MSTRG.13841.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13841.1.p1
Unique NameMSTRG.13841.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000112_pilon:1002896..1030265-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13841.1.p1 ID=MSTRG.13841.1.p1|Name=MSTRG.13841.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=27370bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:1002896..1030265- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGGATTTTTCCTGGAGATACGTTGAGGTCGCTTTCTTGCTTGCTTCAAC CAAACTGGATACTTTATTTGACCAAAAATTGTCGTTTATTTTTAGAGGTG GCTTTTGAATAAAGAAATTTTCATAAAAAAGTTAGATTTACTTTTAATGC TAGACAATGTCAACTAAAGGGGGTGGAGGAGAAGAAGGAGCAAGAGGGTT TAACAGACGTGGAGCTATCAGAGAGAAAAATATATTTGAAGTAAAGGATC ACAAATTTGTACCAAAGTTTTTTAAGCAGCCAACATTTTGCTCACATTGT AAAGATTTTATTTGGTAAGTTGACTGGATCCAAACATATTGTGTATGTAC ATCCAGACTCTCCAACTTGGAACAATCAATAACTTTTTCCAATACACCTT TCCCGTAATTTGTAAAACTAATGTGCACACATTATTTTGATGCTTTCCCC ACTGGTGGACCGTTTGGTCTCTGAGGTAAACAAACCCATTTTTGGCTGCA TTTCCTTAGCCCTTAGGGAAAGTTGTTTTTTTTAGCTTTTCTTAAGTTCT GTCAAACAAAAAATTCCCTCAAATTTTAGTAGTTCAATCTATTCATGATA TTATACCACCCTGAAAATCTTTTGCTAAAAGAAGATCGCTATCAAAAGTT AGAAGTTGAAAACCCACTTTCCCTATTAAAAGGGAATAGGTTTCCCTATT TCCCTTTTGAGATTAAACCCCTTGTAGGCAAAAACGCGTTTCTTTACCTC CCAAACAATTTTATACACAATGGTGGAGCACACATTTTTCCAGGTTATTT CTGAGAATTTTGAAAGTTGTATTGATGATCAATATACCTTTTGTAGGATG TAATGTCATGTTACTTTAGGCTAACAAACTTTCACAAGCAGAAACCTTTG CGCTTTTCGCGAATATGTTGTTTGAAAATTCTTAACAGGACAATTCCTGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:1002896..1030265-

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TTCCCACGATCGCTGTCCAGAGAAGCTATTTCTATAATCAAAGGCATCAT
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GATCACTGCGGAACTCTACTATATGGTTTGTTCAAACAAGGGTTAAAATG
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TCAAATGTCCAGGAGCTGACACTGGGCCTGATGACGGGTGTAGTTGGAAA
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TGAAGTAAAGGATCACAAATTTGTACCAAAGTTTTTTAAGCAGCCAACAT
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CGTAATTTCATTCAACACGTCGATCAAAGGGTCTTCGAAAACTTCTCTTA
CATCAATAATACTTTTGTTGGTCAGTAATTTTTGACGAAGAATCCGAGTC
GTCGTTTGGGGTCTGGTGAAACTGGAGAACAAGACATTCGAGATCATCAG
TTCTTCAAATATATTGATTGGGTCAAATTATACAAAATGGAAATTCAACC
ACCATACAAGCCTAAAGTTCCTCCTTTTGATGGTGAGGACGAAGACGAAC
TTTTCAATTCAGTTTTGGAGCAAACTGTCTCTTTCCCACGATCGCTGTCC
AGAGAAGCTATTTCTATAATCAAAGGCATCATCGCATATCAACCATACGG
TGCTTCAGTTGATTGGTGGGCGCTTGGTGTTCTCATTTATGAAATGTTGG
CGGGACAGGGATTTGAAATTAGACAACGTGTTATTAGACCAGAGTGGCCA
CATCAAGATTGCTGATTTCGGTATGTGTAAGGAAAACATCTTTGCACCGA
AGACAACAAGAACTTTCTGTGGTACTCCTGATTACATCGCTCCTGAGGTT
TTATGCAGCTGAGATTGTAGAGGGGTTATTATTTTTACACAAGCGTGGTA
TTATTTATCGGATCGTTTGTATTTTGTGATGGAGTTTGTCAACGGTGGTG
ATCTGATGTTTCACATTCAACAAGTTGGGAAGTTTAAGGAACCTCAAGCT
GTGTCATGTTAGCAGAGAAGAAAGGTTCTGATCGTGTATACGCCATCAAG
ATTCTAAAGAAAGACGTCGTCTTACAAAACGACGATTTAGAATGCGTCAT
GACGGAGAAGAGAGTGTTGGCTTTGCAAGGGAAACCACCATTCTTGACTG
CGTTACAGTCCTGTTTTACTACTCAGTTCATGAGTCCTTCAGAACGTGAC
AATATCCAAGCGCCGCCCACCACCCCACATCAACCGCCACAAGAAGTCAT
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CCCTATTCAAGACGATGCTGCCGTGGCTGCACTCGCTAAAAAATTCCAGT
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AAGAAAAACTTGAATCCAACCTGGGGCGAAACTTTTTCTTTCATGTGACA
TGAACGTCCACAAACGTTGCGAACAGTCAGGTTGTATCCCGAAATTATGC
GGCGCCGATCACACGGAGAAACGTGGTCGTATCCAAGTCAAAATCTTCTT
CGAACCGAAAGCTAAAGACGAAGGACGGCTCACTGTTCAAAGCTCCACAA
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TTCAATTCAGTTTTGGAGCAAACTGTCTCTTTCCCACGATCGCTGTCCAG
AGAAGCTATTTCTATAATCAAAGGCATCATCGCATATCAACCATACGGTG
CTTCAGTTGATTGGTGGGCGCTTGGTGTTCTCATTTATGAAATGTTGGCG
GGACAGGGATTTGAAATTAGACAACGTGTTATTAGACCAGAGTGGCCACA
TCAAGATTGCTGATTTCGGTATGTGTAAGGAAAACATCTTTGCACCGAAG
ACAACAAGAACTTTCTGTGGTACTCCTGATTACATCGCTCCTGAGGTTTT
ATGCAGCTGAGATTGTAGAGGGGTTATTATTTTTACACAAGCGTGGTATT
ATTTATCGGATCGTTTGTATTTTGTGATGGAGTTTGTCAACGGTGGTGAT
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TCTAAAGAAAGACGTCGTCTTACAAAACGACGATTTAGAATGCGTCATGA
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TTACAGTCCTGTTTTACTACTCAGTTCATGAGTCCTTCAGAACGTGACAA
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GTGATATGGAAAGGTTCAAATTAGAAGATTTCACTTTCTTAAAAGTTATT
GGAAAAGGATCTTTCGGAAAGTGATATCACACCAGCGGAAAAAGACAAAC
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AACCGAAAGCTAAAGACGAAGGACGGCTCACTGTTCAAAGCTCCACAAAA
CCCACATCGTTTCAAAGTACACACGTACGGAAGTCCCACGTTTTGCGATC
ACTGCGGAACTCTACTATATGGTTTGTTCAAACAAGGGTTAAAATGTCAA
GTATGTAGTTTTGGTGTACACAAAAGATGCCATGAATATGTCTCATTCAA
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CTCACATTGTAAAGATTTTATTTGAAATCCAAGAGGTCACATGACAATTT
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ATTTCATTCAACACGTCGATCAAAGGGTCTTCGAAAACTTCTCTTACATC
AATAATACTTTTGTTGGTCAGTAATTTTTGACGAAGAATCCGAGTCGTCG
TTTGGGGTCTGGTGAAACTGGAGAACAAGACATTCGAGATCATCAGTTCT
TCAAATATATTGATTGGGTCAAATTATACAAAATGGAAATTCAACCACCA
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AAGCTATTTCTATAATCAAAGGCATCATCGCATATCAACCATACGGTGCT
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AAGATTGCTGATTTCGGTATGTGTAAGGAAAACATCTTTGCACCGAAGAC
AACAAGAACTTTCTGTGGTACTCCTGATTACATCGCTCCTGAGGTTTTAT
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TTATCGGATCGTTTGTATTTTGTGATGGAGTTTGTCAACGGTGGTGATCT
GATGTTTCACATTCAACAAGTTGGGAAGTTTAAGGAACCTCAAGCTGTGT
CATGTTAGCAGAGAAGAAAGGTTCTGATCGTGTATACGCCATCAAGATTC
TAAAGAAAGACGTCGTCTTACAAAACGACGATTTAGAATGCGTCATGACG
GAGAAGAGAGTGTTGGCTTTGCAAGGGAAACCACCATTCTTGACTGCGTT
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TCCAAGCGCCGCCCACCACCCCACATCAACCGCCACAAGAAGTCATTAGT
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AAAAGGATCTTTCGGAAAGTGATATCACACCAGCGGAAAAAGACAAACGT
CTATCAGTCGAAGTATGGGACTACGACTTCGCAACTTCAAACGATTTCAT
GGGTTCCATGTCATTCGGTATCTCGGAACTACTGAAAGAACCAATCGAAG
GATGGTTTAAACTCCTCAACCAAGAAGAAGGAGAGTTTTATAACGTCCCT
ATTCAAGACGATGCTGCCGTGGCTGCACTCGCTAAAAAATTCCAGTTAAA
GAAGCGAAGAATTTGATTCCAATGGACCCAACAGGCATGTCTGATCCGTA
CGTCAAAATCAAGCTACAGCCTCACAAAAAGAAGACCAAAATCATGAAGA
AAAACTTGAATCCAACCTGGGGCGAAACTTTTTCTTTCATGTGACATGAA
CGTCCACAAACGTTGCGAACAGTCAGGTTGTATCCCGAAATTATGCGGCG
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TGCGGAACTCTACTATATGGTTTGTTCAAACAAGGGTTAAAATGTCAAGT
ATGTAGTTTTGGTGTACACAAAAGATGCCATGAATATGTCTCATTCAAAT
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TTATCAATGTAAAGATGTCAACTAAAGGGGGTGGAGGAGAAGAAGGAGCA
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TGGGGTCTGGTGAAACTGGAGAACAAGACATTCGAGATCATCAGTTCTTC
AAATATATTGATTGGGTCAAATTATACAAAATGGAAATTCAACCACCATA
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GCTATTTCTATAATCAAAGGCATCATCGCATATCAACCATACGGTGCTTC
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GATTGCTGATTTCGGTATGTGTAAGGAAAACATCTTTGCACCGAAGACAA
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AAGAAAGACGTCGTCTTACAAAACGACGATTTAGAATGCGTCATGACGGA
GAAGAGAGTGTTGGCTTTGCAAGGGAAACCACCATTCTTGACTGCGTTAC
AGTCCTGTTTTACTACTCAGTTCATGAGTCCTTCAGAACGTGACAATATC
CAAGCGCCGCCCACCACCCCACATCAACCGCCACAAGAAGTCATTAGTGA
TATGGAAAGGTTCAAATTAGAAGATTTCACTTTCTTAAAAGTTATTGGAA
AAGGATCTTTCGGAAAGTGATATCACACCAGCGGAAAAAGACAAACGTCT
ATCAGTCGAAGTATGGGACTACGACTTCGCAACTTCAAACGATTTCATGG
GTTCCATGTCATTCGGTATCTCGGAACTACTGAAAGAACCAATCGAAGGA
TGGTTTAAACTCCTCAACCAAGAAGAAGGAGAGTTTTATAACGTCCCTAT
TCAAGACGATGCTGCCGTGGCTGCACTCGCTAAAAAATTCCAGTTAAAGA
AGCGAAGAATTTGATTCCAATGGACCCAACAGGCATGTCTGATCCGTACG
TCAAAATCAAGCTACAGCCTCACAAAAAGAAGACCAAAATCATGAAGAAA
AACTTGAATCCAACCTGGGGCGAAACTTTTTCTTTCATGTGACATGAACG
TCCACAAACGTTGCGAACAGTCAGGTTGTATCCCGAAATTATGCGGCGCC
GATCACACGGAGAAACGTGGTCGTATCCAAGTCAAAATCTTCTTCGAACC
GAAAGCTAAAGACGAAGGACGGCTCACTGTTCAAAGCTCCACAAAACCCA
CATCGTTTCAAAGTACACACGTACGGAAGTCCCACGTTTTGCGATCACTG
CGGAACTCTACTATATGGTTTGTTCAAACAAGGGTTAAAATGTCAAGTAT
GTAGTTTTGGTGTACACAAAAGATGCCATGAATATGTCTCATTCAAATGT
CCAGGAGCTGACACTGGGCCTGATGACGGGTGTAGTTGGAAATAACGGTT
ATCAATGTAAAGATGTCAACTAAAGGGGGTGGAGGAGAAGAAGGAGCAAG
AGGGTTTAACAGACGTGGAGCTATCAGAGAGAAAAATATATTTGAAGTAA
AGGATCACAAATTTGTACCAAAGTTTTTTAAGCAGCCAACATTTTGCTCA
CATTGTAAAGATTTTATTTGAAATCCAAGAGGTCACATGACAATTTCGAT
CCAGAATTTACAGAAGAAGCAACTCGCCTGACGCCCATCGACCGTAATTT
CATTCAACACGTCGATCAAAGGGTCTTCGAAAACTTCTCTTACATCAATA
ATACTTTTGTTGGTCAGTAATTTTTGACGAAGAATCCGAGTCGTCGTTTG
GGGTCTGGTGAAACTGGAGAACAAGACATTCGAGATCATCAGTTCTTCAA
ATATATTGATTGGGTCAAATTATACAAAATGGAAATTCAACCACCATACA
AGCCTAAAGTTCCTCCTTTTGATGGTGAGGACGAAGACGAACTTTTCAAT
TCAGTTTTGGAGCAAACTGTCTCTTTCCCACGATCGCTGTCCAGAGAAGC
TATTTCTATAATCAAAGGCATCATCGCATATCAACCATACGGTGCTTCAG
TTGATTGGTGGGCGCTTGGTGTTCTCATTTATGAAATGTTGGCGGGACAG
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TTGCTGATTTCGGTATGTGTAAGGAAAACATCTTTGCACCGAAGACAACA
AGAACTTTCTGTGGTACTCCTGATTACATCGCTCCTGAGGTTTTATGCAG
CTGAGATTGTAGAGGGGTTATTATTTTTACACAAGCGTGGTATTATTTAT
CGGATCGTTTGTATTTTGTGATGGAGTTTGTCAACGGTGGTGATCTGATG
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TTAGCAGAGAAGAAAGGTTCTGATCGTGTATACGCCATCAAGATTCTAAA
GAAAGACGTCGTCTTACAAAACGACGATTTAGAATGCGTCATGACGGAGA
AGAGAGTGTTGGCTTTGCAAGGGAAACCACCATTCTTGACTGCGTTACAG
TCCTGTTTTACTACTCAGTTCATGAGTCCTTCAGAACGTGACAATATCCA
AGCGCCGCCCACCACCCCACATCAACCGCCACAAGAAGTCATTAGTGATA
TGGAAAGGTTCAAATTAGAAGATTTCACTTTCTTAAAAGTTATTGGAAAA
GGATCTTTCGGAAAGTGATATCACACCAGCGGAAAAAGACAAACGTCTAT
CAGTCGAAGTATGGGACTACGACTTCGCAACTTCAAACGATTTCATGGGT
TCCATGTCATTCGGTATCTCGGAACTACTGAAAGAACCAATCGAAGGATG
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AAGACGATGCTGCCGTGGCTGCACTCGCTAAAAAATTCCAGTTAAAGAAG
CGAAGAATTTGATTCCAATGGACCCAACAGGCATGTCTGATCCGTACGTC
AAAATCAAGCTACAGCCTCACAAAAAGAAGACCAAAATCATGAAGAAAAA
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GATCACAAATTTGTACCAAAGTTTTTTAAGCAGCCAACATTTTGCTCACA
TTGTAAAGATTTTATTTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13841MSTRG.13841Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.13841.1.p1.exon9MSTRG.13841.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13841.1.p1.exon8MSTRG.13841.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13841.1.p1.exon7MSTRG.13841.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13841.1.p1.exon6MSTRG.13841.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13841.1.p1.exon5MSTRG.13841.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13841.1.p1.exon4MSTRG.13841.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13841.1.p1.exon3MSTRG.13841.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13841.1.p1.exon2MSTRG.13841.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13841.1.p1.exon1MSTRG.13841.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13841.1.p1MSTRG.13841.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000112_pilongenomesc0000112_pilon:1002896..1030265 -