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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000113_pilon:440776..444899+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13878.1.p2 ID=MSTRG.13878.1.p2|Name=MSTRG.13878.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4124bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:440776..444899+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAAAACATACTTTAGCTGGATTAATTTTTGCATGATTTGATTTCAGATT
cacaattttttgcatttttttgcagaaataAAACTGGGTGTGGATTAGTG
TATTCATAAGAATATTcaTtatttaaactttttataacaaaatattttag
tgaactgtataaacataaaaacaaaacaagatggttGCTTACTGGAGACA
AGCTGGCTTGAACTACTTGCAATTTTCACGTCTGGCGTCACAAACATTAC
GAAAGTGCTTGAAACCTGAATTCCAAACTGAAGCTGTGATGCAAAAACAA
TCTGAATTGAAAATGATCAAATGGGAAGGTGGTAAACCAACTGGAGAGAC
CAAGTCAATTAAACTCTAAATTAAAAGACTAACTAAAATGGTTGAGTagg
aatttttttattgtatacatcattttgaaaaagacatgactaaaaaaaat
tgctgaaaatatattttagttttttttttgcattcctAAATATTCCCCAG
AAGAATCTGTTGTGCATTCATttacttaaaatttcaaaaagctcCTTGTC
AAAGTATATTTGAAGTATAGTATCTTTTAGAATTTGAACTAAGCTTTTAT
CAAACCTCCTAATATCCATTAATCTAAGGGTATCTAATGAAACTTCAGTA
TAACACATTGTTTAGTATAGTCTAGTCTCTGATGAGCAaagtactttttt
tcttttttttttggttttagaaAGTAAATGAAATAATTAACTTACTAGAT
TGGACCCATCCTTGAGTAGGCTGAAATATTAAAAGTCCACAATGGAAAAC
AATCTTGCTACTACAACTTTTGAGGAATGTTATTCAAGCTTTGAAGGCTT
ACCCAGCAAACTCAACGAGGTTTACATCAGCAAAAGTGAACGCATCAATC
AGTTGGTGATACTTTTCCCTGGTGATGTTCAGGTAATTGATTCAAAGTTA
CCCTAAGGGGATTAATTATGGCAAAACCtatattgacctctatgaaagaA
ACGGAAATTAAAACTGCCAAATTTGCTAGAATTACGAAATTAGTTCTCCC
CACCATTAAAATTGCCTTAATATGATAAATATTGCACTTTTCAATAATCA
GGAAAATGTTTCTAGCCCTACTTGTTATAAATTGTTTTCAGTTTTGAGGA
ACTATAACCCATGATCACTACCACAAAGCAAATATTTAAATCcccaggtt
ttttttaatccttTTTCACTTTCAAGGATCACTAAGTTTCTTTACTTTCT
CACTTTGTCACAGGAATGTTATAAAGACATGATGTTAAGACGAGATACAA
GATACAAAGAATTTTGTTACGAAAATTGTACTAAATGGTTACACCAAGTT
TTTAATGATAGTTGTATTTTCGTTGTCAAGCCATCAAGAATGCACCTTCA
CACGTTTGCTTGTTATGAACACTTCTTGGACACTAACGATGTGGGTATGC
CAAACTATAAAACGGAAGATAAGCCAAAGGCATGGTTACACTTGAGAGCG
CTCCTTCAAAGTTGCACTTCGAAATGTGAGTATAGTCTGGTATAATTCAT
CTTTTTATCATTTCAGTAGGGCCTATATCAGCctatataaataaaaatgt
tcatttaatttgcaaaagaaccttgaaataggctcttccagaaaatgttc
ataCACCCCAGGTGGAGGATATCCTTGTCCGGGGTagcgaaaatcatcaa
aatttgactggggggtaaatttgctctgtctgGGGATTGTctggggggtc
aactgatgcttgtccggggagtaaaacctgttgtccgggggctaaaagtc
actttgtccgggggtaaatcagtgaaaattgttatatcctacAccccccc
cATATAgaaatattttctggaagagcccaatcttgGAATAAGTTTCATCG
AAGGGAAATTGGTGACTCTGTCTTATCCTATCATTCTGCTGTGTGGTTTT
AATTTGACTGATTTCAAACTTTATCTTAAATCATAGATGATGCTGACAAA
ACGTGGAATGACAAACCAATATCACTTGTTTCTTTCAGTAAAGGCTGTAT
TGTTTTGAATCAGTTGGTTTTAGAATTACCATTATTAGTTGAAACACAAA
AACAGTCTCTTTTGACCAACATTCAAACGTTTTGTTGGTTGGATGGTGGT
GTACCAGGAAACAGTGGAGCGTATCCACGTAATGAAAAATGTATTGAACT
TTTATCAAAACATGTTCCAAACATTGAGGTTCATACCACGCCCTATCAGA
TGAAAGACCCTTTACGTGTTTGgattttaaaagagaaaaaacgtTTTGTA
CAGCTCTTGAAGAAATATAAAGCCGGATTGATAGACTGCTCGTATTTTGA
AAATGGCGTACCAGATTTAAATATGCATTTTAATTTGATACATAGTTTTC
GTAGATAGTATATTTTGTTATATTGGGGTGGGAATCAATATTTTAACTTG
TAAATATAGTCTTCGAAAGTTAGAAACAATTCTGGTCATCTGTGAAACCT
GATCAGACAATTAGAATATAGTTCCTGTGATCACATAACTTAAAACATTC
ATAATTAAAGCTTTTGATGTTTCCCTTTTCTGTTGCCCACTCTTCTCTAT
TGAGaatataaactttttattttatgatcGTCAAAATTTAGGGTTTAGTT
TCTGTTTTACCATACTTAAAGCAAGCCAACCAATTTTTAAATCTGATTAA
AATCAGAATTTAGACTATATAAATTACATTATCACtgcaaattgattttt
tctcttttagatTTTAATTAATGCATTGTGATAAACCTGTAAATAGATGG
CATGTGTTCAGAAATGGCTAAATTTAATACtggttttatatatttttata
aaccTGTTCAACACTACTGATGGACTTCAATGTCAGGATATTGAAAATGA
TGTCCAAATCAACGAAGAAATAACCAGTGGACGTGTCAAGGGTTTATATt
ctggtttttataaagacaTTCCAGTGGTTTTAAGTTATCCTGCAGATTTG
GAAATGAGAGATGACTTCAAGCATGGTTTACAAATGCTGATTGATTTTCA
AGAGAGTGGTTTTGTAACAGAATTGGTTGGCTATTGTTTGgatataaaaa
atttaaaggtacataATATGATTCCTAAAATGTTGGTTTGTCTAATTATT
CAGGTcAActtcagattcacattttcattttaaacgaaaattttagatga
attgttttgattacttcttgttttaaaagatttttaagtttttaatttca
aatagtACATTTGGGTTAAACTATGCAGGTTACATTAAAAAATCACACTT
AACTGAGTCTAGCGGAGTTAAAAGGTTTCTTTTAATCAAAGTTATAACTA
tttttttCTCTACAGATGGTGACGAAATATTATAAGCATGGTTCACTCGT
AAATCTTGACAAGATTCTTGAAGAATTCACTTCAGAGGAAGCGTGGAATA
AGAGACTCCAACTGGCTGTCGATTATTTATCCATTATAGAATTTCTACAT
GAGAAGTCTAGAGTCATGTGTGATAGTAGTGATTTGACAAAAACACTTAG
TCAATATCTAATCACTGACGATTTTCGATTAGTTGTGAATGATCTAGACG
CTTTACCGAGTGTATTAAATAATCAAATGATCAAGTGTGGACATAGACAA
TTATTTGGTGAGTTTGTAGCACCAGAACAACTGTGGCCTCACGATGATCG
ACCTTTTTTGGACGAGGAAATGATTGGTTATGATGAAAAGACTGACATTT
GGAAGATGCCAAAcgtgttgttgtttttattagGACGTTCTGCGTTAGCG
ACACGGACTAAAGTGTTGCTTTTTGAATTATTCGGACAGTGTAAGAATAT
CGAGCCGGCTAAAAGACCCTCGGCTAAAGAAGTGAAACAGAAACTTAAAG
ATGTTTTAGAAGGTATTAGATTGAAAATAGAGCTTTGAGATATGTACTAC
TTAAATTTGCATTGATTGTAAGAAGGAATAGTGgcgggaatttattttgg
cggatTACATATTACAtattttaagtcaataaaatacTTCTTTAATTAAT
TAAGAACAAACCCGGTTAAGGTGGGAGTTTTATTTGGGGGAGTTTGgtca
aatctgcaaaattttctttccgtg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:440776..444899+ >MSTRG.13878.1.p2 ID=MSTRG.13878.1.p2|Name=MSTRG.13878.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2475bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:440776..444899+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAACAATCTTGCTACTACAACTTTTGAGGAATGTTATTCAAGCTT
TGAAGGCTTACCCAGCAAACTCAACGAGGTTTACATCAGCAAAAGTGAAC
GCATCAATCAGTTGGTGATACTTTTCCCTGGTGATGTTCAGGAATGTTAT
AAAGACATGATGTTAAGACGAGATACAAGATACAAAGAATTTTGTTACGA
AAATTGTACTAAATGGTTACACCAAGTTTTTAATGATAGTTGTATTTTCG
TTGTCAAGCCATCAAGAATGCACCTTCACACGTTTGCTTGTTATGAACAC
TTCTTGGACACTAACGATGTGGGTATGCCAAACTATAAAACGGAAGATAA
GCCAAAGGCATGGTTACACTTGAGAGCGCTCCTTCAAAGTTGCACTTCGA
AATATGATGCTGACAAAACGTGGAATGACAAACCAATATCACTTGTTTCT
TTCAGTAAAGGCTGTATTGTTTTGAATCAGTTGGTTTTAGAATTACCATT
ATTAGTTGAAACACAAAAACAGTCTCTTTTGACCAACATTCAAACGTTTT
GTTGGTTGGATGGTGGTGTACCAGGAAACAGTGGAGCGTATCCACGTAAT
GAAAAATGTATTGAACTTTTATCAAAACATGTTCCAAACATTGAGGTTCA
TACCACGCCCTATCAGATGAAAGACCCTTTACGTGTTTGgattttaaaag
agaaaaaacgtTTTGTACAGCTCTTGAAGAAATATAAAGCCGGATTGATA
GACTGCTCGTATTTTGAAAATGGCGTACCAGATTTAAATATGCATTTTAA
TTTGATACATAGTTTTCGTAGATAGATGGAAAACAATCTTGCTACTACAA
CTTTTGAGGAATGTTATTCAAGCTTTGAAGGCTTACCCAGCAAACTCAAC
GAGGTTTACATCAGCAAAAGTGAACGCATCAATCAGTTGGTGATACTTTT
CCCTGGTGATGTTCAGGAATGTTATAAAGACATGATGTTAAGACGAGATA
CAAGATACAAAGAATTTTGTTACGAAAATTGTACTAAATGGTTACACCAA
GTTTTTAATGATAGTTGTATTTTCGTTGTCAAGCCATCAAGAATGCACCT
TCACACGTTTGCTTGTTATGAACACTTCTTGGACACTAACGATGTGGGTA
TGCCAAACTATAAAACGGAAGATAAGCCAAAGGCATGGTTACACTTGAGA
GCGCTCCTTCAAAGTTGCACTTCGAAATATGATGCTGACAAAACGTGGAA
TGACAAACCAATATCACTTGTTTCTTTCAGTAAAGGCTGTATTGTTTTGA
ATCAGTTGGTTTTAGAATTACCATTATTAGTTGAAACACAAAAACAGTCT
CTTTTGACCAACATTCAAACGTTTTGTTGGTTGGATGGTGGTGTACCAGG
AAACAGTGGAGCGTATCCACGTAATGAAAAATGTATTGAACTTTTATCAA
AACATGTTCCAAACATTGAGGTTCATACCACGCCCTATCAGATGAAAGAC
CCTTTACGTGTTTGgattttaaaagagaaaaaacgtTTTGTACAGCTCTT
GAAGAAATATAAAGCCGGATTGATAGACTGCTCGTATTTTGAAAATGGCG
TACCAGATTTAAATATGCATTTTAATTTGATACATAGTTTTCGTAGATAG
ATGGAAAACAATCTTGCTACTACAACTTTTGAGGAATGTTATTCAAGCTT
TGAAGGCTTACCCAGCAAACTCAACGAGGTTTACATCAGCAAAAGTGAAC
GCATCAATCAGTTGGTGATACTTTTCCCTGGTGATGTTCAGGAATGTTAT
AAAGACATGATGTTAAGACGAGATACAAGATACAAAGAATTTTGTTACGA
AAATTGTACTAAATGGTTACACCAAGTTTTTAATGATAGTTGTATTTTCG
TTGTCAAGCCATCAAGAATGCACCTTCACACGTTTGCTTGTTATGAACAC
TTCTTGGACACTAACGATGTGGGTATGCCAAACTATAAAACGGAAGATAA
GCCAAAGGCATGGTTACACTTGAGAGCGCTCCTTCAAAGTTGCACTTCGA
AATATGATGCTGACAAAACGTGGAATGACAAACCAATATCACTTGTTTCT
TTCAGTAAAGGCTGTATTGTTTTGAATCAGTTGGTTTTAGAATTACCATT
ATTAGTTGAAACACAAAAACAGTCTCTTTTGACCAACATTCAAACGTTTT
GTTGGTTGGATGGTGGTGTACCAGGAAACAGTGGAGCGTATCCACGTAAT
GAAAAATGTATTGAACTTTTATCAAAACATGTTCCAAACATTGAGGTTCA
TACCACGCCCTATCAGATGAAAGACCCTTTACGTGTTTGgattttaaaag
agaaaaaacgtTTTGTACAGCTCTTGAAGAAATATAAAGCCGGATTGATA
GACTGCTCGTATTTTGAAAATGGCGTACCAGATTTAAATATGCATTTTAA
TTTGATACATAGTTTTCGTAGATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:440776..444899 + |
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