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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000111_pilon:579983..592793+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13756.1.p1 ID=MSTRG.13756.1.p1|Name=MSTRG.13756.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12811bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:579983..592793+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCCTCACGTGCTCTGCCATTTCTCTTCGAATTTTAGTTTTCTGGCAGCTT
TATTGAACGTTTGGTGATGACAGGtattatttaatcttcactttttatgt
tcttctttttattttcgaattcaactttattttatACCAAGACAACCCTC
TGCCGAGAACGCGTGCACACTACTACATACACTGCACGCACTGGACTGGA
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CTaaaaaaaCTGCTGTGAAACCGATATGCGGTCAGTCTGTGtaactgtaa
aaaaataaaatatgtatGGCCGTCATGGCGACTAGTCCTCCTCAGCAAAT
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AATTGGGTGAACATCCTCGTGTTGTGGGGCAGGGTTGGCGACTTCACCAT
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TGCTTCTGCGTGTTTCTGTTGTCCTCATCGgcgtgttgttgttgttgtcg
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TTTCAGGAGAACAGTGTCCCCAAACTGGATGTTGTGATGCTTGACATATG
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TCTCTTGCTTCGGTGATGTCTTTTCTGCTGGCTGTTTCATCTTGCTGTGG
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CGGTTGTTGGGTGTGGTGTGGCGCGGTACATCTGTAGAGTCTTGTTCAGC
TCTGCTTTGGGATCATTCTTTTCGACGATGGCTGTGTGCCAGACTTTCTT
GCAAATTTTCATGAAGGCTTCCGCAAGGCCATTTGCTTCCGGATCATCCG
CGCTGAGCGTTGGTTCGTGACGAATACCTGCCCACTTGAAATATTCTTGG
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TGTGTTCTGATCCTGTCCCTTTTACCACTGCTACTTCTGGATATCTTGAC
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GTGGTCGGCTGAAAGTTTCTGCCAAGGTTCCTCCGGAGGTGTGGAAGGTG
TGTTGGGGTCGCGATGCTTCGTCTCCGTTGAGGCTTGGCATGCCAGGCAT
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TGACCGCATGTATCGTTTCATCATGGTTTCTCCTGGGTGTCCTTCGTGTG
CTATGTCAATGAGATTCAATCGGAGGTTGCGTTGTCCTGGTTGCATGGGC
GTGTCTGGAACATAGATTTGACTCCCTCTCATGATGACGCCATTTTCGAC
CGATAGTTCTTTGTAAATTCTGTTGTTGACTTCTGATCCAGATGGCGGCT
CTGATCTGCCTTTTGAGATGTCTTCTATGAGTTGTTGGTAGTGTGGATCA
CTTTGAGCAGCCTGTCTGATGGTGTCGATGTCAATCGCCGGTGTTGTGTT
GTTGAGGTTGATTTTCCGTACTAGAATGGTTGTTCCAATATCGAAGCCTA
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CTGCCATAGTCGCATGGCATTTCTTTCCCCTTCAGGTAGCGGAGATTGAA
TTGGAGATCTTGAACCCGGTCTCTGTGGTTGCTGATTTTGCGGGATGCTG
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GCTGTGAATTGACTTCCGACAACGTAGTAGCGAAACTGCTCCATTGCGAA
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CTCTCCTGGTAGATGCTTGCTTGGATTCCTACCTCTGATGAGTCCGACAC
CACATGAGTCTTTTCATTGGGATCGTACGCTTGTAGAGTCGCTGGATCGT
CCAGGATTTGCATCAGTGTCTGGTATGCAGTTTCCTCTTCTTCCTGCCAG
CGGAATTTCTCCCCCTTCTTCAACAATATGCGAAGCGGTGCGGTAGTGTC
TTCATATGTTGTGTGTAGTTTGTTGTTGAATGTGAACTTTGCATTGTACT
GGCAAGCCATCAACAAAGAGCGAACATCCTCTGTGTTTTCAGGTCTGCCA
CCGTCTTTGATGTTTTGAATCTTCTTTGGGTCCGCCGTCACGCCATTGGA
ATGGAACGTCCGACCAAACCATTTGATTCTTGTCTGTCCGAACGTCGATT
TGGACGGTTTGAGGATTGTGCCATTCTCTTTACAACGATCCAGGAATGCT
GCGAGGTTTCTGTAATGTTCCTTATAGTCTCTTCCGTAGACTAGGATGTT
GTCATGCAATGTAGTGACGCCTTGGAGGCCAGCAAATGCTTTCCGTATCT
CGTTGTGGAAGACGCCGCTTGAGGCTGTGGGTCCAAAATACAGCCTCTCC
ATTCTGTGAAGGCCCTCGTGTGTTTGAAAGATGCTCTTGTCTTTGGATTC
TTTGTCTAGCTGAAGTTGATGGTAACCCCAGCCCATGTCCATTTCACTGA
AAATCTTCGCTTCCTTCAGGTCGTGGCGGATCTCCTGTGGTGTTTGGACG
TGGAATCCAGTGCGCTTCATCCCGCATTGCGTGGTGTGTTGTCTATGTTC
ATCCTGATTTGACCATTGCTTTTATCTGTTATCACCACGTTCATCACGCA
GTCATAGCTTTCTCGTGGGTCCACATCTGTTATCACTCCCTGTGTTCTCA
GAAATTCAAGGAGTTTGCTGACTTCGCCTTGATAGTGGATTGGAACGTTG
CGAAATGGTGGTTGCTTTGGCTCGAATTCTTCTTCATAGTCGAGGTGGAT
GGGCTTCGTTCTGATGCATCCAATTTTGTTGTCGTCTAAGACTAGACCTC
GGTATCCGTCGACAAGTTTCAGTATCTTTTCGATCTCTGTTGGGTCTGCT
TCGTTGCTGTCAGGACGTGTTTCGACTTGTATCCCAAGGTTATCTCTGAT
GAGTTGGGGAATCCTCTTGATTGCACTTGTGTCTTGTGTTCGGGGGCTCT
TTCCTTCCTTGTTGAAGGTGATGAATCCTAGGTGTTCTGCGTCGTTGTCT
CTGAGTAGCGGTTCTGGTTGAAAACCGTCCACAACATATACTTTGCTATT
GATCTTGCTTCCTTTGGCGTTCTCGATCACAGTGTGAACCATTCCGGTGA
TGTTGAGATTGTTTGAAGATCCCCATGCCCTGAGTATGATGTCTGGCTCT
TCCAGGGGTCCCATGGCGTTGCTGTAGTGTTCAGGTGTGATGATGGTGGG
CTGGCTACCCGTGTCTGCGAAGAGGGTGTGTTTTGTGCCGCCTATCTTGA
CATCGACCCATTTGTCTGCTGGTTTAGTCACCTTCTTTATGGCAGTGAGT
GTAGTAGGTTCTTGGTTCGAGTCATTTCGCTTCAATGTTGTAAAGTAATC
TGCGTTGATTCTTTTGACCGTCTTCTTTCCAGGACAAATTGGAGTTCTGG
CAAAATGGTTCTTCCCACCACATGTGAAGCATTCTTTTCCATTTGCTGGG
CATCTCCCTGACTGATGGCTGGAGTTGCATCGGTTGCAAGATCCTTTGTG
TCTGTTGCTATACTTTCCTGCCTTTTTGAGCTTCATTACTTTCAGGGTTT
CAATCATCTCGTCTATCTCCTCTTGTGACATATTATCTTGATTCATTTCG
TGTCGAACACGTTTGATATGTGTTGTCTTGTCCAGGCTGTGGGCGTCGTC
TCGGCCTGCTTCTCGTGCTTGGCCCCATCTGGAAAGTTTCTCTAGGTTTG
GATCCTCCGCAAGCGCCTTCTCTCTCAGGCTGACATCATTCATGCCAAAT
ATGGCAGCATCCTTTATAGCTTCCTCTGTGGTGTAAGGTTTGTTGTCAAA
GTTCAGGGACTTGGCCTTCTTTTCGAGATCTAGAAGGAAGTCACCCCACG
TTCGTGTTCCTTGTTTGGTCCCCAGAAGCTGGTGCATGGCCATTGTTCGA
TTGACCATACGTCTCAGATAGTAACGTAGCCGTTCAATAGTCTGCATGTA
GGTGGGTGCAGCTTCTGCGTTTGCTTCTGCAACTTCCCCATTTGCTTGTG
CACCTTCTTCGTTTGCTCGGGCTCCTGTGTTGAGGTGTGATCTCTCTGCA
CGAATCAACTCAACCATCTCTGGTCCTCCCCAAGTTTTCAGGAGGATGAT
CTTTTCTTTGTCTACTGTTACACCAATGTAGTCCATCCTGTTTTCTGCAT
CATCAAGCCATTCGTTAAAGAGAATGAGCTTCTGCATTTTGTCAGTGCCT
AGGCCGCATTGTCGTATCGGCCCAAGTGCGGATGGATCATTCTTTGGTGG
TGTTGCAGCTGCCGCAGCAGGAGCTGCTTGCTGTAGCTGACCGCCAGTGA
TAGCTGCCATAAGTGTCTGGAATTGTTCAGGACTGAAATTCATCTTGAAC
TGCGTTGTTCGTATTAGACAGGAAAAGGAAAGGTCTTACCTACAACGACC
AGGGCACACCTGGTGTGATGAAAGTTTCAGTAAGACTATGACGtgtcttt
cttcttttccttgatCACGTGACTTGTGAGGTCGTCTCCTGTGCTATGTT
GGCAGCGTCTTGATTCAGTGATTGATCAGTCAAATAGAGTATGGTAATAA
AGTAAGGAATAGTCTTACCTCGAAGGTCCAGGGCAAACCTGGTATGACTG
AGCTTTTGGTAAGACGTCCAAGTCTTTATTCTGGATCAAGTCTGTCAGTG
TGTTGTGTTTGTGTCCAGTTTCAGCTAGTGGTCTTGTGTGTATCACTATA
TGTATCTTGTTTCAATAGTCTCTTCGTTGCCAGTGTAAAAGCGACACAAG
CCAGTATCATATCATATATATTAAGTCTCTTTATTATAGGTCTAGTCTAA
AAATATAGAACAAGATCGTTACAGCGTCACCCGCCCACATCAtatttttc
gctgattttccggtgcggagaagcggaaaaaaatccaggaaaagcaattt
gttcttttaaagtatagctttttcttAATCGCTCTgacggccatcgaaaa
attgttttgttcgcATCACCACCCGTCCTCAAATTACTGgcgtaattaaa
aaaaacccgggaatttTTCTGACCGCctgtccgcccgcatgcatttttaa
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gggttgcgaagcgatccagactccacctcaattcgcaagttgctagcaaa
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AGCCTTATAATACCCCAAACACACAGCACAATCCACGGCGTCACAACACC
CCtgcacaagtgtttcaaccggtattccaacgaagtcatattttggtttg
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aaaaaattcccttcttgcggcaaacataaaaaaagactttaagaggccat
ttatttaagaaaggggtgttatatcataaataaattatgtaagtaagtga
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AGGTCAAggaatgatgaagatcctttctgtcatctttcaaactaattgtt
ttccatttaacagcaaaataaacatttaaaaccgaagaaccactgttTAG
ATGCGTGCCCGCACGGCATTTTGagcaacttcagattctaagttcgtctt
tcggcttccggtaattttttgctgttcattgctagggtacaccattttaa
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CGTTccagtactttgattgttattgattactttcgataacttcGACAACC
AATTGATTACTTCAATAATCAGTTTGGTAAGCCAAACTTgagataaaaaa
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ATGcaatgtatgaagtgatatgattagacaagtggaaacggtgataaaaa
actTATTGTATAATTTACAAGTTgttagcaaaataagagacactcttaAA
AAATCCCTAAAGTGACAGGGTCCCAAGCAAGCCTTAATCCCCAAAACAAT
CGGTGGCACAACACTGCTGCCTCTCACAGTGCTCTTCTTTTTCCTTCTAG
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ggacataacagtacttgcgaaatttgtaaacaaactgtatgcagcggata
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gctaattttgattggtcaattgttttacaagtttgttttggacacgtgat
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tactacttttatgtccctttaaaaactttagacaatttttatttgaattg
atTGTCATGTTCTCCCAAACAACTGATGTACAAGGGTTGCACAGCGATCG
AGACTCCACCCTGTTTCGCAATTTGCAAGCAAAATAAAGGTGTGAGACGG
GGATTGATATTTGCATAAAAAACACCCCCAAAACCTCAGAGACACAGCAC
AAGAAAGGAGATTAATTTGGAAGTGTTTACTGTGGAAAGGTTgtgtgaat
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GCCACTCtctcaataattataagaataaattaacttacagggctgcaaat
aagcgtcggtcatcggtcaatgtccgactgaaaaagctatttgaccgact
gaaaatcttttgtgtcggtcatgatgtccgaatgaaaaaaggaataaacc
attaacttgagagttgaaaataaatctcttacacccctgtctcttactta
gcctattcttttaatactcgcttcctttgtagctttcagggtgtttctaa
gatcacttttatcaattcgctttcttcgtaactttcattcaagggtgttt
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tttaagaccattttcatcaacttgcttacttcataactttcaagagtgtt
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tctaagttaacttttatcaactcgctttcttcttaactattaagagtgtt
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ccctgatAGTATAGTagactttgagtgcttcattgaagatgaagaagtag
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AGACAGTCAAAGAGGCCCCCaagtcacctttcaaatcacgcaatcacgca
aaagaaatttccaaatcacgtcataacgagttaaatttcctttctattAC
AATCACTTTGGTTTCTCCAATCATGCAATCACGcacttttaaaatcttaa
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tacTGTGCTATATTGTCTAggtaaaaagatgtaaaaaaaagacgcaaata
tttttttatgaatgctGATATATGGCAATAATCAGTCAAAACCTACATCA
TACCTACATGACATATTATACAACCTGACTGCTGAAACAAGAATTAAATT
GTATTTAATTCTTTCTTCTAGGCTTAATTTATTCAAATGGAAGCAGCAAC
ACAGATGTTAAAGCGAGCTGTTGAGCTTGACACATCTAAAAAATATTCAG
AATCAAAAATTTGTTATGAAGAAGGTATAGAAATGTTGTTAAAAACCTTA
ACAAAAATGACCGATGAAAATGCTAAAAAGGTCATACGACAGAAGATTGA
TGGGTACATGAAAAGAgctgaagaactgaaaaaatttgtcaagaagttaa
agaaagatgggaaatttcatgagaaaattgaaattgaaaataatcaaaga
gGCTGTAGTTATGGAAGCCTTTTTTCTAAATTCATTGATGATAATTTGAC
TGTTGTTGAGATTAAAGATGCTTACATTAGAAGTCATCATCAGATATTGA
ATTTATTGAGATTTTGCGAGCTGTTGTTACGAAAAGCCAAGAACTTGAAT
GCCATCAACATTACAACAGGTAGGGTAATAAAAATTCTCATTGTTTACTT
ATGGGTCAGAATCTGACAGCTGttgttttcttgacaaaatgCAAAGTGAA
AACTAAAAGTGCATAGGAAAGGCCtttttttGTTCAGCAGACAAAGTACA
ACATTTTCTTGCAATTTCTCTTCTAGGCAGTGATGAGAATCAACCAGAGG
AACaagctcaaaaattaaaaaatttaacaacAAGTTTAGATTCATACAGG
GTGACATTATCTATAAAATATGAAGACACTCTACATGATCGTGAAATATT
ATTTGATAATGGTTGGATTATCAAGATAGGTAGAGGATTGGATTATTTTA
AAAGGCCAAACGGTCCTTTCTCAATAGGATTTTGTGATATGGATTTAAGA
CAATGTCATAAAACAACCATTGACATATATGATGCACGATaacattattt
tcttatattttttgtattcaaagtcactctatttattttttaactatttt
ttcaacttatctaatgctatgctattttaagaatttgtttgtttcattat
ttatttttcaacttacttgtatttcaaaaacattatactatatttttttc
tttttataatatttgTTTCATTCTTTCATATTTACAGTGAAAATAAATTA
ACACCATGCAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:579983..592793+ >MSTRG.13756.1.p1 ID=MSTRG.13756.1.p1|Name=MSTRG.13756.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1398bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:579983..592793+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGCAGCAACACAGATGTTAAAGCGAGCTGTTGAGCTTGACACATC
TAAAAAATATTCAGAATCAAAAATTTGTTATGAAGAAGGTATAGAAATGT
TGTTAAAAACCTTAACAAAAATGACCGATGAAAATGCTAAAAAGGTCATA
CGACAGAAGATTGATGGGTACATGAAAAGAgctgaagaactgaaaaaatt
tgtcaagaagttaaagaaagatgggaaatttcatgagaaaattgaaattg
aaaataatcaaagagGCTGTAGTTATGGAAGCCTTTTTTCTAAATTCATT
GATGATAATTTGACTGTTGTTGAGATTAAAGATGCTTACATTAGAAGTCA
TCATCAGATATTGAATTTATTGAGATTTTGCGAGCTGTTGTTACGAAAAG
CCAAGAACTTGAATGCCATCAACATTACAACAGGCAGTGATGAGAATCAA
CCAGAGGAACaagctcaaaaattaaaaaatttaacaacAAGTTTAGATTC
ATACAGGGTGACATTATCTATAAAATATGAAGACACTCTACATGATCGTG
AAATATTATTTGATAATGGTTGGATTATCAAGATAGGTAGAGGATTGGAT
TATTTTAAAAGGCCAAACGGTCCTTTCTCAATAGGATTTTGTGATATGGA
TTTAAGACAATGTCATAAAACAACCATTGACATATATGATGCACGATaaA
TGGAAGCAGCAACACAGATGTTAAAGCGAGCTGTTGAGCTTGACACATCT
AAAAAATATTCAGAATCAAAAATTTGTTATGAAGAAGGTATAGAAATGTT
GTTAAAAACCTTAACAAAAATGACCGATGAAAATGCTAAAAAGGTCATAC
GACAGAAGATTGATGGGTACATGAAAAGAgctgaagaactgaaaaaattt
gtcaagaagttaaagaaagatgggaaatttcatgagaaaattgaaattga
aaataatcaaagagGCTGTAGTTATGGAAGCCTTTTTTCTAAATTCATTG
ATGATAATTTGACTGTTGTTGAGATTAAAGATGCTTACATTAGAAGTCAT
CATCAGATATTGAATTTATTGAGATTTTGCGAGCTGTTGTTACGAAAAGC
CAAGAACTTGAATGCCATCAACATTACAACAGGCAGTGATGAGAATCAAC
CAGAGGAACaagctcaaaaattaaaaaatttaacaacAAGTTTAGATTCA
TACAGGGTGACATTATCTATAAAATATGAAGACACTCTACATGATCGTGA
AATATTATTTGATAATGGTTGGATTATCAAGATAGGTAGAGGATTGGATT
ATTTTAAAAGGCCAAACGGTCCTTTCTCAATAGGATTTTGTGATATGGAT
TTAAGACAATGTCATAAAACAACCATTGACATATATGATGCACGATaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000111_pilon | genome | sc0000111_pilon:579983..592793 + |
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