MSTRG.13930.10.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13930.10.p2
Unique NameMSTRG.13930.10.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000114_pilon:36488..60644-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13930.10.p2 ID=MSTRG.13930.10.p2|Name=MSTRG.13930.10.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=24157bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:36488..60644- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GAGTTTGGGTGACAATTTTAGAAGTCAAATCCACTCGACAGTGAATGAAA TGAATTTTTGCAAAGTCTTCAGGCCTTTTTTTTGTCTGAGATTGAAGATT GAAGGTTAAATGAGTTTTGCTCTTCAACTTTTTTGAGAAGACATCTTAAT TAGACCATATTTGAGAAGGTTTAATCAATTATAAACAACTTTTCAGAGCT CTCTGGTGCACCCACCACCTGTGTGGTCCCATTTTCAGTCATTTTTAGTT AAGTCTAATAACAACACATGGATTGCTAGTAAGCGTGTATGTGTCTTCTG CTAAATAACCACTTATGGTTCATTTGGGGAATTTCCCAAGTCCCAAAAAA ACTTTTCATGGCACTACTGAGGAAAAGTCTACAGACCTTTTGTCCATGAT TGTATAATAATCAGTAGATTCTAGTAATTAGTAAGGAAAAGACCTTTGGG CTTTATCACGTAAAATGTGGAAACTACGAGATCCAGTATATACAGTCCAG ACAACGCCGATGCTATCAAAAATCTACTGTTAAGTATCCATTCAAACCTT ATAACTTCAATACAAAGAGCGCGTTCACACTGGAAAGTTTACTTAATTAA ATCTATCAAAGTTAAACAAAGAGATTTATGATGGATGAATGCACTGGTTT ATTACAGTTCTTTGTAGGTTCACGAGATCTATTATAAAACGGTAATTGAT TTTGCTTAAGGCTTCTCATTGGTTGATTTTTTATTGAGAGTTTCGATTTA CCTGTGATTGGTTGATATTAGTATCCATCAGTGGCAGCCTGGCAGGGGGT GCAGGGTGTGCAGTGCACCACCCAGAAAGACCTGAGAGGGGCGCCAAAAA AGCTTTTCAAGGGGGCGCCTAAAATTGTTTTAATCTTTGATTGGGCGATT TGGCGCCCTTTGACACGTTTTTAGTGCCTTCTATAAGTGCAATGTAAATT TTTTTTCGCCTGCGGTGCTTCCTTATATTTTACAAATTTTTTCAAAACTA TTATCAACATTGAATTGCGAAAAGTGAAGTGTTGTGTATCCACCAGGGTT TAAAGAGGATGCTCACCCCCAAAATGAGAGATTGATCGAAACTGCTCGCT GTGGTTTTTGTGGTCTTATGCGGACTAACTTTCTCCTTTTTAGAATATCT TTTGAGCTGTTTGACCTTTCTTACACCAAATTTTTTTGCCTGCGGCGCCA GAATTACAAACAACCCTTATTCCTGCCAACTTTCTGAATTTTAGGGCCTC TTTCAGCCATTGATATTTAATGGAGAGTAAAGTAACACCAGGAAATAACA CGGAAATAGATATCAAGTTATCATTACCACCACCTTCGTATAAATAAAAG TTTGTTAACTCAGAGATTCCGGGCGTTACTTTCAACCAGTCACTGCTCTT ACAGTTTAATATTTTCACTTAATGGTGGAGGGCGCAAACAAGGACAAAAA ATACCAGGGGCGCCAATTTCATAGTTTGCACCACCAAGAAAATTAAGCCA GGCCGCTACTGGTATCCATACATCACTTGAAATCCGCAAACATATTTGTT CTAATGGTTTTACTCAATAACTGCATTCATCTTACACATCAACAACACCG TTTGCACTATTTCTAATTTTTTCCTCAGTTCATTCGTTTTTGAAATCGTA AAATTTTTTGTTCACTGCACGCATTCTTTGTTTATGCTTCCTTAATAAAA TCTAAAATCTTTTGTTTTAAGGGAAGCCTCTACCCTACCCTTAAGACAAT AGAGCTTACGACTCTTAATTAAGGAAGATCGATTAAAAATTACGATACTA CGCGTTCGACTCTTTGTTAAATGCACGTTCTGTATTGTAGTCAACAAAAG ATTCTCCTAAATACATTTTTATCAAGGAAGGTCTGTACAGGGTGTCCCTA ATTAAAGTATCGAGTTTGAACATGCGATTGAGTAGAAAAGTTTGTGTGTG TTATCGCTAAAATATAAGAACGTTCTCCATCACACAGGCTTATTACAAAA GGTACAGTGGAACCTCTAATTAGCGGACACCATCGGGGAAAGGGGTTAGT GTCCACTAATTAGAAGTGTCCGCCTTTCAGAAACTTTTGATCTCGGAGCT CCAATTTTGAAATTAGGCCATCCCAGGGTGTTAAAAATACAAAATGGGGG TCTAAAGTACTTATCTGCAGACACTAGGCCAAAGAAGAACAAGAGAAAGG TTATTAAAGCAGCTTGAGTGACTGGCAAGAGGTTAAATCGAGGTAGTGGG TACGGACTTGAAGTACCAGTGATTTATGATTCCTTTGGCCTACCTAAATT TGTTGAATGGGTCAAGGGGAACTGGAAATTTGTAGAAATAATTTGAATAA TAAGACTAATAAGTGCTTGAAATAAAAATATCCAAAAAATTTTTTTTCGA TTTTAGACGTCTGTGCCCCGTTTGATATTCAATGTCCGCTAATTGGAGAG CTAAAATTGTGGTTTTGGCCATTTCGTGCGAAAAAATTTGTCCGCTAATC AGAGGGTCCGCTAATTGAGTGTCCGCCTTTTAGAAACTTTTTTATGAGGA TTTGACTAGGAAACGGCCGGGGAAAATGAAATTGTCCGCTAATCAGAGGT GTCCGCCTTTTAGAGTGTCCGTTAATTAGAGGTTTTACTGTAGTTACAAC GTATAAATTAATCGTAATGACAAAGAAAAAAGAGGGAGAGCTTAAAATAC AATTTTGTGAACACGCACATAAAACTTTCTACTCATAGTTGTGTTTCGAC TCGATACTTTAATTAGGGACACCCTGTAGTGTGAACACGACCAAAGATTT ATTATACACTGGGTAAACGACTCATAAAACGATGGAGAGCGATCATTGTA TTTTCATTGTTTCAGAAAACAATTGATGTTATAGCTTTGTCCGCAAAGGA CAACTGTCGTGATTTTTAAAATGTTTATCAGTCTTGTTTTTAAAAAGTTC TCTAGCTCTTTCTTTTTGTACATTTGCAGAAAAAAAGTTTGAAAGTAAGG CTAGCATTCCAAGCTGGATACATATGTGAAATCTAATGTGAGAAAAACAT CAATAGACAAGAAATTCAGACAAAATGCTTATAGTGGCACGAAATTTTCG ATTGGACTGTCCCAAGAAGAGCTGAAATTAACATACGTAAGACGTGAGTG TCTTGGCTCAATTGTGGTATGAAAATCCTTTGGAGGCACGTGGTGGCAAG GTGGTTTTTTTGAGGTTAAAGTTTGAAAATTTCCGGTGTCAACATTAAAT TTCTTATACACAACAAGTCTTTTGCATCTTTCTCACAGCTTGAAACGTCA TAACGACTTATAATTAGCAATTAAGTGGAAGAATCTGGTCGTGTTCAGAC ATGAAAGTTTAAGTTTAAGGCTTAAGTAGTACTAAGTTGATATGGGAATT AAGAAATGCAACGAATTAATTGCTATTTCATCTTTTAGATAGGTTACATA AGAGAGGAAAAAGGAATCCCCTTTTGAATGTTTGAGTGAGGCTTCGTTTT TTGATACTTCGATCCATGATATTCTCATTAAAAGCCCATTAACTGCCTAA ATTGCTAGAGACGCTCCGAGCGTCTCTAAGTCATAAATTTCACGTTCTCC TTTCATAATTTACAAAAGGAGCATGCTTTTCACTTTCGAATTCTGATTTC GTCTATTCAAAAAACTGTGATAATATCGTAAAAACTTTTTTTTTAAACCA TAGGGTGATTCCTTTTTAAACTTTGGTTTAACTTATGAGGAGCGTGCAGC TAAATACAAAAGGAATATAAAAGAAACATGTAGACTTAATCACTTTAAAC CTTGGTCTGAACACGACCTCTGACTCTAACAGGAAAGTTTTAAGTCTCTT TTGGGAATTGGATGGGTGATTTTCGATAAGAAATACCATAAAAATGCTTC GAAAAATCATTTAATGAGGGAAGGAGAGTTAACAATAATATCATTACTGC GGACATAGCCAGTACACAAGAAATCGGCAAAAATCTGTTACTTGTATATC CAGTGTATAATAAATTCTTGTTCAATATATCCTTAAATCAAACAAGTTTT CTGGTCTTATCAGATAACAAACTCTTATTAAAAACCTCGAACAAGCTCTA ATCTATAGGAAATACTCGACGCGAGGTACAGAGATCTTATGTATGTTCAG GGGACCCTTAAAAGTTATGAGAAAAAGCATGGGTGAACATGGCAAAACAA AACTAATACACTCTCCGACCACATTACCAGGCACTTGATTCGTTTTGTAA TGAATTTAAAAGCGCGCTCAAAAAATTGTATATTACATCCTTCAGTTAAA TCAAAAAAACGCTATACATAGATTTACTTTCTGATACCTTTTTCTAGCGA TCGCTTTGGATAAATGGATGTCAGAATATTACTTGTCCGATATCAAGAAA GCAAACCCGAAAGCTAAAATCCACAAGCACTCAAAACCATTGGATTCTGG GATAGGTTTCATTACTCACGATGAAAATATATTCAAAATGAAGAAGTTTT TCCATGAACAAAATGTGGATAACATGATCAGACTGTGGTACGATATAGCA TTGCAATTCAACCTGGTAAGAAAAATATTTGTTAAAAATGGCCTGGGGGC CGGTAATAGCAACCATTCATGTGAGTATTTTCGAAAATTGCACAAAAATT GGGCTAATACTAGCAAAACTAAAGCAAAAATTGGTGATACATCCACAGAA AATGAGGGAAATTTGCGTACTGAAAAATGTTTTACTTCTAAAAAGTATAT CTCTATCACTTCAAAGAAGACCTGATAATTTTGAGACACGCTACAGAAAG AGCATAATGTTTACCTAAATATGTCCTAAAATCTTAACGTTCATCGTTTT CCCCAGGGTAAATCAAACACGACGACCCTGACGAGCTGGGAAGCAGAACA ACTGAATGCAGCAGTTAAAGATGAGGAAATTGACGTCTTATTCACAACAG AACATGTATCGTTCCCTTTATGTTTGATTCTCATGCTAGTTTTAACAATT TGTTGTATTGCAACAAATATTTACCTTAATAAAAGGCGAAACGAATCATG CATGACTGTTAACAATCCTGCGTCAAACGAATTGTTTGAAATGGAGGAGC AGAATAGATCAGATGCTAACTGTCAAGCTTTAATGAAAAGTCTGCAGAAA TGCGTAAAAGGTACTTCAGGAAGCCAGCAAATAAAAGGGACTCAAGAAAA CTCAAATACAAACACCGGAGAAGGAAGCCAACGAATGTCAGTAATCGGAA ACTACAAGGCACGCGAAGGAGCCCCAGGAAAGCTAGGTCGACATGAATAT CGAGATTCACTTGGAAATCCAGAAAGTTTTTATTCGGTGTGAGAATAAGA AGTCAGGTGTAAAGTCGAGATTAATACTTAGATATTTTTTGGTCTTTAAT TCTCGATCGGTAAAAAGCACATGCGCCCATACGGACCTTATTATGTTACA AATATTCATCGAAGTAAATATCGAGTTAAACAGTTTTAAAAACCGCAGTT ACGTTAGACTATGGCGTTATGTTTGGTGAGAATTCTGTTTGGAAGCTTTT ACATTATAATACGCCTAAATAGGAACCTATTCTTGCATGAAGCTGTTTCG CTGCCGATTTTTAAGCAGACGGCAATTTATTATCGCGTCTTTTTTGTATT GACCTCTCAATTGTTCAATTTTTAGCCTTAAAATGAAAACCGTGAAAACC GTATCCTAATCTCCTTTTTGAACATTTTCAAGAGCACTTTGAAATTGAGA TTGAAATCCGCTTTTTCTTTTTCATTATCTTTCATTAAATATGTTATTTT AAAATTTCCAAAGCTTTCAAAGTCTTTCAAAGTCATCCTTGAATGTCGTC TGCCCACGATGACTAGCCACGATGACTGAACTTTTCTTAGCACAAGAATA GTCTCCATTGCGGTAGATTTTCCTATAAAATACATTTCATTTCTCAAAGA TGACAGAGTGAAGCAAGCTCAATTATCATGGTAAAGAGTCGTCTCGGACA ACGCATGATGGCTCGTCTCGTAGATTTCTTATTTCTAGCTCTAATTTTTT ATATCATTGAAAGATAAATAATAAAGATAGAAGAGAATTCCTGTTTTATG TCTAACC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000114_pilon:36488..60644-

>MSTRG.13930.10.p2 ID=MSTRG.13930.10.p2|Name=MSTRG.13930.10.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2688bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000114_pilon:36488..60644- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTAGAATGAGAAAATCGATCTAAAACGAAACAGTTTCCACGAACATGGC
AGGGCTTATTTGAAGGAATTTGGTTTGCTTTTGTGTCCATGACAGCTGTC
GGGTTATTTCAAGAAAGTCTTCATTGACACTTGCTGTCTTGGATGCGGCA
AAATCAACTACCTTCCACAGAAAACTCATAAAAAGAAAATCGACGATCAA
TTTATTGGCGAAGAAGCCGATATCGTGGTTCCCGTTCAGAATTACATCAA
TGGCGAATATTACCTAGGGATGAGATACGCTAACATTCTCGAACTCGATG
AAATCGAATATATTGGCGTTTTGGACCCTCCAGATCCTGGACGCAAGAAA
ACAATCTTGTTTAAAAGTATATTCGAGACCTGGCCACTCGTTTTAATGTG
TATTTCAATGTCAATCGGTGCTGGATCACTGGTTTGGGTCTTGATGTTTT
TCTGGCTGATCATATTTTGCTGTTCTTTGAATTTTTCGTACCAAGAAACT
TATCTGCCGTCGTGTGAAATACGTTATGATATTCGTCACTATTTCAACCA
TACGTGTGAAGAAGTTTACGAATTACAGCCTGTTTGCAATCGAACTTTGC
AAGTAGCTTACTCGAATTTCCCACCATATGCTTTCAAAGACAAAGATGGA
ACTATACAAGGATTTATACCAGTTTAGAATGAGAAAATCGATCTAAAACG
AAACAGTTTCCACGAACATGGCAGGGCTTATTTGAAGGAATTTGGTTTGC
TTTTGTGTCCATGACAGCTGTCGGGTTATTTCAAGAAAGTCTTCATTGAC
ACTTGCTGTCTTGGATGCGGCAAAATCAACTACCTTCCACAGAAAACTCA
TAAAAAGAAAATCGACGATCAATTTATTGGCGAAGAAGCCGATATCGTGG
TTCCCGTTCAGAATTACATCAATGGCGAATATTACCTAGGGATGAGATAC
GCTAACATTCTCGAACTCGATGAAATCGAATATATTGGCGTTTTGGACCC
TCCAGATCCTGGACGCAAGAAAACAATCTTGTTTAAAAGTATATTCGAGA
CCTGGCCACTCGTTTTAATGTGTATTTCAATGTCAATCGGTGCTGGATCA
CTGGTTTGGGTCTTGATGTTTTTCTGGCTGATCATATTTTGCTGTTCTTT
GAATTTTTCGTACCAAGAAACTTATCTGCCGTCGTGTGAAATACGTTATG
ATATTCGTCACTATTTCAACCATACGTGTGAAGAAGTTTACGAATTACAG
CCTGTTTGCAATCGAACTTTGCAAGTAGCTTACTCGAATTTCCCACCATA
TGCTTTCAAAGACAAAGATGGAACTATACAAGGATTTATACCAGTTTAGA
ATGAGAAAATCGATCTAAAACGAAACAGTTTCCACGAACATGGCAGGGCT
TATTTGAAGGAATTTGGTTTGCTTTTGTGTCCATGACAGCTGTCGGGTTA
TTTCAAGAAAGTCTTCATTGACACTTGCTGTCTTGGATGCGGCAAAATCA
ACTACCTTCCACAGAAAACTCATAAAAAGAAAATCGACGATCAATTTATT
GGCGAAGAAGCCGATATCGTGGTTCCCGTTCAGAATTACATCAATGGCGA
ATATTACCTAGGGATGAGATACGCTAACATTCTCGAACTCGATGAAATCG
AATATATTGGCGTTTTGGACCCTCCAGATCCTGGACGCAAGAAAACAATC
TTGTTTAAAAGTATATTCGAGACCTGGCCACTCGTTTTAATGTGTATTTC
AATGTCAATCGGTGCTGGATCACTGGTTTGGGTCTTGATGTTTTTCTGGC
TGATCATATTTTGCTGTTCTTTGAATTTTTCGTACCAAGAAACTTATCTG
CCGTCGTGTGAAATACGTTATGATATTCGTCACTATTTCAACCATACGTG
TGAAGAAGTTTACGAATTACAGCCTGTTTGCAATCGAACTTTGCAAGTAG
CTTACTCGAATTTCCCACCATATGCTTTCAAAGACAAAGATGGAACTATA
CAAGGATTTATACCAGTTTAGAATGAGAAAATCGATCTAAAACGAAACAG
TTTCCACGAACATGGCAGGGCTTATTTGAAGGAATTTGGTTTGCTTTTGT
GTCCATGACAGCTGTCGGGTTATTTCAAGAAAGTCTTCATTGACACTTGC
TGTCTTGGATGCGGCAAAATCAACTACCTTCCACAGAAAACTCATAAAAA
GAAAATCGACGATCAATTTATTGGCGAAGAAGCCGATATCGTGGTTCCCG
TTCAGAATTACATCAATGGCGAATATTACCTAGGGATGAGATACGCTAAC
ATTCTCGAACTCGATGAAATCGAATATATTGGCGTTTTGGACCCTCCAGA
TCCTGGACGCAAGAAAACAATCTTGTTTAAAAGTATATTCGAGACCTGGC
CACTCGTTTTAATGTGTATTTCAATGTCAATCGGTGCTGGATCACTGGTT
TGGGTCTTGATGTTTTTCTGGCTGATCATATTTTGCTGTTCTTTGAATTT
TTCGTACCAAGAAACTTATCTGCCGTCGTGTGAAATACGTTATGATATTC
GTCACTATTTCAACCATACGTGTGAAGAAGTTTACGAATTACAGCCTGTT
TGCAATCGAACTTTGCAAGTAGCTTACTCGAATTTCCCACCATATGCTTT
CAAAGACAAAGATGGAACTATACAAGGATTTATACCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13930MSTRG.13930Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13930.10.p2MSTRG.13930.10.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13930.10.p2.exon9MSTRG.13930.10.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13930.10.p2.exon8MSTRG.13930.10.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13930.10.p2.exon7MSTRG.13930.10.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13930.10.p2.exon6MSTRG.13930.10.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13930.10.p2.exon5MSTRG.13930.10.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13930.10.p2.exon4MSTRG.13930.10.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13930.10.p2.exon3MSTRG.13930.10.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13930.10.p2.exon2MSTRG.13930.10.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13930.10.p2.exon1MSTRG.13930.10.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000114_pilongenomesc0000114_pilon:36488..60644 -