MSTRG.13832.5.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13832.5.p1
Unique NameMSTRG.13832.5.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000112_pilon:803259..817708+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13832.5.p1 ID=MSTRG.13832.5.p1|Name=MSTRG.13832.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14450bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:803259..817708+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:803259..817708+

>MSTRG.13832.5.p1 ID=MSTRG.13832.5.p1|Name=MSTRG.13832.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=15114bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:803259..817708+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGTACAACCgtgagaaaaagaagaattggAACTGTGTGAAACGACTCTT
TCCAAATTTCACTTCGTACCGGAATAATTGGTCTTTTTATTTATTCCCCG
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GAGAGAGTACCCACCCTGGAGAAAACGTATTTACAAATTATGCACAAGTG
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ATGTCTCTTGAACATTATCAGATGAGTGAGGAATTCCACATTTTGTTGGA
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TGATGGTCGCTCTCTCACCGAGAAGATACGTCAAAAACAAcattAAAATT
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ggAACTGTGTGAAACGACTCTTTCCAAATTTCACTTCGTACCGGAATAAT
TGGTCTTTTTATTTATTCCCCGTGGATTGCAGGTTCCGAAGGACCATGAT
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TGTACAGTTGTGTTTTGTTGGCCCTTGAAAACCCTCACAAAAAGATGTCA
CCAAGTTTACGTTATTTGATCGACACTTCGATGTTTATGATGACGTGGAT
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CAAAGCACAACACATCGAAATAATCAAAGGAATGCGTGTTCTGAGAGCTA
CAAGAGCTTTAAGACCGTTAAgGATGATCAGAAAAGCTCCAGGTTTGAAA
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TGAGCACTAAGGACGGGTGGATTGATATTATGAGGCGTGGCATCGATGCT
AGAGGAGTTGATCTGGCGCCACGTACCAATTATGCACAATGGAGGATTTT
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GTTATCTGTTCAAATGTTGTTATAATGTCTCTTGAACATTATCAGATGAG
TGAGGAATTCCACATTTTGTTGGAAGTTTGCAATATCATTTTCACGACCA
CGTATATTTGTGAGGCTGTTCTGTTGATGGTCGCTCTCTCACCGAGAAGA
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TTCTTTTGAATCATGTAGCCGAGACAATTCCTCAGGTATTAGAGTTCAGT
ACAACCgtgagaaaaagaagaattggAACTGTGTGAAACGACTCTTTCCA
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TTGCAGGTTCCGAAGGACCATGATTCGAATAACAGCATCCAAATGGTTCG
ACGCCATTATACTTCTGTTAATCTTGTACAGTTGTGTTTTGTTGGCCCTT
GAAAACCCTCACAAAAAGATGTCACCAAGTTTACGTTATTTGATCGACAC
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TCATAGCAGACGGATTCATATCAGGCCACGGTTCTTATCTACGTTGTGGG
TGGAATGTTCTTGACTTCATGCTGGTACTAACATCCATCGTTGATGTCTT
CATAACTCTCTACTTCTCTGGCACCAAAGCACAACACATCGAAATAATCA
AAGGAATGCGTGTTCTGAGAGCTACAAGAGCTTTAAGACCGTTAAgGATG
ATCAGAAAAGCTCCAGGTTTGAAATTGGTAGTTCAGACGTTACTGTTCTC
CTTGAAACCGATTGGGAACACTGTTCTTATAGCCACCATTTTCTTCATTG
TGTTCGGAATACTCGGGGTTCAGCAATTGAAAGGGAAGTTTTATTATTGC
TTTGGTGTGACGGCTAACTTGGTGCGCAACAAAACAGAATGTATTCAACA
CCCTGATGGTGTTTGGACCAATTATCAATATAACTTTGATAACTTGCTGG
AGgcgtTGATGACGTTATTCGTTGTGAGCACTAAGGACGGGTGGATTGAT
ATTATGAGGCGTGGCATCGATGCTAGAGGAGTTGATCTGGCGCCACGTAC
CAATTATGCACAATGGAGGATTTTATATTTCGTCTCCTTTCTCCTAATTG
GTGGTTTTTTGGTGCTCAATATGATTGTGGGCGTGGTCGTGGAGAACTTC
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GTTACAGAAGTGGAAGAAGAAGATTGAACAAAGGCGGAACAACTATTGGA
GAGAGTACCCACCCTGGAGAAAACGTATTTACAAATTATGCACAAGTGCA
TCATGGGATGTTGCAATCACCTCGGTTATCTGTTCAAATGTTGTTATAAT
GTCTCTTGAACATTATCAGATGAGTGAGGAATTCCACATTTTGTTGGAAG
TTTGCAATATCATTTTCACGACCACGTATATTTGTGAGGCTGTTCTGTTG
ATGGTCGCTCTCTCACCGAGAAGATACGTCAAAAACAAcattAAAATTAT
TGAAGATGGCAAAAGGATTACGATTTCTTTTGAATCATGTAGCCGAGACA
ATTCCTCAGGTATTAGAGTTCAGTACAACCgtgagaaaaagaagaattgg
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GAATAACAGCATCCAAATGGTTCGACGCCATTATACTTCTGTTAATCTTG
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AAGTTTACGTTATTTGATCGACACTTCGATGTTTATGATGACGTGGATTT
TCTTCATTGAAATGATGATTAAGGTCATAGCAGACGGATTCATATCAGGC
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ACTAACATCCATCGTTGATGTCTTCATAACTCTCTACTTCTCTGGCACCA
AAGCACAACACATCGAAATAATCAAAGGAATGCGTGTTCTGAGAGCTACA
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GGTAGTTCAGACGTTACTGTTCTCCTTGAAACCGATTGGGAACACTGTTC
TTATAGCCACCATTTTCTTCATTGTGTTCGGAATACTCGGGGTTCAGCAA
TTGAAAGGGAAGTTTTATTATTGCTTTGGTGTGACGGCTAACTTGGTGCG
CAACAAAACAGAATGTATTCAACACCCTGATGGTGTTTGGACCAATTATC
AATATAACTTTGATAACTTGCTGGAGgcgtTGATGACGTTATTCGTTGTG
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AGGAGTTGATCTGGCGCCACGTACCAATTATGCACAATGGAGGATTTTAT
ATTTCGTCTCCTTTCTCCTAATTGGTGGTTTTTTGGTGCTCAATATGATT
GTGGGCGTGGTCGTGGAGAACTTCCAGAAATGTCAAGAACTTCAAGATAT
CCAAAGTAATAAAGCACGAAATGTGTTACAGAAGTGGAAGAAGAAGATTG
AACAAAGGCGGAACAACTATTGGAGAGAGTACCCACCCTGGAGAAAACGT
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TATATTTGTGAGGCTGTTCTGTTGATGGTCGCTCTCTCACCGAGAAGATA
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TTTCACTTCGTACCGGAATAATTGGTCTTTTTATTTATTCCCCGTGGATT
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GCCATTATACTTCTGTTAATCTTGTACAGTTGTGTTTTGTTGGCCCTTGA
AAACCCTCACAAAAAGATGTCACCAAGTTTACGTTATTTGATCGACACTT
CGATGTTTATGATGACGTGGATTTTCTTCATTGAAATGATGATTAAGGTC
ATAGCAGACGGATTCATATCAGGCCACGGTTCTTATCTACGTTGTGGGTG
GAATGTTCTTGACTTCATGCTGGTACTAACATCCATCGTTGATGTCTTCA
TAACTCTCTACTTCTCTGGCACCAAAGCACAACACATCGAAATAATCAAA
GGAATGCGTGTTCTGAGAGCTACAAGAGCTTTAAGACCGTTAAgGATGAT
CAGAAAAGCTCCAGGTTTGAAATTGGTAGTTCAGACGTTACTGTTCTCCT
TGAAACCGATTGGGAACACTGTTCTTATAGCCACCATTTTCTTCATTGTG
TTCGGAATACTCGGGGTTCAGCAATTGAAAGGGAAGTTTTATTATTGCTT
TGGTGTGACGGCTAACTTGGTGCGCAACAAAACAGAATGTATTCAACACC
CTGATGGTGTTTGGACCAATTATCAATATAACTTTGATAACTTGCTGGAG
gcgtTGATGACGTTATTCGTTGTGAGCACTAAGGACGGGTGGATTGATAT
TATGAGGCGTGGCATCGATGCTAGAGGAGTTGATCTGGCGCCACGTACCA
ATTATGCACAATGGAGGATTTTATATTTCGTCTCCTTTCTCCTAATTGGT
GGTTTTTTGGTGCTCAATATGATTGTGGGCGTGGTCGTGGAGAACTTCCA
GAAATGTCAAGAACTTCAAGATATCCAAAGTAATAAAGCACGAAATGTGT
TACAGAAGTGGAAGAAGAAGATTGAACAAAGGCGGAACAACTATTGGAGA
GAGTACCCACCCTGGAGAAAACGTATTTACAAATTATGCACAAGTGCATC
ATGGGATGTTGCAATCACCTCGGTTATCTGTTCAAATGTTGTTATAATGT
CTCTTGAACATTATCAGATGAGTGAGGAATTCCACATTTTGTTGGAAGTT
TGCAATATCATTTTCACGACCACGTATATTTGTGAGGCTGTTCTGTTGAT
GGTCGCTCTCTCACCGAGAAGATACGTCAAAAACAAcattAAAATTATTG
AAGATGGCAAAAGGATTACGATTTCTTTTGAATCATGTAGCCGAGACAAT
TCCTCAGGTATTAGAGTTCAGTACAACCgtgagaaaaagaagaattggAA
CTGTGTGAAACGACTCTTTCCAAATTTCACTTCGTACCGGAATAATTGGT
CTTTTTATTTATTCCCCGTGGATTGCAGGTTCCGAAGGACCATGATTCGA
ATAACAGCATCCAAATGGTTCGACGCCATTATACTTCTGTTAATCTTGTA
CAGTTGTGTTTTGTTGGCCCTTGAAAACCCTCACAAAAAGATGTCACCAA
GTTTACGTTATTTGATCGACACTTCGATGTTTATGATGACGTGGATTTTC
TTCATTGAAATGATGATTAAGGTCATAGCAGACGGATTCATATCAGGCCA
CGGTTCTTATCTACGTTGTGGGTGGAATGTTCTTGACTTCATGCTGGTAC
TAACATCCATCGTTGATGTCTTCATAACTCTCTACTTCTCTGGCACCAAA
GCACAACACATCGAAATAATCAAAGGAATGCGTGTTCTGAGAGCTACAAG
AGCTTTAAGACCGTTAAgGATGATCAGAAAAGCTCCAGGTTTGAAATTGG
TAGTTCAGACGTTACTGTTCTCCTTGAAACCGATTGGGAACACTGTTCTT
ATAGCCACCATTTTCTTCATTGTGTTCGGAATACTCGGGGTTCAGCAATT
GAAAGGGAAGTTTTATTATTGCTTTGGTGTGACGGCTAACTTGGTGCGCA
ACAAAACAGAATGTATTCAACACCCTGATGGTGTTTGGACCAATTATCAA
TATAACTTTGATAACTTGCTGGAGgcgtTGATGACGTTATTCGTTGTGAG
CACTAAGGACGGGTGGATTGATATTATGAGGCGTGGCATCGATGCTAGAG
GAGTTGATCTGGCGCCACGTACCAATTATGCACAATGGAGGATTTTATAT
TTCGTCTCCTTTCTCCTAATTGGTGGTTTTTTGGTGCTCAATATGATTGT
GGGCGTGGTCGTGGAGAACTTCCAGAAATGTCAAGAACTTCAAGATATCC
AAAGTAATAAAGCACGAAATGTGTTACAGAAGTGGAAGAAGAAGATTGAA
CAAAGGCGGAACAACTATTGGAGAGAGTACCCACCCTGGAGAAAACGTAT
TTACAAATTATGCACAAGTGCATCATGGGATGTTGCAATCACCTCGGTTA
TCTGTTCAAATGTTGTTATAATGTCTCTTGAACATTATCAGATGAGTGAG
GAATTCCACATTTTGTTGGAAGTTTGCAATATCATTTTCACGACCACGTA
TATTTGTGAGGCTGTTCTGTTGATGGTCGCTCTCTCACCGAGAAGATACG
TCAAAAACAAcattAAAATTATTGAAGATGGCAAAAGGATTACGATTTCT
TTTGAATCATGTAGCCGAGACAATTCCTCAGGTATTAGAGTTCAGTACAA
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TCACTTCGTACCGGAATAATTGGTCTTTTTATTTATTCCCCGTGGATTGC
AGGTTCCGAAGGACCATGATTCGAATAACAGCATCCAAATGGTTCGACGC
CATTATACTTCTGTTAATCTTGTACAGTTGTGTTTTGTTGGCCCTTGAAA
ACCCTCACAAAAAGATGTCACCAAGTTTACGTTATTTGATCGACACTTCG
ATGTTTATGATGACGTGGATTTTCTTCATTGAAATGATGATTAAGGTCAT
AGCAGACGGATTCATATCAGGCCACGGTTCTTATCTACGTTGTGGGTGGA
ATGTTCTTGACTTCATGCTGGTACTAACATCCATCGTTGATGTCTTCATA
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AATGCGTGTTCTGAGAGCTACAAGAGCTTTAAGACCGTTAAgGATGATCA
GAAAAGCTCCAGGTTTGAAATTGGTAGTTCAGACGTTACTGTTCTCCTTG
AAACCGATTGGGAACACTGTTCTTATAGCCACCATTTTCTTCATTGTGTT
CGGAATACTCGGGGTTCAGCAATTGAAAGGGAAGTTTTATTATTGCTTTG
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GATGGTGTTTGGACCAATTATCAATATAACTTTGATAACTTGCTGGAGgc
gtTGATGACGTTATTCGTTGTGAGCACTAAGGACGGGTGGATTGATATTA
TGAGGCGTGGCATCGATGCTAGAGGAGTTGATCTGGCGCCACGTACCAAT
TATGCACAATGGAGGATTTTATATTTCGTCTCCTTTCTCCTAATTGGTGG
TTTTTTGGTGCTCAATATGATTGTGGGCGTGGTCGTGGAGAACTTCCAGA
AATGTCAAGAACTTCAAGATATCCAAAGTAATAAAGCACGAAATGTGTTA
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GTACCCACCCTGGAGAAAACGTATTTACAAATTATGCACAAGTGCATCAT
GGGATGTTGCAATCACCTCGGTTATCTGTTCAAATGTTGTTATAATGTCT
CTTGAACATTATCAGATGAGTGAGGAATTCCACATTTTGTTGGAAGTTTG
CAATATCATTTTCACGACCACGTATATTTGTGAGGCTGTTCTGTTGATGG
TCGCTCTCTCACCGAGAAGATACGTCAAAAACAAcattAAAATTATTGAA
GATGGCAAAAGGATTACGATTTCTTTTGAATCATGTAGCCGAGACAATTC
CTCAGGTATTAGAGTTCAGTACAACCgtgagaaaaagaagaattggAACT
GTGTGAAACGACTCTTTCCAAATTTCACTTCGTACCGGAATAATTGGTCT
TTTTATTTATTCCCCGTGGATTGCAGGTTCCGAAGGACCATGATTCGAAT
AACAGCATCCAAATGGTTCGACGCCATTATACTTCTGTTAATCTTGTACA
GTTGTGTTTTGTTGGCCCTTGAAAACCCTCACAAAAAGATGTCACCAAGT
TTACGTTATTTGATCGACACTTCGATGTTTATGATGACGTGGATTTTCTT
CATTGAAATGATGATTAAGGTCATAGCAGACGGATTCATATCAGGCCACG
GTTCTTATCTACGTTGTGGGTGGAATGTTCTTGACTTCATGCTGGTACTA
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AAGGGAAGTTTTATTATTGCTTTGGTGTGACGGCTAACTTGGTGCGCAAC
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TAACTTTGATAACTTGCTGGAGgcgtTGATGACGTTATTCGTTGTGAGCA
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CGTCTCCTTTCTCCTAATTGGTGGTTTTTTGGTGCTCAATATGATTGTGG
GCGTGGTCGTGGAGAACTTCCAGAAATGTCAAGAACTTCAAGATATCCAA
AGTAATAAAGCACGAAATGTGTTACAGAAGTGGAAGAAGAAGATTGAACA
AAGGCGGAACAACTATTGGAGAGAGTACCCACCCTGGAGAAAACGTATTT
ACAAATTATGCACAAGTGCATCATGGGATGTTGCAATCACCTCGGTTATC
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TTTGTGAGGCTGTTCTGTTGATGGTCGCTCTCTCACCGAGAAGATACGTC
AAAAACAAcattAAAATTATTGAAGATGGCAAAAGGATTACGATTTCTTT
TGAATCATGTAGCCGAGACAATTCCTCAGGTATTAGAGTTCAGTACAACC
gtgagaaaaagaagaattggAACTGTGTGAAACGACTCTTTCCAAATTTC
ACTTCGTACCGGAATAATTGGTCTTTTTATTTATTCCCCGTGGATTGCAG
GTTCCGAAGGACCATGATTCGAATAACAGCATCCAAATGGTTCGACGCCA
TTATACTTCTGTTAATCTTGTACAGTTGTGTTTTGTTGGCCCTTGAAAAC
CCTCACAAAAAGATGTCACCAAGTTTACGTTATTTGATCGACACTTCGAT
GTTTATGATGACGTGGATTTTCTTCATTGAAATGATGATTAAGGTCATAG
CAGACGGATTCATATCAGGCCACGGTTCTTATCTACGTTGTGGGTGGAAT
GTTCTTGACTTCATGCTGGTACTAACATCCATCGTTGATGTCTTCATAAC
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AAAGCTCCAGGTTTGAAATTGGTAGTTCAGACGTTACTGTTCTCCTTGAA
ACCGATTGGGAACACTGTTCTTATAGCCACCATTTTCTTCATTGTGTTCG
GAATACTCGGGGTTCAGCAATTGAAAGGGAAGTTTTATTATTGCTTTGGT
GTGACGGCTAACTTGGTGCGCAACAAAACAGAATGTATTCAACACCCTGA
TGGTGTTTGGACCAATTATCAATATAACTTTGATAACTTGCTGGAGgcgt
TGATGACGTTATTCGTTGTGAGCACTAAGGACGGGTGGATTGATATTATG
AGGCGTGGCATCGATGCTAGAGGAGTTGATCTGGCGCCACGTACCAATTA
TGCACAATGGAGGATTTTATATTTCGTCTCCTTTCTCCTAATTGGTGGTT
TTTTGGTGCTCAATATGATTGTGGGCGTGGTCGTGGAGAACTTCCAGAAA
TGTCAAGAACTTCAAGATATCCAAAGTAATAAAGCACGAAATGTGTTACA
GAAGTGGAAGAAGAAGATTGAACAAAGGCGGAACAACTATTGGAGAGAGT
ACCCACCCTGGAGAAAACGTATTTACAAATTATGCACAAGTGCATCATGG
GATGTTGCAATCACCTCGGTTATCTGTTCAAATGTTGTTATAATGTCTCT
TGAACATTATCAGATGAGTGAGGAATTCCACATTTTGTTGGAAGTTTGCA
ATATCATTTTCACGACCACGTATATTTGTGAGGCTGTTCTGTTGATGGTC
GCTCTCTCACCGAGAAGATACGTCAAAAACAAcattAAAATTATTGAAGA
TGGCAAAAGGATTACGATTTCTTTTGAATCATGTAGCCGAGACAATTCCT
CAGGTATTAGAGTT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13832MSTRG.13832Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13832.5.p1MSTRG.13832.5.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13832.5.p1.exon1MSTRG.13832.5.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.13832.5.p1.exon4MSTRG.13832.5.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.13832.5.p1.exon9MSTRG.13832.5.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13832.5.p1.exon10MSTRG.13832.5.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13832.5.p1.exon11MSTRG.13832.5.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000112_pilongenomesc0000112_pilon:803259..817708 +