MSTRG.13792.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13792.1.p1
Unique NameMSTRG.13792.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000112_pilon:185445..196817+

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13792.1.p1 ID=MSTRG.13792.1.p1|Name=MSTRG.13792.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11373bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:185445..196817+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCTTCTTGTTCGGTGGTCATCGGGTATACAAgaatatttttgatcaaaaa aaGTATGCCGAAGTGTACCTATTGGATGACCTCATCAAAAAGTTATGTAA GTTGCAAGCtttcaatgaaattgatttttcaactgACGAATTACACTATT TTACACGAGGACAATTTTATAAGGGATCACGAGGTATGAAatcgtcaaaa aaaaattgaataaattgcTTCTCAATACAAGTGATTTAAGGGTCAAAGTG CTACGAGTCAGATAGAAAACCTAAAATACCTTAATTTTGCCTTAGAAATA AGAACAACCGATCCTTCACTGATTCTTATTAAGAGTAGTGCTCAAAAGAT AAAGTGCCAAAAAGTGATTTAAGGGTCAAAGTGCTACGAGTCAGATAGAA AACCTAAAATACCTTAATTTTGCCTTAGAAATAAGAACAACCGAGTCTTC ACTGATTCTTATTAAGAGTGTAGTGTTTTATTGCACaaaagataaagtgc caaaaagtgaaacaaatataaaatcgcgagacagaaataagttaaaaaag GAATCATGTTAGTCTCATAAAAGTTATAAATCTTCTTTGTCTTTGACGAG ACAAGGGCGTTGTTATTTTGGCACATCGAGTCGTCTTTCTTtccatgttc ttattttcagctcAAATTTGGCCATATTTTTAGGGATATATAGATCTTTT AATTTTCTAATTACAACTTACTTGATTCAGCTATTTCAAGGCTCGGGATG TTCTTATTGGCtttttttGTGCCCCATTGAATATTATAAGAAGCCTTGTA AGAATCCAAAGCTGTTCTAATAAAAGCCGTTTCTGTTTCAGATTTGACGC GTGAAAAGTTAATTGCACTGGCGTTTATGACAGGAAGTGATTATACCGAG GGAATACGAGGTACCTTTTAATTTTCGATTCACGGGTTTCCAATCCGTGT TTTGTTTCGATTCCGTGTAATttgtacgcagagaaaaatatcaacatcaa GTAAACAAACTCGCATCGGTTAAATtcttagtctacacaatagacagatc caggcttttaggccttactcttggtctataggcactgctataggtgtcca ctagtgacccccatcGGTTAAATTCTGCGCTCATTCACATGATATTGTTT ATTTACTTGATCtttttttCATGTCGCTTACACGGAATCAAAAGATAGTG CTAATTGGAAATTAGTGTATTCTGTTTCTGTCGGATCTCATTATGTGACT CTCCAAGCGATTTTAAGCACTTTGACGGTACTTCTAAGAGTATGCAACAT TTTATTGAAATCCCCCTACGAAATCGAATTCTACAAGGTCTGAAGGCcga tttaaaacaaaaatgttatcGCTATCAGACCGCTCGTAATACCGTACCGT ACCAAAACCGACCCGATTTTTAGGTACGTTAAATCACTTGGGGAGTCTCA TATTTTAATCATGcacaacataattttttttaattattatattataaaaa aaacatatttataGTGGCTGGCCATggaataattctaaaaatgtatAAAG CTTacattttattaatttattatttatttatttatttattgactCTTAAA AGTTGTCCATCTCTTCCGCAGGTATAGGTGCTGTAACTGGAATGGAAGTA CTTCACGAATTCAACAAAAATAAGCCGAAAGAGACACTCAAGTTTTTCAG GTATCTAGGTCATTAATAACACATTTTTGAATTATCGAGGGTCGCTTGGA GTAAACAAACTAAATCTGTGTTCGAATCTTCAATCTATTCTTTCTCTTCA TATTAGCGTATACCTTTGATTGTTAAAATCCCTTCCTTAGTGTCAGAAAT CTATGTCGAGCCTGGAAAAATGACTTTTCTAATGACACTTCACAATTGGT GGATTTGGTGAGTGTTCAGGACACGACAAGAACCTGGTCTTTAATTATCC AAAGGTACAAACTTGTGAAAGTATCTCCAATATAAAATATCCGATTTTTA TCTAGGGATTGGCTACGCGGGAAGATCAAAGATTTTAATCCTGGCTCGAA TCTCAAGAATAAGTTGGTGAGTCTTgatccattgagtttaaagcccgaaa gtCTAGAGAGGAATTCCCATTTCCTCTAAAACAAGAAAACGAGTGATTGA ATCTAGtgcgttttttgttttcacacggcatatttaaaaaaatcttgcta TTGATTTTACTTTCGATGCGGCATATATGTGAAAGCCACGCAGGTGAAAC GTTTTGAATGGACAGTAAGGGGCATCATATCCCATCCAAAAGTTTCAACT ATAGCCCCTTCAGGACTTTAAACTCGATGTCTTGAattgtttttggacct accccggtggggtggaggtcctataaattaaccttcgctcgttcgttcgt tcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttc gttcgttcgttcgttcgtcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgtt cgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcgtttgtttgttatttat tagctttcctcgtgattgattagttttttccgattttttacacaaagatg cataactataaaccctcgaatgtgacggagtccgattttccgagaaaaaa aattaggcaaatttgggccaaaaaatagtctagcaagctagacgactaat tcagatatagtagaaataaaacaaaaagtaatggagggaacaaattttag tcgtctagaaacctttgtgcaagCCAAAAGCTTCATATTAATATTGGTTT GCTATTGttaatgaaaaaatatctaaagtctgtccagatataattggcag tggaaacaagaatgcctgtaacttttgatagtcaaatataattatggaat ttttttttgcttgttttagagaatcaaaagcgctatttttgaatgtattt ttggttttaaaattcgcaatttttagcggttaaatttgcgattgcaaaaa ttgagctttttttctacttatgctataacatTCATTTTTATACCAGTGAT AGGTcgaccttaggttaagaagtttgttaaatttcaaggcaaacagaaaa gtccttcggaagatatgggacccgaaatacccctttttttatctatagta tagtaacacgaacaaatagtacaaatctaaaggttcttatcctcccgcaa aaggaccaccagatcataccgccaggaggaaggaaccccaaatgagctta caaaatgagcaataatgactaagaaatgaaaatatatataaaaagaaaaa aaaaacaaaaactaactacagaaaataattgataacaaaaagaaaaataa acaaaaagagctaggagagcaCTTGGAGCTTAAGACtagaataacggtcc cccaaaacgtccAGTATCGCAGATGAATTTTAtcgtagactagtaaacta gtcggttattacttataaccttataatacaactgtcaatcaaataatgta aacactaattaaatattcagcgtgcgtgagagaaaaggaaaataaccgac tagaagcggcataccggataagtgggatgggggtacccgggaacctaaag tgggaacctaaatgaacacctgaaaagtgggatgggggaacctaagtggg aacctaaatgaacacctgaaaagtgggatgggggaacctaagtgggaacc taaatgaacacctgaaaagtgggatgggggaacctaagtgggaacctaaa tgagcacctgaaaagtgggatgggggaacctaagtgggaacctaaatgaa cacctgaaaagtgggatgggggaacctaagtgggaacctaagttgtttaa ttattaatagaattgaaatatttttctttaaaaacaaatacataaagagT GCGGTCACACCAAATGATTTACCTCCGCTTATATAGCTGTTgtcataaca aaaatatttttatctattttttgaTGTGACCACtcgaaaaaatggaagaa aaaattatgtttaaataaataggtctattgaaaatggcgatttgtgttta cttttcaaattttgaaaattttgaaaagatgtgcacatatttttatctga aaagtgggatgggggaacccgggaacctaaagtgggaacctaagttgttt aattattaatagaattgaaatatttttctttaaaaacaaatacataaaga tacagacaccagttatttactttttacattacggttcgcaaacaataatg ttgaaaataaaacaaagggaatttatttattcaattagctcaaaaaagca tgtttatttatcagcagttttatagtgcatctttttgaaaggttcttttt agtaaattgacttaattgactttaaaactttaaactttaaaccgtcatat cttcaaatctagaaggaattagaagttcgttcatagctcgatggataact tagagcctcttctttcttttgcacggatctaatttgcttgaatacagaat ctagtaaaacattatttacgatctagtttttgttcactcttgatgcaata cacattgatttttattagcagctccaattttcgggtcagggctggggtcg cttagcatttaacggattctagctcgtttttctttctgtaccaaccaaac agtacagcgtgtgaatacacttcattaattaaaaatgtttgatagtaaaa tagaacatattgcacggcttgccacgtttcaatacacataggcatagatc cacgggggggggggggggcactcaaggtaaacgacctaccgtacgttcgg cccttttttccaagcttcccaaagtacactgtaagggtggaaatgagcaa aaatgacAATAAGTtcactctaagggtttaaaatttggtcaaaggactgg cttttagaatttcatccgaacaagtgtcatgttttaacactgggtaaatt ttggaacatcaaatatgtccatccctataccatagcaggatctgttctag aacatgttgaccaagaaaaagatctaggagtgataatcgatagtgacctg acctttgaagcccatatattcagtaaaatcaagaaagctaactctatcgt tggcttgattagcaggagcttcgaatttctctcaccagatatgtttcgaa cgcttttcattgcatttgtcagaccccatttggaatatgcacatgtagta tggtctccaaggctaatcaaacatatcaaagcaatcgagggcgtccaacg aagagctacaaggctagttagttgctatagaaactactcatacgaagatc ggctacgactcatcaatctacctagcctaaagaccaggcggcaagttggt gatatggtggaagttttcaagaacctccacatttatgacgagtctataag atcagagaaatttactcctcgaacacgaccacgacgtcagcatgattacg agcttcaaaggaactttgctaatgacggtatgagaggctaccaaagcaac tctctttttcacagaagtgtgaaaccttggaatgatctagaagaagatat tgttgaagcaccatccttacaagttttcaaagagcgtttgataaaagaaa gggagaaaaaagctttataaaatgtaaaatcaaaagttctgtttcataga ggtcaatagacctgctaaatatattgctataaaaaagaaataaaataaaa aaaaaaaaaataataataaaaataaaaatttaggttcccactttaggttc ccccatcccacttttcaggtgttcatttaggttcccacttaggttccccc atcccacttttcaggtgttcatttaggttcccacttaggttcccccatcc cacttttccggtgttcatttaggttcccacttaggttcccccatcccact tttcaggtgttcatttaggttcccacttaggttcccccatcccacttttc aggtgttcatttaggttcccacttaggttcccccatcccacttttcaggt gttcatttaggttcccacttaggttcccccatcccacttttcaggtgttc atttaggttcccactttaggttcccaggttcccccatcccacttatccgg tatgccactagaagctacttccaacgcctttttttcttcacctaaaatcg taaggagagacatacagatttctgtatgtctgacccgtgcggaattgcat ttatttttctttctgtttattgcgtttttagaaatgctcatttatttata tgttcccatgttcaatgttactatgaaatatcatttagtcaaaaaagttg gatggattctcaaaaacttaaaaaaagttgtaaaattaaacaacgttttt tgagggaagtagcttctagtcgttgaaattcaaaaaagaaacgcaacttc accccttcgattctttttatttggagcttgattttttgtatatgggtctg ttttcaacgactagtttactagtctaatttTATCGTTATGCTCAATATAT CATGAATTTGGACAACACTAAATTCGGGGtcaccataaagaagtattcta cacaatgttctggaattaaatggaaacaaagttatgtcaagttgaagaat taccccttggtagcacttttctgtgaaatatcaaatctccaacttattac taatttttttcccactcaaaaaaaaacttttcttgaaaaaagaaTGTGTG TTGATTTGTTGtgtgttaaatttttttttttcgtctttcattttgttttg agagtttgttattgcttgatcaaaattaatttctccTTACCTTTCGCGCG CCAAATTCTTACGGAAGCACCCCCTTCCGAGAAaagctttcttttgtttt cagaaaaaaccctttgttttctcgctacgcaagtttctgcgtagctagcc ggggattctataaggccggaacaccggattcttccagtcgtttatacaaa ctaatattatcccgtaacaattatcgtattatcatataacgcctatacta ctgtattacacgcattataaacgactcctgtctagccaaaaaacggctaa aaaacgggttttttggactttgtgaaaaattggatcattaactttttcgg attttttgcatgaaagtagggtaccatcataggaaAAAGAtggcagattt tttcaaaaaaattttgttggctcaaaaaacgcatgtttatctataagaat cactattaataagcatacatcattgaatgttcttagccaaattactaaat ttttcgatgagatagatgtttttttttgctcacgaagtcttgaatatgaa agaatatttcaagagcatgaaattaagtttctaaacgtttttttttataa gaaacaaacgactaattttaatagatcgtcactatttgtgttctgaatga ttgtttaatggtcacgctcacgtagatatcaattatatatgtgttaaatg catgaccaggtaggtccataaaagttaTTATTGGTGCCGCAACGAAAAAT AAATAATCGTTACCAGCAGTTAATAGTTCCGTGATCACTGTTCGGACAAA ACTAAattacttttgttttatttctaatTTAAACATGTAATTAGAGGATG ATTTTATAAAGGAATAAAATATTTGATGGTCTTATAGTATTTAATATTCA TAGATAGCTAAGCCGGTGCGACGTGAATTCCATCAAAGTAATTGAATGAC GGATAGTTCATAAAAGTCTATGGtctatagtatagtatagtggggtcgtt tagcataatttacaggaaaacAATTAcatatagctgaaactttctccaga ctttctttataggatgcttatgcctcaggaaaaaatcccctaaaatccga ctggtggaacatccctttttggGGCAggttcttttttccccaggcaaaac cctaagggcgaaattttttgaaaatttcagctaGATATAATtctttttcc tacaaacagcctgtatttttgtaacacgaccacactacaCGATATGCTAC GTAAaacatgttttgatttttgatcttCTTCATTGCAGAGAGATGTAGAC ATGTCTCAAACATTCAACTCATCTTTAGTGTGGGACGCGTACCTTTCACC GACCGTGGAAACTTCAGAAGAACAGTTTGAATGGTCCAACCCCGATATTG ACGCTCTCAAAGAATATCCTTTTCTGTTTATTACCTTACTGTACTAGATA TTAACCCTTCAAACCTTAGTGACGTGTAAACACGTTCCAGATAAGCCAAT TTACCaagctcctgaccacttgatgcTTTGTAAAAAAGTATAAGGTaaaa aaaCCATTGTCTAACTCTTAAGTTACTTTtcacattttcaagaaaaagaa tgggcgctggaaaggttaagacTGTAATTGTTTAACATCAATGGTAATTT TCGACTGCCATTAAGAATGGCATACTAATGGGTTTTCTGGTTTCCTGATT GTGCATGCAGTGCAGTGGTTAGGCTACGATCGAATTATCTCCTAAACAAG GCTGGAATGCTCTTGCTCAtaattagatttgaattttaagccttaTTATA AAGTGTACGCCTTTCTAATTGCTCATTTGCCTTAATAGCAACTTTGATTT TTTAACTTCTTGTTAATGATGGCTGGATATCCAGCCATATTTAAACACGG TTCATTAAAGGAGAACAAAGTACTTATCCAAAAGACCATCCAATAGTAGG AAAGTCTTTTCTACGAGTCACTTTTTCACTAGATTATGTCAAGGCCCGAT TACTCCTGTCGGATATCCGCTATGAACAAACCCTCGTTTGAAATTGAGAt atcaacctcgttcccttgtattccaggctttatttacgttactgttGAAC GCAAGAGAATATTATTATCAAGAGCCATCAGTGAGCATAATCAGtaaagc tgataatacacaaGGAACGAGGGATATTTAGTTGTTTTCCGATTTTTACG TAACTAATACAACGATTAGATTTGCGTATTTTAGCACAGTTTTATTCCAT CGATAAAATCTCTTCTTATCGGATTCATAATCTAATTTAAATGATTCAAA GGATGCAAAAACcaaatgaatatttttaaaaacagtcAATCATAAATGAA CTCGCGTCACTAGTTGGAAACTTTAGATGGATCGAAGCTCTTTATAAGTT TTGAACATTGACCATTCGTTCTTTCATCAGgtaaatttctctgattttGT CAGTTTGTTGGAACTTTTATTATCTTTGATCCTTAAAAATTGCCCGTTGT TTGTCGAATCATTAGTTTTCtgccgatttttttttttttttttttggcaa aaaaatgctAAATGTTTTTACCCAGAATGCAATGGCTTATTTAATGCTTT GTCACCCTAAAGTGTATTATCATTGAGATTGTTTATTTGCCCACCATAGG ACCTCCCTTATCTCATAAAGGATTGCCTATTCTGTCAGCACCTCGTTTTg ttagagaaaaaaataaacaaactgcACCACAGCATTTGCCAGAACTAAAG TTCGATTGTTTTGATCATTCGCAAGATTATCTTGTGTTTGGATTGTTTCT TTGGTTTCCCAATCAATAAATTCATCCACATCTGGATAAAACTTGACCTT GGTATCGCAAGGCGAGAGATTGATTGTTTCTTGTTTCGTCTGCGttgaaa tgaatatttttgccCTTAGTGGAGCGGATTTTGCTCAACCATAAGTAGTA TAAAAAAGCTCTGAAATTTTGCTCACATACGCTCAATATAGCAAAGGGAA CAAATTGGAAGAGACACCCTACCTTGTCTAAAACTAGACTTTATGAGAAA GAGAAGTGTTAAATGTTCTCAAACGATGGTCGTCTAAATTTGTCGATTTC TATACAgtcttattttttgaatttcatcaaACACTTTAGCGAGttgatgt atttgcattttcggGGACGGCGGAGTGACTGGGGCCATTTGGAACAACCC GCcttttttgacccgcaaaatcgagggcGGTTAGATGCTTGTTTAGGGTC GTCCTCAGTTCATCAGAGACCATAAAGAGAATTTTAGCCGTCACCGTTGC AGAAAAACAGACATACACAAGAATCCGCTACTTCTCTATCTCTTGACGGA AAGCGAGTGTAGGCTACACTCAATAGATTGAGCGATGGGCTTTAGTCTTA GTATTCTTTCCTTGACAATTTTGAATTAAACGTATGCgagtgaaaaatta ggttggtTGTACAATAAAACAGACGAATTATTGTTGCCTGTGCTTGAAAA TATGAAGAAACGAAAAGAGGTACCAATCATTCTTACTTTCatctccaaat ttttgaaatgacaTTTTGAATACTTCAACATATATTTTATGGCCTTGTTG TTATGATCAGTCtgcaaaatttgtcatttttttgtaaacttgcctcggca attttcgttctttttcgggcttttgcgggtctttttcgaatcacagtgag gttttttatgaaaatttattttaagttttataatatgtaatatttgctaa tgaatttattCCAGCGGCAAAAGACTTTGATGGCATATTTCCAACCCAAA GTAGAAGATGATATTGAAACTAACATAAAAAGTAACCGTTTGAAGAAAGT TCTCAGTAAAATGTCTTCAAAAGATTACACGGAAAACGAGGCAGGACCCT CTGGACTATCatccaaaaaatctgaaaaacctgaaattttctttgaaatg gaTGATAATGACGTAGACTCGGATATTCTGAAGGTGTCGCTAAATGATAT AAAACCTTCCGGAACAAGGTCTACAGCTTCAGCTAGTAGACCCTACAATT CTAAAAAATTGATAAGTACATCGCAGTCTAAAGTAGACCAATCTTTACCG TATATCGACGATTCAGATGTAGTTTCGAAGCGTCCACGAAGGTCTGTAAA GTCTAGTGAACCTTCAACGTCTTCGACAATCAGTAGTAACGAACATGTAC AAGCAATGAAAGTTGCCAACCTTGTCAAAGCAGCTGGGGAAAGTTTAAAA CCTACTACACCATACATCGCTATACAGAATGTTAATAACATGGTCTGGAA TCGAATGCGCggtaaaaacaaacaaatgaaaCGAGGGCAGAGAGGTGGTA AAAGTCGACGTTCAAAGACAACGGCTGATTTATTAGAACAAGTTAATACT GCAAAATCTTCCGTTCAAAGCAGTGACTCAGAATCGGaccattaaaatat ttattgttcAGTTTCTACCGTTGTTtaacaatgggctcttccaggaaatg ttcgtacatgggggttggaggatattgatcgaaggggggggggggttaat gaaaatcttaaaaagctGACTTGCTCGGTGGTAAACTTGCCGTCCggagg gtcaaaagtcacaatgtccaagG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:185445..196817+

>MSTRG.13792.1.p1 ID=MSTRG.13792.1.p1|Name=MSTRG.13792.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=8379bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:185445..196817+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCTTGTTCGGTGGTCATCGGGTATACAAgaatatttttgatcaaaaaaa
GTATGCCGAAGTGTACCTATTGGATGACCTCATCAAAAAGTTATATTTGA
CGCGTGAAAAGTTAATTGCACTGGCGTTTATGACAGGAAGTGATTATACC
GAGGGAATACGAGGTATAGGTGCTGTAACTGGAATGGAAGTACTTCACGA
ATTCAACAAAAATAAGCCGAAAGAGACACTCAAGTTTTTCAGGGATTGGC
TACGCGGGAAGATCAAAGATTTTAATCCTGGCTCGAATCTCAAGAATAAG
TTGAGAGATGTAGACATGTCTCAAACATTCAACTCATCTTTAGTGTGGGA
CGCGTACCTTTCACCGACCGTGGAAACTTCAGAAGAACAGTTTGAATGGT
CCAACCCCGATATTGACGCTCTCAAAGAGTATGCgagtgaaaaattaggt
tggtTGTACAATAAAACAGACGAATTATTGTTGCCTGTGCTTGAAAATAT
GAAGAAACGAAAAGAGCGGCAAAAGACTTTGATGGCATATTTCCAACCCA
AAGTAGAAGATGATATTGAAACTAACATAAAAAGTAACCGTTTGAAGAAA
GTTCTCAGTAAAATGTCTTCAAAAGATTACACGGAAAACGAGGCAGGACC
CTCTGGACTATCatccaaaaaatctgaaaaacctgaaattttctttgaaa
tggaTGATAATGACGTAGACTCGGATATTCTGAAGGTGTCGCTAAATGAT
ATAAAACCTTCCGGAACAAGGTCTACAGCTTCAGCTAGTAGACCCTACAA
TTCTAAAAAATTGATAAGTACATCGCAGTCTAAAGTAGACCAATCTTTAC
CGTATATCGACGATTCAGATGTAGTTTCGAAGCGTCCACGAAGGTCTGTA
AAGTCTAGTGAACCTTCAACGTCTTCGACAATCAGTAGTAACGAACATGT
ACAAGCAATGAAAGTTGCCAACCTTGTCAAAGCAGCTGGGGAAAGTTTAA
AACCTACTACACCATACATCGCTATACAGAATGTTAATAACATGGTCTGG
AATCGAATGCGCggtaaaaacaaacaaatgaaaCGAGGGCAGAGAGGTGG
TAAAAGTCGACGTTCAAAGACAACGGCTGATTTATTAGAACAAGTTAATA
CTGCAAAATCTTCCGTTCAAAGCAGTGACTCAGAATCGGaccattaaTTC
TTGTTCGGTGGTCATCGGGTATACAAgaatatttttgatcaaaaaaaGTA
TGCCGAAGTGTACCTATTGGATGACCTCATCAAAAAGTTATATTTGACGC
GTGAAAAGTTAATTGCACTGGCGTTTATGACAGGAAGTGATTATACCGAG
GGAATACGAGGTATAGGTGCTGTAACTGGAATGGAAGTACTTCACGAATT
CAACAAAAATAAGCCGAAAGAGACACTCAAGTTTTTCAGGGATTGGCTAC
GCGGGAAGATCAAAGATTTTAATCCTGGCTCGAATCTCAAGAATAAGTTG
AGAGATGTAGACATGTCTCAAACATTCAACTCATCTTTAGTGTGGGACGC
GTACCTTTCACCGACCGTGGAAACTTCAGAAGAACAGTTTGAATGGTCCA
ACCCCGATATTGACGCTCTCAAAGAGTATGCgagtgaaaaattaggttgg
tTGTACAATAAAACAGACGAATTATTGTTGCCTGTGCTTGAAAATATGAA
GAAACGAAAAGAGCGGCAAAAGACTTTGATGGCATATTTCCAACCCAAAG
TAGAAGATGATATTGAAACTAACATAAAAAGTAACCGTTTGAAGAAAGTT
CTCAGTAAAATGTCTTCAAAAGATTACACGGAAAACGAGGCAGGACCCTC
TGGACTATCatccaaaaaatctgaaaaacctgaaattttctttgaaatgg
aTGATAATGACGTAGACTCGGATATTCTGAAGGTGTCGCTAAATGATATA
AAACCTTCCGGAACAAGGTCTACAGCTTCAGCTAGTAGACCCTACAATTC
TAAAAAATTGATAAGTACATCGCAGTCTAAAGTAGACCAATCTTTACCGT
ATATCGACGATTCAGATGTAGTTTCGAAGCGTCCACGAAGGTCTGTAAAG
TCTAGTGAACCTTCAACGTCTTCGACAATCAGTAGTAACGAACATGTACA
AGCAATGAAAGTTGCCAACCTTGTCAAAGCAGCTGGGGAAAGTTTAAAAC
CTACTACACCATACATCGCTATACAGAATGTTAATAACATGGTCTGGAAT
CGAATGCGCggtaaaaacaaacaaatgaaaCGAGGGCAGAGAGGTGGTAA
AAGTCGACGTTCAAAGACAACGGCTGATTTATTAGAACAAGTTAATACTG
CAAAATCTTCCGTTCAAAGCAGTGACTCAGAATCGGaccattaaTTCTTG
TTCGGTGGTCATCGGGTATACAAgaatatttttgatcaaaaaaaGTATGC
CGAAGTGTACCTATTGGATGACCTCATCAAAAAGTTATATTTGACGCGTG
AAAAGTTAATTGCACTGGCGTTTATGACAGGAAGTGATTATACCGAGGGA
ATACGAGGTATAGGTGCTGTAACTGGAATGGAAGTACTTCACGAATTCAA
CAAAAATAAGCCGAAAGAGACACTCAAGTTTTTCAGGGATTGGCTACGCG
GGAAGATCAAAGATTTTAATCCTGGCTCGAATCTCAAGAATAAGTTGAGA
GATGTAGACATGTCTCAAACATTCAACTCATCTTTAGTGTGGGACGCGTA
CCTTTCACCGACCGTGGAAACTTCAGAAGAACAGTTTGAATGGTCCAACC
CCGATATTGACGCTCTCAAAGAGTATGCgagtgaaaaattaggttggtTG
TACAATAAAACAGACGAATTATTGTTGCCTGTGCTTGAAAATATGAAGAA
ACGAAAAGAGCGGCAAAAGACTTTGATGGCATATTTCCAACCCAAAGTAG
AAGATGATATTGAAACTAACATAAAAAGTAACCGTTTGAAGAAAGTTCTC
AGTAAAATGTCTTCAAAAGATTACACGGAAAACGAGGCAGGACCCTCTGG
ACTATCatccaaaaaatctgaaaaacctgaaattttctttgaaatggaTG
ATAATGACGTAGACTCGGATATTCTGAAGGTGTCGCTAAATGATATAAAA
CCTTCCGGAACAAGGTCTACAGCTTCAGCTAGTAGACCCTACAATTCTAA
AAAATTGATAAGTACATCGCAGTCTAAAGTAGACCAATCTTTACCGTATA
TCGACGATTCAGATGTAGTTTCGAAGCGTCCACGAAGGTCTGTAAAGTCT
AGTGAACCTTCAACGTCTTCGACAATCAGTAGTAACGAACATGTACAAGC
AATGAAAGTTGCCAACCTTGTCAAAGCAGCTGGGGAAAGTTTAAAACCTA
CTACACCATACATCGCTATACAGAATGTTAATAACATGGTCTGGAATCGA
ATGCGCggtaaaaacaaacaaatgaaaCGAGGGCAGAGAGGTGGTAAAAG
TCGACGTTCAAAGACAACGGCTGATTTATTAGAACAAGTTAATACTGCAA
AATCTTCCGTTCAAAGCAGTGACTCAGAATCGGaccattaaTTCTTGTTC
GGTGGTCATCGGGTATACAAgaatatttttgatcaaaaaaaGTATGCCGA
AGTGTACCTATTGGATGACCTCATCAAAAAGTTATATTTGACGCGTGAAA
AGTTAATTGCACTGGCGTTTATGACAGGAAGTGATTATACCGAGGGAATA
CGAGGTATAGGTGCTGTAACTGGAATGGAAGTACTTCACGAATTCAACAA
AAATAAGCCGAAAGAGACACTCAAGTTTTTCAGGGATTGGCTACGCGGGA
AGATCAAAGATTTTAATCCTGGCTCGAATCTCAAGAATAAGTTGAGAGAT
GTAGACATGTCTCAAACATTCAACTCATCTTTAGTGTGGGACGCGTACCT
TTCACCGACCGTGGAAACTTCAGAAGAACAGTTTGAATGGTCCAACCCCG
ATATTGACGCTCTCAAAGAGTATGCgagtgaaaaattaggttggtTGTAC
AATAAAACAGACGAATTATTGTTGCCTGTGCTTGAAAATATGAAGAAACG
AAAAGAGCGGCAAAAGACTTTGATGGCATATTTCCAACCCAAAGTAGAAG
ATGATATTGAAACTAACATAAAAAGTAACCGTTTGAAGAAAGTTCTCAGT
AAAATGTCTTCAAAAGATTACACGGAAAACGAGGCAGGACCCTCTGGACT
ATCatccaaaaaatctgaaaaacctgaaattttctttgaaatggaTGATA
ATGACGTAGACTCGGATATTCTGAAGGTGTCGCTAAATGATATAAAACCT
TCCGGAACAAGGTCTACAGCTTCAGCTAGTAGACCCTACAATTCTAAAAA
ATTGATAAGTACATCGCAGTCTAAAGTAGACCAATCTTTACCGTATATCG
ACGATTCAGATGTAGTTTCGAAGCGTCCACGAAGGTCTGTAAAGTCTAGT
GAACCTTCAACGTCTTCGACAATCAGTAGTAACGAACATGTACAAGCAAT
GAAAGTTGCCAACCTTGTCAAAGCAGCTGGGGAAAGTTTAAAACCTACTA
CACCATACATCGCTATACAGAATGTTAATAACATGGTCTGGAATCGAATG
CGCggtaaaaacaaacaaatgaaaCGAGGGCAGAGAGGTGGTAAAAGTCG
ACGTTCAAAGACAACGGCTGATTTATTAGAACAAGTTAATACTGCAAAAT
CTTCCGTTCAAAGCAGTGACTCAGAATCGGaccattaaTTCTTGTTCGGT
GGTCATCGGGTATACAAgaatatttttgatcaaaaaaaGTATGCCGAAGT
GTACCTATTGGATGACCTCATCAAAAAGTTATATTTGACGCGTGAAAAGT
TAATTGCACTGGCGTTTATGACAGGAAGTGATTATACCGAGGGAATACGA
GGTATAGGTGCTGTAACTGGAATGGAAGTACTTCACGAATTCAACAAAAA
TAAGCCGAAAGAGACACTCAAGTTTTTCAGGGATTGGCTACGCGGGAAGA
TCAAAGATTTTAATCCTGGCTCGAATCTCAAGAATAAGTTGAGAGATGTA
GACATGTCTCAAACATTCAACTCATCTTTAGTGTGGGACGCGTACCTTTC
ACCGACCGTGGAAACTTCAGAAGAACAGTTTGAATGGTCCAACCCCGATA
TTGACGCTCTCAAAGAGTATGCgagtgaaaaattaggttggtTGTACAAT
AAAACAGACGAATTATTGTTGCCTGTGCTTGAAAATATGAAGAAACGAAA
AGAGCGGCAAAAGACTTTGATGGCATATTTCCAACCCAAAGTAGAAGATG
ATATTGAAACTAACATAAAAAGTAACCGTTTGAAGAAAGTTCTCAGTAAA
ATGTCTTCAAAAGATTACACGGAAAACGAGGCAGGACCCTCTGGACTATC
atccaaaaaatctgaaaaacctgaaattttctttgaaatggaTGATAATG
ACGTAGACTCGGATATTCTGAAGGTGTCGCTAAATGATATAAAACCTTCC
GGAACAAGGTCTACAGCTTCAGCTAGTAGACCCTACAATTCTAAAAAATT
GATAAGTACATCGCAGTCTAAAGTAGACCAATCTTTACCGTATATCGACG
ATTCAGATGTAGTTTCGAAGCGTCCACGAAGGTCTGTAAAGTCTAGTGAA
CCTTCAACGTCTTCGACAATCAGTAGTAACGAACATGTACAAGCAATGAA
AGTTGCCAACCTTGTCAAAGCAGCTGGGGAAAGTTTAAAACCTACTACAC
CATACATCGCTATACAGAATGTTAATAACATGGTCTGGAATCGAATGCGC
ggtaaaaacaaacaaatgaaaCGAGGGCAGAGAGGTGGTAAAAGTCGACG
TTCAAAGACAACGGCTGATTTATTAGAACAAGTTAATACTGCAAAATCTT
CCGTTCAAAGCAGTGACTCAGAATCGGaccattaaTTCTTGTTCGGTGGT
CATCGGGTATACAAgaatatttttgatcaaaaaaaGTATGCCGAAGTGTA
CCTATTGGATGACCTCATCAAAAAGTTATATTTGACGCGTGAAAAGTTAA
TTGCACTGGCGTTTATGACAGGAAGTGATTATACCGAGGGAATACGAGGT
ATAGGTGCTGTAACTGGAATGGAAGTACTTCACGAATTCAACAAAAATAA
GCCGAAAGAGACACTCAAGTTTTTCAGGGATTGGCTACGCGGGAAGATCA
AAGATTTTAATCCTGGCTCGAATCTCAAGAATAAGTTGAGAGATGTAGAC
ATGTCTCAAACATTCAACTCATCTTTAGTGTGGGACGCGTACCTTTCACC
GACCGTGGAAACTTCAGAAGAACAGTTTGAATGGTCCAACCCCGATATTG
ACGCTCTCAAAGAGTATGCgagtgaaaaattaggttggtTGTACAATAAA
ACAGACGAATTATTGTTGCCTGTGCTTGAAAATATGAAGAAACGAAAAGA
GCGGCAAAAGACTTTGATGGCATATTTCCAACCCAAAGTAGAAGATGATA
TTGAAACTAACATAAAAAGTAACCGTTTGAAGAAAGTTCTCAGTAAAATG
TCTTCAAAAGATTACACGGAAAACGAGGCAGGACCCTCTGGACTATCatc
caaaaaatctgaaaaacctgaaattttctttgaaatggaTGATAATGACG
TAGACTCGGATATTCTGAAGGTGTCGCTAAATGATATAAAACCTTCCGGA
ACAAGGTCTACAGCTTCAGCTAGTAGACCCTACAATTCTAAAAAATTGAT
AAGTACATCGCAGTCTAAAGTAGACCAATCTTTACCGTATATCGACGATT
CAGATGTAGTTTCGAAGCGTCCACGAAGGTCTGTAAAGTCTAGTGAACCT
TCAACGTCTTCGACAATCAGTAGTAACGAACATGTACAAGCAATGAAAGT
TGCCAACCTTGTCAAAGCAGCTGGGGAAAGTTTAAAACCTACTACACCAT
ACATCGCTATACAGAATGTTAATAACATGGTCTGGAATCGAATGCGCggt
aaaaacaaacaaatgaaaCGAGGGCAGAGAGGTGGTAAAAGTCGACGTTC
AAAGACAACGGCTGATTTATTAGAACAAGTTAATACTGCAAAATCTTCCG
TTCAAAGCAGTGACTCAGAATCGGaccattaaTTCTTGTTCGGTGGTCAT
CGGGTATACAAgaatatttttgatcaaaaaaaGTATGCCGAAGTGTACCT
ATTGGATGACCTCATCAAAAAGTTATATTTGACGCGTGAAAAGTTAATTG
CACTGGCGTTTATGACAGGAAGTGATTATACCGAGGGAATACGAGGTATA
GGTGCTGTAACTGGAATGGAAGTACTTCACGAATTCAACAAAAATAAGCC
GAAAGAGACACTCAAGTTTTTCAGGGATTGGCTACGCGGGAAGATCAAAG
ATTTTAATCCTGGCTCGAATCTCAAGAATAAGTTGAGAGATGTAGACATG
TCTCAAACATTCAACTCATCTTTAGTGTGGGACGCGTACCTTTCACCGAC
CGTGGAAACTTCAGAAGAACAGTTTGAATGGTCCAACCCCGATATTGACG
CTCTCAAAGAGTATGCgagtgaaaaattaggttggtTGTACAATAAAACA
GACGAATTATTGTTGCCTGTGCTTGAAAATATGAAGAAACGAAAAGAGCG
GCAAAAGACTTTGATGGCATATTTCCAACCCAAAGTAGAAGATGATATTG
AAACTAACATAAAAAGTAACCGTTTGAAGAAAGTTCTCAGTAAAATGTCT
TCAAAAGATTACACGGAAAACGAGGCAGGACCCTCTGGACTATCatccaa
aaaatctgaaaaacctgaaattttctttgaaatggaTGATAATGACGTAG
ACTCGGATATTCTGAAGGTGTCGCTAAATGATATAAAACCTTCCGGAACA
AGGTCTACAGCTTCAGCTAGTAGACCCTACAATTCTAAAAAATTGATAAG
TACATCGCAGTCTAAAGTAGACCAATCTTTACCGTATATCGACGATTCAG
ATGTAGTTTCGAAGCGTCCACGAAGGTCTGTAAAGTCTAGTGAACCTTCA
ACGTCTTCGACAATCAGTAGTAACGAACATGTACAAGCAATGAAAGTTGC
CAACCTTGTCAAAGCAGCTGGGGAAAGTTTAAAACCTACTACACCATACA
TCGCTATACAGAATGTTAATAACATGGTCTGGAATCGAATGCGCggtaaa
aacaaacaaatgaaaCGAGGGCAGAGAGGTGGTAAAAGTCGACGTTCAAA
GACAACGGCTGATTTATTAGAACAAGTTAATACTGCAAAATCTTCCGTTC
AAAGCAGTGACTCAGAATCGGaccattaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13792MSTRG.13792Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13792.1.p1MSTRG.13792.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13792.1.p1.exon1MSTRG.13792.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13792.1.p1.exon2MSTRG.13792.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13792.1.p1.exon3MSTRG.13792.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13792.1.p1.exon4MSTRG.13792.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13792.1.p1.exon5MSTRG.13792.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13792.1.p1.exon6MSTRG.13792.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13792.1.p1.exon7MSTRG.13792.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000112_pilongenomesc0000112_pilon:185445..196817 +