|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000113_pilon:545102..550983+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13888.1.p1 ID=MSTRG.13888.1.p1|Name=MSTRG.13888.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5882bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:545102..550983+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTAGTGAtttttttAGCGTcggaaaaaaagaatttactatcaaatttta
gtattttttttttaatttaggattttttattagtcgcatttgaaatattt
tggtaagtttcactttttttgaattctatatAAAGTATCCAAATAAgcat
tataaaaataataatcaaaagATGGATTTGTGGGTTCTAGTGCATAATTA
ACATTATTTGGTTGCTTTTTGGACTTGAAATTTTAATGGCGTTTGAGTTT
TAAAGCTATCGTTATGCGGAATCATGTTAGGCAAAAGATcgagttttaaa
tttttattttttagcaaatATGTGGCGACTAACCATTTTATTGGTGGCTC
TATGCATCTTCACTGCAAGCATCGAAAGCAGAGCTTTGAAAGGTATGTTA
CATTTTGAGCTTCATTATCATTACAaaattacacccccttctctcTGGCC
CACTGAGACCCCTTTCCAccggaaaaattggccaaaatatcgtccccggt
ggaaaatgaTCCTCCAATCTTTGTCCccaatgaaaataatcaaataaact
aaccctcactgcaaaatattatgttatttcaccaccactgaattttctga
cttaaaaacaaaagaattgaaactcCCAGCCATAGAAACATGGGAacatc
aatccccattgagtttgaGTTCGTTTCTATCCTACCGGGTCTATGATAAG
GGGGTGTGAAATTGTTCAACAATCCATGAAAAGATTAATAGATACCCTGT
CCGAAACGAAATAAATGGATCCGGTTCGTTTGGACCAAATGTCCGAAATG
AAATAAGTGGGAGGACTGTATGTTTCTTTTAGatgtttcttcttctctat
cTAGTTTCGTACTAATCATAATTTACAAATGCCGCGCTATTTATATATCC
ACGTGACCCTACTGGTCACGTGGTCAAACTGTCAATCATAATTTCTATTC
CACGACATACCCTGTCTCGACAAAAAGCGTTGCaagttttgtattttatt
ttgagTTTCAAATATTGCTTTCCTGTCTGGTCTTACCGATACTCAATCAA
TCATGGTTATTATGAAATCTAGGAATTGAAATCTCAAGAAGTATTGCTCT
TGAACGAAAAAATATAACTATAAAAGTATTATCTCGGTGGATAAATAATT
CTGAGTGGATGAATTCAAGACATACAGTAGGAATTTAAAagcaatgtatc
aaaatgtACAGACTGTCCGATTTTCGGAGCTAAACTTTACTTTGTCTATT
CCATGAGAAAACTGAACAATAGTGGTAACTTTTTCCGTCGAGTTTTATTT
CTATACTACCAtttttttCGTAAAGGggattgagtttgaagcccgaaggg
ctagaaaaGAATCTCTAccctaacctttcccaggcaagaaaaggtgaagc
cacttattacttcccatccagaacgcacATAGAACGCGCCGAAATGATGG
TGACGAATTGTATCTGTCGACgaattgtattttttgaaatctagcgatag
attttactttcaatctggtgtttgtgtaaaaaccacgcgcaggcgttctg
gaagggaaataagtggcttcatttcccatctaggagtctcgagtctagcc
cttcgaggcttggaagtcaatggggAATACCTTTAAAATGCTCAAGGATA
AACGTGACCCCTCTAATTCTTTACTtatcatttgatttgatttactCTTT
CAACGAATTGTATCTTCTTTCAGCCTCACATTCGAAATCACACCAACACG
CTTCACATGTCACCAAATCTGAGAAAGCAGACAAAGGGCCTGGAAAGAAA
GgtataaatttgttttttattgcaataaatcaagttttgtttgtAATGGA
AATCGCCTGGATTTTCGTCTTACGTCTTACCTTTTGATGTCTTCAATTTA
AATTACATGCTTAAGTGAAGGGCAACTTTAATCACTTCCAGTTCAAATCT
CAACATGATTTGTTTACCTTTTAATCCAACTTAATTTACAAACTCCGGAC
CAGAAAGCCTACTGTGTTTTATTTACCCGGGAGAAGGTTCGGgtacttgc
caagtgaaccgtaccgagtgggaattgaaccAGGGTTGCCCGTGCAGCAA
CTAAAGGTAATAACCACTATACCAAAACGTCATTAATAAACTTCCTAATG
CTTCATAAAAATAGAATACccttttttgaccattttagcGGAAGTGCACG
CAGCCAAAGTGAGCGAAGAAGATGATGATGAGGATGGACCAGCTGAAGAA
GCTGATGAAGATGCCAGTATCAATGAAGATAATGGATCTGCTGCTTCTGC
CAGATCTCCAGTTATCCTCCCTCCTCCAATGCCTTCAAACAACCAAGGTA
GATATTATATAAAGAGTATAGATAAGAGTTAAAGAGCTCGATTTAACCTC
TTGATGAAGGATAAATGAAGTGTAGTAAAGTAAACTTCAATCGATATTGT
TCAATAGAATCGAAGAGTAATCCATTCCTGTATTTCAGTCTTTGCGAATC
TCCTACAACCACTTAATTTTAGAGCTTCAACATGATAAGACTTTCTTAGA
TTTTTCTAACTATGTAAGCCAAAAAGATTACAAGGTTGAAAATTAGTTGA
AAATGATAGTATGAAAGGAAGTTTATgagaacacccctgtgtcacagtcc
cggtgggatttttttccCACAATGGGGGTAAAGATTTATCGACGTCCCAA
Tggggattgaaattctattgttgcaagcttaaaatatccagtggggatgg
ttttggagtgcaatttatgacattgaatttcgaatgggaatgaaattaaa
gtcaatttcccagtggggctgaaattatagAGTATATTTCTTAAACAGTG
AGTTGGGgccccaccgggtctgtgacacaggggtgtatgagAACTTCTTA
GCTTACCATATTAATACAAGACAAAATTTGCTCATAAAGATGGAGCCATT
AATCGAGCTAAAGTTACGAGGAATCAGAAAAACAACTTTAGCTTCAGAAG
TATAGATTATTAAGAGTTTCCTTTCTACTTTTTATCCACTTAGGTCTTGA
TATAAGTAAAAACCCCGAAGCCATTGCAGCAGCAAGTAATTTACGCCAAG
CCATTCATGATAGTCTGGGTGAGCAACACATACACATCACATACACATTT
CTTAAAATGATTTAACTAAAACAAACGGCCATTCAATGTACATAACGTTT
ATAAATGTACGTAAAAATGAATGTTCATACATATACTACACTTTGGAACA
AAAACTGGCCATCGGACTTTaaattctttcaaaactttCCATTTTTGAAC
TCgattattgaaaaacaaaacagacgAAAAATGACATtccatttttcttt
gattttgtagGCAAATTAGCCAGAGCTGAAATAGACATGCACAAAGCAAT
CGTTAACCCAAACAAAAAACAAGATGGTATGTGTTGCTCACTGTATACAT
TGGTACCTTATTAACATTACTAAGATCCACTGGGATTAATATTGATCTAA
AACTAGGTGACAGATGTTTggtcaatttctttttctcttgGTAGATGTCT
TATCCCTGTTTTTCAAGATAATAGAATTGTTTTATAAAGCTTTACTATAC
CAATTTATTTGTCTCGTTTAATTTTTAGTCCGACCACCACCACAACGTGC
TTTGAAATGTCCACAACCATGTCCACAAGATTGTGCCCAATCTGGATGTT
CACCAAGCTGTTGTATGTCTGGTatgccaatgccacaacaacccatgatg
atgcctatgccaatgatgatgcctggaatgatgccTTCGTGCCAACCAGG
ATGTATGCCACAAGGATGTGCCCCACCAGGATGTATGCCACCTCCACCAT
GCTCACCACCAGGTTGTCAACCACCAGCCAGCTGTAATCCTGGATGCGTC
CCACAACAGCAAGCTATGATGCCTATGCAAATGGCTCAACAAGCTTCTTG
TCAACCAGGATGTATGCCACAAGGATGTGCTCCACCAAGCTGTATGCCAC
AAGCCTGTATGCCACCAAGTTGCATGCCACCACCAAGCTGTAACCCTGGA
TGTGTCCAACAACCAGCAATGCAATTCAAAGTCCAAGTTTTACCTCCACA
AATCTTCCAATTGCCAGCTGCACAAGCTTGTCCACAACAATGCCAACCTG
GATCTTGCCAAGTTGGCTGTCCAACATCTTGCTGTCCACAACCAGGAATG
ATGCAACCTCCACAAATGATGATGATGCCTCCACAAATGCCGGCTGGATG
TAACCCAGCTTGCCAACAAAGCTGTGCACCATCATGCCCACGTCAATGCT
GTCCACAAACTCCACCAATGATGGCTCCACCACCAATGCCAGCAGGTTGC
GCACCATCCTGTGCACAACAATGCAGTGCACAATGTCAACAGCAATCATG
CTGTGGTGCTGGTatgcaacaaccaatgatgatgcctgctccaatgatga
tgccagctccaatgccaatgcaaatgcaatCTGGATGTCCATCTCTTTGC
CAACAACAATGTGCTGCACAATGTCCAAGAATGTGCTGTGGGCCAGGACC
AGCTGGAAAATAGATCTTCACCAATAGTTATTCTAATGAGATGACTTAGT
AGATAAATCTCTACTTGGTAAAATACGATCATGGACTGTCAATGAATAAC
ATCTTTGTAAAGACGATTTGATaggattttttatttcagactCTCCAAAT
TCTTCCGAATCTGTTAGATTGAAAAACACTTTTGTAGATTCTTAAAACTg
aagttttcaaatttaccAGTAGATTTTGCCATAATACTGTCGTGTTGATC
TGTTAATTTGTCACGTGTCTTTCTTTttgacaaaacaaaaagtaGGTAGT
AGGCTTTCCAAATGAATTATTAtagttatttttttgtatatttaataaaa
actatatattagttctatttatactgagacgattaatttgtatgcgacga
gcaatttagaaaatgagcattatggaggagtgtactttccattcaggttt
caataaataggatctcctccacagatcacattttacaaacttctcgtctc
agacgatttttccgtctcagtataaatggaactattatttatttttttgt
gaaagaattaaaatatatctaaacaactttttaaaagtttctacTAACAC
GCAcgtttcacagacccggtaaaGCTTCCACCCAAATGATTTTCCCCGTT
GAAAAATGATCcaaaatttcaaccccactgagAAATTACCTTATCATTTG
TATCCCAATGGGAAATTgaatggaaatgaaaatgaaaattgcacCCCAAA
ACCATTTCCATGGACTCTTCCACGATCggtgacgaaatacttggcacaaa
aaggaaatccaccggggtgttttgaaaccacaatcgatttgcaagtgctt
tATAGTATGTTGGAagtgtagagttttaacgctagacttaggaggacctt
aggatctgaagatccaaaagttcaaaaggccccctcaaaaatggtccagt
cgggcttgaaatatagcctagaaatcaataaatccctcccatcaaaataa
tcgttgaaatcaagttgaaggcctgaaattgacattctcgctcgaacttc
aattttcgaaaaatggtaaatcagccaaaagtgccaatatgttattgCAC
CGATTGCAgatggaaacaatagattttctatccccaccCATTGGGATTTG
GATTGCAATTTTCATTCCCACTGAGGGCGAAActccaccgggtcactgag
agaCAGGGGTATCTTCTAGAAGTAGAATAGGAAACTAGTGAACTTTATAA
AAAACTTCAGGAGAAAAATAACATACGGATGAAAGGTTTATTAGTCTGGA
AATCTACACAGACCACTGTCTCACTAATCGTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:545102..550983+ >MSTRG.13888.1.p1 ID=MSTRG.13888.1.p1|Name=MSTRG.13888.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4980bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:545102..550983+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGGCGACTAACCATTTTATTGGTGGCTCTATGCATCTTCACTGCAAG
CATCGAAAGCAGAGCTTTGAAAGCCTCACATTCGAAATCACACCAACACG
CTTCACATGTCACCAAATCTGAGAAAGCAGACAAAGGGCCTGGAAAGAAA
GcGGAAGTGCACGCAGCCAAAGTGAGCGAAGAAGATGATGATGAGGATGG
ACCAGCTGAAGAAGCTGATGAAGATGCCAGTATCAATGAAGATAATGGAT
CTGCTGCTTCTGCCAGATCTCCAGTTATCCTCCCTCCTCCAATGCCTTCA
AACAACCAAGTCCGACCACCACCACAACGTGCTTTGAAATGTCCACAACC
ATGTCCACAAGATTGTGCCCAATCTGGATGTTCACCAAGCTGTTGTATGT
CTGGTatgccaatgccacaacaacccatgatgatgcctatgccaatgatg
atgcctggaatgatgccTTCGTGCCAACCAGGATGTATGCCACAAGGATG
TGCCCCACCAGGATGTATGCCACCTCCACCATGCTCACCACCAGGTTGTC
AACCACCAGCCAGCTGTAATCCTGGATGCGTCCCACAACAGCAAGCTATG
ATGCCTATGCAAATGGCTCAACAAGCTTCTTGTCAACCAGGATGTATGCC
ACAAGGATGTGCTCCACCAAGCTGTATGCCACAAGCCTGTATGCCACCAA
GTTGCATGCCACCACCAAGCTGTAACCCTGGATGTGTCCAACAACCAGCA
ATGCAATTCAAAGTCCAAGTTTTACCTCCACAAATCTTCCAATTGCCAGC
TGCACAAGCTTGTCCACAACAATGCCAACCTGGATCTTGCCAAGTTGGCT
GTCCAACATCTTGCTGTCCACAACCAGGAATGATGCAACCTCCACAAATG
ATGATGATGCCTCCACAAATGCCGGCTGGATGTAACCCAGCTTGCCAACA
AAGCTGTGCACCATCATGCCCACGTCAATGCTGTCCACAAACTCCACCAA
TGATGGCTCCACCACCAATGCCAGCAGGTTGCGCACCATCCTGTGCACAA
CAATGCAGTGCACAATGTCAACAGCAATCATGCTGTGGTGCTGGTatgca
acaaccaatgatgatgcctgctccaatgatgatgccagctccaatgccaa
tgcaaatgcaatCTGGATGTCCATCTCTTTGCCAACAACAATGTGCTGCA
CAATGTCCAAGAATGTGCTGTGGGCCAGGACCAGCTGGAAAATAGATGTG
GCGACTAACCATTTTATTGGTGGCTCTATGCATCTTCACTGCAAGCATCG
AAAGCAGAGCTTTGAAAGCCTCACATTCGAAATCACACCAACACGCTTCA
CATGTCACCAAATCTGAGAAAGCAGACAAAGGGCCTGGAAAGAAAGcGGA
AGTGCACGCAGCCAAAGTGAGCGAAGAAGATGATGATGAGGATGGACCAG
CTGAAGAAGCTGATGAAGATGCCAGTATCAATGAAGATAATGGATCTGCT
GCTTCTGCCAGATCTCCAGTTATCCTCCCTCCTCCAATGCCTTCAAACAA
CCAAGTCCGACCACCACCACAACGTGCTTTGAAATGTCCACAACCATGTC
CACAAGATTGTGCCCAATCTGGATGTTCACCAAGCTGTTGTATGTCTGGT
atgccaatgccacaacaacccatgatgatgcctatgccaatgatgatgcc
tggaatgatgccTTCGTGCCAACCAGGATGTATGCCACAAGGATGTGCCC
CACCAGGATGTATGCCACCTCCACCATGCTCACCACCAGGTTGTCAACCA
CCAGCCAGCTGTAATCCTGGATGCGTCCCACAACAGCAAGCTATGATGCC
TATGCAAATGGCTCAACAAGCTTCTTGTCAACCAGGATGTATGCCACAAG
GATGTGCTCCACCAAGCTGTATGCCACAAGCCTGTATGCCACCAAGTTGC
ATGCCACCACCAAGCTGTAACCCTGGATGTGTCCAACAACCAGCAATGCA
ATTCAAAGTCCAAGTTTTACCTCCACAAATCTTCCAATTGCCAGCTGCAC
AAGCTTGTCCACAACAATGCCAACCTGGATCTTGCCAAGTTGGCTGTCCA
ACATCTTGCTGTCCACAACCAGGAATGATGCAACCTCCACAAATGATGAT
GATGCCTCCACAAATGCCGGCTGGATGTAACCCAGCTTGCCAACAAAGCT
GTGCACCATCATGCCCACGTCAATGCTGTCCACAAACTCCACCAATGATG
GCTCCACCACCAATGCCAGCAGGTTGCGCACCATCCTGTGCACAACAATG
CAGTGCACAATGTCAACAGCAATCATGCTGTGGTGCTGGTatgcaacaac
caatgatgatgcctgctccaatgatgatgccagctccaatgccaatgcaa
atgcaatCTGGATGTCCATCTCTTTGCCAACAACAATGTGCTGCACAATG
TCCAAGAATGTGCTGTGGGCCAGGACCAGCTGGAAAATAGATGTGGCGAC
TAACCATTTTATTGGTGGCTCTATGCATCTTCACTGCAAGCATCGAAAGC
AGAGCTTTGAAAGCCTCACATTCGAAATCACACCAACACGCTTCACATGT
CACCAAATCTGAGAAAGCAGACAAAGGGCCTGGAAAGAAAGcGGAAGTGC
ACGCAGCCAAAGTGAGCGAAGAAGATGATGATGAGGATGGACCAGCTGAA
GAAGCTGATGAAGATGCCAGTATCAATGAAGATAATGGATCTGCTGCTTC
TGCCAGATCTCCAGTTATCCTCCCTCCTCCAATGCCTTCAAACAACCAAG
TCCGACCACCACCACAACGTGCTTTGAAATGTCCACAACCATGTCCACAA
GATTGTGCCCAATCTGGATGTTCACCAAGCTGTTGTATGTCTGGTatgcc
aatgccacaacaacccatgatgatgcctatgccaatgatgatgcctggaa
tgatgccTTCGTGCCAACCAGGATGTATGCCACAAGGATGTGCCCCACCA
GGATGTATGCCACCTCCACCATGCTCACCACCAGGTTGTCAACCACCAGC
CAGCTGTAATCCTGGATGCGTCCCACAACAGCAAGCTATGATGCCTATGC
AAATGGCTCAACAAGCTTCTTGTCAACCAGGATGTATGCCACAAGGATGT
GCTCCACCAAGCTGTATGCCACAAGCCTGTATGCCACCAAGTTGCATGCC
ACCACCAAGCTGTAACCCTGGATGTGTCCAACAACCAGCAATGCAATTCA
AAGTCCAAGTTTTACCTCCACAAATCTTCCAATTGCCAGCTGCACAAGCT
TGTCCACAACAATGCCAACCTGGATCTTGCCAAGTTGGCTGTCCAACATC
TTGCTGTCCACAACCAGGAATGATGCAACCTCCACAAATGATGATGATGC
CTCCACAAATGCCGGCTGGATGTAACCCAGCTTGCCAACAAAGCTGTGCA
CCATCATGCCCACGTCAATGCTGTCCACAAACTCCACCAATGATGGCTCC
ACCACCAATGCCAGCAGGTTGCGCACCATCCTGTGCACAACAATGCAGTG
CACAATGTCAACAGCAATCATGCTGTGGTGCTGGTatgcaacaaccaatg
atgatgcctgctccaatgatgatgccagctccaatgccaatgcaaatgca
atCTGGATGTCCATCTCTTTGCCAACAACAATGTGCTGCACAATGTCCAA
GAATGTGCTGTGGGCCAGGACCAGCTGGAAAATAGATGTGGCGACTAACC
ATTTTATTGGTGGCTCTATGCATCTTCACTGCAAGCATCGAAAGCAGAGC
TTTGAAAGCCTCACATTCGAAATCACACCAACACGCTTCACATGTCACCA
AATCTGAGAAAGCAGACAAAGGGCCTGGAAAGAAAGcGGAAGTGCACGCA
GCCAAAGTGAGCGAAGAAGATGATGATGAGGATGGACCAGCTGAAGAAGC
TGATGAAGATGCCAGTATCAATGAAGATAATGGATCTGCTGCTTCTGCCA
GATCTCCAGTTATCCTCCCTCCTCCAATGCCTTCAAACAACCAAGTCCGA
CCACCACCACAACGTGCTTTGAAATGTCCACAACCATGTCCACAAGATTG
TGCCCAATCTGGATGTTCACCAAGCTGTTGTATGTCTGGTatgccaatgc
cacaacaacccatgatgatgcctatgccaatgatgatgcctggaatgatg
ccTTCGTGCCAACCAGGATGTATGCCACAAGGATGTGCCCCACCAGGATG
TATGCCACCTCCACCATGCTCACCACCAGGTTGTCAACCACCAGCCAGCT
GTAATCCTGGATGCGTCCCACAACAGCAAGCTATGATGCCTATGCAAATG
GCTCAACAAGCTTCTTGTCAACCAGGATGTATGCCACAAGGATGTGCTCC
ACCAAGCTGTATGCCACAAGCCTGTATGCCACCAAGTTGCATGCCACCAC
CAAGCTGTAACCCTGGATGTGTCCAACAACCAGCAATGCAATTCAAAGTC
CAAGTTTTACCTCCACAAATCTTCCAATTGCCAGCTGCACAAGCTTGTCC
ACAACAATGCCAACCTGGATCTTGCCAAGTTGGCTGTCCAACATCTTGCT
GTCCACAACCAGGAATGATGCAACCTCCACAAATGATGATGATGCCTCCA
CAAATGCCGGCTGGATGTAACCCAGCTTGCCAACAAAGCTGTGCACCATC
ATGCCCACGTCAATGCTGTCCACAAACTCCACCAATGATGGCTCCACCAC
CAATGCCAGCAGGTTGCGCACCATCCTGTGCACAACAATGCAGTGCACAA
TGTCAACAGCAATCATGCTGTGGTGCTGGTatgcaacaaccaatgatgat
gcctgctccaatgatgatgccagctccaatgccaatgcaaatgcaatCTG
GATGTCCATCTCTTTGCCAACAACAATGTGCTGCACAATGTCCAAGAATG
TGCTGTGGGCCAGGACCAGCTGGAAAATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:545102..550983 + |
|
