MSTRG.13864.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13864.2.p1
Unique NameMSTRG.13864.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000113_pilon:321663..334786+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13864.2.p1 ID=MSTRG.13864.2.p1|Name=MSTRG.13864.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13124bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:321663..334786+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGGGCTTTTTCAAAAAACgtggataatttttttgatattattcTCACTT ACTGTATTCTTATATTCCTGGTCTGTCGTTTCAAaagatcattaaaaaag aagcaaaagtaTCGTGTTATAACATTGAAATTTTAGCTGTATTATTACTG ACTTTAAAAGTTGTGTCTGAAGTCTGGAATGTCGAGATACTTTACCATTT GTTGAAagttaaagatatttttgtaCTTGAGAACGATTCTATTGATACAA GATGAGAAAACCTTTATTCTTATGCTGGAATAtttttttGGTGTTATGTT TCGTGGTCCAAATACATTGCAGACAAACTTATTCTTTGATTGGAGATAAA GGATCCAATGAAGGGATTCTAGTTGTTGAAGAAAATGGCAGTTTGAAATT TACTTGTTCAAATTATTGGGGTGCACAAAATTCTAAAGTTCTTTGTCGTG AATTGGGCTATCGTAAACATTTGGCCACGAATTCAAAGAGGTATCAAATC TCtatgtgaatttttttatcaacacGTTTTTACCCCAAGAAGGttgtgcc cccccccctttggaTGTGATTAGCTTCAgtctaaaagtgttcttaaaata tttttaatttcaccACTTTgggagtatttttgtgcaatttcctaggaaat tgggtgttttagagtccataaagcctaaaaattctttacttatttttaat gttttgaccATTTAAGCCTCGTGTccttatatggtttgttcttataaaaa acatgtatacgtTAGCTACCAatatacaaatttgaaaaaaaaatagaagt tAGTGGTCGCATTTTATTTTGATTCATCAAGGGAAAATGGATCTTGCTTT CTAAAAGACAGAATTGAACCTAAGTGTTGCATAATTTAGAAacgatttat ttttgaaagttattAAGATTTTCAGGGCTATCTAACCAAACCACAGACAC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:321663..334786+

>MSTRG.13864.2.p1 ID=MSTRG.13864.2.p1|Name=MSTRG.13864.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=27504bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:321663..334786+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAAAACCTTTATTCTTATGCTGGAATAtttttttGGTGTTATGTTT
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ACTAATGATTTCGATCAGGATGGAAAATGGGGATATTGTagtgaaaaaat
ctga
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13864MSTRG.13864Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13864.2.p1.exon1MSTRG.13864.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.13864.2.p1.exon3MSTRG.13864.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13864.2.p1.exon4MSTRG.13864.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13864.2.p1.exon5MSTRG.13864.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13864.2.p1.exon6MSTRG.13864.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13864.2.p1.exon7MSTRG.13864.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13864.2.p1.exon8MSTRG.13864.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13864.2.p1.exon9MSTRG.13864.2.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13864.2.p1.exon10MSTRG.13864.2.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13864.2.p1.exon11MSTRG.13864.2.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13864.2.p1.exon12MSTRG.13864.2.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13864.2.p1MSTRG.13864.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000113_pilongenomesc0000113_pilon:321663..334786 +