MSTRG.13805.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13805.1.p1
Unique NameMSTRG.13805.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000112_pilon:388516..403214+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13805.1.p1 ID=MSTRG.13805.1.p1|Name=MSTRG.13805.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14699bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:388516..403214+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:388516..403214+

>MSTRG.13805.1.p1 ID=MSTRG.13805.1.p1|Name=MSTRG.13805.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4800bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:388516..403214+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGTAACAACCCTTCACCAGCATATCAAGGTAGAAGTTGCAGCGGAAGTAC
CTCTCAAACTGCTGTATGCTCCGAAAACCCTTTTTGCCAAGATTGTGACA
TTGCAATGGCAAAACGCTCGTATATACCGTCAATCACGACCAATACATTT
TGTTTGAGTAACCTCAAGaaatgctttgaaaaagaaCAGTTGAGCCGACA
AAGAAAGTGTTATGAGAAAAAAGTGCATGGTGATTGGACAGTTTGGACCA
CGTGGTCAAGATGTCAACCTATCTGCGGTGGAGCATGGCATCGACGAAGC
AGAACTTGCACCAATCCACCTCCTGAGTATACTGGTGACCAATGTCATGG
TCCAAGCGATGAATATCGGCCATGCGATATCCCACAAATGAAAGGAACAC
CCTATAAAGCGAACAATGTTGATATGAGAATGTACGATCGTCAAATTTTA
GCTAAATCAGTATCTAAAATTCAATGTGTATTAAAATGTAAACTTAGAAA
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GTTACGGAACTTGTTACTCACTGGCCAATAAATCAACAGAAAATGATGGA
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TTGGAGGCTCGTGTAAATGGAGTAAAAGACACGGAGGTTGGTCTAACTGG
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TCAAATTTTAGCTAAATCAGTATCTAAAATTCAATGTGTATTAAAATGTA
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AAATGATGGAAATACAGACGGAGATTTGCAAATCTTCAATAAACAGTTAC
CAATGATACccgaaaaaaaacaagatcCGAACCTTGTTGACTTTTGTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13805MSTRG.13805Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13805.1.p1MSTRG.13805.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13805.1.p1.exon1MSTRG.13805.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13805.1.p1.exon2MSTRG.13805.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13805.1.p1.exon3MSTRG.13805.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13805.1.p1.exon4MSTRG.13805.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13805.1.p1.exon5MSTRG.13805.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000112_pilongenomesc0000112_pilon:388516..403214 +