MSTRG.13762.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13762.4.p1
Unique NameMSTRG.13762.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000111_pilon:796369..805656+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13762.4.p1 ID=MSTRG.13762.4.p1|Name=MSTRG.13762.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9288bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:796369..805656+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAAGAGTGGATGAGTCTAGATAAGGcttaattttatcattttcatcatc acGTATAAATATAAGGGTTGGTATGAGAAGAGAAATATAGTTAGTCTTAA CTATTGACAGGACATAGACATACAGGAAGAGGATAAATTCAGGATTGATA AGATGTGGAAAGCCATATGTTACTGCATGGTTATACTTTCTACTCTGACG GAGTTCACTTATTCAATACCTGATCTCGTCAAATTGAACGGAGATAGTGA ATCACTGACAGAACAATTTGGAGCAGTCGTCTTCGATGTAAAGAATAACG ACCCAGCGGATATAAGATGTCCGAAAACGAAAATTGGAGAGAAAAATTAT GTCAATAATGAATGTGCTAAGAATCTAAATCAATTTGTAGATGTTGACGA TTTCAATTACTTTTTGAGACCTTTCAATAAACAAGATAGTCCTGGTGCTG GCAGAGTAAAGGTAAGAAAAataacttaaaggttttgaattgtttttaaa ttagagtgatatcgtttgcttactcatcacttttaattcacaagcttttt cacattggattaacACGAATgtagagcaagattggtcagaaaaaggaaaa gaaagacaatttttgtttatattagCAGAATATAGCAATAGGCAGAcatt gtcctgatatgaaatatgcgtcttatatgaaacgggaacacttatgtaaa aataaaacatttaattaaattttcatttaagaaCAATCAAATTTCATATC AGCCTCATTTGGATTGACAATTTCCATGTTGTATGAGATGTTCCTCTTGA CCTTTTtctgttacatgttttttataagaacatccaaattttttgaatcc TCCGGATGTTCTttaacttttgagtttgaaGTCTAGAAATGATCTtaaca tcttcttttttttcaccattttgcgaGTATTTTTTGCCCATTATCCTAAG 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CGTTAAATTTCAGACTTGAAACCAACAGACCTGACAACCGTTACCGTAAC ACTCAACAATCCAAAGGAGACCATCTCAACATTACACAAATTCTGGACAA TCAATTTGGTGATAAAACCTAAAGGAATCGTCTCTACAACAGATACAAGT GCTTTCTATGCTGTTTTCAAAAACTCACCAACACCAAGTATCTTATTCGA GAGAGGATCCACCAAAATTAAGGTAACGGTTTTTATGAATTTACTAATTC AGTTACAGTCGGCGTTCTActtttcgatacgctccattatgcGATAATAT TGAAACTcgctgtcaacaagaaactcttataaacgacgctctTCTATACG CTCCTTTATTTAATGAAAATCCGATCCGTCTCGAAAAACCAAGTAGTGGG CGTCAACATAaaagtccaaatttgaaataatatttaCTACAAAAATATCC CTAGCATCAAGACTAAAGGATAAACAAtccttaaggccggtctccactct CGCGCGACATGagggaaaactttttgacgtttttgtaaggtcattggtcg gttaaaaaatgaagcaattctataggtagaaattgacgtaacggatgaaa aaagtagaacttccttcaaatttttttttgttcgcgcaaaacttttttat gacgtaatcttttcttgaggcaaaaaaggttaagaaaaaaactgtcgccc atttcgcacGAAAGTGGAGGCCGGCCTTTATACTAAAGTTCAACTGATTC ATTCAAATACATATTATCATCATCTCTACAGGTTTGTACAACTTTCACCT ATCCAAGCCCATCCACCTGTCAAACAATACCAACACCACTACCTCTCAAC AAATTCACCAGAgtacaaattcaacaaatccCAAATGGAGCTGACTCCAA ATTCATCGTCAGATACAATGGTGTTAACCAATACATTGGAACACCTACAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:796369..805656+

>MSTRG.13762.4.p1 ID=MSTRG.13762.4.p1|Name=MSTRG.13762.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=23160bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:796369..805656+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTGGAAAGCCATATGTTACTGCATGGTTATACTTTCTACTCTGACGGA
GTTCACTTATTCAATACCTGATCTCGTCAAATTGAACGGAGATAGTGAAT
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GAAGTTGGGTCTATCGCCTTTCACCGCGTCAAAGTCGCCAAATAGAGGAA
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GAAGCTTTTCAAAGTGAAACAGATCGATTTTGCGAATACCGTGATGATGG
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GAAAAGTTTCATTCGCTACTTGCGATGAAGGAGAACATTTTCATCCGAAG
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GATACAATGGTGTTAACCAATACATTGGAACACCTACAAACTTACAAGTG
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TGATCGAGACTTTGCCGAAACTTTACGATACCTGGGATTTGACACTAAGC
TTCACCCCTCTTGGTGCAAAAACAGGTGATACAAACATTCTTCATGCAAC
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ATGGTACAACTCGTTTACGAATTTGTTCTCCATCAATAACATTTGGTTCA
TCGAACTGTGTCAGATTCTTTCGTCCCTTTGAAGTCAACAAACTGGTAAC
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TCTGGAAGCTTATCAATTTCAAACACCATTACCAATTGCTAATTGAATGT
GGAAAGCCATATGTTACTGCATGGTTATACTTTCTACTCTGACGGAGTTC
ACTTATTCAATACCTGATCTCGTCAAATTGAACGGAGATAGTGAATCACT
GACAGAACAATTTGGAGCAGTCGTCTTCGATGTAAAGAATAACGACCCAG
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AATGAATGTGCTAAGAATCTAAATCAATTTGTAGATGTTGACGATTTCAA
TTACTTTTTGAGACCTTTCAATAAACAAGATAGTCCTGGTGCTGGCAGAG
TAAAGATTCATTTCAACGGCTTCCTATCGTTTGGTACTGAATCACAAAAC
GAAGCAGGGAAAGTAAAATGTCTCAAATGGGATCAAAGAGTAGTCTCGTT
ATCTCACTCAAAATTCCAGTCAAACTATCTAGCACCTTATTGGATGAGGT
ATTTCGAAGGGTCTGTTTACATCTTCAAAATGGATAAGGATCACGAAGAT
CGAAGCAAAATTATTAAAGATTTAAGCGAAGGAGGATTTTTTGAGCAAAC
TGGAAGTGATGAAGAAAATGAGTTAGATAAAAATGCACAGATTATTGTGA
TTACATATGTCAGGATGGCTTCGGATGGAACGATTAATCCTGACCCTAAC
AAACATACGTTTGACGCAAAATTaatgaacacatttcaattGAACTTGAT
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CAAATGAAATTGTTGTGGAAAACGATTCCGAAAGAATATGCTTTGGACAG
GTTGGTATTGCAAGACATGTTCAATTTGATCAGATTGGACAAAATGGTGT
TGGTTTTAATGTTGGTAATTTTCCTTTTGGTACAGACAGTGTTGGATATA
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GATAACAAAGATGTTGGAAGTTGGGTCTATCGCCTTTCACCGCGTCAAAG
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AATACCGTGATGATGGAAAATTCCTGTTTCCCTTGGATTGTCGTGGATAT
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GCTATAACCTGATGCCTATTCATAAAGACTTGAAACCAACAGACCTGACA
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GCATGGCACCAGCCAATGCAGAAACCAAGTACTACAAGTTCAATTCAGGC
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TACTCTGACGGAGTTCACTTATTCAATACCTGATCTCGTCAAATTGAACG
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AAGAATAACGACCCAGCGGATATAAGATGTCCGAAAACGAAAATTGGAGA
GAAAAATTATGTCAATAATGAATGTGCTAAGAATCTAAATCAATTTGTAG
ATGTTGACGATTTCAATTACTTTTTGAGACCTTTCAATAAACAAGATAGT
CCTGGTGCTGGCAGAGTAAAGATTCATTTCAACGGCTTCCTATCGTTTGG
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CCTTATTGGATGAGGTATTTCGAAGGGTCTGTTTACATCTTCAAAATGGA
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GCACAGATTATTGTGATTACATATGTCAGGATGGCTTCGGATGGAACGAT
TAATCCTGACCCTAACAAACATACGTTTGACGCAAAATTaatgaacacat
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TATCGTTCATTGGATACAAATGAAATTGTTGTGGAAAACGATTCCGAAAG
AATATGCTTTGGACAGGTTGGTATTGCAAGACATGTTCAATTTGATCAGA
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TTCAAATGAATTTGGTGATAACAAAGATGTTGGAAGTTGGGTCTATCGCC
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GACATTAAAGATAACCGAAAATGTTACGTACGACAGGCTGCAATAGATTG
TTTACAAGGGGAAGAATGTAAACCACCACCCGAACAAGACGGCGATAACG
AATTAGGTAGAAGCCGTAGGTCAGTGACAGCTGAAGCTTTTCAAAGTGAA
ACAGATCGATTTTGCGAATACCGTGATGATGGAAAATTCCTGTTTCCCTT
GGATTGTCGTGGATATATGATTTGCAGGGGTGGAAAAGTTTCATTCGCTA
CTTGCGATGAAGGAGAACATTTTCATCCGAAGCTTCGAAAATGTGTTGTC
GAATCAGAGTATTCATGCTATAACCTGATGCCTATTCATAAAGACTTGAA
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CCATCTCAACATTACACAAATTCTGGACAATCAATTTGGTGATAAAACCT
AAAGGAATCGTCTCTACAACAGATACAAGTGCTTTCTATGCTGTTTTCAA
AAACTCACCAACACCAAGTATCTTATTCGAGAGAGGATCCACCAAAATTA
AGGTTTGTACAACTTTCACCTATCCAAGCCCATCCACCTGTCAAACAATA
CCAACACCACTACCTCTCAACAAATTCACCAGAgtacaaattcaacaaat
ccCAAATGGAGCTGACTCCAAATTCATCGTCAGATACAATGGTGTTAACC
AATACATTGGAACACCTACAAACTTACAAGTGTTCAACGATGTTAAGGTC
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GAATTTGTTCTCCATCAATAACATTTGGTTCATCGAACTGTGTCAGATTC
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TCGGATTATTGGATGCCATCTGCAAATGCTGTTCTGGAAGCTTATCAATT
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AAACGAAAATTGGAGAGAAAAATTATGTCAATAATGAATGTGCTAAGAAT
CTAAATCAATTTGTAGATGTTGACGATTTCAATTACTTTTTGAGACCTTT
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TGTCTCAAATGGGATCAAAGAGTAGTCTCGTTATCTCACTCAAAATTCCA
GTCAAACTATCTAGCACCTTATTGGATGAGGTATTTCGAAGGGTCTGTTT
ACATCTTCAAAATGGATAAGGATCACGAAGATCGAAGCAAAATTATTAAA
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TGAGTTAGATAAAAATGCACAGATTATTGTGATTACATATGTCAGGATGG
CTTCGGATGGAACGATTAATCCTGACCCTAACAAACATACGTTTGACGCA
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GTTCAATTTGATCAGATTGGACAAAATGGTGTTGGTTTTAATGTTGGTAA
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TGACGATTATTGTGACGACATTAAAGATAACCGAAAATGTTACGTACGAC
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TCTATGCTGTTTTCAAAAACTCACCAACACCAAGTATCTTATTCGAGAGA
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tacaaattcaacaaatccCAAATGGAGCTGACTCCAAATTCATCGTCAGA
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CAAATTCATCGTCAGATACAATGGTGTTAACCAATACATTGGAACACCTA
CAAACTTACAAGTGTTCAACGATGTTAAGGTCTACCCAAGGGATCCGAGC
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AACTGTTAGAGAGCCACAATATTTTGTGATTAGATTTAATGATCCTGCAT
CAAGATTGATGGACGATGTCAATGTTTATGTCTCGGATTATTGGATGCCA
TCTGCAAATGCTGTTCTGGAAGCTTATCAATTTCAAACACCATTACCAAT
TGCTAATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13762MSTRG.13762Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13762.4.p1MSTRG.13762.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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