|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000113_pilon:50675..62012+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13847.14.p1 ID=MSTRG.13847.14.p1|Name=MSTRG.13847.14.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11338bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:50675..62012+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCGATTGTGAGCGGATTTATTTGTTATTTCAACTTTTACTATGTGTGCG
TGGTGAGATGAAGGTGCCAAGCCTGTTGAACGATGTCAACAAAATCACTT
GGATATCTCGACTTATAGAAAATTATTCTTTGCTTATTAAAACAACGGTT
TCTTAGAAGACTTAGaaagatataattttttttgtttttgcctttCCATG
AAAAGGACAGCAGACGAAAAGAATGTGAGTAACTTTGTGCAttctttttt
atctgaaaagtTTATGATTTTCTACAATTTTGTCTTGTCTAATAATCGTA
TAGGTATCAAATGGAAGAAAATGAAGTGTTTTGAAGTAGTTTCGTAAGTT
CTTTAACTAtttttttACATGACCAGATTTACCAAAATCGTCGTATTCAC
TTTCGACAGATTCGACAGATTCAAATCGAAAGTAGTGCCATAGCCAACCT
GAATCGAACGGCACGTGACCCAAACATAGTGTGGACAATAGCTATACTCA
AtagtgaccttttaaagaaaaaatcaagttcatACCTCTTTTAGTTGTTG
AGATACTGCCACTACTATCAGGAAAAGCCTTCTATTTGGACATTTGGATG
CATTTTTGTAGAAGATCGTTCTTTTAATTTCGAACACTTAAGGAACGCTT
TTCGAATGCTTTTAAAGGGGAGGGGGTTTCATGGGGAAcctgattctgga
attttgaatatttttttctaattccgaaattccgcaaattttgtcGCCAA
ATTCCGTTTTTcggcactaaaattgtctaattttccgtctccttCAGaaa
acccaatttccgtaatttcgtctaaatttttgccaaattccgCCACCCCG
TCCGAAAAAAGAGCCGATTCCGCCACTCTGCAAATcaggaaccccccccc
ctttaaaagatatttttgaagGCGTTCCTAAAGTGTTCGTTAAGAACGCT
CTCAGAAtgctttcaaaaaaatatcttcaaaagcGTTCCTAAAGTGTTCG
AAATGAACGCTTTTCGAATGCTTTAGAAAGGGGTTTTTTAAAAGCGTTCA
AAAAGTGTTCATATAGAATGCTCTAAGAATATGCTTTAGATAGGAGATCT
CTAAAAGCGTTCCTAAAGTGTTCATATAGAATGCTTTCCGTATGCTTTAG
AACGGAGATCTTTGAAAGCGTTCCTTAAGTGTTCATATGGAACGTTTTAC
GAATGTTTCCAGATAGGGGATTTTTAAAAGCGTTCATAAAGTGTTCCTAT
AGAACGCCTTCAGAATACGTAGAAAATGAGATCTTTAAAAAAGCGTTCGC
ACGCGGAAAGCACCGTATAGGGTGTATATAACATTTTGGTTGTTTTATGT
AGATTTAAAGGTGATAATGTTAATTTGCATAAACGACTGGTAACAGCGAG
TGTTGCGACCTTGTGAGACCTCTAACCGGACACGCAGAAGTCTGTGTGTT
gacttttcagccaaaaatctCTAACTATGGTgttgaaaaagttaaaactt
tctattttattgtactttgaaaaaatgaaaatattttctatttattttgt
tgataatcttttcccgcgctttttctaattttttttctaaagtttacaga
ctacattttttgagaCAAATCTTCGTAGAGAGAATCTTTCTCTTGCACAA
AACATAAACACTCGACATTTcacggtttgtgtaaaccgcaggttacaggt
cgcaggttacaggtcacaggttacaggtcacaggttacaggtcaacaaag
tgcagaccggaaaaaagataataagatcataacatatacataacataaca
tcaatacataacgcattaaattacaaaaaagtaatataatatacatgtta
tttagatattataaaatgacaattgaatagaataacaacctagtgacact
tacttacaaaaataatgacaaaatcataaaatatgatgcctaacgagaca
aaagcacgaaaaatatttattaaacaaaatgtgatgtggatggtgtgaat
ggataaaaaatggcaccaaacagaagcttgcaaggtccctaagagagtgg
ttttagaatgATGGAActaatagcgcaccgcgctgaatctaaaaatagat
tttatttttgacataatcattactctcgatgtgtttgtacgagttccaat
cccatcaacctttgcgctaatctcttttgcacgttaattgcatcgtttga
caaaagatatataacagcttgcacgtatctttaattgagccgcgttgaat
tgtgggattgcaactcgtacaaatatcaaaaaaagtgaaaagtaataatt
atgacgtatgtgttgcggagcgctattaattattcagttattattttaat
gtcttaatgacaattttttaaaatctgatgcaagaaaagacaaaaacacg
aaagatatttataatacagaatgtgatgttgatagtgtgaatggatataa
aacggcaccaattaGAAGCTTGttaggtccctaagagagtggttttagaa
ggatgaaactaattaatcattcaattgttattttaatgacttaatgacaa
tttttgacaaaaatattgacagaatcacataatatcatgtcttacaagag
aaaaacaccaaaaatatttagcatactgaatgtgatgataacaatatggc
tggatataaaattacaccaatcagaagctcgtgagttctctgagaaggta
gttttagagcgatgtgttttattatatgtaaccatcatataacattagcc
tagttaactaagcccgtattcacaaggctaggacacacggcttatggcaa
tatagcgtttttcggcgctttaaagattttaagtttgccttggaatagtt
attcagtcacaacttaaccattagatttatccaagtgactgaatcaaact
agcttagatttctaggctaatataacattacaaacattacaatatgtaat
atacctgttatacgtataatatggtttcaaatattttctggtctgcgtta
tacatggcgcaaactgcgaaagatcgataaaagcacatggttaaattttg
atgtttgaaatggttttatatggatgaaattgcttgagaattatgttttt
gataattctttgtgttttccaaacattttcctctgcaatgacattaatta
gagtcaacctgtcatcactgacctgtaacctgtaacctgtaacctgtaac
ctgcggtttacacaaaccgcGACATTCATCTtatgttattttattttcaa
ggatatgaaattgaaaagtcgaaaaatgtAATGAGTCAGTACTTGATGCG
TTAAGAATGTTTTGCTGGACCATGGTCTGGAcctggaatacacgggtttc
gaattaaatctggcgcgagagaaaaaatcaagtaaataaaaggagcgata
aggggaaatgccttataaaaggttgatagatttcctttcttctcttttga
aagccaggtgttcattcaaaagatgtttttctattttaaattcaataaaa
gaaatatgattaaacgattgactttttattttaatgttttttgttttcat
aatgacccataaagtctgtcaaaatggaaaattgagctaaaattgcttga
tacacggccaattttcgttctgtttacttgatatttttcgtgcaaattta
catgggatcaaagctaaagctgagcaaaaatttaattcgaaacccgtgta
ttaaaggttttctttttacataagtgtttccgtttcatatcagacacata
tttcatatcaggacagtgtcttgctattgttattggtccagcgcgcagca
gaatggacctttaaaaagcaactgatcgaaaagattttgtctttgtcgga
gCCTGCGCGCGCAATGAATTAAttaagtccaggctaaaccaaccgccgat
ctagaatttttgccctgcctaaccgcgcgatgtttgacctatgttttgga
ttgaattggtagtagagtcaaatttcccggttagattaaagggttgtttc
aggtagggtcaggtagggttagggctagggttggggatgggagttaaccc
ctggttagggttttagcccccgggtagagtttggagtaaataccatgttt
ataaggaactttgaactccttaatgcagttgtgactcgatggccgagtgg
ttaaggcgcagGCGTTCTTATCATAAgtgctttgtatatagtgggttcga
atcccatcagctgcaaaagtttcaaaatttcgggaaatgcatcaaaaact
ctCTCATCTTAGCTATAcaagtgtcaaagaatagaagctcagagtggagg
atgggaaggaaatttttttgcgtcacttaagaaggaacccggtacgaaca
acattcggttattgccacgtcagctggaccttcacgccacTCTGGCTTCT
TGTATTatactgatataagcaaaaaaatgtttttcttttcctctttctgt
ccaatcttgctccacatccgtgtcaatccaatgttaaaaagcttgtaaat
taaaattgatgagtaagcaaacgatatcactcttatttaaaaacaaaacc
tttaagataaCAAATGATTCTTTGACATTACTTGAAAtccagtttgcaga
gtgtggcACGTTTACACTTGCTTTTTCTCGAGTGCACAACTCGGAAGAAG
TCgagtgcaggtgcaaaatttgaggttttcaggtgcTCGTGCAGACGGTT
TTTTAACCCCAAGTGCAGAGTTCCGCAATTTTCTCCTCAAATGTAgctaa
tttttgcaatttttgcctttttgggccaatttccgAGGTATAGGTGCACC
TTGTCTGAACCAAATTTTATCAAGTGCGCTCTTCCAGAGCAGGAACTTGG
TATTTCCGAATTTTTCCTCGAGTGCAGccttgccatactctgcaaactgg
cttGAAATTATCAGGGGCATAGAGATATTCTGAAGTTTCTAAAGggatta
aattttaattttatttcgcCAACATTCACTTTGCGGTATATGGATTAATT
TTCCCAAGTGCAGCTCCAttttttttCGTAGAGTTTTCATTACAAATGTT
GCCATTCTTCCAGAGGATTCGCACAATTTTAGCTATCCTTTTGGCTTGAA
AAGTTTCGTCCACCTTTGAATCCAGGAGAACAATAGTCCGGGGAAACAAA
GACACCTCAGGCTAAGGCGAGTTGCCAGTCCGAGGTTGtgtcacaaaaac
aaaaacaaaagtcgaaaagtactctcgggtacctaatagccgtccccccc
cccgctaattaatttttgggaaaatgtttttgaaagtttcctcttttgtc
ctaattctgttGTATTAGCCTccctttcaaaaaatattatgttttattaa
gttttcagattttttccaaccccccccctgcttattccaatgttccggct
attaggtacccgagagtagtccctcgtagggtactTTTCTTGCTATATTT
TGGGAGAAATTAGAACCAGGCCAATCGGCTACTGTAAGTCCCCTTTAAAT
CACGGGGGTTTTTGGAATGAAAAACATGCGGATTggtttacacatttttt
ataagagatATTCTACTTACACTGGTTTAAGATAAATGGGTTTGTTGCTA
ATCCGGGCAAGATTCAAGTTATGTTTCTCGGTAGATTTGAACCTATACAG
AGTGTTACTATAGGTAATATCAAAGTCAAAGTTAAAAATCAGGTTAACTA
TTAGGTATCTATATTGATGAAAAACTACACTTTAACTCTCATGTTGAATT
ATACCAAATACCAAAAGGCGGAAAATAAAATCAGCACACTTAGACGCATC
CGCCCCTTTCTTTTTCTGAGAACGGCAAAGGCTTTAGGTCACGCTTATAT
ATTCTCAAACTTTAAACTAGTATCCGCTAATCTggataaattttgtaaaa
cacaACAATAAGCAAATTCAGAAAATTAACGTAGAGCTTTGGCTGTAGTT
CATCAAGATTATGACTCTAATCTATCTCAATTATTGACTATATTCTAAAA
CAGCATCTTTTCACATCAAGTTCATCCTTGAAGAAAtctataaaactttg
aaaaaacaaaatcatttattTCCAGCTAAACTATTTAATATTAAAACTTC
TGGCTTCAGTCTAAGACGAGAAAACAGCATATGCTACCTACAGCAAACAC
CGTCAAGTTTGGTTTGCAATCTTTGTGTTTTGTCGGATCTTTATTAAAAG
TGTTACCAGAGAATTTTTGTACTTTGTAGTTTGTACCCATTATGCAAATT
GTAGTAAATaggtatttttattttaaataagtTGGATTTTATTAGTAAAC
GGGCACGGCTGTAATTATTTAGGACATTGGGTCCTATCGTTAttaccaac
tgaaaataaattgataataattGCCCAACAgcggcttttgttgcttcacg
tagcgggcttgttcgccagaaaaatattcatgatgtcGATGTTGTTTCTT
CtgattctgagcgggccgcctCGGTTAAAAAATGCTCGCGCGCACCTAtt
gttttatctattttgttatctggcacccagatggtgaaatttttatccga
cacgctaaagctctaaaggtcgGAAAATATTTTCTACATCTGGAAGGTTA
TGattagttccatttatactgagacggaaaaatcgtctgaaacgagtagt
ttgtaaaatgtgatctgtggaggagatcctatttattgaaacatgaacgg
aaagtacactcctcctTAATGTTCGTTTTCTAAATTGTTtgtctcagaca
aattaatcgtctcagtataaacatggaggtaataaagatatagatggaga
gaaaacgtctcggtaatgaacTAAAttgtcgttgaaatcttttatgaatc
tattcaaagcggcttttctttgatgtaccatcatttttggaagcaaaaaa
catcaatttataactttataagaacagaaggagactgtttggttgatttt
gaaaaacttaattttgccgaaaatccttgttaaaatgcgattcgaaatag
tttcaactgatgtaagactaaaagagtatattaatttcatagggacacat
ttttgggctggtattttgttaacattgagagttgcatcacattatcattg
aatgtctctaatcttaaaatctccacgtctaagtgggcagcggttttcat
actctgacaaaatgatcgatacaaggttcctaatcgtaacacgtaattct
tttttaaatctatcgatggctttatgggcagcttcccctagaagtttgga
gtattgtgcttattatgtgaagtttttttcaatttttcatgacaaggcta
ttatatttcaatatacttgttaaaaatgtaatgtcttttcattcatctta
aatattcccacgagtatacccaaaattaatcatcttattcccaaagcaac
caaacagctgtttgcttccgatgataaatcagaatagaacaaaaggcatt
gactctccatctatatttttattacctccatggacacagctgattggctt
aggtttcgaaactctctattgtttcattaaaacctcagtgtccatgcgat
ttatccggagaatttcaatattcaaaccaagagcagtgctcatccCGAAG
AGAAGGAGTTTTAAACGCTcgaacgaaggaagatatgacgtagcctaaga
aaaataaagctttcAGTGTaattaatttcattgttttcatgaTACTGGaa
aaaaaGTGCTGAAAatcattacatgtttttttcttttttaagcataacgt
ttataagcatatacaggctcagtttttggtacctaaacaatgactctatt
gtttgagaacaatagaatactaagcataatgcgagcctgacatagggaca
gacacttgcttataaaaaaaacatgtatgagaTAAGCTCGTAATTACATG
ATAGCTCGTGCAATTCAAAAATTTACACACCAATTCTTTCCGGATAATTC
TTGTGATTACATAGTATAATTGGCTCGTTTAAAAGAGCAGTTTTTCAATA
TGAATCATGCTGCTCTATTGTCCTCGGGAACGACAATTTATATGTCAATG
TTTTGAATGGTACAAATTATCGCAGTCTTATATTGAATGTACTTGTAAGC
ATTTGCTTGTGTATATATACGTGTTGttgggaaataaaaaatgaaagacg
AACGTTCGTTGACAGTCAAAGATTCAAgttagttttatttatttttgagt
ttCTCAAAAAGTCTTTCAATTTCTATTCATTGGGTAGTATATGATGGTCT
AGGGCTCacattttttaattatatatttttcaccGGTTATAAAAATGAAT
ATCCTAAGAATTTTCTACCAATGTAGTTTAGCCTTAAAAACTATAGCTAG
AGTGTAGTGTAAAACAAAGGCAAAGTTTCTCCACGCTTTCAGGCTTGCAA
CAACACCTTCGAGAAAATTTGTTGTTGTGCCAAAAATGAAACAACGGTTT
TCATAATTGCGTAACTTTactaaatacacgcttttttttataagaatggt
gtaaatccatttcatcatggatattcttaacttttttggggaaatcatcc
taaaatattgttacagcattcttaggttaggatcctaattcagactagat
ttaacatttagtacatacgtctcaagcagaaaatggcatttttgtgaaag
aagtgAACCTTACTTGAGGgcaattgacaatttataatcgaaaatactct
cgggtacctaatagccgccccccctgctaattaatttttgggaaaatgtt
tttgaaagttccctcttttgtcctaattcagctgtattagcctccatttc
aaaaattttccacccaggacatttttattccaaccccccccccctcactt
attaagttttgagattttttccaaccccccggctattaggtacccgagag
taggttgTTTtgaggttttggccaattttcagttTCActcttagttctta
taaaaaaagcgtgtatttaaagTATTGCAAAAGCAATCTTTCCAAAAGCA
TCACATTTCAATCTTTCCTAACTCCTAACATTTTATCAACATCacatttc
ataaattacgtcacgaacatcacttgcctcgtattcaaacaatttctatG
GAGATTatataggaagtagttttaataaaatccgctgggagctAATCACC
AATGCaacaatttcaaaacgaggcacgtgatgttcgtaacgtaatttatg
aaaaggtctattcttttcttttttagaaatgttcGATATGTTAACACGAC
ATAGCCGTAATCGATATCGGATCATTGTTCTATCCTTAATCTTCGTCACA
TCAATATACGTTTTTCTTAATAAACGTAATTGGGCATGGTACAATCGGTC
TAGTGGGGAGAGTATTTGTGAAACACCAGAGCCTGAAATGAAGGACTTGA
TTGCACTAGCGACTGATACCCGTGACGTCTTACACGGACTGAAAATGACG
TATTTCTTGATATATGGCAGGTATGTTTATTTGAAGTTTTTCTCTCTGAT
GGTATTGAAACTTTTTTCGGATTGTTATTGTAagcttattttttataaga
aagaatatttttaaagcctttggatgttcttaactttttgggttttatgC
CTTAAATGtgatcatagtccgtataaaaaaccccggtctggaagcctttt
gtttctttctattgaaCTTGAACTTGCAttgagaaattattttattttgc
tcactttttgatcatgtgattaacttttgaaccaatcccaagaggagtat
tGGTAATGTGATccaaaactgagcaaatcgatttttatcttttgaaatta
tCAACAAATGAAAAAGTTAATAAATAGTTACACAAAAGGCTTTTAGACCA
GGGCTTTTTATACGTTCATAGTTAGAggggggggTCTtaggttttgatga
accaaaagcaagggggtgctaaaagtatgactttcttaaggggggttgcc
agttaaggggggtctttttacctaaggggggtcttcttacctaagggggg
tcttcttagataagggggatcttccttgaattatgactcttgtacaatcg
tttcatttatactgattttctaaggggagggtgtaaaattttaaatgaat
ttcataagggggttagcacttaatggggggtcctcttacctaaggggggg
ggtcttgacccctctagaaactatgaatACGGACTATATGACGTGATAAA
GTGATGTCACTGAATCCTGATGCATGGTTGTGTTCAAAAAGTCAATACTA
TAGAGAACAATATGATACGAACGTTTGAATTTCCATCATTTTTTAGCCTG
TGGGGTGCATTACGACACAATCGACCACTAGCCTGGGACAACGATTTCGA
TATCGGTTTAGTTTACGAAGAACTAAAAGATAAAGGATTAGAacaaaaac
tttataaagaacttcaaaagaaaaatatcaaaatttattatcGGTTATGG
TTCGGTACCTATCGGGTTACTCGGGATACCGCACGTGGTGATTTGATGAT
ATACCGACGAAACTATTTTGATACTTGTGTACGGTTAGGTATGGAGTCGT
GGGTTTTCTTTGTGAATTATCGTAAGTATCATCAATTCCCATGTCGATTG
ATTAAGAAACCATTACCTagtatgaaattttcaaaagtgaacTTCACGGT
ACCGAGAGAAggaaatgaaattcaaaaacatttttatccaGAAGACTGGT
GGGTTGAAAGTAAACCATCTGGTTGTTGATGATGTTGATGAAACATTCAG
AAACATTCTACGATTTTAGCTTCTTGatttttcaatgaatttaaGACTTG
AAAATGTTCAAGTATCATATGCCGGAGCAACACTGTTGTTATTCCGTTGT
TGCTAGATTTAGTTAGTTTATATTAAGTCcgaacttgatttttcaaaatg
tgaaatGAATGATTCTCTGATATAATATTTGGGCGAATATTAAACGTCGT
CGAGTCAAAGcacatttaagggctctgaccatagtcgaaaaattgatttt
agtatttgaacataaaagttatgtttaacacttttaacaaagaattgcct
ttacaaattgcttaagagtaattaaaaatttaattacaaaaatgacgcta
tgaactttaaaaagacgttaataatatgttgtattaccttcttttataaa
aagtgctaacttttgatagtttttttcaaactgttcgcaaagaagaattt
tctaaattaatgcatcaaatgttatggctgtttttctttggaaaattggg
atgaaaaattggtcaaaaagcactattttcaagattttgagacaaataag
cgtttagaaaaattttccgaaaatttaattttagttcg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000113_pilon:50675..62012+ >MSTRG.13847.14.p1 ID=MSTRG.13847.14.p1|Name=MSTRG.13847.14.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1350bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000113_pilon:50675..62012+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgttcGATATGTTAACACGACATAGCCGTAATCGATATCGGATCATTGT
TCTATCCTTAATCTTCGTCACATCAATATACGTTTTTCTTAATAAACGTA
ATTGGGCATGGTACAATCGGTCTAGTGGGGAGAGTATTTGTGAAACACCA
GAGCCTGAAATGAAGGACTTGATTGCACTAGCGACTGATACCCGTGACGT
CTTACACGGACTGAAAATGACGTATTTCTTGATATATGGCAGCCTGTGGG
GTGCATTACGACACAATCGACCACTAGCCTGGGACAACGATTTCGATATC
GGTTTAGTTTACGAAGAACTAAAAGATAAAGGATTAGAacaaaaacttta
taaagaacttcaaaagaaaaatatcaaaatttattatcGGTTATGGTTCG
GTACCTATCGGGTTACTCGGGATACCGCACGTGGTGATTTGATGATATAC
CGACGAAACTATTTTGATACTTGTGTACGGTTAGGTATGGAGTCGTGGGT
TTTCTTTGTGAATTATCGTAAGTATCATCAATTCCCATGTCGATTGATTA
AGAAACCATTACCTagtatgaaattttcaaaagtgaacTTCACGGTACCG
AGAGAAggaaatgaaattcaaaaacatttttatccaGAAGACTGGTGGGT
TGAAAGTAAACCATCTGGTTGTTGAatgttcGATATGTTAACACGACATA
GCCGTAATCGATATCGGATCATTGTTCTATCCTTAATCTTCGTCACATCA
ATATACGTTTTTCTTAATAAACGTAATTGGGCATGGTACAATCGGTCTAG
TGGGGAGAGTATTTGTGAAACACCAGAGCCTGAAATGAAGGACTTGATTG
CACTAGCGACTGATACCCGTGACGTCTTACACGGACTGAAAATGACGTAT
TTCTTGATATATGGCAGCCTGTGGGGTGCATTACGACACAATCGACCACT
AGCCTGGGACAACGATTTCGATATCGGTTTAGTTTACGAAGAACTAAAAG
ATAAAGGATTAGAacaaaaactttataaagaacttcaaaagaaaaatatc
aaaatttattatcGGTTATGGTTCGGTACCTATCGGGTTACTCGGGATAC
CGCACGTGGTGATTTGATGATATACCGACGAAACTATTTTGATACTTGTG
TACGGTTAGGTATGGAGTCGTGGGTTTTCTTTGTGAATTATCGTAAGTAT
CATCAATTCCCATGTCGATTGATTAAGAAACCATTACCTagtatgaaatt
ttcaaaagtgaacTTCACGGTACCGAGAGAAggaaatgaaattcaaaaac
atttttatccaGAAGACTGGTGGGTTGAAAGTAAACCATCTGGTTGTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000113_pilon | genome | sc0000113_pilon:50675..62012 + |
|
