MSTRG.13798.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13798.1.p1
Unique NameMSTRG.13798.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000112_pilon:305887..319767+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13798.1.p1 ID=MSTRG.13798.1.p1|Name=MSTRG.13798.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13881bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:305887..319767+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aaaaataaaggcagataaaaaatatatatcctataatatttttttaaata aagttgaaaaGACTTACGCTTCGGCCATCTTTGAGCTTTACTGTTGTTAT CTTAATTCGTGTAAAATGGTGAATAAAGTTTGACTCTTCAAGTGCAAGAA AATTGAAGCTTTTCTTGCTTTTAGTAAGTGGAAATGTGATAGCCAAAGAG AGTGATTTTGATTTCTCATTCCAAAAATTACTTGCGGAATGGTTGCcatc aaaataattctttatttaCATCTCGGCCAACCAGCCCAGCATTCATACGC AAAATACATTTTGcttcaaaacttcaaatcaattcggTTTAGCTTACGAG ACAACTCgaatttactttcgttttcacatGTAATAAGATTGCGACATGTG GAGCAAGAAGAGTTGTTTACATATTCGACAAAAGGGATAATAAtcaaaag tagtaaaaaatTCCTTCTTATCCCCTAACAACTATCCCAAGCTAGAAGGT TTCTAAgaaagtgaaatattcaattcaTTAATTGTTTTACAGAGTTTTTA TATCACCTAAAAATGGCAAACAAAAGTCAAGAGGAAGGAAAGTTGTTGGA TAGTTTGGAAACCGAAGGAGATTCTCGAGTAAATTTTCTCAAAGAGGCTC TTCACATTGCAAGAGAAGCTGGCAGTGTAAGAAATTATCTCTTTGCTTTT TATTCTAGAAACCCATTTTGGAAATTACTTAAATGCTGTATTTCGTGTGA AGGAATAGAATTTAGTCGCCCGCTCCTCCCTTTTTTGCGGGGTCTAGCTA GCTAACACTTAGGAACAATCGccttaggagacgcctcctgatcaggagac atgtaggtcgcttgggGTCGCTCGATTAGGAGacgcgtctcctaataagg agacataaaactttgatctcaattttaagggctttaggcttttccgtgca 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:305887..319767+

>MSTRG.13798.1.p1 ID=MSTRG.13798.1.p1|Name=MSTRG.13798.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7056bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:305887..319767+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAAACAAAAGTCAAGAGGAAGGAAAGTTGTTGGATAGTTTGGAAAC
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CTATGCTCCTATGTTGGATCAAATATATTTTGGTGTGCGTGGACATGGCT
CGTTTTTAAATGGAAGACGATTGTCAGTCAGCAAAAGTATTACAGatata
tCGCAAGCACTAATTGCAACAGAATTCGGTTCAAGGAGAGACGAAAGTGT
AACAACAGTTTGTGCAAACATTCAGAACATCTTGATGAAGCATAAAGTTG
GAGGCATTCGGTGTACAGGATCGGCAGCTTTGAACATGTGTAGTGTAGCA
AGTGGTGCAGTTGATTTGTATTATGAATGGGGTCCACAATGTTGGGATGT
TTGTGCTTCACATGTTATTGTCCATGAAGCTGGAGGAGTCACTACTGATG
CTCTTGgaCAAAATTTCGATATGATGTCACGTTCTTACATTTGTGCAAGC
AATAAACACCTCATTGAACAGCTTGTTCCCTCTGTCACGCAGATATCGCT
CGCACAATAAATGGCAAACAAAAGTCAAGAGGAAGGAAAGTTGTTGGATA
GTTTGGAAACCGAAGGAGATTCTCGAGTAAATTTTCTCAAAGAGGCTCTT
CACATTGCAAGAGAAGCTGGCAGTGTTATTGCTAACGTTTTCCAAgagac
aaaacaaaatgttcaaACAAAAGCCAACTGTGCTGATTTGGTCACCGAGA
CTGACAAAGCTGtagaaaaattaatatttgattATTTGAGAACAAAATTC
CCAAGTCACagTTTTATAGGTGAGGAGTCAGTATCTGATGGTGCGATGCA
ATGTCATTTAACAGAAAATCATACTTGGGTTGTTGACCCAATCGATGGAA
CTATGAACTTTGTTCACATgaATCCAAACGTTGCTGTTTCCATCGGATTA
GCCATCAACAAGCAGACAGAAGTTGGTGTTGTCTATGCTCCTATGTTGGA
TCAAATATATTTTGGTGTGCGTGGACATGGCTCGTTTTTAAATGGAAGAC
GATTGTCAGTCAGCAAAAGTATTACAGatatatCGCAAGCACTAATTGCA
ACAGAATTCGGTTCAAGGAGAGACGAAAGTGTAACAACAGTTTGTGCAAA
CATTCAGAACATCTTGATGAAGCATAAAGTTGGAGGCATTCGGTGTACAG
GATCGGCAGCTTTGAACATGTGTAGTGTAGCAAGTGGTGCAGTTGATTTG
TATTATGAATGGGGTCCACAATGTTGGGATGTTTGTGCTTCACATGTTAT
TGTCCATGAAGCTGGAGGAGTCACTACTGATGCTCTTGgaCAAAATTTCG
ATATGATGTCACGTTCTTACATTTGTGCAAGCAATAAACACCTCATTGAA
CAGCTTGTTCCCTCTGTCACGCAGATATCGCTCGCACAATAAATGGCAAA
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GGCAGTGTTATTGCTAACGTTTTCCAAgagacaaaacaaaatgttcaaAC
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GGTGAGGAGTCAGTATCTGATGGTGCGATGCAATGTCATTTAACAGAAAA
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GCGTGGACATGGCTCGTTTTTAAATGGAAGACGATTGTCAGTCAGCAAAA
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GAAGCATAAAGTTGGAGGCATTCGGTGTACAGGATCGGCAGCTTTGAACA
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CAATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13798MSTRG.13798Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13798.1.p1MSTRG.13798.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13798.1.p1.exon1MSTRG.13798.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13798.1.p1.exon2MSTRG.13798.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13798.1.p1.exon3MSTRG.13798.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13798.1.p1.exon4MSTRG.13798.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13798.1.p1.exon5MSTRG.13798.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13798.1.p1.exon6MSTRG.13798.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13798.1.p1.exon7MSTRG.13798.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13798.1.p1.exon8MSTRG.13798.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000112_pilongenomesc0000112_pilon:305887..319767 +