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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:1099866..1108173- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13845.3.p1 ID=MSTRG.13845.3.p1|Name=MSTRG.13845.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8308bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:1099866..1108173- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TAGGGCAAAATAGGGCTTTTCGTAGACAAATAATTCCCTCAACCGCGAAA
TTAAATTCCGTGAAACTTTTGAAATCGGCTCATCCGTGAAATTGAATTCC
GCAAAAATTTCTTCTCGCGAAAATTTCTTCCCTTAAGGTAGCTGTGGGGG
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TTCATTGTTGGAGTTAATTATTTAGTCGTGTTATAATTGTTTTATGGTTA
ACGTTACTCGTGTTATTGAGCAAATATTGTTGATTATTTTATTGGAGAGA
TATTGTTCATTGTTTTGTTGGAGAGATATTGTTGAGAGATATTGTTCATT
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AAGCAAAAAATTATAACAACCAAATTTTCATTAACCAGGTAAAATTCATT
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AAAAATGTTTTTGGAGAATTTTATTTGACATGTTATTGTGACATATTTGG
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AAAAAGCTAAAAAATGATTATTTCTGTGACACAATTTTCACTTAGTGCAA
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TTTTTGTTTGCAGCAAACAACTTTCCAACAAAAAAAAAATTTCAAATTAT
AAAAATTCTCAGATTTTTTCAGAAAAATTGTCCAAAAAATTAAAAGAATT
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ATTTACCTTCTCATTCCTGAAAATATAGCAATCCAAAATCACCATCATCA
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ATGGAATTAGGTAACTGAACCTAAAGAATGTCATTATTTTCAGGCAATTT
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ACCCCAAAAAAGTTAAGAATATCTATGATGAAATGGAAAAAACACCATTC
TTATAACAAAAATCGTGTACACTTAGAGATGCAGTTGACCTTTAAGGCTT
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AAAAATAGCGTGTATTTCATTGTTTAGGTAAATTTATAAGTTCTCTTGTT
ATTTATTGTCGGATTATCGAAAAATTCTAGTTGTTGAGTTTTGAGTTTTG
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GTGCTCTCGATGCAGCCGAATACAATTTTTTTTAACATCAAGAAGTTTTA
TTTAGTAATAATATTCTGTTGTGTAAAGAATCGCGCTGATAGAACTAAGT
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AATCAAAGTGAAAGGGATTATGGGATTGAATGTCGGACAAATTTGAAAAG
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ATTTTTCACAGTTGTGTTGAAGTTTTTATAAGATGCTCATATATTTGGGT
ATTCAAAACAATAGAGATGACGCGTTCTTTAGAAAAATATAATAAAAGTT
TTTGTTTGAATAGTTAACGACCAATCCAATGACAAAAATTCTTGTAAAAT
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TTTTTTGATTTGTATTCTGTTCTGTTCTGTCATAGATAAATATTTAAAAG
TTAAGGAGTGATACAAAATAAACTATGCTGGGTTGATATTTATTTTCATC
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TACTTGCATCACTGATCATAATCTTTGTTCTTTCATGGGTTATCGAGGCA
AACGTTTCAAATATAAACAACCAAACTGAATTTCCTTTGGAAGAATTCAT
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GAACCCAATTCCCTTATCAGAATACATGAAAAACTTTAAAAAAGAGGTTG
ACAAGACTCTGCCCCTGCAATGTAAATTCTTCGAACCATTCGGTAGTTTA
CCAATATTTAAACAGATGACTATAGCTAAACCAGATAGTAGATTGGAATA
TTTCTTGGTCAATTCTTGCCCGCCAGACTCTTCATACGCGACAGAATGTA
TAAAGGACGAAAGTTTACCAGATATTGAAAGACTACCAGTTATCGATAAA
CGATTCTATATCTTCAAGAACAAGTATTGCGCAATGTGTAATAATGTTGA
AAGTTTCGTTAACTTGAACTTGACTGTAAAATGCACCACGCCAGTAATTA
CTGGACAACCAACTGTAATTATAACCGCACCGCCTAACCCGCCCTTCACC
AATCCATCTGTACTGCCAAAGGAAACATTCACTGTTCCTACCCTCCCGCC
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AATCCAGAATTTACTGTTCCAACCCTTCCGCCACACCCAGGAGTTACAGA
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AACCAGAACCAGAACACACTGGTCCGCCCCTCTCGCCTAATCCCGAATTT
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TAAAAGTTCCATTGCAGGTTACCAGAACCTCCATTGTCATCAATGCAATG
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GACGAACATATTATATGGTCAATTCACTTAAGCTTCACGCGGACGTCCAC
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ATTCTCCACCCCCCCCCCCATATTCAATTTTTTTTCTGGAAAAGCCCAAT
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AGGCTTAAATGTTCTTAAAATATTCTTAGTTAAGTTAAAAGAGGATAGAA
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ATGAACATACCTTATATTTCCCTTGTAAAATACTTTTTTTTCTTTTTAGG
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AAATAACTCATCCTTTCCTCATTCACAAGACTACCAGTGGTATCGAGACA
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TTAGGAGGTGTCCTCCTGATTGTGACACATACCCTCTTTAAGGAGCTACG
GAACCGTGGTGGTTTACTTCTAATAGGACTCTCATCTGCTATTCTCTTCA
CAGACATCCTGTTTTTCATTTGTGAGCAAAATAATAAAGTTGTTGGTATC
TTATTACATTGGGGACTATTGGTTATCAATCTGTGGACCATCATAATTGC
CGTAGATCTTTGTGCAACATTTTTGAGGAAAGGATTTAGAACTTTCCGCA
ATACAGTTTCATGGATGGATTATTTTTACTTCAGTTTGGTTGCTTACGTC
ACACCATTGCTGATTGTTATTTTATGTGTGATTCTGGATGAAACGAACAC
TATCCATTTTGGTTATGGTGAAAATAATGTATGTTGGATGTCCTCATATT
ATCCAAGGATCATATCATACACAATTCCATCGTTGCTTGTGAATTTATCA
TGTATCGTTTGTCTTCTTGTCTTATTGATGTACCTCAAAAAACAAAATCA
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ATACAAATTCCAAACTCAACATTGACAGAAAACGAAATGAAATTTAACGC
GAGTTTCGCTTTCATTTACGGCGTTTTACGTTCGTTACGAAATACTTTTA
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TACTGTTCTGACGAATCTTAATGCGGCCTCGAGTGTGGCTACAGAGACCA
AGTAATGAAAATGATAATTTCTTCTTCTCACAAACTCGGTATGATTTTAT
TTATCCAGTGGGGATAAAAATAACCGATGGCGATTGATGTTCCCATAGGC
GAGGATTGTTTTTCTTAATTAGTTTCAGTGGGGACAAAAATTGAATGATA
ATTTTACACCGAGGACGATATTTTGACCTATTTTTCAGTGGGAAGGGGTC
CCAGTGGATCTGTGAGAAGGGGGTGTTTTTTTATAATTGATACTGTAATT
TTTGATAAAATTAGTTTATTATGGTTATTATTGGACCTACCCCGGTGGGG
TGGAGGTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:1099866..1108173- >MSTRG.13845.3.p1 ID=MSTRG.13845.3.p1|Name=MSTRG.13845.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7686bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:1099866..1108173- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTCCATTGCAGCTCTGGACAATTGTACAATATTCTGAAAGGCACATGTGA AAAATTCACTTGCTCAGCTGGCTACTACGCAAGAGAAAAATATTGTATCA AAAATAACTCATCCTTTCCTCATTCACAAGACTACCAGTGGTATCGAGAC ACCAACCAGGTGGAATACTACCTCACACACGTCTGTGTCAGTATCAGTGT CTTAGGAGGTGTCCTCCTGATTGTGACACATACCCTCTTTAAGGAGCTAC GGAACCGTGGTGGTTTACTTCTAATAGGACTCTCATCTGCTATTCTCTTC ACAGACATCCTGTTTTTCATTTGTGAGCAAAATAATAAAGTTGTTGGTAT CTTATTACATTGGGGACTATTGGTTATCAATCTGTGGACCATCATAATTG CCGTAGATCTTTGTGCAACATTTTTGAGGAAAGGATTTAGAACTTTCCGC AATACAGTTTCATGGATGGATTATTTTTACTTCAGTTTGGTTGCTTACGT CACACCATTGCTGATTGTTATTTTATGTGTGATTCTGGATGAAACGAACA CTATCCATTTTGGTTATGGTGAAAATAATGTATGTTGGATGTCCTCATAT TATCCAAGGATCATATCATACACAATTCCATCGTTGCTTGTGAATTTATC ATGTATCGTTTGTCTTCTTGTCTTATTGATGTACCTCAAAAAACAAAATC AAGAACGAAAATCAAAACTGAAATCGAGTTACCGAGTCAATCTAACTCGT CTAGCTTTGAAACTCGTTTCTTTACTCGGTGTTATCGAGTTGGTTGGTTT TATACAAATTCCAAACTCAACATTGACAGAAAACGAAATGAAATTTAACG CGAGTTTCGCTTTCATTTACGGCGTTTTACGTTCGTTACGAAATACTTTT ATATTTTTGTTCGTGCTTATGGATAGTAAAACGTTGAAATTATATCGCAA ATTTGTATCGAGTATGAGAACGATCAACACAAGTGAAGTTTCAATTCCAG ATACTGTTCTGACGAATCTTAATGCGGCCTCGAGTGTGGCTACAGAGACC AAGTAAAAAAAGATGTTTTCTCGATTAATACTTGCATCACTGATCATAAT CTTTGTTCTTTCATGGGTTATCGAGGCAAACGTTTCAAATATAAACAACC AAACTGAATTTCCTTTGGAAGAATTCATCCAATCTGCGTTTACGTACCCT GTGAATTTTACCGGAGACTTCATGGAAATAGCGAAAGAGACTTTTCTATG CGGCTCCGATTGTTGTGATTGTGAACCAGACTGTTTCAGAAAACAAAGTT GCTGTATTGACAAATTATGGAACACTTCGAACCCAATTCCCTTATCAGAA TACATGAAAAACTTTAAAAAAGAGGTTGACAAGACTCTGCCCCTGCAATG TAAATTCTTCGAACCATTCGGTAGTTTACCAATATTTAAACAGATGACTA TAGCTAAACCAGATAGTAGATTGGAATATTTCTTGGTCAATTCTTGCCCG CCAGACTCTTCATACGCGACAGAATGTATAAAGGACGAAAGTTTACCAGA TATTGAAAGACTACCAGTTATCGATAAACGATTCTATATCTTCAAGAACA 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TTCATTAACCAGGTCCATTGCAGCTCTGGACAATTGTACAATATTCTGAA AGGCACATGTGAAAAATTCACTTGCTCAGCTGGCTACTACGCAAGAGAAA AATATTGTATCAAAAATAACTCATCCTTTCCTCATTCACAAGACTACCAG TGGTATCGAGACACCAACCAGGTGGAATACTACCTCACACACGTCTGTGT CAGTATCAGTGTCTTAGGAGGTGTCCTCCTGATTGTGACACATACCCTCT TTAAGGAGCTACGGAACCGTGGTGGTTTACTTCTAATAGGACTCTCATCT GCTATTCTCTTCACAGACATCCTGTTTTTCATTTGTGAGCAAAATAATAA AGTTGTTGGTATCTTATTACATTGGGGACTATTGGTTATCAATCTGTGGA CCATCATAATTGCCGTAGATCTTTGTGCAACATTTTTGAGGAAAGGATTT AGAACTTTCCGCAATACAGTTTCATGGATGGATTATTTTTACTTCAGTTT GGTTGCTTACGTCACACCATTGCTGATTGTTATTTTATGTGTGATTCTGG ATGAAACGAACACTATCCATTTTGGTTATGGTGAAAATAATGTATGTTGG ATGTCCTCATATTATCCAAGGATCATATCATACACAATTCCATCGTTGCT TGTGAATTTATCATGTATCGTTTGTCTTCTTGTCTTATTGATGTACCTCA AAAAACAAAATCAAGAACGAAAATCAAAACTGAAATCGAGTTACCGAGTC AATCTAACTCGTCTAGCTTTGAAACTCGTTTCTTTACTCGGTGTTATCGA GTTGGTTGGTTTTATACAAATTCCAAACTCAACATTGACAGAAAACGAAA TGAAATTTAACGCGAGTTTCGCTTTCATTTACGGCGTTTTACGTTCGTTA CGAAATACTTTTATATTTTTGTTCGTGCTTATGGATAGTAAAACGTTGAA 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TTACTGTTCCAACCCTTCCGCCACACCCAGGAGTTACAGATCAACCCCTC CCGCCACAACCCGAAATCACTTCACGGCCAACCCTTTCACAACCAGAACC AGAACACACTGGTCCGCCCCTCTCGCCTAATCCCGAATTTACTATTCCAC CCCTCCCGTCACACCCAACCGAACCAGAGGTCAAAGCTAAAGATTTAATG AATGAATTCCAAGAATGTTTGGTACAAGTCAATCCAAACCCTCAACAAGC ACCTCATAACCGTATGGACAAACTCAAATGCAACGCTCGCAAAGTACTAA AACGAAGATGCCAAGACCCAAATTCTTATTGTCATTTATATAAAAGTTCC ATTGCAGGTTACCAGAACCTCCATTGTCATCAATGCAATGGAGAGTTGTT TACGGAGAGCATTCTTCAGAACCAGTGTGTTGCCTTACCTGACGAACATA TTATATGGTCAATTCACTTAAGCTTCACGCGGACGTCCACAAGACTGACA TTGGATACACAGGATGAAAATGTCGGTGAACAGATGAACGTTTATTTGAT GAAATCCGTTGCCTTGATATTGTTGCAAAAGAATTTGAAATGCACGATCA CTACCGTAAGAGATTCGGAGAATGGATTTGGCGAAGAAGCAAAAAATTAT AACAACCAAATTTTCATTAACCAGGTCCATTGCAGCTCTGGACAATTGTA CAATATTCTGAAAGGCACATGTGAAAAATTCACTTGCTCAGCTGGCTACT ACGCAAGAGAAAAATATTGTATCAAAAATAACTCATCCTTTCCTCATTCA CAAGACTACCAGTGGTATCGAGACACCAACCAGGTGGAATACTACCTCAC ACACGTCTGTGTCAGTATCAGTGTCTTAGGAGGTGTCCTCCTGATTGTGA CACATACCCTCTTTAAGGAGCTACGGAACCGTGGTGGTTTACTTCTAATA 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AATAGCGAAAGAGACTTTTCTATGCGGCTCCGATTGTTGTGATTGTGAAC CAGACTGTTTCAGAAAACAAAGTTGCTGTATTGACAAATTATGGAACACT TCGAACCCAATTCCCTTATCAGAATACATGAAAAACTTTAAAAAAGAGGT TGACAAGACTCTGCCCCTGCAATGTAAATTCTTCGAACCATTCGGTAGTT TACCAATATTTAAACAGATGACTATAGCTAAACCAGATAGTAGATTGGAA TATTTCTTGGTCAATTCTTGCCCGCCAGACTCTTCATACGCGACAGAATG TATAAAGGACGAAAGTTTACCAGATATTGAAAGACTACCAGTTATCGATA AACGATTCTATATCTTCAAGAACAAGTATTGCGCAATGTGTAATAATGTT GAAAGTTTCGTTAACTTGAACTTGACTGTAAAATGCACCACGCCAGTAAT TACTGGACAACCAACTGTAATTATAACCGCACCGCCTAACCCGCCCTTCA CCAATCCATCTGTACTGCCAAAGGAAACATTCACTGTTCCTACCCTCCCG CCCAATCCAGGATTCACTGTTCCACCCCTTCCGCCACTACCAGGATTCAC TGTTCCACCACTCCCGCCAAAGCCAGAAGTTACTGTTTCAACCCTCCCGC CCAATCCAGAATTTACTGTTCCAACCCTTCCGCCACACCCAGGAGTTACA GATCAACCCCTCCCGCCACAACCCGAAATCACTTCACGGCCAACCCTTTC ACAACCAGAACCAGAACACACTGGTCCGCCCCTCTCGCCTAATCCCGAAT TTACTATTCCACCCCTCCCGTCACACCCAACCGAACCAGAGGTCAAAGCT AAAGATTTAATGAATGAATTCCAAGAATGTTTGGTACAAGTCAATCCAAA CCCTCAACAAGCACCTCATAACCGTATGGACAAACTCAAATGCAACGCTC GCAAAGTACTAAAACGAAGATGCCAAGACCCAAATTCTTATTGTCATTTA TATAAAAGTTCCATTGCAGGTTACCAGAACCTCCATTGTCATCAATGCAA TGGAGAGTTGTTTACGGAGAGCATTCTTCAGAACCAGTGTGTTGCCTTAC CTGACGAACATATTATATGGTCAATTCACTTAAGCTTCACGCGGACGTCC ACAAGACTGACATTGGATACACAGGATGAAAATGTCGGTGAACAGATGAA CGTTTATTTGATGAAATCCGTTGCCTTGATATTGTTGCAAAAGAATTTGA AATGCACGATCACTACCGTAAGAGATTCGGAGAATGGATTTGGCGAAGAA GCAAAAAATTATAACAACCAAATTTTCATTAACCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:1099866..1108173 - |
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