|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:798763..802665+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13832.4.p1 ID=MSTRG.13832.4.p1|Name=MSTRG.13832.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3903bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:798763..802665+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTAATTTTTATTTGGATCTTCACTATCGAGATGATCGTCAAAATGTTTGG
TATTGGATTGAGAGCATATTTCCAAATGGGGTTCAATTGTTTTGATTGCA
TCGTTGTCATGTTAAGGTAATGTTTTGGCTTACTAAATAACAATTGatga
tatgcatcattgcaatgtcttccacatCACCCACATGGACtcgacagctg
attggttgtaagtgaagtaaaatcagtcaaaacgTCACCTGCaatcaatc
agctgttgggtccgtgatgtaatgtcagaaaacATTGctatggtgcatat
catggataTCTATTTATGGACATCAGAAGGTTTTGAGTCTGGCTAGAAGA
GTTCCTCCCCTTGGTCAAGTCAAATTTAATTTGGAACACTGTTCCGTTGA
GTGAATTTCCTAGGGGGAGACAAATTTCCGGGAAGCATATTTCCAGAAGG
GGGTAAGTAACCGGGAGCGAAATTCCTGGGCACACGTTTCCGTACGGTAG
ATCTTTTTGGTGCAAGTTTCCGAGGGGCAAGTTTCCCGGGGTCAAAGTTC
ATGTCACCAGTAGGGAAATGATTGAGTTACGTTAACTACTATAATCATGC
ttaggatttttcaaaatgtttttttcgtaTATTTAGCATGATGGAATTAC
TCATCAATGATAATAACAGTTCCGGTAATTTTACCGTATTCCGGTCATTA
CGATTACTCCGGATTTTCCGTCTTATCCGACCGATGCGTCATCAAATTGC
CGTTATGTTACGAACAACGTCGTCCGTCATGACGTTTTTTGCGTTGCTGT
TTCTCTTCATGTTCACATTCGCTATTTTGGGAATGCATATTTTTGGTGGg
aaatttgttttcaagaaTCGATATGGGAAAATGGTGTTGGCAAGATCcaa
ttttgattcttttgtATGGGCTATTGTGACTGTTTTCCAGGTAAATCGAA
ACCCGTTAAATACTCTCGGGTCCTTAATagccgggggtttggaataagca
ggggggttggaaaaatctcaaaaattgagCGGGGGGTAATTTTCCTGTAA
CGAAAAGGAGGCTTACAGcagaatagttttcaaaatcaaggttttaaaat
ttgaaattcattaaACTACATCGAATCAAAAATTCGTTTAGGGAAttaaa
atcgtgaatttttcgagtaatcacatgttttgactgcattgatataattt
ttcaaCCCGTGTATTTTGGAGTTTATCTGTAATTTAACAGGTGGTTTTTC
ATCCACCTCTAACTGTTAGGTTTTTTCGATTCGGGTGGGTTattggcttc
caggctatattctgagccttattttTAGCCAGTTAGTTAAAGTCAGAGTT
AAAACACTGCTTAAAAATCGTAAGTAAAAgcgcacttaaaaatcacttgc
agtTTTAGAATTtcgagggaattccccttttgtgccaattttataGCCAA
CATTGTATTAGGTTCTAATAGAGGGGACACGGTATATACATTAAGCAAGG
TGTTTGAATATTTATTTGAAAGGTTTTGcttttgaataagagtgatatcg
tctgcttattcatcaatttaaattcataagctttttcacacttgattgac
acggatgtggagcaagattggtcagaaagaacaaaagaaaaacatttttt
gcttatatcagcataatataacaatagacagacactgtcctggtatgaaa
CATCTCTCTAacatgaaacggaaacacttatgtAaaaatAaaACCCTTAA
TATGTTTCTTACCTTACAGATACTGACTCAAGAAGACTGGAATCTAGTCA
TGTACGACGGTATCCGAGCGACAACAAAATGGGCGTCACTTTATTTCTTA
TCCTTGATGACGATTGGTTATTATGTCTTGTTCAACCTGTTGGTTGCTAT
CCTTGTCGAAGGTTTTACCACGCCGCTCGTAAGTGTATTTAGAGTGTTCA
ACCTGTTGGTTGCTATCCTTGTCGAAGGCTTTACCACGCCACTCGTAAGT
TGATCTAATACATAGTCCCTCATTAGTTCCCTTTTTTAACAATTCTTATA
GCCCTCACGGTCGAGCCACATTCATCAGGaaaaaaaTTGGTCGTATATAA
CAGCTTTTAGGACCTCCGTTCAGGTAAAGAGGGTTCAGGTAATAGTTGAT
GGTAGTTTACTATATCGTATAATTTATTGTATCGTATTTTGATTTCCTAT
AATTCAGGAAAAGAAACGTATGACTCGACACATTGTTTCATTGTTGAAAA
GCAAAGCCAACAAAAAGATGTTAACATTGAAGCGGACAATCAGTTTACCG
GACATGCTGATGAACAATAATAACGTTTCCAATAACAACAATCAAAACAC
ACAAGAAGATGAGGTTCGTGTGGGAGGAGGGTTCCTTGATCATTGTTTTT
CCAGGGATgtcaaaatcaaagtcaatttccctgTGGGGTCGACACTGTAt
ggtatttttccaccggggacgaaatgccgtatcggggaaaaaaatttcag
agttttatttagtcgggttttttttcgtcgggggaaaatttcgtcacccc
ctgaaaatttttcatcactttcccccgacatttttttcccccgataaggt
atagtaAAGTATTATTCCCTTTGCACAAAATATTATTATTGACTTATGTA
AGAAATAACGGGCGTTAGAAACAAGTCGTGTTTTCATGCTCCGGTCCTTT
TCCTTTTGATAGATATCTACTTTATTTTCAGAAACAACCGTATGAATGAA
GTGTTGATCAAAAATTGTACTCTTTCTTTAGACAGAAACACAAGGACAAA
TATATGCACGGATGATGGCAAGACGTCGTACGCTGGGTGAGTCTTGACTT
TATAGGTGCACGTATCtttgaaatagtttttgttATAAGAGATGCGAATC
AAACTTGGAAATCGCTCGGAAAACCTAGAAAATTTTTGCTGATAAGCaat
ttttttgtggttttgccctttttattAAACctttgtcacaaaaattgaaa
aagatctATAATATCATAATATCATACCCTAAAGTTTTAATGAGGACAAC
GATTACCAGCTCAAAAAACTTACTTGGCAAAAATTGGCTGAGCGGACGTG
ATTTTTGAGGTCGATTCGCATctcgataaaacaaaattagaaGGTGCTAG
CAGCCTAGAGTTTGGTTATTTATAAAGCCATCGATTTTAGCGCCCGTCAA
TCCCAGCAACTGGGACTAGAGTAAATATGAGCTAAAATGTGCTAGAATTT
TCTAGCTTGTGAAAGCATGAATTGTTATGTCTACAAAAATCTGATTTCAC
AAAAtcattattttataaaagatttctgttcttaaaatacaataatttat
ttccaaacatttttCCACAGGAACGATAGGTTTGAACAACCACGACACCT
TCTCTTCCACCAAGAATAATGCTGGTGATTACAGCTCTAGTGAAGGTGAG
ACTTCTTGGGAATTCTATCGAGCGTTACATGCATGACTTTTCTTCCTAGA
ATGTTTATATTTTAGTCATGACGAGAATTTTATTAATTATTGCACCATAT
TAAATAAATCTGCCGATATATCAATCCGGCGGTTCTGTGAGAACTATCCG
GGCTTCGTGTTTCAGATAGGAATGAGTGGCTTcgtttcccatccaagagt
ttcatTTCTAGCTCCATTGAGGCTTTAAATCCAATGGTGATTTCCACAAT
GAACATAAAATTGTATGCACTCCCTTTACCTTAAAGATGAAGAAGACATC
AACCTCTCACCGCTTGCTCAATGTGTTAAAGAGAAAACGAAACAAAACAA
ACCCATCCTATTATCAGCACGAGTAACATACGATGATGACCCAAAAGTCT
TGGAATGGAAAGCTCTGAATGATGTGGAAGCTAACACTGCACTATTGCAA
GAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:798763..802665+ >MSTRG.13832.4.p1 ID=MSTRG.13832.4.p1|Name=MSTRG.13832.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4140bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:798763..802665+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGCTATTGTGACTGTTTTCCAGAAGACTGGAATCTAGTCATGTACGA
CGGTATCCGAGCGACAACAAAATGGGCGTCACTTTATTTCTTATCCTTGA
TGACGATTGGTTATTATGTCTTGTTCAACCTGTTGGTTGCTATCCTTGTC
GAAGGTTTTACCACGCCGCTCGTAAGTGTATTTAGAGTGTTCAACCTGTT
GGTTGCTATCCTTGTCGAAGGCTTTACCACGCCACTCGAAAAGAAACGTA
TGACTCGACACATTGTTTCATTGTTGAAAAGCAAAGCCAACAAAAAGATG
TTAACATTGAAGCGGACAATCAGTTTACCGGACATGCTGATGAACAATAA
TAACGTTTCCAATAACAACAATCAAAACACACAAGAAGATGAGACAGAAA
CACAAGGACAAATATATGCACGGATGATGGCAAGACGTCGTACGCTGGGA
ACGATAGGTTTGAACAACCACGACACCTTCTCTTCCACCAAGAATAATGC
TGGTGATTACAGCTCTAGTGAAGATGAAGAAGACATCAACCTCTCACCGC
TTGCTCAATGTGTTAAAGAGAAAACGAAACAAAACAAACCCATCCTATTA
TCAGCACGAGTAACATACGATGATGACCCAAAAGTCTTGGAATGGAAAGC
TCTGAATGATGTGGAAGCTAACACTGCACTATTGCAAGAGATGGGCTATT
GTGACTGTTTTCCAGAAGACTGGAATCTAGTCATGTACGACGGTATCCGA
GCGACAACAAAATGGGCGTCACTTTATTTCTTATCCTTGATGACGATTGG
TTATTATGTCTTGTTCAACCTGTTGGTTGCTATCCTTGTCGAAGGTTTTA
CCACGCCGCTCGTAAGTGTATTTAGAGTGTTCAACCTGTTGGTTGCTATC
CTTGTCGAAGGCTTTACCACGCCACTCGAAAAGAAACGTATGACTCGACA
CATTGTTTCATTGTTGAAAAGCAAAGCCAACAAAAAGATGTTAACATTGA
AGCGGACAATCAGTTTACCGGACATGCTGATGAACAATAATAACGTTTCC
AATAACAACAATCAAAACACACAAGAAGATGAGACAGAAACACAAGGACA
AATATATGCACGGATGATGGCAAGACGTCGTACGCTGGGAACGATAGGTT
TGAACAACCACGACACCTTCTCTTCCACCAAGAATAATGCTGGTGATTAC
AGCTCTAGTGAAGATGAAGAAGACATCAACCTCTCACCGCTTGCTCAATG
TGTTAAAGAGAAAACGAAACAAAACAAACCCATCCTATTATCAGCACGAG
TAACATACGATGATGACCCAAAAGTCTTGGAATGGAAAGCTCTGAATGAT
GTGGAAGCTAACACTGCACTATTGCAAGAGATGGGCTATTGTGACTGTTT
TCCAGAAGACTGGAATCTAGTCATGTACGACGGTATCCGAGCGACAACAA
AATGGGCGTCACTTTATTTCTTATCCTTGATGACGATTGGTTATTATGTC
TTGTTCAACCTGTTGGTTGCTATCCTTGTCGAAGGTTTTACCACGCCGCT
CGTAAGTGTATTTAGAGTGTTCAACCTGTTGGTTGCTATCCTTGTCGAAG
GCTTTACCACGCCACTCGAAAAGAAACGTATGACTCGACACATTGTTTCA
TTGTTGAAAAGCAAAGCCAACAAAAAGATGTTAACATTGAAGCGGACAAT
CAGTTTACCGGACATGCTGATGAACAATAATAACGTTTCCAATAACAACA
ATCAAAACACACAAGAAGATGAGACAGAAACACAAGGACAAATATATGCA
CGGATGATGGCAAGACGTCGTACGCTGGGAACGATAGGTTTGAACAACCA
CGACACCTTCTCTTCCACCAAGAATAATGCTGGTGATTACAGCTCTAGTG
AAGATGAAGAAGACATCAACCTCTCACCGCTTGCTCAATGTGTTAAAGAG
AAAACGAAACAAAACAAACCCATCCTATTATCAGCACGAGTAACATACGA
TGATGACCCAAAAGTCTTGGAATGGAAAGCTCTGAATGATGTGGAAGCTA
ACACTGCACTATTGCAAGAGATGGGCTATTGTGACTGTTTTCCAGAAGAC
TGGAATCTAGTCATGTACGACGGTATCCGAGCGACAACAAAATGGGCGTC
ACTTTATTTCTTATCCTTGATGACGATTGGTTATTATGTCTTGTTCAACC
TGTTGGTTGCTATCCTTGTCGAAGGTTTTACCACGCCGCTCGTAAGTGTA
TTTAGAGTGTTCAACCTGTTGGTTGCTATCCTTGTCGAAGGCTTTACCAC
GCCACTCGAAAAGAAACGTATGACTCGACACATTGTTTCATTGTTGAAAA
GCAAAGCCAACAAAAAGATGTTAACATTGAAGCGGACAATCAGTTTACCG
GACATGCTGATGAACAATAATAACGTTTCCAATAACAACAATCAAAACAC
ACAAGAAGATGAGACAGAAACACAAGGACAAATATATGCACGGATGATGG
CAAGACGTCGTACGCTGGGAACGATAGGTTTGAACAACCACGACACCTTC
TCTTCCACCAAGAATAATGCTGGTGATTACAGCTCTAGTGAAGATGAAGA
AGACATCAACCTCTCACCGCTTGCTCAATGTGTTAAAGAGAAAACGAAAC
AAAACAAACCCATCCTATTATCAGCACGAGTAACATACGATGATGACCCA
AAAGTCTTGGAATGGAAAGCTCTGAATGATGTGGAAGCTAACACTGCACT
ATTGCAAGAGATGGGCTATTGTGACTGTTTTCCAGAAGACTGGAATCTAG
TCATGTACGACGGTATCCGAGCGACAACAAAATGGGCGTCACTTTATTTC
TTATCCTTGATGACGATTGGTTATTATGTCTTGTTCAACCTGTTGGTTGC
TATCCTTGTCGAAGGTTTTACCACGCCGCTCGTAAGTGTATTTAGAGTGT
TCAACCTGTTGGTTGCTATCCTTGTCGAAGGCTTTACCACGCCACTCGAA
AAGAAACGTATGACTCGACACATTGTTTCATTGTTGAAAAGCAAAGCCAA
CAAAAAGATGTTAACATTGAAGCGGACAATCAGTTTACCGGACATGCTGA
TGAACAATAATAACGTTTCCAATAACAACAATCAAAACACACAAGAAGAT
GAGACAGAAACACAAGGACAAATATATGCACGGATGATGGCAAGACGTCG
TACGCTGGGAACGATAGGTTTGAACAACCACGACACCTTCTCTTCCACCA
AGAATAATGCTGGTGATTACAGCTCTAGTGAAGATGAAGAAGACATCAAC
CTCTCACCGCTTGCTCAATGTGTTAAAGAGAAAACGAAACAAAACAAACC
CATCCTATTATCAGCACGAGTAACATACGATGATGACCCAAAAGTCTTGG
AATGGAAAGCTCTGAATGATGTGGAAGCTAACACTGCACTATTGCAAGAG
ATGGGCTATTGTGACTGTTTTCCAGAAGACTGGAATCTAGTCATGTACGA
CGGTATCCGAGCGACAACAAAATGGGCGTCACTTTATTTCTTATCCTTGA
TGACGATTGGTTATTATGTCTTGTTCAACCTGTTGGTTGCTATCCTTGTC
GAAGGTTTTACCACGCCGCTCGTAAGTGTATTTAGAGTGTTCAACCTGTT
GGTTGCTATCCTTGTCGAAGGCTTTACCACGCCACTCGAAAAGAAACGTA
TGACTCGACACATTGTTTCATTGTTGAAAAGCAAAGCCAACAAAAAGATG
TTAACATTGAAGCGGACAATCAGTTTACCGGACATGCTGATGAACAATAA
TAACGTTTCCAATAACAACAATCAAAACACACAAGAAGATGAGACAGAAA
CACAAGGACAAATATATGCACGGATGATGGCAAGACGTCGTACGCTGGGA
ACGATAGGTTTGAACAACCACGACACCTTCTCTTCCACCAAGAATAATGC
TGGTGATTACAGCTCTAGTGAAGATGAAGAAGACATCAACCTCTCACCGC
TTGCTCAATGTGTTAAAGAGAAAACGAAACAAAACAAACCCATCCTATTA
TCAGCACGAGTAACATACGATGATGACCCAAAAGTCTTGGAATGGAAAGC
TCTGAATGATGTGGAAGCTAACACTGCACTATTGCAAGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:798763..802665 + |
|
