACAGACAGCCAAACGTTTGATATAAC
TCTTATCATCGTTTTGATTATTAATTTCACAACATTGCCACCTCCGAAAA
ATGGCTGGAATAAAAAGTTAGCAGCTGGTGACATCAGTCCTGCAGCATTT
GTTATTCTTGCTCGTGATTGGAGAAATCGTCTTTTACACGCTGATGCCAA
AAGTATTGATTTGAATGAGCTTAACTTGAGATGGAATGAAGGGGAAAAGA
TTGTCATTGGTTTAGGTTTTACAACGTATAATATGAACGCCTTGAGAACC
AGACCGCTTGATGTCACAAATAATCTTGTAGTCCAATCGCTTTCCTTCTT
CTCGAAAAAACTGAAGAAGGACGTTTCGAAACACGACACAGCCCTAAAAC
TTCATGTCACCACCCTATCATCGCACAGTACTACCCTGAACAAACACGGT
ACTACCCTGACCTCACATGACACTACCCTGAACAAACACGACACTACCCT
GAACTCGCACGACACTGCATTGAAAAAACACGACAATGCCCTGACCGAAC
ACGACAATGCCCTGACCGTACACGACAATACCCTGAACAAACACGACAAT
ACCCTGAACAAACACGACACTGCATTAAATAAACACGACGATACCCTGAC
CGAACACGACAATACCCTGTACAAACACGACACTGCATTGAACAAACACG
ACTATACCCTGACCGAACACGACTATACCCTGACCGAACACGAGAACACT
TTGGATAAACAGCAAAGTTCCATCGACGATCACGGCGATGTCCTGGACCA
TCACTCAAACATTTTGACCGATCATAACGATTTCCTGCAGGAAAATAAAG
AATGTATTTTAAGACTTGACCAAGTAGTTGAGTGTTTGAAAGAGGAACAT
GAGTTCATAAAGAAGACTTTACCCACTTATAAAGATATCCAATTAGCATC
ATCAAAATTACGATGTCAATACGCTAAAGAAAAGATCACTTCACTCGCTC
ATGAGCCCTTGATGGGAGACCAAAATGAAGTCCATTACCAATACGACGAA
GATCTATACACCGATCTAGCAGTCCTCAAAGCAACCGAGGTTGAAAAGGA
GATCAATAATTCTGATCGTGAGGTATTAATGGAGCAGAAGCTGTTACAGA
AAGAAAGCATAGAGCTCCATGACTTGTTCCAGAAGGAGGATGAAGCAGTT
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CACTCGAAAGTGGGCCAGGCATCAACTGGGCTTAGATTTCCCATTGGAAT
TTGTCTTCTTCTTTTCCTGCCGGGAGATCAATCAAATGTATGGCAAGGTC
AAATCGATCGAGGACCTTTTCAAAGACAAATACCCTGACATTTTTGATAA
AACTACTTTAAAAGATCTCGAACCAGTTGCAGATAAGATTTTACTGGTTG
TTGACGGACTTGATGAGCTACAAGACGTTTACGATTGCTCCCAAAAGAAA
GTAAACAAAAACGGAACGCTAACTCCTTTTCAAATCGTCTTCGATCTCAT
CAACACACAAGGTCGTATCTTGAAAGGTCACAAAAGCATTGCATGTGGAA
GACCAAAAGCGTGTGACTTTTTAAAGAGAAAGATAATGGATCTGAAAACT
TCCAATAGAACGGTGATCAAAATCAAAACAGTCGTAGTTTGCGGATTTAA
GGAGGAGGACGTCGGAAAATACATCGATAAATTCTTCAACGGGAACATTG
AGAAAATCAATCGGGTGAAAGAAATCATCAGCGTATCCCACAACTTGAAA
GTCATGTCCACCGTTCCCGTGTTTGCTTGGGTCATCTGTAACGTATACAG
CGAGGATCTCATAACGAAACCCTTAAACACTTGTACAGAACTTTACATGT
ATGCTTGTTTTGTCTTTTTGAGAAAACATTTACAAGGTGTTTCCACTCAA
GGTTATGATAACTTGCTTGATATGCTAAACGATAATAATGTTATTGATTG
CATTTATTCACTCATGACTTTATCGGTGAAAACGTACATGCAAAACCAGG
TGCTATTTTCTGAAGAGGAGGTTCGTCAATTGAACTGTCCCGTACATCTT
GAGCAAACGGGTCTTATCGTCAAATACAATCGTGGCGAAATGAGAGAACC
GATTTACCATTACAAGCACCTAGTTCTTCAGGAATTCCTGACAGGACTTT
ATTTGTGCGTTACGAAAGGGATGTCCCCGTATTTAACAAACCGCGAACTT
TCAAGTTGTGCACCAGTTATATTTGGCATTGGACGTCTTCTGAAAGAGAA
TGACTTCTTCATTAAATTCTTCCAACGACTCTCTAATTTACATACAACAA
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TCTCATAGATCATTTGAACCTGAAATTGAAAGTACCTGAACGGATGTTGG
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ACCAAAGTTTTAATGAAGTCAAATTCAATAATAGTGGATTGCCCTTTTAC
CAGAACTTATATTCATTGTGAAACAGCTGACATAGAATCAGTCCTATTTC
TTGTTCAACGTTTAAATCTGACATTGAAATTACCAAATTTAATGAGTGAT
CATGATACTTTGATCATTTATGGATTAGATGTCGAATGTGCTCGATTCAT
GGAAATTGTCTATAGAACGGAGGCTAAAGTTGAATGCCCATTTTCTGAAG
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TGGCTCTGACACTATAATCATCAACACTGATTTTCCAGAATGCAAAGCTT
ATATAAAGGCTATTTTTGAGCTGAAATTACAACCTGTTTATCAAGCAGCA
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ATGGACCTCAAACTCAAACTCAAAATCCCGAGTTGTATGAAAGATCAACG
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AAACAGTCGAATGGGCACGGTTATCATCGGAGTTGGAAAGATTGGAACGA
GTGGATTTGGTCAGCGATATCAAGAAAAAAACACCAGTTACTGAAGATGT
CATCCTACGTTACTGTAGCTCAAGCCATTCAAGAAATTGAAAACTGGCTG
AGATTGGCTACTCTGCTTCACGAACCCTTAAAAGAAGCACTGCTTGCTAA
CTTACACAACGATTATAAACATAATTATTATGTTGGTCTGCCAAGGAATC
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TTGGTAAAGAAGGGGGTATTGAAGCAAGATCAAGTAGATACTCTATTACC
TCCGAACTCAACTCAGACAGACAGCCAAACGTTTGATATAACTCTTATCA
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AATAAAAAGTTAGCAGCTGGTGACATCAGTCCTGCAGCATTTGTTATTCT
TGCTCGTGATTGGAGAAATCGTCTTTTACACGCTGATGCCAAAAGTATTG
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GGTTTAGGTTTTACAACGTATAATATGAACGCCTTGAGAACCAGACCGCT
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AACTGAAGAAGGACGTTTCGAAACACGACACAGCCCTAAAACTTCATGTC
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CTGACCGAACACGACTATACCCTGACCGAACACGAGAACACTTTGGATAA
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TTAAGACTTGACCAAGTAGTTGAGTGTTTGAAAGAGGAACATGAGTTCAT
AAAGAAGACTTTACCCACTTATAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1396MSTRG.1396Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1396.4.p1MSTRG.1396.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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