MSTRG.13757.9.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.13757.9.p1
Unique Name	MSTRG.13757.9.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000111_pilon:643909..682696+
coding sequence from alignment at sc0000111_pilon:643909..682696+

mRNA from alignment at sc0000111_pilon:643909..682696+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.13757.9.p1 ID=MSTRG.13757.9.p1|Name=MSTRG.13757.9.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=38788bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:643909..682696+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GAACGGTGTTTCATCTGAGGAATTGATTTTCAAGAATGGAGATAGATTAT
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AATGCCACAATCTATCATTTGAATTCGTGTTATGTTTTCAATGAGACGGA
ATATCAATACAGTGATTACTTCTGGTCGGAGATGTCAGAATGtgaaattt
acagaccagaattacAAGGAGTTCCAGAAACCAATGAACAGTGTGGAAAT
GGATTTCAATATTCCAATCAAACATATTGTACTATGGGTGAATACCAGGA
GCATCCACCACAGAACGAAAGTCTTTGTCCACCTGCTGGTTACATTGTGA
AAGCGTGTTACGTACCTTGCAAAGGAGCGGGTGCTGTTAGTAGTACACTC
ATCGACGACccaaatcaaatcaaacttcACAAACCGAATAGTCAAGAAAA
CTGGACTCTTTATAATTTCAATGAGGCTTACCCGGATAACAAAGCAGATG
ATTTACATGGCTTCTTGAAATTCCATCCTGCATCAGACAACGAATTTGAT
GGCACTGACAAATTAGTGGCTGAAGAATTGCTTTCAAAGCAGGTCGAACT
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TTTATACGATGGATAATTTTAAATGGAAACTTCTCCTCACCACTGACCAA
ACCAAATGGTGGAACATTACAAGCGAAGAgACCCGTAACCCTAATTCGTC
TCCTCAAAATCTTCTTGTGGTGGATGATATTCAACAAATTATCAATGGAT
TGAAAGTCGAACTGGAGTTTGATTCAACGCCAACAAACGAGCTGAAAGCA
GAATTAAATCGCATCGATTATTATAATTTGGGAGATTGGACCGAATGGGG
GAGTTGGGGTGATTGTAGCGGAAATTGTCGTTTGGAAAATTCAACTTACG
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AGGTTTGTTGAAATGGACAATTGTAAATGCAAAGAGGACTTTCAATGGAA
AGCTATCAACACGACATTCAGTCCCTGCAATGCCACAAAAGATGAATGTG
GACCTGGATGGCGGTACAAAACAGCTGATGTTTGTCAATACATCATAGAC
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TTGACGGATTATAAGGAAGATATATTTGTATCACGGTTCGGTATTTGTTC
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CCATGATAAAAGTTGGATACTTTCTACCATTATTCCCGAATGGAGACAAA
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aaatccaCCCATCGACTCTACATACAAGATGCCATTTTGTAAGGCGCCAC
AATGGGGTTGGGTAAATTCTTCGTGTAGCGTATCGTGTGGTGTTGGCTAT
CTGAACAGTACAGTAGTTTGTATGGGTGCTGACGGAACAACTCATCCAGA
CCATTACTGCCCGTTCGAAGAAGACTTAGAACCTAAGATATTAGAGTGTG
TCAATAATGTTTCATGTTATGATCTGACAGAATGGACAGATTTTTCAAGC
TGCGGTGGAGGGTGTGGTATCAATGGAACACAAAATCAAACAAGAGAATG
TCTCCGTGACGGAGAGCCGATTGCTAATTATGCAGAGTGTATCAGTTTGG
GGAAGATGGACGAATCCACAGAATTTTTAAACGTCACTTGGTGTTATAAT
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AAGTGAAACGTGTGGGAATTACACAGAAACAAGTCAACGAGATTGTCTGA
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TAGCGTCACGTGCGGTGAAGGGGTACAAAAATATACACGTGATTGTCTCG
ATGGAGAAGGGAATGCGATTGATGAAGTCTCGTGTCATGAGTTGTACGAT
GGATATGGTTTCAAAGGAAATCTAACCGGCAAATGCTCATTTAATTTCAC
CTGTACTGATCCGGTCACTGATTGGACAGAATGGAGCACGTGCACCACAA
CATGTGGAGGTGGACAGACTAAACGTACACGAAAATGTATCATCCCAGGG
AGTTGTAATCATTTGCTGGAAGAACATCAATTGTGTAATGAAGATCCCTG
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TAAGCTGTGGAAACGGAACACAATTTCGTACCCGGACATGCTTTCCGCCT
CTGCATGGTGGATTAGATTGTGTGGGAAATGATACAGATGTCCAAAGTTG
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CAAAAGTTTGTGATGATGTTGATTTGGCTTGTGATCCTGAATTCTTCAAA
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ATGAAACGTGCCTTGGATTCAAGAATATCGGAAGCTACGATTGTTCTATA
AGGGCACCTGGTAACGGAGAAAAGCGTGTTTGTGGTTGTATCAGTAAagA
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TGCAATGAACATGAGTGATATACAGGACTGTGATTACAATGTCGTACCCA
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GTTGATGATTACTGGTGCGGTGAAAATGCCACAATCTATCATTTGAATTC
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GTCCACCTGCTGGTTACATTGTGAAAGCGTGTTACGTACCTTGCAAAGGA
GCGGGTGCTGTTAGTAGTACACTCATCGACGACccaaatcaaatcaaact
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CCTGCATCAGACAACGAATTTGATGGCACTGACAAATTAGTGGCTGAAGA
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GCAATGCCACAAAAGATGAATGTGGACCTGGATGGCGGTACAAAACAGCT
GATGTTTGTCAATACATCATAGACGGAAGCTCACATCCTGAAGAACTTTG
TGGTGAAAAGCCAATCATCACCCAGAATTGCTATCACGTTTGTCCGGCTC
TCTGTACCAATGAAATGGCTTCGAACACAGAATCTAATCTACAAATTAAT
GGATCGTCCACTGATATTTACCAGTTGACGGATTATAAGGAAGATATATT
TGTATCACGGTTCGGTATTTGTTCAACCAATATAAACCCGACCTCTAGCT
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CTACTGGATCATTTTTCATGCTTGAGCCCTTTAGGTGCGGAGGAAAAGTC
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TGATTTTCAAGAATGGAGATAGATTATTTCCTGTAGGGACTCTGACAATG
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TCCATTCAAAGATACTGTACAAATTCAAACAACACCCTGCAATTCGACTT
ACGAATGGAAGTCATGGTCTGATTGGTCGAAATGTGAACCAATCAACGCG
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CCACAATCTATCATTTGAATTCGTGTTATGTTTTCAATGAGACGGAATAT
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GTGTTACGTACCTTGCAAAGGAGCGGGTGCTGTTAGTAGTACACTCATCG
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GTATATTTCAGCCGTTTTgtgaaagtcaaaaaattcgcCATCAACCTTTA
TACGATGGATAATTTTAAATGGAAACTTCTCCTCACCACTGACCAAACCA
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TAAATCGCATCGATTATTATAATTTGGGAGATTGGACCGAATGGGGGAGT
TGGGGTGATTGTAGCGGAAATTGTCGTTTGGAAAATTCAACTTACGAGAG
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TGCTATCACGTTTGTCCGGCTCTCTGTACCAATGAAATGGCTTCGAACAC
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AATATAAACCCGACCTCTAGCTCACCCTCACATATGGAAATAGATGCCAT
GATAAAAGTTGGATACTTTCTACCATTATTCCCGAATGGAGACAAAGATT
GTGAGGATGAATCTTTTGTTAAAGTTGAAGGcggatttttcaaatcaaat
ccaCCCATCGACTCTACATACAAGATGCCATTTTGTAAGGCGCCACAATG
GGGTTGGGTAAATTCTTCGTGTAGCGTATCGTGTGGTGTTGGCTATCTGA
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TGATCCGGTCACTGATTGGACAGAATGGAGCACGTGCACCACAACATGTG
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GGTGGATTAGATTGTGTGGGAAATGATACAGATGTCCAAAGTTGTGACAC
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AACCATCTGGAACTTGCTTCGAGATTAAAAATCAATTGTGCAACTACCAC
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CGTGCCTTGGATTCAAGAATATCGGAAGCTACGATTGTTCTATAAGGGCA
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TACTATGGGTCCTTGGAGTCGTTGGGGCGAATGCAGTACATCATGTGGAG
TGGGTAACCGCACGCGGTCGCGCGATCAAGTGACAAGCGATGACGAAACT
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GAACATGAGTGATATACAGGACTGTGATTACAATGTCGTACCCAGTATTT
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GAGAAACTATCAAAAAGGTGGAGTGCACAGGTGTCAAGGAGTGCATTCCT
GTTGATGTTACAGCCGCGATCAAAATCACGGACAGAGACTTCACTAAAGA
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AAAAATTTGTGAACAAGGTTTACGAAAAAGAATTGGCaaaagacaaaaat
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GAACTGGATTGCTCCAAAATATACGAAGTACAAACAATCGGTGTATTAGA
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GAACACAAAATCAAACAAGAGAATGTCTCCGTGACGGAGAGCCGATTGCT
AATTATGCAGAGTGTATCAGTTTGGGGAAGATGGACGAATCCACAGAATT
TTTAAACGTCACTTGGTGTTATAATGAGAACGAACCATGCGCATTCTGGG
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TCCTTCGAAGGAGGGCGTTATTATGGGGCGGTGAATTATTCTTCAGATAC
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CCGGCAAATGCTCATTTAATTTCACCTGTACTGATCCGGTCACTGATTGG
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TGGAGCAAGTTTTCCGAATGTTCGGTAAGCTGTGGAAACGGAACACAATT
TCGTACCCGGACATGCTTTCCGCCTCTGCATGGTGGATTAGATTGTGTGG
GAAATGATACAGATGTCCAAAGTTGTGACACTGATAAACCATGTCCAGCT
GTACTCATGGTGGCAGAAGACTGCTCAAAAGTTTGTGATGATGTTGATTT
GGCTTGTGATCCTGAATTCTTCAAAGGAATGAACCATCTGGAACTTGCTT
CGAGATTAAAAATCAATTGTGCAACTACCACCACCTTTCAAAACCATACC
TCGCATCCTAGTTATGACACATCCAATGAAACGTGCCTTGGATTCAAGAA
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GTGTTTGTGGTTGTATCAGTAAagACGAAATTACTATGGGTCCTTGGAGT
CGTTGGGGCGAATGCAGTACATCATGTGGAGTGGGTAACCGCACGCGGTC
GCGCGATCAAGTGACAAGCGATGACGAAACTGAAACATACACTCAATTAG
GAACTTGTAGTGAACGACCCTGTCCAATTGATGGGGAATGGGGACAATGG
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GCGCACGCGTCAATGTAATGACCCACTTCCAATGCACGGAGGAAGAGAAT
GTATGTCACCTGAAACCAATGAGGGTGCAATGAACATGAGTGATATACAG
GACTGTGATTACAATGTCGTACCCAGTATTTGTCCAGTGCATGGTGGTTG
GTCTACTTGGAAACCTGTATCCAACTGCTCAATGTCGTGTCGACCAAAGA
ATTCCACAGAAAAGATATATAGCAGTTACGCTCGACATTGTGATTCGCCC
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GGAGTGCACAGGTGTCAAGGAGTGCATTCCTGTTGATGTTACAGCCGCGA
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GAAGCCAGCCTCGATATACAAAACGAAATACAAAAATTTGTGAACAAGGT
TTACGAAAAAGAATTGGCaaaagacaaaaattatgtCAAAGTCGTCTTGC
ATGGTTTCAGTGATGGAACCGGTGTGGAGGCTGAAGAGTTCGGTATCAAA
AAGAAAGGGAAGAAATGAaTGTTGGCTTTTCTTGTTTATATGAGTATTTT
GGTGCAAAGATCAACAGCTGTGAAGCGGTACGAACTGGATTGCTCCAAAA
TATACGAAGTACAAACAATCGGTGTATTAGAAAAAGACTGGGCTGAAGGC
TCTAGCTTTGCTACTGGATCATTTTTCATGCTTGAGCCCTTTAGGTGCGG
AGGAAAAGTCATTTCAGTAAATCCACCTGACTTAACCATCAAGAACAAGA
TGACTTCTACAGATacaGAGAAGACATACACATTCTTGAACGGTGTTTCA
TCTGAGGAATTGATTTTCAAGAATGGAGATAGATTATTTCCTGTAGGGAC
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AATTCGACTTACGAATGGAAGTCATGGTCTGATTGGTCGAAATGTGAACC
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GGTGAAAATGCCACAATCTATCATTTGAATTCGTGTTATGTTTTCAATGA
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GGAAATGGATTTCAATATTCCAATCAAACATATTGTACTATGGGTGAATA
CCAGGAGCATCCACCACAGAACGAAAGTCTTTGTCCACCTGCTGGTTACA
TTGTGAAAGCGTGTTACGTACCTTGCAAAGGAGCGGGTGCTGTTAGTAGT
ACACTCATCGACGACccaaatcaaatcaaacttcACAAACCGAATAGTCA
AGAAAACTGGACTCTTTATAATTTCAATGAGGCTTACCCGGATAACAAAG
CAGATGATTTACATGGCTTCTTGAAATTCCATCCTGCATCAGACAACGAA
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CGAACTTCAGGTATATTTCAGCCGTTTTgtgaaagtcaaaaaattcgcCA
TCAACCTTTATACGATGGATAATTTTAAATGGAAACTTCTCCTCACCACT
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TTCGTCTCCTCAAAATCTTCTTGTGGTGGATGATATTCAACAAATTATCA
ATGGATTGAAAGTCGAACTGGAGTTTGATTCAACGCCAACAAACGAGCTG
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GTCGGAAGGTTTGTTGAAATGGACAATTGTAAATGCAAAGAGGACTTTCA
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AATGTGGACCTGGATGGCGGTACAAAACAGCTGATGTTTGTCAATACATC
ATAGACGGAAGCTCACATCCTGAAGAACTTTGTGGTGAAAAGCCAATCAT
CACCCAGAATTGCTATCACGTTTGTCCGGCTCTCTGTACCAATGAAATGG
CTTCGAACACAGAATCTAATCTACAAATTAATGGATCGTCCACTGATATT
TACCAGTTGACGGATTATAAGGAAGATATATTTGTATCACGGTTCGGTAT
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GACAAAGATTGTGAGGATGAATCTTTTGTTAAAGTTGAAGGcggattttt
caaatcaaatccaCCCATCGACTCTACATACAAGATGCCATTTTGTAAGG
CGCCACAATGGGGTTGGGTAAATTCTTCGTGTAGCGTATCGTGTGGTGTT
GGCTATCTGAACAGTACAGTAGTTTGTATGGGTGCTGACGGAACAACTCA
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AGTGTGTCAATAATGTTTCATGTTATGATCTGACAGAATGGACAGATTTT
TCAAGCTGCGGTGGAGGGTGTGGTATCAATGGAACACAAAATCAAACAAG
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GTTTGGGGAAGATGGACGAATCCACAGAATTTTTAAACGTCACTTGGTGT
TATAATGAGAACGAACCATGCGCATTCTGGGGTAATTGGAGTGATTGGAC
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ACTGCTCAAAAGTTTGTGATGATGTTGATTTGGCTTGTGATCCTGAATTC
TTCAAAGGAATGAACCATCTGGAACTTGCTTCGAGATTAAAAATCAATTG
TGCAACTACCACCACCTTTCAAAACCATACCTCGCATCCTAGTTATGACA
CATCCAATGAAACGTGCCTTGGATTCAAGAATATCGGAAGCTACGATTGT
TCTATAAGGGCACCTGGTAACGGAGAAAAGCGTGTTTGTGGTTGTATCAG
TAAagACGAAATTACTATGGGTCCTTGGAGTCGTTGGGGCGAATGCAGTA
CATCATGTGGAGTGGGTAACCGCACGCGGTCGCGCGATCAAGTGACAAGC
GATGACGAAACTGAAACATACACTCAATTAGGAACTTGTAGTGAACGACC
CTGTCCAATTGATGGGGAATGGGGACAATGGACAGCTTTTGGTCCTTGTT
CGGTCGAGTGTGGACCAAATGGTTATCAAGTGCGCACGCGTCAATGTAAT
GACCCACTTCCAATGCACGGAGGAAGAGAATGTATGTCACCTGAAACCAA
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TACCCAGTATTTGTCCAGTGCATGGTGGTTGGTCTACTTGGAAACCTGTA
TCCAACTGCTCAATGTCGTGTCGACCAAAGAATTCCACAGAAAAGATATA
TAGCAGTTACGCTCGACATTGTGATTCGCCCGCTCCAGAGTTTGGTGGTA
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CTTCACTAAAGAGCTTGATGATTTACAATCTGAAGCCAGCCTCGATATAC
AAAACGAAATACAAAAATTTGTGAACAAGGTTTACGAAAAAGAATTGGCa
aaagacaaaaattatgtCAAAGTCGTCTTGCATGGTTTCAGTGATGGAAC
CGGTGTGGAGGCTGAAGAGTTCGGTATCAAAAAGAAAGGGAAGAAATGA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.13757	MSTRG.13757	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.13757.9.p1	MSTRG.13757.9.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


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MSTRG.13757.9.p1.exon30	MSTRG.13757.9.p1.exon30	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000111_pilon	genome	sc0000111_pilon:643909..682696 +

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MSTRG.13757.9.p1 (mRNA) -