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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:1099866..1108429- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13845.2.p1 ID=MSTRG.13845.2.p1|Name=MSTRG.13845.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8564bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:1099866..1108429- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) AGAATTAAAAATGAAAAATAAAAAAAAAACTGAAAAAAAAACTAAAACTT
AATACTTTTACCTTTAGACTATCAATAATTAACAAAATATTACCTTAAGG
GAAGAAATTTTTGCGGAACTTAATTTCGCGAATTTGGGCGTAATTCGCGA
AATTAAATTCCGCGAAACACACTAAAATGGCTAAACTGCGAAATCAAATT
CCGCGAAACACGAATATTCTCACAATTAAAAAAATCACCCCTAAAATTGG
TCTTTTTAGGGCAAAATAGGGCTTTTCGTAGACAAATAATTCCCTCAACC
GCGAAATTAAATTCCGTGAAACTTTTGAAATCGGCTCATCCGTGAAATTG
AATTCCGCAAAAATTTCTTCTCGCGAAAATTTCTTCCCTTAAGGTAGCTG
TGGGGGAGCTTGAAAATACACCAGTGAAACTGTACATAGTTTAATTGTTT
TATGGTTTCATTGTTGGAGTTAATTATTTAGTCGTGTTATAATTGTTTTA
TGGTTAACGTTACTCGTGTTATTGAGCAAATATTGTTGATTATTTTATTG
GAGAGATATTGTTCATTGTTTTGTTGGAGAGATATTGTTGAGAGATATTG
TTCATTGTTTTGTTGGAGAGATATTGTTCATTGTTTTGTTGGAGAATTAT
TGTTTTTATCGTTACCTTGACATAACATCTACTGACCTGTGACAGGCATT
TACCATCACTGACTGATTAACAGAAACTAACAACAAGGTAACTTACCTCA
ATTTCCTAAAACTTTGAATGAGGTAAACAAGAAGAGTATCTTGGAAGCAA
AAGATGAACGTTTATTTGATGAAATCCGTTGCCTTGATATTGTTGCAAAA
GAATTTGAAATGCACGATCACTACCGTAAGAGATTCGGAGAATGGATTTG
GCGAAGAAGCAAAAAATTATAACAACCAAATTTTCATTAACCAGGTAAAA
TTCATTTATTTTTATCAACACCTTCAGCCATTGATCGGATAAATATACTT
TTAGTTTTAGTAAAAGGGCTGCAAATATGAAGGGCAGAAAGTTTCGCGGG
CAAAAATGTTTCGCAGAGTCAAAAAATCGCGAAATTTAGCGAATTTAAGT
ATCGCGAATTATGGTTTCGCAGATAGAACTTTCGCTAATTCATATAAAAT
TTACCTTTTTTGGTAACAAAAACTCACATAACACGCAAAAATTTAGCAAA
GAGTGCAAAACTGAGTAGGAAAGTTTATTTTTCGCGAAAAAAAAACTTTT
GCGTTTTTCAGGTTTAATTTCTTACCTTGCAGAAACTTTTGTGAAAAAGG
ATCATAATCGCGAAAAACGCGAAAGTTTCTGCCCTTAAAGTTATAAGTCA
AATCTAAGCGCAAGACCTTTGTTTTTTATTTCTTTTTTCGTCTTTCACTT
CCTATCCACCATTGCAAGTGGACGAAATGAAAAAGCCGAAAACTGATTTC
ACCTCATTGAAGCTCTATATCGATCGTAACATAATCGAAGAAAGCAAAGT
TTTCTATGAAGGTCTAGAAGTAGCATTTCCGTACTCAAAATAGTCGTTTT
TTCGTGTTTTACTACCTGAAACTTTCCAAATATGTTACATGTCAAATACA
ATTTTCCAAAAAAACACCCGTTTTCTTTTATACAGGATTCTCCGGTCAAC
TTTTTGAAAAATGTTTTTGGAGAATTTTATTTGACATGTTATTGTGACAT
ATTTGGAAAGTTTCAAGTAGTAACAGGGGGGGTCGGTAGTAAAATCTCAG
ACATATATGAGTAGTAAAAGGATTTTTACGAATTTTTACATACCACCACC
CAGACTCTTGGAAGAGTTATTTTACTACCCTGGTAGTAAAAGTTTTTGGG
ATAATTTGTCATGGAGACCACCTATTTTTTGGTTGCTTTTCGGACTGATT
TTACAAAAAAAGCTAAAAAATGATTATTTCTGTGACACAATTTTCACTTA
GTGCAAAAAATAATGTTTTGCCCTTAGAATTAGTCTTTTTTATATTGACG
AAAAATTTTTTGTTTGCAGCAAACAACTTTCCAACAAAAAAAAAATTTCA
AATTATAAAAATTCTCAGATTTTTTCAGAAAAATTGTCCAAAAAATTAAA
AGAATTACAAAAATAGCTAAAAGTTGCTAATTTTACCAGTTTTAACTACC
CAGGTAGTAAAATTTTTTCAACAATTAACACATAGATACCACCCATTTTA
GTATTTAACTACACTGGGTAGTAAAAAAAATTTTCGATTTTTCGTCACAC
CACCACCGTAGTAAACGTCATTATGTCTGAGATTTCCTAGAGACCCCCCC
CCCCTGGTAGTAAAACATTCTAGATGGTGCACAATCACACTATAAAGTTG
TCATGGTGTTTTAGCTCTCAGGCAAAATCCCTTACAAATTGGTATTTTCA
CAAAAGACACCTCCACTTTGATAGGCTACCATTTTAGATATCGGCCTGCT
CAGCCCATTTACCTTCTCATTCCTGAAAATATAGCAATCCAAAATCACCA
TCATCAAATATTTTTCATCTCTTTGGGGACGCACACCTCCCAACTCGATC
ACCATCATGGAATTAGGTAACTGAACCTAAAGAATGTCATTATTTTCAGG
CAATTTCCCTATAAATTGCTAATTATCCTCTATAATCACCCTCGAAATAT
ATTGAGATTTTAGTGTATTTTAACGTTTTTGAGAATTTAAAGTTCGGGCG
AGAATTGCTATTTTAGCACTTCCACTTTCTTCCATTGAATATTTCGATTT
TAGAGGGGTTTTAAAGCTTTTAAATCCTGAGATCCTAAGGTCCTAAGGCT
TAAGTCTCATGTTAAAACTCAAAGTTAAAACTCTTCTTTCCAACTGTAGT
TTAAGGCGCTTAAAAATCAATTGTGGTGTTCAAAATTACACCGGGAACTC
CCCTTTGTCTCAAATATTTAGTGGATGATTGTAGCAATGCTAAAAGCTTT
CAAAAAATGTCATTTTCTTTGCTTGAGGTATACATTGAATGCTAGCTTTA
ACCTCGTTTTAGATCTCAACCTATAAAAATAACGTAAGAATATTTTTGGA
TGATTTACCCCAAAAAAGTTAAGAATATCTATGATGAAATGGAAAAAACA
CCATTCTTATAACAAAAATCGTGTACACTTAGAGATGCAGTTGACCTTTA
AGGCTTTTTGAGGCAACTTATAATGCTTTTCTATTAGTTAAGTAGGTTAT
TAAAAGGTAGGATTTCAAAGGATGACTTATAACATTGAACCAATTAGAAT
GACAATCTAATGTTTGGCATGAACACCGGGGGGGGTGTACTTTTACGGTG
TGACGGGATTGGCCCTATTTTAGTACGGTATTACGGGATTCGACGAAAAA
AGAGACAGGAAAACGGTATTTCAAAATCAGACGGTGACGGTATTTAGCCT
TATTTTTTGTTATTATGCCGGTATTTTAACCTCTACAAACCGGTGTGACG
GTGTTATTATTTTTTCCAATTTTCGGGATTTCGGGATTTTAGCAAAAATT
TTGACGGGAAAACGGTATTGCGAACACCTACAACCCCCTATAGAAGGTAT
TCTTATAAAAATAGCGTGTATTTCATTGTTTAGGTAAATTTATAAGTTCT
CTTGTTATTTATTGTCGGATTATCGAAAAATTCTAGTTGTTGAGTTTTGA
GTTTTGAAGACGCTCGAATTGCAGAAAATATAGAGAAATTCAATGTTCGA
GTTATGGACAGGCTCGACCTGTAAAGCTTCGAGTTATGGAGAAATTGGAA
TCACAGAAGTTCGAGCTATCTTAAATAGAAATTATCATTTATTCTGCCCT
TGCAGTTTGATTATTAGCTCTCTAGTGCTATTTGCGCAATGACACTCTCA
GGCTAATAACCAAACTGCGCGGGCAGAAAATAACAACAACAACCTCAAAC
TGAACGCTATATTGTTATATTCGAAATTGCGAAAGAAGTATATACTGCCC
TTAAAGAGGGAAAGTGTGTTTATTGGCTTATTCATAAGCTTAACTTTTGA
ATATGCAATTAAAAAGATGTAGGCTATAGGATGTAAGCAAATGATAATTA
AAACATGATAAAAATATGGTATTCAGTAATGGAGTAGTAATTAGCTTAAT
TGCTTTGTGCTCTCGATGCAGCCGAATACAATTTTTTTTAACATCAAGAA
GTTTTATTTAGTAATAATATTCTGTTGTGTAAAGAATCGCGCTGATAGAA
CTAAGTTGTAGTGAATAGCACACCGTGGTGAATCTAAAAATAGACATCAC
TTTCTTTATTTGCCCGAGTTTCAATCCCATCGTTCATTGCGTTAATTTCT
TGTGCACATTAATTACACTTATAACAAAGAAAATGTAACAACTCTCACGA
TTTTGAAATCAAAGTGAAAGGGATTATGGGATTGAATGTCGGACAAATTT
GAAAAGTAATAATTATGACGTTTGCATAACGGAGCGCTATTGTATTAGAG
GCTCAGCGGTCGGTTTGAAAAATCTCAAATGAAAAACAACAGACCCTCTA
CGGCAATGAATTTTGAAATTAGCCGTACATATCGGGTTTGTGTAAAGACT
AACTAGCACGAGGTGGCACTATATTTTAGGCTTTCATTGTGTAACATTTG
TGTGGTATTTTTCACAGTTGTGTTGAAGTTTTTATAAGATGCTCATATAT
TTGGGTATTCAAAACAATAGAGATGACGCGTTCTTTAGAAAAATATAATA
AAAGTTTTTGTTTGAATAGTTAACGACCAATCCAATGACAAAAATTCTTG
TAAAATGTTCATCTTGACCCATTTTTCATGTAGTTTGACTTTGCAGAATG
ATACATTTTTTTGATTTGTATTCTGTTCTGTTCTGTCATAGATAAATATT
TAAAAGTTAAGGAGTGATACAAAATAAACTATGCTGGGTTGATATTTATT
TTCATCCCGAAAGAATCTGCTTAGCGATCAATAAAGGTTGGATTTAGAAA
ATTGTTTTTAAAAGAGAAGTCTTTTACGTTACAGAAAAAGATGTTTTCTC
GATTAATACTTGCATCACTGATCATAATCTTTGTTCTTTCATGGGTTATC
GAGGCAAACGTTTCAAATATAAACAACCAAACTGAATTTCCTTTGGAAGA
ATTCATCCAATCTGCGTTTACGTACCCTGTGAATTTTACCGGAGACTTCA
TGGAAATAGCGAAAGAGACTTTTCTATGCGGCTCCGATTGTTGTGATTGT
GAACCAGACTGTTTCAGAAAACAAAGTTGCTGTATTGACAAATTATGGAA
CACTTCGAACCCAATTCCCTTATCAGAATACATGAAAAACTTTAAAAAAG
AGGTTGACAAGACTCTGCCCCTGCAATGTAAATTCTTCGAACCATTCGGT
AGTTTACCAATATTTAAACAGATGACTATAGCTAAACCAGATAGTAGATT
GGAATATTTCTTGGTCAATTCTTGCCCGCCAGACTCTTCATACGCGACAG
AATGTATAAAGGACGAAAGTTTACCAGATATTGAAAGACTACCAGTTATC
GATAAACGATTCTATATCTTCAAGAACAAGTATTGCGCAATGTGTAATAA
TGTTGAAAGTTTCGTTAACTTGAACTTGACTGTAAAATGCACCACGCCAG
TAATTACTGGACAACCAACTGTAATTATAACCGCACCGCCTAACCCGCCC
TTCACCAATCCATCTGTACTGCCAAAGGAAACATTCACTGTTCCTACCCT
CCCGCCCAATCCAGGATTCACTGTTCCACCCCTTCCGCCACTACCAGGAT
TCACTGTTCCACCACTCCCGCCAAAGCCAGAAGTTACTGTTTCAACCCTC
CCGCCCAATCCAGAATTTACTGTTCCAACCCTTCCGCCACACCCAGGAGT
TACAGATCAACCCCTCCCGCCACAACCCGAAATCACTTCACGGCCAACCC
TTTCACAACCAGAACCAGAACACACTGGTCCGCCCCTCTCGCCTAATCCC
GAATTTACTATTCCACCCCTCCCGTCACACCCAACCGAACCAGAGGTCAA
AGCTAAAGATTTAATGAATGAATTCCAAGAATGTTTGGTACAAGTCAATC
CAAACCCTCAACAAGCACCTCATAACCGTATGGACAAACTCAAATGCAAC
GCTCGCAAAGTACTAAAACGAAGATGCCAAGACCCAAATTCTTATTGTCA
TTTATATAAAAGTTCCATTGCAGGTTACCAGAACCTCCATTGTCATCAAT
GCAATGGAGAGTTGTTTACGGAGAGCATTCTTCAGAACCAGTGTGTTGCC
TTACCTGACGAACATATTATATGGTCAATTCACTTAAGCTTCACGCGGAC
GTCCACAAGACTGACATTGGATACACAGGATGAAAATGTCGGTGAACAGG
TAATGGGCTCTTCTTGAAAATGTTCGTACATGGGGGATGGAGGATATAGT
GTCCGGGGGTAGTGAAAAATTCCACAAAATTTACCTTGTCCGGGGGGTAA
ACTTGCTCTGTTTTAGGGTAAATGTCCAGAGGGTCAACTGATGCTTGTCG
GGGGGGTTAGACTTGCTGTTCGAGGGTCCGAGGGGTAAATTTCCAAAAAA
AGTTATATTCTCCACCCCCCCCCCCATATTCAATTTTTTTTCTGGAAAAG
CCCAATGAATATGCACGTTTTTTTTTTTTCAGTATTGAAACTTTTCCGTA
AATAGAAAATCTATCCAGTTGAGATTATTACTTAGGTTTCTGCGGTGTAA
GCCATGCAGATTCACCAGGGGTGTTGCAGCACTGTTCAGTTATCTTATAA
GGGCAGAAGTAGTAAATTTAGCCTGATGCTTGCTGTTCTTATTTTTCGTG
ATTTTCAGGCTTAAATGTTCTTAAAATATTCTTAGTTAAGTTAAAAGAGG
ATAGAATCAGTATTTTTTATGCCGTTTCTAAAATCTGAGACTTGGTTTGT
TTTTAATTTGTTATTTATACAGTTTAGTCTCTATAAATCGAACCCACACG
GGAAACACAAATTTATACAAGTTAAGGAAATTTATGTACCCAGCTGGCAC
ACAACGTTGTTTCAACGTTCATCTAACGTTATATGGACGTTGTGAAACAG
TGCCAGCTGGGTAAGCTTTATAAGCATCGTTAACTGAAGGGACGAGAAAA
CTTGTTCGAGTTAAGGAGATATTCGAGATATAAAGGTTCGAGTTAAAGAG
ACTCTAATGAACATACCTTATATTTCCCTTGTAAAATACTTTTTTTTCTT
TTTAGGTCCATTGCAGCTCTGGACAATTGTACAATATTCTGAAAGGCACA
TGTGAAAAATTCACTTGCTCAGCTGGCTACTACGCAAGAGAAAAATATTG
TATCAAAAATAACTCATCCTTTCCTCATTCACAAGACTACCAGTGGTATC
GAGACACCAACCAGGTGGAATACTACCTCACACACGTCTGTGTCAGTATC
AGTGTCTTAGGAGGTGTCCTCCTGATTGTGACACATACCCTCTTTAAGGA
GCTACGGAACCGTGGTGGTTTACTTCTAATAGGACTCTCATCTGCTATTC
TCTTCACAGACATCCTGTTTTTCATTTGTGAGCAAAATAATAAAGTTGTT
GGTATCTTATTACATTGGGGACTATTGGTTATCAATCTGTGGACCATCAT
AATTGCCGTAGATCTTTGTGCAACATTTTTGAGGAAAGGATTTAGAACTT
TCCGCAATACAGTTTCATGGATGGATTATTTTTACTTCAGTTTGGTTGCT
TACGTCACACCATTGCTGATTGTTATTTTATGTGTGATTCTGGATGAAAC
GAACACTATCCATTTTGGTTATGGTGAAAATAATGTATGTTGGATGTCCT
CATATTATCCAAGGATCATATCATACACAATTCCATCGTTGCTTGTGAAT
TTATCATGTATCGTTTGTCTTCTTGTCTTATTGATGTACCTCAAAAAACA
AAATCAAGAACGAAAATCAAAACTGAAATCGAGTTACCGAGTCAATCTAA
CTCGTCTAGCTTTGAAACTCGTTTCTTTACTCGGTGTTATCGAGTTGGTT
GGTTTTATACAAATTCCAAACTCAACATTGACAGAAAACGAAATGAAATT
TAACGCGAGTTTCGCTTTCATTTACGGCGTTTTACGTTCGTTACGAAATA
CTTTTATATTTTTGTTCGTGCTTATGGATAGTAAAACGTTGAAATTATAT
CGCAAATTTGTATCGAGTATGAGAACGATCAACACAAGTGAAGTTTCAAT
TCCAGATACTGTTCTGACGAATCTTAATGCGGCCTCGAGTGTGGCTACAG
AGACCAAGTAATGAAAATGATAATTTCTTCTTCTCACAAACTCGGTATGA
TTTTATTTATCCAGTGGGGATAAAAATAACCGATGGCGATTGATGTTCCC
ATAGGCGAGGATTGTTTTTCTTAATTAGTTTCAGTGGGGACAAAAATTGA
ATGATAATTTTACACCGAGGACGATATTTTGACCTATTTTTCAGTGGGAA
GGGGTCCCAGTGGATCTGTGAGAAGGGGGTGTTTTTTTATAATTGATACT
GTAATTTTTGATAAAATTAGTTTATTATGGTTATTATTGGACCTACCCCG
GTGGGGTGGAGGTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:1099866..1108429- >MSTRG.13845.2.p1 ID=MSTRG.13845.2.p1|Name=MSTRG.13845.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2394bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:1099866..1108429- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTCCATTGCAGCTCTGGACAATTGTACAATATTCTGAAAGGCACATGTGA AAAATTCACTTGCTCAGCTGGCTACTACGCAAGAGAAAAATATTGTATCA AAAATAACTCATCCTTTCCTCATTCACAAGACTACCAGTGGTATCGAGAC ACCAACCAGGTGGAATACTACCTCACACACGTCTGTGTCAGTATCAGTGT CTTAGGAGGTGTCCTCCTGATTGTGACACATACCCTCTTTAAGGAGCTAC GGAACCGTGGTGGTTTACTTCTAATAGGACTCTCATCTGCTATTCTCTTC ACAGACATCCTGTTTTTCATTTGTGAGCAAAATAATAAAGTTGTTGGTAT CTTATTACATTGGGGACTATTGGTTATCAATCTGTGGACCATCATAATTG CCGTAGATCTTTGTGCAACATTTTTGAGGAAAGGATTTAGAACTTTCCGC AATACAGTTTCATGGATGGATTATTTTTACTTCAGTTTGGTTGCTTACGT CACACCATTGCTGATTGTTATTTTATGTGTGATTCTGGATGAAACGAACA CTATCCATTTTGGTTATGGTGAAAATAATGTATGTTGGATGTCCTCATAT TATCCAAGGATCATATCATACACAATTCCATCGTTGCTTGTGAATTTATC ATGTATCGTTTGTCTTCTTGTCTTATTGATGTACCTCAAAAAACAAAATC AAGAACGAAAATCAAAACTGAAATCGAGTTACCGAGTCAATCTAACTCGT CTAGCTTTGAAACTCGTTTCTTTACTCGGTGTTATCGAGTTGGTTGGTTT TATACAAATTCCAAACTCAACATTGACAGAAAACGAAATGAAATTTAACG CGAGTTTCGCTTTCATTTACGGCGTTTTACGTTCGTTACGAAATACTTTT ATATTTTTGTTCGTGCTTATGGATAGTAAAACGTTGAAATTATATCGCAA ATTTGTATCGAGTATGAGAACGATCAACACAAGTGAAGTTTCAATTCCAG ATACTGTTCTGACGAATCTTAATGCGGCCTCGAGTGTGGCTACAGAGACC AAGTAAATGAACGTTTATTTGATGAAATCCGTTGCCTTGATATTGTTGCA AAAGAATTTGAAATGCACGATCACTACCGTAAGAGATTCGGAGAATGGAT TTGGCGAAGAAGCAAAAAATTATAACAACCAAATTTTCATTAACCAGGTC CATTGCAGCTCTGGACAATTGTACAATATTCTGAAAGGCACATGTGAAAA ATTCACTTGCTCAGCTGGCTACTACGCAAGAGAAAAATATTGTATCAAAA ATAACTCATCCTTTCCTCATTCACAAGACTACCAGTGGTATCGAGACACC AACCAGGTGGAATACTACCTCACACACGTCTGTGTCAGTATCAGTGTCTT AGGAGGTGTCCTCCTGATTGTGACACATACCCTCTTTAAGGAGCTACGGA ACCGTGGTGGTTTACTTCTAATAGGACTCTCATCTGCTATTCTCTTCACA GACATCCTGTTTTTCATTTGTGAGCAAAATAATAAAGTTGTTGGTATCTT ATTACATTGGGGACTATTGGTTATCAATCTGTGGACCATCATAATTGCCG TAGATCTTTGTGCAACATTTTTGAGGAAAGGATTTAGAACTTTCCGCAAT ACAGTTTCATGGATGGATTATTTTTACTTCAGTTTGGTTGCTTACGTCAC ACCATTGCTGATTGTTATTTTATGTGTGATTCTGGATGAAACGAACACTA TCCATTTTGGTTATGGTGAAAATAATGTATGTTGGATGTCCTCATATTAT CCAAGGATCATATCATACACAATTCCATCGTTGCTTGTGAATTTATCATG TATCGTTTGTCTTCTTGTCTTATTGATGTACCTCAAAAAACAAAATCAAG AACGAAAATCAAAACTGAAATCGAGTTACCGAGTCAATCTAACTCGTCTA GCTTTGAAACTCGTTTCTTTACTCGGTGTTATCGAGTTGGTTGGTTTTAT ACAAATTCCAAACTCAACATTGACAGAAAACGAAATGAAATTTAACGCGA GTTTCGCTTTCATTTACGGCGTTTTACGTTCGTTACGAAATACTTTTATA TTTTTGTTCGTGCTTATGGATAGTAAAACGTTGAAATTATATCGCAAATT TGTATCGAGTATGAGAACGATCAACACAAGTGAAGTTTCAATTCCAGATA CTGTTCTGACGAATCTTAATGCGGCCTCGAGTGTGGCTACAGAGACCAAG TAAATGAACGTTTATTTGATGAAATCCGTTGCCTTGATATTGTTGCAAAA GAATTTGAAATGCACGATCACTACCGTAAGAGATTCGGAGAATGGATTTG GCGAAGAAGCAAAAAATTATAACAACCAAATTTTCATTAACCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:1099866..1108429 - |
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