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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000113_pilon:1069872..1075730- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13925.1.p1 ID=MSTRG.13925.1.p1|Name=MSTRG.13925.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5859bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:1069872..1075730- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GCTGAAGGTAGTTTTTCATCAATTTTTAGGGATTTTGGGTGATCGATGTT
TTGGGTATGGGTTGGTGGGTCAGCTTTTAAAACTTCATATGTTTTTCTAA
CCTAAAATTGATTTGTGAGTGACCCCTTATTCAATAGACTGTCGCTTTCT
TCTAAACAACTATTGGTACCTTGTCAGATTAAGTTTATGAGTTCAAAGGT
TGATTGATTGATCAATCAAATAACACTTCTAGGCTAATCAAAAAGATGAT
TTCATATCTATTCTGAAACGACAGGAGAACATATTACTTCTTACTTTGTT
CAAAAATTGCTGCACGAAAGAAAACAAAAAAACCAATGAATTTTACCACA
CATACAATTGCAATCGACAGCAAGTCACAGTGTTTTTAAAGTTTGTAAAT
ATGGATTGGGACTTCCATGAGCTAGAACTTGGTGTCATACTCTGTAGTTA
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GAACTTTTATTTGAATAATTATGCCAAAGGACTACATTTCTTTTTAGAAA
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GAAAATTTGGATGATGTAGATGTCCCATGTTGTGACAGTTATCTTACATG
TCCATATGAAGCTAAAAATACACTGAAAGAACACTTGTTCAAAGTCAACA
GTGGCTTTTACATTCCTGGTATTTATGACAATCAATTGAGGTAAATATTA
ATTTCCATTTCCTTATTTCTAATTTTGAAAAGATTACTATACAGGGTGTC
CCCAAAAAAGTCCTTGTCAGACCACTGCAATAAGTAGAAATTTTTTTTCT
TCTATGGGATAAACACCTTTCTATGTTTTTATCTTCAATTTCTATTATTG
CTATTTCAATTGCTTAAAGAAAGAGCTAAAAAAAGCACCAATGACACCTT
TCTATGTGCACATCTTTTATAATAATATGCTGTCTTTTTGTGTCAATCAA
TAGAAATGCCTTAATTCAAATAGGAATACGTTAAAAGTTTCTTTTTCAAA
TGCAATGGTAATTTTTTTTTAATCACAATAATACATCAATAAAACAAAAA
CCTATAAACTTCAATTGACAATACAACATGATAATAAAAAGATACTATTT
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TTTTCTCTTTGAATCCTTTCAATTCCTTTGACATTTTGTCAACAACAAAA
AATTTTGTTCATATAACAAGCTTTTCAAGCATTTTAAAGCAAAGAAGATA
AGCTTATTTTGGTAGCTCAAATATAATTTTCATTTCAGCACTTGCCAACA
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CCAATGTGTTGAATGTGGTGAAAGCAATTCTGTTCTCGTTATTGGACCTA
GAGGAAGCGGAAAATCTAAAGTAAGCATTTGGCGCTACCCACCTTTTAAG
TTGATGAAATTAACAGATGGTAGTTACGAAATTGCCATTACTAAAAATAA
TAAAAGTTTAGTTTGGTTTGTCCATTAATGAAATTTATTTCATAATTCAA
ATTCATGTGTTGAACGGTGGAAATGAATGCACTTATTATAATTCGATTTT
TTATAGTTTAAATTCGTGTTCTTTTTTAACAGAAAAGTAAAATATGAAAA
GTAAATGACTTGTCTTAAACTACTGAGGTTAAATAAGTTTTTTCTAATTT
TTAGTTGCTTTCAAAAGTGTTTATTGGATGTTTACAACAACCATGGCAGT
GATTATTTCTATGTTTACTTAAGTGGTGAGTATCTTTCCTTATTATGATG
ATAAAAAGTTAAACGACATAGTTTGCATACACAGTATGTTTAAACAAAAG
TAAAAGAAACTTTATTAGCATAGGGGTGGTCCTCCTATCTTTACTATAAA
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CATATGTTATATGTTTACGTTTATTTCAACAATTTTAAACTATTCTTAAT
CCTATTGTTAATTTCCTACATCAATAAATTATTTTTCAGGTTTGATACAC
ACTGATGATCGATCAGCTCTTCAAGACCTAGCAAGACAATTAGAACTAGA
AAATGTTATTGGGGATAGAGTCTTTGTAAGTACTGTCACTGAGTGACTCT
TGACTTTTTTTTTATCAGTTAATTCCCATTCATTTGTTGTAGTGATCGAT
TGTTTTCATTTCTTTTCTCTCCAGGGATCTTTTGCTGATAATTTGGCCTT
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ATATCTCAACTTCAGTTGAACCTGGGGATGTCTGTCTGTCTTTATCTGTG
TGTATGCCCAAAATGCTTTGGGGCAACCTGGAGACTGTTGGCCCAATTAG
GCACACTTGGGTGTTTTTTTTTTTTCAATTTTTGAAAAATTTGATTTTTC
GTGTATGGGGGTGGGGGTCAATTTTTTTGCCAAAACAAGGCTGAACTTTG
GGCGACCTATAAAATGCTTCAAAAATAGATAGGTTGGGCTGAAATTTTTG
GTACACCTGTTTTTTTGGTGAAAACCTGGGGAGTTTTTTTCATTTTTTAA
AAATCACAATTGGGCCCTCAAATAGTTGGAATAATAGTTGAGCCCAGTGT
ATAATCCATGTTTAACTATTCTTCAAAATTTGACAAGAGCAGTGTCCAAT
TAAAGATATTTTCACTTTTGTATTTCTCTTCCTTGAATTTCAGATAATGG
ACAATCAAAGTCAGTTATTTTGGTATTAGATGAATTTGATTTGTTTGCCT
ACCATAAAAACCAATCGTTACTTTACAACTTGTTTGACATTGCCCAAAGT
AAACAAAACCCATTATGTGTCATTGGCCTGACTTGTAGACTTGATGTGGT
TGAGTTGTTGGAAAAAACGAGTGAAATCAAGATATTCACACAGAGCTATA
TTGACATTTCCATCTTATAGTTTTGAAGAATATGTAGACATTGTAAGGTA
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TTTTTGACTTTCTTATTTAATCCACGACATTTTTCGAATAACTTTAGAAA
GAGAGCCTGATTGTTAAGCTTTCCGATGAATAAATTATTAAAGTTTGTGG
GTAACTAGGTATGATTTTACACGAGCTTTTTACAGGTAAAGTGTTGTGGG
TTAAAATGGCATGTGGGTTACTTCTTTACTGATCTTCTACCATTATCTTT
TCTTTTAGCTCCTTTCTAAAACTATCAGAAGATTTTTCATGTAAAAAGTT
CAGGGACAGATGGAATCGTAATTTAGATGTAAGTCATCATTGTGTTTTGC
AAATGCAAATACAATCACTTAAGCTTGTTATATGAGAATCTAGTAATACT
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TGTTTACAAAATTGATTTTAATGTTTTTTCTTACGTTTTTTTCATGGAAC
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ACAACAATAAAATAAAAAACATAGAGAGAAGAGAAACGTATAAAACTTTC
AGTGTAATTTACTTTCCTAACAGGGAAAAAGTACTTAGATAGACCCATTG
TGCGATCAGCTCGTAATCACCTAGATAATAACTCGTACAATTCGAAAATA
GACCTTATCGGAGTTTTTGATTTTTCTAAAAAAGCGATGTATTGTGGGAT
TGTTTCGAGTGTATTACAATAGAAATCTCTTAGGAATTCCTCGAGGGAAT
TCTATTGTAATACACTGGAAACAATCCCACAATGCATCGCTTTTTTAGAA
AAATCAAAAACTCTGATAAGGTCTACTGCACTCGTAATTCTTTTTGTTTC
GAATTTTCCTCGTCCTTTTGGATTTGGAAAATTAATAACAAAAAAGATAC
CAATGCAATTATTCTCGCATTGCACTCGTTATCATGTGATCACATATACT
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TAAAAAAGCGAGAAATACTCTACTTTATTTTTAGGAAAATCTTTCTGAAG
GTTCAGTATGTTGTGAAATACTTTTGAAACAGTATAATCTACAAAAGGAC
TTTCAAAGTCTCATACGTCTCTTGGTAAGGACACCTCATACTTTTCTTTC
AATTTATTTATATGTACCGGTTACACTTTTAACTCGCAAGAAGGGAAGTT
GCAAGCTTACTTTCTTATAACAAAGTTTGTCAAATTAGATTGTAAAACTT
TGTTTCCAATTGAGACCTCTGTAACATTTACTTCTCCTTCTCAAAATACA
GTAGAACTTTAGAAATTTATTGCGAACAGTTTAACTGTCCAAAAATATTT
TGTATTCCCTATTTAAACTTATTTAAACCTAATTTTTAGACACCTGTTGT
GTATGGAATCTCAAACAAAAAGCCCTTCATATCAAACACAGACTTTGTGG
AAGCATATACATCACTTCACATCGATAGCAAAACAGCTTTGTTAAATGGT
ATGAATTGATATTTTGCAGCAGTTGTACCGGAACTTGTATATAAAGAATT
GATAATTTCTTTTTAGTCATTCATTTTCACATCTTGGAGTCCCATTAAGA
TCTATTTTTTCAGCTATCATAGTCCCACACAGAGTCGAAATTTGGCCCTT
TCTGGGTCCCTTAGAGGGTACAGTTAGCGTGAAAATACAATCACTGCAAA
TCAATTGCGAAAATAAAAATGGGTACAAAAAGTATGAAACTTCTATCAGG
TTTTCATTTAAAACTTTATAGGACTTTCAACTCTTGAGTTAAGTTTATTG
GTAGCAGCAAAGCACGTCTTTAACCGAAGAGAAGGACAACCTTTCAATTA
CGAAATGGTGTATAATGGTAAGTAACTTTCTGTCATCCTTGAATAGTTCG
ACTTAATGATATATTGCTGTCAGGTCTCATCTGCTTCATTCAACATAGAA
GTTGTGCACATAGAAGTTGTACACTCAGTGAATTTGAAAATGATTTCTTC
CCTCTTTCCTTTCTAGAGTATGAAAACTTTTTGAAACGTAGATTATCCGG
TATGCAAAATTTCAACAAAGCAGTTGCTTATAAAGCTTATGAACATTTGA
TTTCATTGGAACTCTTAAAAAGTACGGAAACATTATCCATCAATTCAACA
TCAAAGGAGTTCAAAGCAATGACACTTTTACTTGAACCTTCCCAAATTAA
AGAGATTGTCTACAGATATCCTGAATGTCCAACTGAACTTCGACAATGGG
CTGATAGCATGTTTGTGTACTGATTTTTGTTGGTGTTTGCTGGTATGATT
TATTTTTAATGTTTGAATAATGTATCCCATTTATAAAGACGATTTCCATT
CTAACAATATGCCACATAGGATTCTATGTGACCTAAAATTCATTCGCTTT
AAGTAAAAACTTTTTTGCCAAGTAAGCGTTATTGAAGTAATTCCCTTGGG
ATGGTTTCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:1069872..1075730- >MSTRG.13925.1.p1 ID=MSTRG.13925.1.p1|Name=MSTRG.13925.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4356bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:1069872..1075730- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AGTATGAAAACTTTTTGAAACGTAGATTATCCGGTATGCAAAATTTCAAC AAAGCAGTTGCTTATAAAGCTTATGAACATTTGATTTCATTGGAACTCTT AAAAAGTACGGAAACATTATCCATCAATTCAACATCAAAGGAGTTCAAAG CAATGACACTTTTACTTGAACCTTCCCAAATTAAAGAGATTGTCTACAGA TATCCTGAATGTCCAACTGAACTTCGACAATGGGCTGATAGCATGTTTGT GTACTGAGACTTTCAACTCTTGAGTTAAGTTTATTGGTAGCAGCAAAGCA CGTCTTTAACCGAAGAGAAGGACAACCTTTCAATTACGAAATGGTGTATA ATGACACCTGTTGTGTATGGAATCTCAAACAAAAAGCCCTTCATATCAAA CACAGACTTTGTGGAAGCATATACATCACTTCACATCGATAGCAAAACAG CTTTGTTAAATGGAAAATCTTTCTGAAGGTTCAGTATGTTGTGAAATACT TTTGAAACAGTATAATCTACAAAAGGACTTTCAAAGTCTCATACGTCTCT TGCTCCTTTCTAAAACTATCAGAAGATTTTTCATGTAAAAAGTTCAGGGA CAGATGGAATCGTAATTTAGATATGTGGTTGAGTTGTTGGAAAAAACGAG TGAAATCAAGATATTCACACAGAGCTATATTGACATTTCCATCTTATAGT TTTGAAGAATATGTAGACATTGTAAGAGTATGAAAACTTTTTGAAACGTA GATTATCCGGTATGCAAAATTTCAACAAAGCAGTTGCTTATAAAGCTTAT GAACATTTGATTTCATTGGAACTCTTAAAAAGTACGGAAACATTATCCAT CAATTCAACATCAAAGGAGTTCAAAGCAATGACACTTTTACTTGAACCTT CCCAAATTAAAGAGATTGTCTACAGATATCCTGAATGTCCAACTGAACTT CGACAATGGGCTGATAGCATGTTTGTGTACTGAGACTTTCAACTCTTGAG TTAAGTTTATTGGTAGCAGCAAAGCACGTCTTTAACCGAAGAGAAGGACA ACCTTTCAATTACGAAATGGTGTATAATGACACCTGTTGTGTATGGAATC TCAAACAAAAAGCCCTTCATATCAAACACAGACTTTGTGGAAGCATATAC ATCACTTCACATCGATAGCAAAACAGCTTTGTTAAATGGAAAATCTTTCT GAAGGTTCAGTATGTTGTGAAATACTTTTGAAACAGTATAATCTACAAAA GGACTTTCAAAGTCTCATACGTCTCTTGCTCCTTTCTAAAACTATCAGAA GATTTTTCATGTAAAAAGTTCAGGGACAGATGGAATCGTAATTTAGATAT GTGGTTGAGTTGTTGGAAAAAACGAGTGAAATCAAGATATTCACACAGAG CTATATTGACATTTCCATCTTATAGTTTTGAAGAATATGTAGACATTGTA AGAGTATGAAAACTTTTTGAAACGTAGATTATCCGGTATGCAAAATTTCA ACAAAGCAGTTGCTTATAAAGCTTATGAACATTTGATTTCATTGGAACTC TTAAAAAGTACGGAAACATTATCCATCAATTCAACATCAAAGGAGTTCAA AGCAATGACACTTTTACTTGAACCTTCCCAAATTAAAGAGATTGTCTACA GATATCCTGAATGTCCAACTGAACTTCGACAATGGGCTGATAGCATGTTT GTGTACTGAGACTTTCAACTCTTGAGTTAAGTTTATTGGTAGCAGCAAAG CACGTCTTTAACCGAAGAGAAGGACAACCTTTCAATTACGAAATGGTGTA TAATGACACCTGTTGTGTATGGAATCTCAAACAAAAAGCCCTTCATATCA AACACAGACTTTGTGGAAGCATATACATCACTTCACATCGATAGCAAAAC AGCTTTGTTAAATGGAAAATCTTTCTGAAGGTTCAGTATGTTGTGAAATA CTTTTGAAACAGTATAATCTACAAAAGGACTTTCAAAGTCTCATACGTCT CTTGCTCCTTTCTAAAACTATCAGAAGATTTTTCATGTAAAAAGTTCAGG GACAGATGGAATCGTAATTTAGATATGTGGTTGAGTTGTTGGAAAAAACG AGTGAAATCAAGATATTCACACAGAGCTATATTGACATTTCCATCTTATA GTTTTGAAGAATATGTAGACATTGTAAGAGTATGAAAACTTTTTGAAACG TAGATTATCCGGTATGCAAAATTTCAACAAAGCAGTTGCTTATAAAGCTT ATGAACATTTGATTTCATTGGAACTCTTAAAAAGTACGGAAACATTATCC ATCAATTCAACATCAAAGGAGTTCAAAGCAATGACACTTTTACTTGAACC TTCCCAAATTAAAGAGATTGTCTACAGATATCCTGAATGTCCAACTGAAC TTCGACAATGGGCTGATAGCATGTTTGTGTACTGAGACTTTCAACTCTTG AGTTAAGTTTATTGGTAGCAGCAAAGCACGTCTTTAACCGAAGAGAAGGA CAACCTTTCAATTACGAAATGGTGTATAATGACACCTGTTGTGTATGGAA TCTCAAACAAAAAGCCCTTCATATCAAACACAGACTTTGTGGAAGCATAT ACATCACTTCACATCGATAGCAAAACAGCTTTGTTAAATGGAAAATCTTT CTGAAGGTTCAGTATGTTGTGAAATACTTTTGAAACAGTATAATCTACAA AAGGACTTTCAAAGTCTCATACGTCTCTTGCTCCTTTCTAAAACTATCAG AAGATTTTTCATGTAAAAAGTTCAGGGACAGATGGAATCGTAATTTAGAT ATGTGGTTGAGTTGTTGGAAAAAACGAGTGAAATCAAGATATTCACACAG AGCTATATTGACATTTCCATCTTATAGTTTTGAAGAATATGTAGACATTG TAAGAGTATGAAAACTTTTTGAAACGTAGATTATCCGGTATGCAAAATTT CAACAAAGCAGTTGCTTATAAAGCTTATGAACATTTGATTTCATTGGAAC TCTTAAAAAGTACGGAAACATTATCCATCAATTCAACATCAAAGGAGTTC AAAGCAATGACACTTTTACTTGAACCTTCCCAAATTAAAGAGATTGTCTA CAGATATCCTGAATGTCCAACTGAACTTCGACAATGGGCTGATAGCATGT TTGTGTACTGAGACTTTCAACTCTTGAGTTAAGTTTATTGGTAGCAGCAA AGCACGTCTTTAACCGAAGAGAAGGACAACCTTTCAATTACGAAATGGTG TATAATGACACCTGTTGTGTATGGAATCTCAAACAAAAAGCCCTTCATAT CAAACACAGACTTTGTGGAAGCATATACATCACTTCACATCGATAGCAAA ACAGCTTTGTTAAATGGAAAATCTTTCTGAAGGTTCAGTATGTTGTGAAA TACTTTTGAAACAGTATAATCTACAAAAGGACTTTCAAAGTCTCATACGT CTCTTGCTCCTTTCTAAAACTATCAGAAGATTTTTCATGTAAAAAGTTCA GGGACAGATGGAATCGTAATTTAGATATGTGGTTGAGTTGTTGGAAAAAA CGAGTGAAATCAAGATATTCACACAGAGCTATATTGACATTTCCATCTTA TAGTTTTGAAGAATATGTAGACATTGTAAGAGTATGAAAACTTTTTGAAA CGTAGATTATCCGGTATGCAAAATTTCAACAAAGCAGTTGCTTATAAAGC TTATGAACATTTGATTTCATTGGAACTCTTAAAAAGTACGGAAACATTAT CCATCAATTCAACATCAAAGGAGTTCAAAGCAATGACACTTTTACTTGAA CCTTCCCAAATTAAAGAGATTGTCTACAGATATCCTGAATGTCCAACTGA ACTTCGACAATGGGCTGATAGCATGTTTGTGTACTGAGACTTTCAACTCT TGAGTTAAGTTTATTGGTAGCAGCAAAGCACGTCTTTAACCGAAGAGAAG GACAACCTTTCAATTACGAAATGGTGTATAATGACACCTGTTGTGTATGG AATCTCAAACAAAAAGCCCTTCATATCAAACACAGACTTTGTGGAAGCAT ATACATCACTTCACATCGATAGCAAAACAGCTTTGTTAAATGGAAAATCT TTCTGAAGGTTCAGTATGTTGTGAAATACTTTTGAAACAGTATAATCTAC AAAAGGACTTTCAAAGTCTCATACGTCTCTTGCTCCTTTCTAAAACTATC AGAAGATTTTTCATGTAAAAAGTTCAGGGACAGATGGAATCGTAATTTAG ATATGTGGTTGAGTTGTTGGAAAAAACGAGTGAAATCAAGATATTCACAC AGAGCTATATTGACATTTCCATCTTATAGTTTTGAAGAATATGTAGACAT TGTAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:1069872..1075730 - |
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