MSTRG.13906.5.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13906.5.p1
Unique NameMSTRG.13906.5.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000113_pilon:864676..876536+

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13906.5.p1 ID=MSTRG.13906.5.p1|Name=MSTRG.13906.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11861bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:864676..876536+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTACAAAGGTTTTCATAATGGTGTATAAAGCCTGGGacacgatttcaaa aacgttGTACGGCAAACGAGTTACCGTGGTACGAAAACATAACCATCGTC AGAAGCGACGTACCAGTCAGAAAAGACGTATGTCACAAGCTATGGAACGT TCCTCTATGGCTGTCTTACAGGTTACTCTATTGTtctagtgtttttttat ttttttgttttctttccgagcatcatatcaggcacattactagtctgaat cgcggacctctacaaaaccccaggtagtatataaggagcacgaatccgtt agtggatgcgaGCAGCCTAGCACATTACGCAATTTATACACATTTGTAAA GAACACATCACTAGCtttttttACATCGGCTCTTTATCCGCCGATGCCTT ATTTTGAGCTTACGCCCATTTAGGGCCGTTAATAAATAACGACTAAACTT GTTAAAATCAATAACAGGCTTTAAATACTGAATATTGACTTTAATTGGCA ATAAATACCCTGCTTTGGTCGCTACTTTATTTATAGCTGAAAAAGGACCG AAAGTCAGTATCTCTTATATAGTTTCTGGGATCTGAGGTTGTGGTTGTTC TTAATCTGATCTTGATTTTTGGCTAAATGTCAGTCTTGCTCCTATAAAAA CGTGTTTACTCGATAATTTAACGACTGTCCGATTCTACTACTCAGAATAT CTTATTTACAGGGCCGGCGAATCAATTTTGAAAGTGGAGGGGCCAAATAG TAAGTGTCTAAGGAGGCGCCACCATGGTTGGTTGGTTTTTTTTTTCTTAG CAAAAAAGTGGGGGGCCATGGCCCTGATTTACAATCCCTGATGTTATATA GTAAATTATTCTTCTATATTTGATACATCTAGAACTTTAAATGCAATGTC GGTGTATATTTTCCAGCCCTTTATATCAATCAAaaatacccccttctcac 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GCCATATTGATCTAGGCTATTTACTCGCGCCTTCAAGTCTATCAAAAATG AACCCCGGGCTGATGTGCCCGATTAAAGAGAGGAACGGATATTATGTTAT AGAGTAAAATCCTCAAACCTCTTTTTATCTCATCTGGCTTTAGAATAATG GGTTAGAAAACCTATAAGAATCTAGAATTCCAGAAGGTCAGGCTGATCTA ACAGGCTGCATACGTTACAAAGATTGAACTGAAccttttgaaaatatctt ttctgCTTTCCTTTCAATGttaagaaatttttactttattttatttattc atagACGACCACGTTGATCGGTTTACTGAAGACGGCGCGTTTGCTACGTT TGGTTCGCGTCGCACGGAAGCTAGACCGTTACTCAGAATACGGTACCGCC CTTCTCATGTTACTAATGTTTGGTTTCGCCCTAGTGGCGCATTGGTTAGC CTGCGTGTGGTACGCCATTGGAAATTTTGAACGCCATCAAGTCCAAGAAA TGGGATGGCTTTATAAGTTAGGTATCAATACAAATCAACCGTATAACCGG ACAGATTctaacagtggaccggacattcAAACCAAGTATTTGACAGCTCT GTATTTTACATTATCAAGCTTGACAAGTGTTGGGTTTGGAAATGTATCAG CAAACACCAATAGCGAGAAGATATTTACCATTGCTGTTATGCTAGTCGGA GGTTAGTATGTTAGTAATAACATTAAGTTGAAGGTCTTTTTTAGGACGTG TGACAAAGTTTTAGCGCTGCGAAACCTACTTTTGTTTATGGTCTATTTCC ATGTGCAAAGGGAAAGTTCACCACTTCCTTCAATTCTATCGGCCTATTTG AATGAAGAGTGTATTTCAGACACATTTTTGGGATTAGGTAAATGATTAGG ACccttaaaaattatttgtaaCATGGATAAAATCGTAGACGATTTCCAAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:864676..876536+

>MSTRG.13906.5.p1 ID=MSTRG.13906.5.p1|Name=MSTRG.13906.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=17031bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:864676..876536+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTACAAAGGTTTTCATAATGGTGTATAAAGCCTGGGacacgatttcaaa
aacgttGTACGGCAAACGAGTTACCGTGGTACGAAAACATAACCATCGTC
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GGGTTTGGAAATGTATCAGCAAACACCAATAGCGAGAAGATATTTACCAT
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GTTCCGTGGTTGCACTCCAGGTTGTTTGCGCTCGCTCTCCTTGAAGTTCA
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GATCAGACGACCACGTTGATCGGTTTACTGAAGACGGCGCGTTTGCTACG
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GCCTGCGTGTGGTACGCCATTGGAAATTTTGAACGCCATCAAGTCCAAGA
AATGGGATGGCTTTATAAGTTAGGTATCAATACAAATCAACCGTATAACC
GGACAGATTctaacagtggaccggacattcAAACCAAGTATTTGACAGCT
CTGTATTTTACATTATCAAGCTTGACAAGTGTTGGGTTTGGAAATGTATC
AGCAAACACCAATAGCGAGAAGATATTTACCATTGCTGTTATGCTAGTCG
GAGCATTGATGCATGCGGTTATCTTTGGTAACGTCACGGCAATCATACAA
CGTTTATATTCGGGTATGGCCCATTACCATTCCACCATGAGACGTGTCCG
TGAATTCATACGTTTCTATCAGATACCGTCACCGTTGCGGCAACGGTTGG
AAGATTATGCTCAATATGATTACTCCTATACTAACGGTATTGATATGAAC
GAGGTTTTACGGAACTTTCCTGAAGGTTTACAAGCAGACATTTCGTTACA
CTTAAACCGTCATCTTTTGTCCAACAACTTGGCGTTCCGTGGTTGCACTC
CAGGTTGTTTGCGCTCGCTCTCCTTGAAGTTCAATACAACACATTGTCCA
CCGGGTGATTACATCATTCACTATGGTGACGAAATCAACAATTTGTACTG
GATCGGCCGTGGTACGGTAGAAGTTATACAGTGTGATAGTATTATCGCTA
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CGAGTAACTGGCAAAGCAAAAGCCAGTATACGAGCCTTGACTTATTGTGA
TTTACATTCCATTTCCAAAGAAAACCTCATGCATATTATGGCAGCTTATC
CAGAATTTCGAAAAACTTTCAATGTGGATTTGCATATTACTTACGATTTG
AGAGATTCACAGCTTGAAGAAAAAGATGTCAACAGCTCAATCTTCAATTC
CTCACCATCATTCAACGCGCAACGTTTCTCGAATAACGTACGTACTACGC
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CCTCCAGCAGTTGTCAAAGTCGCATGACTAAAAATAAATGTCCAACATCT
AATAAAATAGTTGATAGTTCTTTTATCGCGACGTCACCAGTAGCTATACG
AAGAGATACACATCTTTCAGCTACGTCTCATCATAACGTTGCTGCAACGT
CGTACCACGATGGATCTTGTACTTTAGAACTGAGACGAGAAGTTGAAGAG
ATGAGAACCCATTTATTCCGTATTGAAAGTCTTTTGAAACAAGACATGAA
AAAAGTTGTCGATTTGTTAGAAGAGAAAGTGACGTCAACATCTTCGACCA
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AAGAACAACAATACCCATAATGCAACAGTAGTCAAAAATAACAATAACCA
TACTTCGATTCCATCTACAACGACATCCAATCACAACCATATCAAGGTTT
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GTTAAGAACCAATAGCTTACAAAGGTTTTCATAATGGTGTATAAAGCCTG
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CAAGCTATGGAACGTTCCTCTATGGCTGTCTTACAGGTGATGTCTTTAGG
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GGACAATTCTCCATTACTCACCATTCAAAGCCATCTGGGATTGGGTGGTC
TTATTTCTCGTCATGTATACCGCCATTATCACGCCCTACATGGCCGCCTT
CGTATTAACCAGAGATTCCAACGAGGAAACATTCGCGATGCATACATCTC
ATGCCGCTTCTGCAATCACCATAGCTGATGATCCATTGGTCATCTTAGAT
TACATTGTTGATGTCATGTTTattattgatattttcatcaacTTTCGAAC
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CATTGGAAATTTTGAACGCCATCAAGTCCAAGAAATGGGATGGCTTTATA
AGTTAGGTATCAATACAAATCAACCGTATAACCGGACAGATTctaacagt
ggaccggacattcAAACCAAGTATTTGACAGCTCTGTATTTTACATTATC
AAGCTTGACAAGTGTTGGGTTTGGAAATGTATCAGCAAACACCAATAGCG
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GGCCCATTACCATTCCACCATGAGACGTGTCCGTGAATTCATACGTTTCT
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TCACTATGGTGACGAAATCAACAATTTGTACTGGATCGGCCGTGGTACGG
TAGAAGTTATACAGTGTGATAGTATTATCGCTATACTTGGTAAAGAGGAT
TCATTTGGAGAGAACTTTGGCCTGACATACAATCGAGTAACTGGCAAAGC
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AAGAAAACCTCATGCATATTATGGCAGCTTATCCAGAATTTCGAAAAACT
TTCAATGTGGATTTGCATATTACTTACGATTTGAGAGATTCACAGCTTGA
AGAAAAAGATGTCAACAGCTCAATCTTCAATTCCTCACCATCATTCAACG
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CAGCTACGTCTCATCATAACGTTGCTGCAACGTCGTACCACGATGGATCT
TGTACTTTAGAACTGAGACGAGAAGTTGAAGAGATGAGAACCCATTTATT
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aatgatagtaataataacaataatactTCTATCAAGAACAACAATACCCA
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AAAATTAATTCTTCATCTTCAAACTCGAACAGGGTTAAGAACCAATAGCT
TACAAAGGTTTTCATAATGGTGTATAAAGCCTGGGacacgatttcaaaaa
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AGTGGCGCATTGGTTAGCCTGCGTGTGGTACGCCATTGGAAATTTTGAAC
GCCATCAAGTCCAAGAAATGGGATGGCTTTATAAGTTAGGTATCAATACA
AATCAACCGTATAACCGGACAGATTctaacagtggaccggacattcAAAC
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GGTTTGGAAATGTATCAGCAAACACCAATAGCGAGAAGATATTTACCATT
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CACGGCAATCATACAACGTTTATATTCGGGTATGGCCCATTACCATTCCA
CCATGAGACGTGTCCGTGAATTCATACGTTTCTATCAGATACCGTCACCG
TTGCGGCAACGGTTGGAAGATTATGCTCAATATGATTACTCCTATACTAA
CGGTATTGATATGAACGAGGTTTTACGGAACTTTCCTGAAGGTTTACAAG
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TGGCCTGACATACAATCGAGTAACTGGCAAAGCAAAAGCCAGTATACGAG
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ATTATGGCAGCTTATCCAGAATTTCGAAAAACTTTCAATGTGGATTTGCA
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AACGTACGTACTACGCCTTTCGATCGTCTATCGCCTAGTTACAACGGCTC
ACCTTGCCGGACGTGTACTAGCAGTGGCTTCACTAAATCAACTACGGAGT
TTTCAAGCGATGAGCGACGTGCAAGTAGACCTTTATTAGACTCGTTATCT
GAAGAAGACCCATGCTCCTCCAGCAGTTGTCAAAGTCGCATGACTAAAAA
TAAATGTCCAACATCTAATAAAATAGTTGATAGTTCTTTTATCGCGACGT
CACCAGTAGCTATACGAAGAGATACACATCTTTCAGCTACGTCTCATCAT
AACGTTGCTGCAACGTCGTACCACGATGGATCTTGTACTTTAGAACTGAG
ACGAGAAGTTGAAGAGATGAGAACCCATTTATTCCGTATTGAAAGTCTTT
TGAAACAAGACATGAAAAAAGTTGTCGATTTGTTAGAAGAGAAAGTGACG
TCAACATCTTCGACCACGCccaataaaacaaataatgatagtaataataa
caataatactTCTATCAAGAACAACAATACCCATAATGCAACAGTAGTCA
AAAATAACAATAACCATACTTCGATTCCATCTACAACGACATCCAATCAC
AACCATATCAAGGTTTTAACAACAGACAAAACTAAAATTAATTCTTCATC
TTCAAACTCGAACAGGGTTAAGAACCAATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13906MSTRG.13906Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13906.5.p1MSTRG.13906.5.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.13906.5.p1.exon7MSTRG.13906.5.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000113_pilongenomesc0000113_pilon:864676..876536 +