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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:691771..742105+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13828.1.p1 ID=MSTRG.13828.1.p1|Name=MSTRG.13828.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=50335bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:691771..742105+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TACTGGTGACGGTGTTGAGCTTGTTACTTATTCATATATTGGCTATCGTT
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tctttccaTTTACCTCCATCATCTGAATTTTGGCTTGACTTCTTTCCGAT
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tatttgtttttttagccTCTTCAAATTGGAATTTGAAATTCTCGATAGTG
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ATCATAGATATAATTTCCATTGATTTGTTTAGAGCTTTCTGTTGTTCAGT
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TTCATTGACAACTCCGATGAAGTCCTTTTTGGTCTCTTCGATGGCTTTTT
GTTGTTCAATTTTGGTTTCATCGATAACTCGGGTGAAATCTTTTGTTGTT
TCTTCGATGGCTTTTTGTTGTTCAATTTTGGTTTCATCGATAACTCGGGT
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AATTGATATCAGTTAAAAAAAAATTCTGTCTTCAAATTACCGCCCTCCCG
CCCTCTTATTCCATCCCCCCCCCGCTTATTAGAATTTAAAAAATTTTTCC
TATCCCCCTGTTTATTCGGACTCCACCCACGTCTATTCGGGAGACAAGAG
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TTAAAGTTCTTCTCTTCACAGTTTATTGGGTCCAATGTCAATGAAATTGA
TTAACGCACACAACTAAGGGCTGTACCTAATAATCAGTAGAATCAGTAGA
TAAGTTTCGAAAGCTCTAACAGTTCTTGTCAATGAAAATTATTGGCCCAC
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AGGACAAATATTGATATTTTAAGGAGCCTCGTAGCCTTGACTAATCAATA
GATCTGGCCATCTTAGAACCGAGATAATACTAGCTGGTTAGGCGAGAACT
GCGTTTTTACTGTGTTCTTAATAAAAAATAATGGTTGGTTGGCTAATAAT
ATAATATAAGAAAAAGATGAATTCTGTCTCTGAAGACATGATAATGGTTC
TCTTTCTTACATTTTTGCGTAGCACGGGCTCTCCACATTGTAGATTACAT
TGAATAGTTACGAAATCACATGTCTTCAAATGCTCCTATAAAAGAACAAA
ATATTGTAAAATCACAGTGCTCGCTTTTTTTATAAGAACAATTTATATAA
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TTTAACAGAAAAGAAACTAAGCATATTAAGAACATCCTAATAAGAACATT
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ATTTTTCCAGTCAGTGTACAACGTACAACTACGGAGGGGGAGTAAGTGCT
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TAAATCAAGAATCTCTCTTTCCTTTCCCAAGTCTTTAAACCACTCGTTGT
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TTttattaaccctttccgtgccacCAGTaaaagaaaagcggcaaaaagaa
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aaaaatgttctttattttaaatgttcttaatttcagtATTTTCAGTATGT
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aaattggccaaaacctaagaacaatttaagaacaatttgagccTTAAGGT
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ttgaaCTTTTCCTGTTGAGACAAGTTGATGAATGCCAGAACGTTTTAGTG
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cgcaccgtagctggatgctctacctttatgCTACGGCCACTTTCTTATAC
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CACTGCTCCTCTTTTGTTCCTCTTCTGTTCCTCACTGctcctcttttgtt
cctcttctattcctcactattcctcttctatttctcttttgttcatcttc
ttttcctcacttttcctcttctgctcctcACTATTCCTCACTGCTCCTCT
TTtgttcctcttttatttctcttctgttcctcactgttcctcttctgttc
ctcactgttcctcttctatttctcttcttttttcacctttcctcttctgt
tcctcttgtattgctcaattttcctcttctgttcctcttttgtttccttt
ctgttcttcactatccgtcttctatttctcttctattcctcacttttcct
cttctgttcctcttctattcctcttctgttcctcttctgttcctcactgt
tcctcttttgttggacctaccccggtggggtgaaggtcctataaattaac
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cttctgttcttcactatccgtcttctatttctcttctattcctcactatt
cctcttctgttcctcttctattcctcttttgttcctcttctgttcctcac
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ACTGCTCCTCACTAttcctcactgctcctcttttgttcctcttctatttc
tcttctgttcctcactgtctctcttctgttcctcactgttcctcttctat
tcctcttctgttccccttctgttcctcttctgttcctcttctaatcctca
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tcactttttctcatctgttcctcttctgttcctgactgttcctcttctgt
tcctcactatttctcttctatttctcttctgttcctcactatttctcttg
tatttatcttctcttcCTGACTGttcctcttctgttcctcactatttctt
ttctatttatcttctgtccctcttctatttctcttctcttcctcactgtt
cctcttctgttcctcttttgttcctcttcttatcctcttctgttcttcac
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cttctgctcctcAATATCAAGATTTTCAGAAGATTCACTACTATCAATCA
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tctatttctcttttgttcctaactgttcctcttctgtttctcactatttc
acttctatttctcttctgttcctcactattcctcttctatttatcttctG
TTCCTGACTGttcctcttctgttcctcactatttctcttgtatttatctt
ctgtccctcttctatttctcttctgtttctcacttttcctctcctattca
tcttctgttcctgactgttcctcttctgtTCCTCACTATTCCTCTTCTGT
TCCTCACTATTCCTCTTCTATTTATCTTCTGTTCCTGACTGTTCCTCTTC
TGTTCCTCGCTATTTCTCTTCTATTTATCTTCTGTCCCTCTTCCATTCCT
CActcctcctcttttgttgctcttctatttctcttctgttcctcactatt
cctcttctatttctcttctgttcctcactatttctcttctatttatcttc
tgtccctcttttatttctcttccattcctcactcctcctcttttgttgct
cttctatttctcttctGTTCCTCACTATTCCTCTTCTATTTATTTTCCGT
TCCTGACTGttcctcttctgttcctcactatttctcttctatttatcttc
tgtccctcttttatttctcttctgttcCTCACTATTCCTCCTATTTATCT
TCTGTTCCTGACTGttcctcttctgttcctcactatttctcttctatttc
TCTtctgtcccttttctatttctcttctgttcctcactattcttttctat
ttatcttctgttcCTGACTGTTCCTCTTCTTTTCCTCACTATTTCTCTTG
TATTTAtcttctgtccctcttcgatttctcttgtgtttctcactatttct
cttctattcctcttcttttttttctcacttcctcttctttctcttctctt
tccttttcccttttgttcctcttctcttctattccttttcctcactttcc
ttcctcttctgttcctcactattcctcttcttctctctcttttctttccc
tcTtctgttcctcttctattgctcaattttcctcttctgttcctcttttg
tttcctttctgttcttcactatccgtcttctatttctcttctattcctca
cttttcctcttctgttcctcttctattcctcttctgttcctcttctgttc
ctcaccgttcctcttttgttcctcttctgttcttcactatccgtcttcta
tttctcttctattcctcactattcctcttctgttcctcttctattcctct
tttgttcctcttctgttcctcactattcctcttctgttcctcACTATTCC
CCTTCTGCTCCTCACTATTCCTCACTGctcctcttttgttcctcttctat
ttctcttctgttcctcactgttcctcttctgttcctcactgttcctcttc
tattcctcttctgttcctcttctgttcctcttctaatcctcaattttcct
cactgctcctcttttgttCctcttctAtttctcttctgttcatcacTttt
tctcatctgctcctcttctgttcctgactgttcctcttctgttcctcact
atttctcTtctattttctattctctcgttcctcactatttctcttgtatt
atcttctGTTCCTGACTGttcctcttctgttccgcactatttcttttcta
tttatcttctgtcctcttctattctcttctcttcctcactgttcctcttc
tgtacctcttgtgttcctcttcttatcctcttctgttcttcACTAttcct
cactgcctcctcttttgttcctcttttgctcctcttctgctcctcttctg
ctcctcAATATCAAGATTTTCAGAAGATTCACTACTATCAATCACCATTC
CTCACGAACATTTGCATTCCTCActattccttttctatttctcttctatt
tctcttttgttcctaactgttcctcttctgtttctcactatttcacttct
atttctcttctgttcctcactattcctcttctatttatcttctGTTCCTG
ACTGttcctcttctgttcctcactatttctcttgtatttatcttctgtcc
ctcttctatttctcttctgttcctcacttttcctctcctattcatcttct
gttcctgactcttctATTTATCTTCTGTTCCTTGTTCTTCACTAttcctc
actgctcctcttttgttcctcttttgctcctcttctgctcctcttctgct
cctcAATATCAAGATTTTCAGAAGATTCACTACTATCAATCACCATTCCT
CCCGAACATTTGCATTCCTCActattcgttttctatttctcttctatttc
tcttttgttcctaactgttcctcttctgtttctcactatttcacttctat
ttctcttctgttcctcattattcctcttctatttatcttctgttcctgac
tgttcctcttctgttcctcgctatttctcttctatttctcttctcttcct
cactgttcctcttctgttcctcttttgttcctcttcttgtcctcttttgt
tcctcttcttatcctcttctgttcttcACTAttcctcactgctcctcttt
tgttcctcttttgctcctcttctgctcctcttctgctcctcttctgctcc
tcttctgctcctcAATATCAAGATTTTCAGAAGATTCACTACTATCAATT
ACCATTCCTCACGAACATTTGCATTCCTCACTAtttcttttctgtttctc
ttctatttctcttttgttcctaactgttcctcttctgtttctcactattt
cacttctatttctcttctgttcctcactattcctcttctatttatcttct
GTTCCTGACTAttcctcttctgttcctcactatttctcttgtatttatct
tctgtccctcttctatttctcttctgttcCTCACTTTTCCTCGCCTATTC
Atcttctgttcctgactgttcttcttctgttcctcactattcctcttcta
tttatcttctgttcctcactgttcctcttctgttcctcttttgttcctct
tcttatcctcttctgttcttcactattcctcactgctcctcttttgttcc
tcttttgctcctcttctgctcctcttctgctcctcttctgctcctcAATA
TCAAGATTTTCAGAAGATTCACTACTATCAATCACCATTCCTCCCGAACA
TTTGCATTCCTCGCTATTCCttttctatttctcttctatttctcttttgt
tactaactgttcctcttctgtttctcactatttcacttctatttctcttc
tgttcctcactattcctcttctatttatcttctGTTCCTGACTGttcctc
ttctgttcctcactatttctcttgtatttatcttctgtccctcttctatt
tctcttctgttcctcacttttcctctcctattcatcttctgttcctgact
gttcttcttctgttcctcactattcctcttctatttatcttctgttcctc
actgttcctcttctgttcctcttttgttcctcttcttatcctcttctgtt
cttcactattcctcactgctcctcttttgttcctcttttgctcctcttct
gctcctcttctgctcctcAATATCAAGATTTTCAGAAGATTCACTACTAT
CAATCACCATTCCTCCCGAACATTTGCATTCCTCActattcgttttctat
ttctcttctatttctcttttgttcctaactgttcctcttctgtttctcac
tatttcacttctatttctcttctgttcctcattattcctcttctatttat
cttctGTTCCTGACTGttcctcttctgttcctcactatttctcttgtatt
tatcttctgtccctcttctatttctcttctgtttctcacttttcctctcc
tattcatcttctgttcctgactgttcctcttctgtTCCTCACTAttcctc
ttctatttatcttctgttcctgactgttcctcttctcttcctcgctattt
ctcttctATTTATCTtttgtccctcttccattcctcactcctcctctttt
gttcctcttctatttctcttttgttcctcactattcctcttctatttctc
tttttttcctcactatttctcttctatttatcttctgtccctcttttatt
tctcttctGTTACTCACTATTCCTCCTATTTATCTTCTGTTCCTGACTGt
tcctctcctcttcctcactattcctcttctatttatcttctgttcctctt
ccattcctcactcctcctcttttgttgctcttctatttctcttctgttcc
tcactattcctcttctatttctcttctgttcctcactatttctcttttat
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ttgttgctcttctatttctcttctGTTCCTCACTATTCCTCTTCTATTTA
TCTTCTGTTCCTCACTATTCCTCTTCTATTTATCTCCCGTTCCTGACTGt
tcctcttctgttcctcactatttctcttctatttatcttctgtccctctt
ttatttctcttctgttcCTCACTATTCCTCCTATTTAtcttctgttcctg
actgttcctcttctgttcctcactatttctcttctatttctcttctgtcc
ctcttctatttctcttctgttcctcactatttatcttctgttcctgACTG
TTCCTCTTCTTTTCCTCACTatttctcttgtatttatcttctgtccctct
tcgatttctcttctgtttctcactatttctcttctattcctcttcttttt
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GAATAAATTAATGGGGAGCATCGGTCATAAGTAGAATGATACCCGGGGTG
TagtacccttgccgaccgacgggggtgctccgctgaggttcaaATAATGG
ATCCTACgcgggactcgttttttcaaaaattttgc Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:691771..742105+ >MSTRG.13828.1.p1 ID=MSTRG.13828.1.p1|Name=MSTRG.13828.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=56745bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:691771..742105+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CTGGTGACGGTGTTGAGCTTGTTACTTATTCATATATTGGCTATCGTTTT TGTGAGAAAAAGAGACCGAAATCTCGCAGATAAGGAGAAGATCTATTACC TACAAGACAATAACAAGagtgatcaatatttttttgagaTCATTGTTCGC ACTGGTATACAACGTGACGCTGGAACTAACTCTAATGTATATTTACAACT AGTTGGCTTCAAAGCACAGAGCACGGTACATCAATTGGTGGACGAAGATC GTGAAGTCTTTCAACGCGCCAGTACAGATGTGTTCGTGCTCTCATCCGAT AGATCGTTGGGAGATATCACTTGCGCTAGGTTATGGCATGATAATGAAGA GGGAGACTGGTATTTAAGgGACATCAATGTGGTCGATTTACAAACGAACA AAAAGTATAAATTTGTTGCAAACCGTTGGGTATCCATTGACAAAACAAAT TCCACCCTCTATTACACCCTCACGCCCCACAATGAAGAAGAACTCAAAAG TTTCCTATACATCTTCAAGTCGAAATCCATGAATGATTTCTCGGACCGCC ATTTATGGTTTTCCATTTTCAACCGCCCTTCCAAGAGTAATTTTACAAGT 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GAATTTTATTGTATTGAACATTTTGATCTCCATTTTAAACGATTCAATCG CTGAAACGGAGAACGAATTGGATTCGTGCGAACAAGAAAGGAAAGATGAA TTTTTGGAATATGTTAAAGAAATATTCACAGATTTAATCCGATGCGTTTT CCGATTCCGTTGCTGTTGTCGTCGTTCAAACAAAAAACCGCCCTCTAAAA CCACCTCGCCCACAAAGCAAACGCCCATCACACTGCCACCACCAAGTAGG GTTGTTCAGGTGAAAGAATTCAAGGAACATGAATTGACCCCCGATGAGAA ACGACATTTCTTCTTCCATTCATCACCCACTCCCATCCACCGCCCACTCC GtgatgaaaaacaacaaaagaaaaagcaagCGGTCAACTTTCAAGATGAG ATACAAATCATGGACTATGAGGAGACTTCGATCCACACTTTCAAGATTGA AGATGATAGTGGTGATGAGAACGTAATCGATTACCAACAATCTCCACCAC AAGGGAAGTCTGATAAAGCATTAATGATGTCCAAGTACCAACATGTGTCC AGTTACCAAGGTGTAGCCAATTATCATCATCATTCAGATGATAGTGATCT CGAGATTGAAGAAATCAGTTGccaccaacaacaacaacatctgCCAGAGA TATCAGGTGAAAAAGCAGTTACCAGATATGAAGATGTAACCAGTGATctc aaaattgaagaaatcgGTTGCCACCAACAACAACATCTGCCAGAAATATC AGGTGAAAAAGCAGTTAAAACCAGATATAAAGATGTAACCAAATATCATG GTGTGACCATATACCAACAGCAACAACATGCAGCTGACAGTAATGCCAAG ATTGAGGAAATCAAATCTGACCGACAACAGCGACATCAGCCAGAGATATC TGATCAAGAGTTAATCACCAAATATCAACGCGCAATAAAATGTTTGAAGA ATATGCACCAATCAGATGTTGACTTTGACGCGGCTTGGCAGAAACGAATG ATTGGTCTTTTACATGGAATGATGGAAGATTGTTTATGCGAGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:691771..742105 + |
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