MSTRG.13911.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13911.1.p1
Unique NameMSTRG.13911.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000113_pilon:879722..900615-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13911.1.p1 ID=MSTRG.13911.1.p1|Name=MSTRG.13911.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20894bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:879722..900615- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:879722..900615-

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AATGCTGCTTACATCAAACTTGCACACATTTGGATTTGTCCAGCCATGGC
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GTCGTATTTACATCATCAATCTGGACGTCTTGAATGATATTATTTGTAAA
GATTGTCGCACGGGTTATTACAATTGGAAATCGGACGAAAAGTTCGGACA
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CTGGTCGATGTTTACAAAGGTTCATTTGGAATACCATATATTGATGTTCT
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ATCTTTAAGACAAAAAGTTGAGTATGAATATCCGTTCCCGATAAACCGAT
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CTTTCCGCCCAATTATCCCGCCATTCTGAATGGAAAAGCGCCAAGCTCAA
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TTCGAGCCCGCTTAGCAGAGATCAGTAAGGAGATCAAAGAACGCAATGCG
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TATTGAGTTATCTTCCAAATAAGGATACAACTCTCTCCATCATGGTGGTG
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GAAGGTTGGATTGATATCACCATGACAATGGGTGTATCTGGCCTCTTCCA
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TCGAGGTACCAATGGTCTCGGTGATTTTGAGATCCAATATCAATATGAAC
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TCCGCCCAATTATCCCGCCATTCTGAATGGAAAAGCGCCAAGCTCAAAGA
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GTCTTACAAACTGTGATACTGGAGTCGGTATTAAGATGGAAAGATTGGCG
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TGGAGTTTGGCAGTGCAGAAGTTGTTGTCACCTGAAGGTTGGATTGATAT
CACCATGACAATGGGTGTATCTGGCCTCTTCCAAATATTGAAGAAAAAGA
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ATCACCCTCGCATCCAGTTTTTCGACTTTTGGGGCCCCATTTTCTCTACC
TGATCGCTATAAACAGATCTTTTTACCAAGTGATCCTGAGTACACATGGA
TGTTGGCGAAAATGTTTTTCAACAATGCTGAATGCTGCTTACATCAAACT
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GTAATGATTATAAGATGGGTGTAGCATTGTCAAGACGTAACGTTGATTTT
GAACTAATTTGTAAAACTGGAGATGTCAAGGGGGCTGGGACAGACTCCAA
CGTATATACTGTCATCGTCGATGAGGATGAAGATAAATCGCGGAACGTTC
TGTTAGATTGTAATTGGCGGAACGATTTTGAACAAGGGAATATAGACACT
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ATGGCGTGATTCATCGGGCGTTAATGATGATTGGTTTGTGGAATATATTA
AAGTAAGACAATACACAGTTGGTAAAAGTGATAACTCTACAGACCAGAAT
GGTAATGTGAGTGTGAATTCTACAGAACAGTTTAAAGACATTGACGGAAA
TCACATGAAAGAGACGAACCAAAGTACAGGATCTTTAAGACAAAAAGTTG
AGTATGAATATCCGTTCCCGATAAACCGATGGATTGAACCGAATCGGACT
TACACATTTACCATCTATGATTCGTTGTTACCTCAAGATGATAAAAACCC
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AAGGAGATTGCGGTGAAGCCCCTAAACAGGTTTCGAGCCCGCTTAGCAGA
GATCAGTAAGGAGATCAAAGAACGCAATGCGAATATGAAGGACCCTTATC
CTTATTTGGACCCTGAAGAAGTTCCAAACGCTATCAGTATTTAAGCTGAG
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CTCCATCATGGTGGTGACAAAGATTTTGAGTGATCGAGGTACCAATGGTC
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GTTGAAAAGGCGTTTTCGGTGACGGCAAATTTGAACAACTGGACGATTTA
ATCAAGACAGTCACTTCCGTTATCTACCTGAGTAGTGTTGCACACGCCGC
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CCATTCTGAATGGAAAAGCGCCAAGCTCAAAGAATCCACCGAAAAACTGA
CGGACGATTTTGAAATCCAACAATGGGGTGCTTGTCTTACAAACTGTGAT
ACTGGAGTCGGTATTAAGATGGAAAGATTGGCGTTTGGATACTGATGGTT
GGTTACCGTCGGAGTTGAAGAAACGTCAAGTCGACGATGATGAACGGTTG
ACAGGCTACATGTATCGAAAAGACGCGTCGACTCTACATCAAGCTATTTG
GGATTATGTTTCAGAAGTTTTGACTAATATTTATGGAGTTTGGCAGTGCA
GAAGTTGTTGTCACCTGAAGGTTGGATTGATATCACCATGACAATGGGTG
TATCTGGCCTCTTCCAAATATTGAAGAAAAAGATTCACTCACTTGGTATG
TGAATCAATCTGTATTTCAATCCATCGAAGTTTATCACCCTCGCATCCAG
TTTTTCGACTTTTGGGGCCCCATTTTCTCTACCTGATCGCTATAAACAGA
TCTTTTTACCAAGTGATCCTGAGTACACATGGATGTTGGCGAAAATGTTT
TTCAACAATGCTGAATGCTGCTTACATCAAACTTGCACACATTTGGATTT
GTCCAGCCATGGCATTGTTTTACGACAAACCAGACGGAACATTATTACCG
ATCGCCATTCAACTTTTCCAAGAACCCGCTGAGAATAACCCTTTTTCCAG
TCACCGGTGAAATGGCGGACCCTCTGTTAGAAGAGACATCCTTAGAAGAA
GCGCTTAAAGACCGTCGTATTTACATCATCAATCTGGACGTCTTGAATGA
TATTATTTGTAAAGATTGTCGCACGGGTTATTACAATTGGAAATCGGACG
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TTGTGCACAGAAATCCCTAAAAATGGGATATTGTTGGTAAAAAGATGCGT
CTACTCGCGCAAAAGAAATTCTTGAAACTTCGAACATCTTCAAAATGGGA
GAACTTGGATGCTCTGGTCGATGTTTACAAAGGTTCATTTGGAATACCAT
ATATTGATGTTCTGCCAAGAGAAGAAAGTTTCAGTAATGATTATAAGATG
GGTGTAGCATTGTCAAGACGTAACGTTGATTTTGAACTAATTTGTAAAAC
TGGAGATGTCAAGGGGGCTGGGACAGACTCCAACGTATATACTGTCATCG
TCGATGAGGATGAAGATAAATCGCGGAACGTTCTGTTAGATTGTAATTGG
CGGAACGATTTTGAACAAGGGAATATAGACACTTTTAAAATCCGGAACGT
GCCAAATTTAGGGCGTGTCAAAAGTATATTATTATGGCGTGATTCATCGG
GCGTTAATGATGATTGGTTTGTGGAATATATTAAAGTAAGACAATACACA
GTTGGTAAAAGTGATAACTCTACAGACCAGAATGGTAATGTGAGTGTGAA
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TGATTCGTTGTTACCTCAAGATGATAAAAACCCAGACCAAAGATTTAAAG
AACTTGAAGAGAAAAGAGAACGTTATGGATTGAAAGGAGATTGCGGTGAA
GCCCCTAAACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13911MSTRG.13911Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13911.1.p1MSTRG.13911.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13911.1.p1.exon14MSTRG.13911.1.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon13MSTRG.13911.1.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon12MSTRG.13911.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon11MSTRG.13911.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon10MSTRG.13911.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon9MSTRG.13911.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon8MSTRG.13911.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon7MSTRG.13911.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon6MSTRG.13911.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon5MSTRG.13911.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon4MSTRG.13911.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon3MSTRG.13911.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon2MSTRG.13911.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13911.1.p1.exon1MSTRG.13911.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000113_pilongenomesc0000113_pilon:879722..900615 -