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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000113_pilon:321663..334786+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13864.2.p1 ID=MSTRG.13864.2.p1|Name=MSTRG.13864.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13124bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:321663..334786+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTGGGCTTTTTCAAAAAACgtggataatttttttgatattattcTCACTT
ACTGTATTCTTATATTCCTGGTCTGTCGTTTCAAaagatcattaaaaaag
aagcaaaagtaTCGTGTTATAACATTGAAATTTTAGCTGTATTATTACTG
ACTTTAAAAGTTGTGTCTGAAGTCTGGAATGTCGAGATACTTTACCATTT
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GAAAAGTCTTGTTTATGAATGCGATCTTTCAAGCTCCCCGTCAAAGACTC
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ATCTACTATACACGACATTAATTAATCTTATCAGTCTTATAAGTCCTTAA
GGTTCCCTGCTATTGGGAGTTGTTCATACTTGTATCGTCCTCCAACGATT
GCAAAAAGTGGTTAGTGTTCGGGCCTCGCGATGAACGCCATTCTCCCAGT
GTTGTTCGAGTGCCTTCACAGCTCACTCGCAACTGTAGAGTCGCAATGCT
TGGCTGCgagctgtgattcctactccctCGCGGTAAGGATCAATTCCTAG
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TGAGATTGTTTTCTTGGAGTGTGGAACTGAAGATGAAAATGCTGTCATTA
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atagccattctattggttacattcaagtgttacgtcacttctaaccaata
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tggtcttagtaGCGATATCTTTCAACGTCATTCTTACATATTTTTGGTAT
AGACATACTAAAAGTTCTTTCGTCTAGggcggatttccgtctcagtgaAG
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TCAAAAATATGTGTTGATTTGCAGTGTAAAATTCATTTTCCGTCTCAAAc
gaaaaactttgtttttgaCCACTGCATAGAACTAAATATGCTTCATTCAC
TTAtttttttGAACTTAAATAGTCAAACCATACTTATATTCCCTAAGGGC
CTTTCTGCTGTTTTCAGATCcataatttaaataaaatttaagcTTACcac
aaatttcaaaatgtaagCTCAATGATCGGAAATTATACTTCTATTTCAAt
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taaattaaccgatgtccgtccgttcgttcgtccgttcgttcgtccgtccg
tctgttaccagcttttctcaggattggctcattagttttttttgattttt
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ttgggaaaaaatttatttgggcaaatttgggccaaaaactacctaaaaat
agggttttttggactttgtgcaaaatcctgtcattacttttttctgattt
tttgtacaaagatggagggcaagattctctaaagaatggctgaagtagtt
tttcccggaaaattcttattcgccttaaaaaacggattttcgtattttgg
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tcattatttttttctgacttttttcacaatgatgcaaaaatggcaatgcc
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ttggccaaaaactccctaaaatagggttttttggactttgtgcaaaatca
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gtaaagaatggctgaagtggtttttcccggaaaattcttattcgccttaa
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gattttcattggatttttttcttatatttggttgttttttcattcaaaaa
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tcgccggaaagacagtatttcttgaatttctggagctctacttaatattt
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ctattttccctactccccttccctcttcccctatcaacaatcaatgataa
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gttttcatttttctccttattgccttattatctagctttcatcatcaggt
aggtccattcagcatgttgcttgtttattcTGCTACGGGaagtttcatgc
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CTACTTATGTATCGAGCACTGTGAAAAACTGAAGAAATACTTACTTCTAT
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TGGTATGCATTTCCTAATGTTTTCTGCGGAAACATCCCGGTTTTTGCCAG
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aaaaaataccATGTGATAGCCTAGCTTTATACTTATTGCTGTTTTCAGCT
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tcttttctatacgctccattattcgataattaccgtcaacaagaaactct
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AATTctccttgaaaatcaaattagggAGCGTACCAACTGTATTCTGATTT
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AACCATATTGATTCCCGGAAAATTCTCCCCCGGTGAATGTCCTCTGGTGA
AGTCCCCTGGAAAATTTCCAAACAGAAAATACCACCTGGAAGATTTGACT
GAAGGTCTCGTCCAACATTTTATTTGCATCGTCGCTCCAAAACTTCATAA
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TCCTGAGTTTATTTCGACTTTTAGAAAAACACTATTCCAAAACCCTGCTC
TGCTTGCATTTAATTTAGAAAGATTCTACTacgaaaaatacaaaatcaac
aaaaaaagaattatgttaaaaactcttccggttcttgagatatttcaatt
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CCTTTGAGGCCCATTCCGTACGTACCCGATATCCTCCAGCCCTACGTACC
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TCAGAAGGTGAAGTCGTTTGCCGGCAATTAGGACTAGATTTTGTGAAGTG
GGCTGGACGCTCATATAAATATGGTAATGTTCATTTCCTAGTCCTAGTGC
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TTTAACACTTAAAGATGAAATTTGCACTTGGATTTTCCAAAagcaattga
ataattaaagGAATTTTTCTATATCTAGACTTCAGAACTTACCTTCAATA
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cgtgccttgctCGTCTTCGTGCCCTTCGTGCCTTTCGGAAAatagttcgt
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TCTAATTAGATTGGCTTTAAATCCTTAAAGTAGTTTGTGTGAGCATGGGT
ATACTTATTTGAGGGtttttttttGAGGGGGCACCAAAAAGGAAAGACGC
AAAAAAGGCTATTCAAAAACACTGATTTCAGcgcccctccccccccccct
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AAGTGTTTGCCAAGATGTCTTCCTCacgtaaataaataaaataaataata
aaataaacattATGCATAGGGACGAATGCACTTTCGAATGTTTAGttcaa
gattcgaatgttttgttttgaaaagacaggaaagacaaaaaagaatataa
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tttcgaaaggcacgaactttttttcaaaaggcacgaacttttttccgTAA
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ttttttttcaaaaggcaccaacttttttcaaaaggcacgaaggtacgaaa
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GTTAAATGtaatttttagcaattttttaatgttattgttaaagtcaattc
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CTATATTTCCGAACCCACAAACTTTACTTTCCTTTCATAGGATTGAATTA
CAGGAAACGCATGTTTGACGTTCGATGCAAGGGAAGTGAATCGGAATTAT
CGGAATGTTCATATTCCGATTATTCCCGATGTCGGTATTATGATATGGCT
AGCGTCATTTGTACACAATGTGAGTAATTGTTTGATTGTCGGTAGAATAT
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TAACAGacacttgttaaaatttacatCAAGGTAAGATTTTAAGTATGTTT
TTAATTTGCGACCGAAGTCGTACCGAAGGTCGACCATTTTTCCTTATTGT
CTACCCGAAAGTAGAAGTGGCCACCACTCTCCTCCTCGccccccccGTAT
TTCTTCACTCACCCTCACCTCTTCTCTTTAATTACTAACAAATTTTCATT
GGGGAATCAAGTAACATTTTCTAACCTTTGGTATGATTCGGTTAGGGTAT
GAACCAACAACCTTGTAAACACGCACCTTGTATCTGCTAGGTGTCTGCTG
GCTTAGCCTTAGGAATGTCAGAGATTCGATGAGCTTATAAATTTCATGTC
TGTTCTTAAAGCCGTTTATTAATGAACTCTAAAGATAACTAACTGCTCTA
CAAGCCCATaggaagcatttttattttgaGGGAGCAAAGTGAGAAGTATA
AACCGAGGGCCAGCCATGGTTTGgccccatggaaaaaaaatttgcaattc
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ATGATGCCATTGATACGAGATTTTCCAAAGCTaccaacttttggaaaaaa
cttGTTTGGGGGGCCAAATGCCCCTGTGGCGTGAGCTTACAAGTTCAAAA
TGATACGAAGACCACGTGGAATCACGTGATCTAAAAGAATAACAATACAC
AAAAGAATGAtagataaaaagataattatgcTAAATATGTGTAATTTGTA
CAAAATGACGTAATAGATTTGACAAACCTTGAGCACCATAGCTCTATCCT
GAGGGGGTTtgtctaaagaatcctgcatttactaaaaataaacaaaaaaa
gcgacaaatttcataaacaacGACAAATGTTGCCATCTACAACCCCGAat
gaaagtgactgtaccacccctacggATTCATTTCTCTTTgattatcacgg
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ctttagtgCAGGAACAGACAGCCTATACTCTACGGTTGTTATTTCTTTCA
TGAGGCAAGAATTTGCATTGACCATTTCTGGTTGAATCTTGTTAAATTCG
CTTGTGAAAGCTAACCATTATATTCCTCACTTTAGGTTCTTAAACAAAGG
AGCGGTAACATTTCGACCACACATCGATAAATCATCATGGCAATGGCACC
AATGTCATGAACATTACCATTCAATGGAAACATTCGCTATCTATGATTTG
ATCGGTAAGACATTCGATTCCGCATTGGACTGttccaaaaaatttcaata
cccggggatggacgaaccttttcaagtcaaaacaaatttcttggaaatgt
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GTTTACCCCCCTGGAAGTTTAAGAATAGCTTTTTACCCCTTGGAAACATG
AAAAAACACTTCCTTAGacctcctggaaatttttctcagttAACCCCCAG
GAAAAGTTCTCCAcccccccccTTGTATgattataaaatggaatggtcca
TTTTTGTATACTCATTTCGACAACTGTAGCCTGGGCTGTAaaccttgttt
ttatttttgatatttctgGCTTACTGCTTGGTGTTCCTAAGAGATTTACA
TTCCAATATCAGAAGTTAGCGCAGGCGTATTTTGTCGGTTGATTGTCCGG
TTGATTGGGTGACAAAGACCCAGTTATACCAAACAACTCTTTGAGTTATA
GTTTACTAAGGTTGAACGATGTCAAATACCTTTATCTATGAGCGCTACAA
TGCAACGAGGTCTCATATTTGGCTTCATTATATCCTTTAACCTCGTACCC
AATTCCTTTATCATGTAGATTTTGTTGGAAATATTTACTAAGGTACTAGA
AACACGACTGATCGATTGGTCTATTATaagttttaagaaaactttttctc
ttttcgaaTTATTTCAGATAACAACGGTTACCGTATTGCGCATGGGCAGA
AAGCCAGTTTTTGTTTAGAAGATTCTGACTGCGAACCAGGATACAAGAAG
AATTTCAATTGTACTGATAAAGGTGACCAGGGAATTACTGTCAATTGTGC
TGATAATTACAGTAATCGAATTGATTGCCAATGGATAGATGTTACAAATG
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GTTACCGAAAGTGATTGGTTGAATAATAGAGCAGTCTGTGAAATCGGATA
TTTTAATCGCGATGATATTATTGTGAGAGGTTGTACGACAGGTATGCTCT
tctattgggctcttccagaaaatgttcgtacatgggggtagaagatatag
tgtccgggggatAGTGAAAAATCCACAACATTtgccttgtccagggggta
aacttgctctgtttgggggtaattttgtaattttgctctgtttgaggatA
GTTTGGATGTCCAGGGGTCAACTGAtgtttgtccgggggggggttggacc
tgctgtccagggggtaaattttcaaaaaatgttatatcctacacccatat
tcaaaatatttctgtaTGAGCCCATTTCTATTATCTTTGATAATAGCATC
GACACTACTATCCAGTGAAGTTCCCTTCACTAATGCTAGCTTCACTGTTC
TTCTGGACAAAGCTTAAGGCTTGGTTACagatcattgagtttaaagcccg
aagggctagaggcaaaactttaacccttctcaggcaagaaaaagtgaagc
cacttatttcctacCCAAAACGCACCGTAATCATGACCACGGATTTTATC
TAGGGCCTCCttttttttgaggactgcatttttttaaatctagcgataga
tattagtttcaatccggcgtttgtgtaaatgCCACGCCTgggtgttctgg
atgggaaataaatgatttcaattcccatccaggagtctcaagtctagccc
ttcgggcttggaagtcaatgataCAGCCTGATGttctttatatagtttgt
tcttatgaaaaaaacgagTATTTATTTTTAGATCCTTGTTATCAAGAATC
GTTTGGTGGAAATTCTTTTGGTCATTGTTGTCAATTTCCATTCGTGTACA
ATGGACAATTACATTATCAATGTATACAAAAGAACAATAGTTCTGAGAAC
AATGGAAACAATAGCGAATTAAACAATGAAAATAGATCATGGTGTTCGAC
CACTAATGATTTCGATCAGGATGGAAAATGGGGATATTGTagtgaaaaaa
tctgaaaaggaaatttacatacacgtttttttaataagaacatccataat
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gttcttaaaatgttcttattttaaccattttgcgaccatttttacccatt
ttcctaggAAAACGGGTGTATTTGAGtctgcaaagctttaaaatgttctt
accttgttcttagcattttggccatcgaagccttatgttctatatagttt
gttcttataaaagaaacgtgtatgACTAACATTTTAGCCAGTAACAAAGC
TTTGCTCtccactctttttttataagaatcagtaaatTGTTCTTGAGGTT
CAgctattcttttttttcaggcaaTTTGAatcttattcttatttttaggg
aTATAACAGGCTTTATACCCgattttactactttgaccctaAACGTGTTC
CCAATTCAGAAATTCCAAGCTCACACTGCACTAAAACTGTTTTAAGAATT
GTATCATAAAGAAAAGATTGTGCCTTACAAAACACGACAGCATTGTGACA
CAGTTGTATCGTTGTTGATAGATA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:321663..334786+ >MSTRG.13864.2.p1 ID=MSTRG.13864.2.p1|Name=MSTRG.13864.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=27504bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:321663..334786+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGAAAACCTTTATTCTTATGCTGGAATAtttttttGGTGTTATGTTT CGTGGTCCAAATACATTGCAGACAAACTTATTCTTTGATTGGAGATAAAG GATCCAATGAAGGGATTCTAGTTGTTGAAGAAAATGGCAGTTTGAAATTT ACTTGTTCAAATTATTGGGGTGCACAAAATTCTAAAGTTCTTTGTCGTGA ATTGGGCTATCGTAAACATTTGGCCACGAATTCAAAGAGAGCATCTTCAA TCAGAACACTGCGGGGTCATCAGAAAACTTTTTATCCGTTTGATGTCACT TGTGAAAGCAACGAAAAAACATTGACTGAATGTCACCGCAAGTACGTCAA GAATGTAAACATCGATAGGCATTGTTGGGCGAATTCTTACGTTTATATCC AATGTGATTCACAGATAGAAGAAAGAGATAATCGAACTCTCGAAGATCCT TTTAATGTTCGGTTAATCAACAAGAATGTGGTTCAAGGTCCTGTAAGCTC TGGTTATCTTCGTATATCATCCTTTTCAAGTGATGGAGAACGTAGATTGG CGAGTGTCTGCATAGATGATTGGAGTGATGCCAGTGCCTTAGTTGCTTGT AAAAACACTGGCTTCTCTAAAGTTAAGAAATTCACCAGTTCCGTTTACAA TGATATTGATTCGAACGAAATGGCGTTCCTTAGATTCCGTTGTCATGGAA ATGAATCCATTTTAGAGCAATGTGAACATGAGACTACAGAATTTTGCACG AATAATGAGATTGTTTTCTTGGAGTGTGGAACTGAAGATGAAAATGCTGT CATTACAGAATtgAATGGTGAAATTCGTGTAAGAGGAGGTGCTTACTCAA GCGTTGGGCGTGTCGAAGTGTTTGATGGACAACAATGGGGTACAATCTGT GATGACAAATGGGATCTATTTGATGCAAATATTGTTTGCCAGCAGCTTGG TTTTGGCTCTGCAATAGAAGCGACGCATTGGGCTGACCATGGTGAAGGCC TTGGGAATATTTTGATGACAAACGTGGCTTGTAATGGCAcggaaaaacat ttgaaagatTGCATTCATTCAACGGACACCACGTCATGTACACATCGAGA AGACGCTGGTGTTAGATGTAGGAGACCTTTCGCCAACCATAAAATGCAAA TCAAACTTGTTGGTGGGAAGAAACCTACAGAAGGTCGTATTGAATTTCTG GATAGTAAAAATGAATGGAGCGGTATTTGCGGTATTGGGTTCGGACGATC AGAAGGTGAAGTCGTTTGCCGGCAATTAGGACTAGATTTTGTGAAGTGGG CTGGACGCTCATATAAATATGGATTGAATTACAGGAAACGCATGTTTGAC GTTCGATGCAAGGGAAGTGAATCGGAATTATCGGAATGTTCATATTCCGA TTATTCCCGATGTCGGTATTATGATATGGCTAGCGTCATTTGTACACAAT ATGCACCAGACCTGGTCATGGACATTCACTTATTCAAACAGAGCATCAAA GTGGATACACATCCTCTCCATCATTTACGTTGTTCCTTCGAAGAAAGATG TCTTTCACCTGAGGTGGATAATATTTGGGGTAGAAATGGTTTCCATAACA 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:321663..334786 + |
|