MSTRG.13754.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13754.4.p1
Unique NameMSTRG.13754.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000111_pilon:460485..490536-

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13754.4.p1 ID=MSTRG.13754.4.p1|Name=MSTRG.13754.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=30052bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:460485..490536- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGGCGAACGTGATGGAGTATCTAAGATTGTCTTCTTGATCACCGATGGT AATCAAAACCCCAAACAAAGCCCTGATGGAAAAGTCCAATACGACCCTGT CGTTGCATCACAACCAATGGTTGATAGAGGTATGATGATTTCATGATTCA TGTTTCGTGGAAGCTGTTGATATGTCTCCAAAAATACGGAAGAAAACTGT TAACATTGCTGGTCCCAGGGACCATATATGTGAAGAATTATGTGAACTAC TGCTGTTTCCAGGGGAGGGGAAAGTTTATTAAAAAAACGACCATGTGTGC AGAACAGAATCAGGCCTTTGAAATCGGATCCTTACAGTTCAGAGAAATTT TAGCCAAATTTGGGCAAAAAATCGACCCTGTCGGTGTAATTTCTTGAACA TTTTGACCATTTTAAGGCAAAATATGGTCAGAGTTTACACCCTTAGAGTG AACATTTTCTCATCTTTGTTCATTTCAACCCTTACGGTGCACTTTGTGAA CTTGGAAAAAGGAACCTTAAGGCCCCCCCAAGGTTATTGTCCTAGTTCTA TGTAACCATCTTTCTTTTTCGCCATCTTTAAAAACTAGATACTCTTGGTA TCCATGACGTAATCTTTTAAACGGAAACACCCGAAAAACACTGGGCATTA AGATTAAACTGGTGGCAAACGCCCGGCAATTTCAAGTGTTTCCGTATAAA AGATAACGTCGTGAATATCAAGAATTACCATAAGTAAGATTTTATGTATT ATTGTTCTTATATCTACCAATAGGAATCGACATTTTTGCCATCGCTGTTG GAGACAAAGCATCCGAAGCCGATTTATCAGCCATCACACGTGATCCAGAA CGTGTCTTCACTTCAAAGGATGCCGCCTCTTTGAAAAGCGATGTCTTCAT GAAACAAGTCACCAGAAACACGTGCAAGAAAGTCACTACAACTACAACAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:460485..490536-

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GACGTGTTATCCAACCTCAAAGCTTTGAAACCTGATGTTAACATGCAAGA
GAAAATTGGTGAAAATAACGAAGAAGTTATCAAGAGAATGGAGTTCCAAA
ATGCAGTCAATGTTGTCCAAAACAAAATGTCTACATCAATATCTTCAAGT
CTGGCGATCCCCAACAACTACAACCACAACAACGACCACCCCTACTACAA
CTACCACTACGACCACCCCTACAACTACAACGACCACAGAGCCACCAACA
ACGACCACTGAATGTCTGACAACCAAAGCACCATGTGGAGCTACTACAAC
AACTACCACCACAACAACAACGACTAGAATTGACATTTTCGCCATCGCTG
TTGGAGACAAAGCATCCGAAGCCGATTTATCCGCCATCACACGTGATCCA
GAACGTGTCTTTACTTCAAAGGATGCCGCCTCTTTGAAAAGTGATGTCTT
CATGAAACAAGTCACACGAAACACTTGCAAGAAAGTCACTACAACTACGA
CGAGGCGAACGTGATGGAGTATCTAAGATTGTCTTCTTGATCACCGATGG
TAATCAAAACCCCAAACAAAGCCCTGATGGAAAAGTCCAATACGACCCTG
TCGTTGCATCACAACCAATGGTTGATAGAGGTTTCACACAAGATCAACGA
TGCCCATGTAAAAGTAGCCTTAAGTTATGGGCCTAACCTCACTATCACTG
TAATCGATGACCTCATCAAGCACTCTGCTATCAAACTCATGCAAACATTG
AAGAGCAACGAAGATTTGTCTGTCATGTACTCGCTTTTTAAGAAGAGTCC
AATCAGAGGTTTGTTACAAAATCGCAAAATGGTTGTTGATAAAGTTTGCT
TCGTCAAAGGATTATGCGTTAAAGTCACTGGTGATGTTCAACAACATTTC
AAGGAGCTTCTCAAGGCTAAGCAATTCACTATACAAGTCTTACATGATGA
CGTGTTCCACCAAATGGGCTTTGAAAAAGTCAACGAGCTCGAAGTTAACA
AGAAGTTGAGAGATGAATTTTTGTTACAACATATTTTCCTTGGCATCTTA
CAACACAACGATCAAGACAACAACTCAAGATTAATCGCTGCTTCGGCACA
ACAACAACAACCCGTTTCGGAATGGTTATGGAGTGATGGCAAACCGATTG
TTTCCCGACCGGACGAATCGGTTTATGCTATAGATCGTCAGATGAGAGTT
AAAGAAGGATTGGTTCAAGTTTTGAGAAATGTAGAGTGAAGCCACTTGCT
TCTGGGATCACAGATGTTATCAACATTGCTAAATCAGCTGGTTGCAACCT
CTTCTTGAAATACCTCGACAATCTGAATCTCTTGAAATCCATCATCAAAA
AATCAACTCGAAACACTATCAACATTTTCTGTCCACAAGACAACACATTT
AAAACGTACCTTCAATCCACCAGGAACTCTGGTCCTAGGAGTTTACAGAA
CATGATACTGGGACATGTCACCAAAAAAACCGGACGAATGACTTTTAAGC
CATTCACCTATGGAAATAAACAAAAGAATTTTGTCTTACAACCTTTCATC
CAACCCAACGGACAGAAATTATTGCCAGGCAACGCAGAAGTCATCGATGC
ATTGCGAACAGCTTTCGACCAATCAAAGAGAGTCAGACGATCGGTTAATG
TGAAAGAAGGGACCATACTACTTATTGCAAGGAGCACCTTTGGGAAAAAA
CAATGGTAATGACGTGTTATCCAACCTCAAAGCTTTGAAACCTGATGTTA
ACATGCAAGAGAAAATTGGTGAAAATAACGAAGAAGTTATCAAGAGAATG
GAGTTCCAAAATGCAGTCAATGTTGTCCAAAACAAAATGTCTACATCAAT
ATCTTCAAGTCTGGCGATCCCCAACAACTACAACCACAACAACGACCACC
CCTACTACAACTACCACTACGACCACCCCTACAACTACAACGACCACAGA
GCCACCAACAACGACCACTGAATGTCTGACAACCAAAGCACCATGTGGAG
CTACTACAACAACTACCACCACAACAACAACGACTAGAATTGACATTTTC
GCCATCGCTGTTGGAGACAAAGCATCCGAAGCCGATTTATCCGCCATCAC
ACGTGATCCAGAACGTGTCTTTACTTCAAAGGATGCCGCCTCTTTGAAAA
GTGATGTCTTCATGAAACAAGTCACACGAAACACTTGCAAGAAAGTCACT
ACAACTACGACGAGGCGAACGTGATGGAGTATCTAAGATTGTCTTCTTGA
TCACCGATGGTAATCAAAACCCCAAACAAAGCCCTGATGGAAAAGTCCAA
TACGACCCTGTCGTTGCATCACAACCAATGGTTGATAGAGGTTTCACACA
AGATCAACGATGCCCATGTAAAAGTAGCCTTAAGTTATGGGCCTAACCTC
ACTATCACTGTAATCGATGACCTCATCAAGCACTCTGCTATCAAACTCAT
GCAAACATTGAAGAGCAACGAAGATTTGTCTGTCATGTACTCGCTTTTTA
AGAAGAGTCCAATCAGAGGTTTGTTACAAAATCGCAAAATGGTTGTTGAT
AAAGTTTGCTTCGTCAAAGGATTATGCGTTAAAGTCACTGGTGATGTTCA
ACAACATTTCAAGGAGCTTCTCAAGGCTAAGCAATTCACTATACAAGTCT
TACATGATGACGTGTTCCACCAAATGGGCTTTGAAAAAGTCAACGAGCTC
GAAGTTAACAAGAAGTTGAGAGATGAATTTTTGTTACAACATATTTTCCT
TGGCATCTTACAACACAACGATCAAGACAACAACTCAAGATTAATCGCTG
CTTCGGCACAACAACAACAACCCGTTTCGGAATGGTTATGGAGTGATGGC
AAACCGATTGTTTCCCGACCGGACGAATCGGTTTATGCTATAGATCGTCA
GATGAGAGTTAAAGAAGGATTGGTTCAAGTTTTGAGAAATGTAGAGTGAA
GCCACTTGCTTCTGGGATCACAGATGTTATCAACATTGCTAAATCAGCTG
GTTGCAACCTCTTCTTGAAATACCTCGACAATCTGAATCTCTTGAAATCC
ATCATCAAAAAATCAACTCGAAACACTATCAACATTTTCTGTCCACAAGA
CAACACATTTAAAACGTACCTTCAATCCACCAGGAACTCTGGTCCTAGGA
GTTTACAGAACATGATACTGGGACATGTCACCAAAAAAACCGGACGAATG
ACTTTTAAGCCATTCACCTATGGAAATAAACAAAAGAATTTTGTCTTACA
ACCTTTCATCCAACCCAACGGACAGAAATTATTGCCAGGCAACGCAGAAG
TCATCGATGCATTGCGAACAGCTTTCGACCAATCAAAGAGAGTCAGACGA
TCGGTTAATGTGAAAGAAGGGACCATACTACTTATTGCAAGGAGCACCTT
TGGGAAAAAACAATGGTAATGACGTGTTATCCAACCTCAAAGCTTTGAAA
CCTGATGTTAACATGCAAGAGAAAATTGGTGAAAATAACGAAGAAGTTAT
CAAGAGAATGGAGTTCCAAAATGCAGTCAATGTTGTCCAAAACAAAATGT
CTACATCAATATCTTCAAGTCTGGCGATCCCCAACAACTACAACCACAAC
AACGACCACCCCTACTACAACTACCACTACGACCACCCCTACAACTACAA
CGACCACAGAGCCACCAACAACGACCACTGAATGTCTGACAACCAAAGCA
CCATGTGGAGCTACTACAACAACTACCACCACAACAACAACGACTAGAAT
TGACATTTTCGCCATCGCTGTTGGAGACAAAGCATCCGAAGCCGATTTAT
CCGCCATCACACGTGATCCAGAACGTGTCTTTACTTCAAAGGATGCCGCC
TCTTTGAAAAGTGATGTCTTCATGAAACAAGTCACACGAAACACTTGCAA
GAAAGTCACTACAACTACGACGAGGCGAACGTGATGGAGTATCTAAGATT
GTCTTCTTGATCACCGATGGTAATCAAAACCCCAAACAAAGCCCTGATGG
AAAAGTCCAATACGACCCTGTCGTTGCATCACAACCAATGGTTGATAGAG
GTTTCACACAAGATCAACGATGCCCATGTAAAAGTAGCCTTAAGTTATGG
GCCTAACCTCACTATCACTGTAATCGATGACCTCATCAAGCACTCTGCTA
TCAAACTCATGCAAACATTGAAGAGCAACGAAGATTTGTCTGTCATGTAC
TCGCTTTTTAAGAAGAGTCCAATCAGAGGTTTGTTACAAAATCGCAAAAT
GGTTGTTGATAAAGTTTGCTTCGTCAAAGGATTATGCGTTAAAGTCACTG
GTGATGTTCAACAACATTTCAAGGAGCTTCTCAAGGCTAAGCAATTCACT
ATACAAGTCTTACATGATGACGTGTTCCACCAAATGGGCTTTGAAAAAGT
CAACGAGCTCGAAGTTAACAAGAAGTTGAGAGATGAATTTTTGTTACAAC
ATATTTTCCTTGGCATCTTACAACACAACGATCAAGACAACAACTCAAGA
TTAATCGCTGCTTCGGCACAACAACAACAACCCGTTTCGGAATGGTTATG
GAGTGATGGCAAACCGATTGTTTCCCGACCGGACGAATCGGTTTATGCTA
TAGATCGTCAGATGAGAGTTAAAGAAGGATTGGTTCAAGTTTTGAGAAAT
GTAGAGTGAAGCCACTTGCTTCTGGGATCACAGATGTTATCAACATTGCT
AAATCAGCTGGTTGCAACCTCTTCTTGAAATACCTCGACAATCTGAATCT
CTTGAAATCCATCATCAAAAAATCAACTCGAAACACTATCAACATTTTCT
GTCCACAAGACAACACATTTAAAACGTACCTTCAATCCACCAGGAACTCT
GGTCCTAGGAGTTTACAGAACATGATACTGGGACATGTCACCAAAAAAAC
CGGACGAATGACTTTTAAGCCATTCACCTATGGAAATAAACAAAAGAATT
TTGTCTTACAACCTTTCATCCAACCCAACGGACAGAAATTATTGCCAGGC
AACGCAGAAGTCATCGATGCATTGCGAACAGCTTTCGACCAATCAAAGAG
AGTCAGACGATCGGTTAATGTGAAAGAAGGGACCATACTACTTATTGCAA
GGAGCACCTTTGGGAAAAAACAATGGTAATGACGTGTTATCCAACCTCAA
AGCTTTGAAACCTGATGTTAACATGCAAGAGAAAATTGGTGAAAATAACG
AAGAAGTTATCAAGAGAATGGAGTTCCAAAATGCAGTCAATGTTGTCCAA
AACAAAATGTCTACATCAATATCTTCAAGTCTGGCGATCCCCAACAACTA
CAACCACAACAACGACCACCCCTACTACAACTACCACTACGACCACCCCT
ACAACTACAACGACCACAGAGCCACCAACAACGACCACTGAATGTCTGAC
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CGACTAGAATTGACATTTTCGCCATCGCTGTTGGAGACAAAGCATCCGAA
GCCGATTTATCCGCCATCACACGTGATCCAGAACGTGTCTTTACTTCAAA
GGATGCCGCCTCTTTGAAAAGTGATGTCTTCATGAAACAAGTCACACGAA
ACACTTGCAAGAAAGTCACTACAACTACGACGAGGCGAACGTGATGGAGT
ATCTAAGATTGTCTTCTTGATCACCGATGGTAATCAAAACCCCAAACAAA
GCCCTGATGGAAAAGTCCAATACGACCCTGTCGTTGCATCACAACCAATG
GTTGATAGAGGTTTCACACAAGATCAACGATGCCCATGTAAAAGTAGCCT
TAAGTTATGGGCCTAACCTCACTATCACTGTAATCGATGACCTCATCAAG
CACTCTGCTATCAAACTCATGCAAACATTGAAGAGCAACGAAGATTTGTC
TGTCATGTACTCGCTTTTTAAGAAGAGTCCAATCAGAGGTTTGTTACAAA
ATCGCAAAATGGTTGTTGATAAAGTTTGCTTCGTCAAAGGATTATGCGTT
AAAGTCACTGGTGATGTTCAACAACATTTCAAGGAGCTTCTCAAGGCTAA
GCAATTCACTATACAAGTCTTACATGATGACGTGTTCCACCAAATGGGCT
TTGAAAAAGTCAACGAGCTCGAAGTTAACAAGAAGTTGAGAGATGAATTT
TTGTTACAACATATTTTCCTTGGCATCTTACAACACAACGATCAAGACAA
CAACTCAAGATTAATCGCTGCTTCGGCACAACAACAACAACCCGTTTCGG
AATGGTTATGGAGTGATGGCAAACCGATTGTTTCCCGACCGGACGAATCG
GTTTATGCTATAGATCGTCAGATGAGAGTTAAAGAAGGATTGGTTCAAGT
TTTGAGAAATGTAGAGTGAAGCCACTTGCTTCTGGGATCACAGATGTTAT
CAACATTGCTAAATCAGCTGGTTGCAACCTCTTCTTGAAATACCTCGACA
ATCTGAATCTCTTGAAATCCATCATCAAAAAATCAACTCGAAACACTATC
AACATTTTCTGTCCACAAGACAACACATTTAAAACGTACCTTCAATCCAC
CAGGAACTCTGGTCCTAGGAGTTTACAGAACATGATACTGGGACATGTCA
CCAAAAAAACCGGACGAATGACTTTTAAGCCATTCACCTATGGAAATAAA
CAAAAGAATTTTGTCTTACAACCTTTCATCCAACCCAACGGACAGAAATT
ATTGCCAGGCAACGCAGAAGTCATCGATGCATTGCGAACAGCTTTCGACC
AATCAAAGAGAGTCAGACGATCGGTTAATGTGAAAGAAGGGACCATACTA
CTTATTGCAAGGAGCACCTTTGGGAAAAAACAATGGTAATGACGTGTTAT
CCAACCTCAAAGCTTTGAAACCTGATGTTAACATGCAAGAGAAAATTGGT
GAAAATAACGAAGAAGTTATCAAGAGAATGGAGTTCCAAAATGCAGTCAA
TGTTGTCCAAAACAAAATGTCTACATCAATATCTTCAAGTCTGGCGATCC
CCAACAACTACAACCACAACAACGACCACCCCTACTACAACTACCACTAC
GACCACCCCTACAACTACAACGACCACAGAGCCACCAACAACGACCACTG
AATGTCTGACAACCAAAGCACCATGTGGAGCTACTACAACAACTACCACC
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AAAGTAGCCTTAAGTTATGGGCCTAACCTCACTATCACTGTAATCGATGA
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AAGATTTGTCTGTCATGTACTCGCTTTTTAAGAAGAGTCCAATCAGAGGT
TTGTTACAAAATCGCAAAATGGTTGTTGATAAAGTTTGCTTCGTCAAAGG
ATTATGCGTTAAAGTCACTGGTGATGTTCAACAACATTTCAAGGAGCTTC
TCAAGGCTAAGCAATTCACTATACAAGTCTTACATGATGACGTGTTCCAC
CAAATGGGCTTTGAAAAAGTCAACGAGCTCGAAGTTAACAAGAAGTTGAG
AGATGAATTTTTGTTACAACATATTTTCCTTGGCATCTTACAACACAACG
ATCAAGACAACAACTCAAGATTAATCGCTGCTTCGGCACAACAACAACAA
CCCGTTTCGGAATGGTTATGGAGTGATGGCAAACCGATTGTTTCCCGACC
GGACGAATCGGTTTATGCTATAGATCGTCAGATGAGAGTTAAAGAAGGAT
TGGTTCAAGTTTTGAGAAATGTAGAGTGAAGCCACTTGCTTCTGGGATCA
CAGATGTTATCAACATTGCTAAATCAGCTGGTTGCAACCTCTTCTTGAAA
TACCTCGACAATCTGAATCTCTTGAAATCCATCATCAAAAAATCAACTCG
AAACACTATCAACATTTTCTGTCCACAAGACAACACATTTAAAACGTACC
TTCAATCCACCAGGAACTCTGGTCCTAGGAGTTTACAGAACATGATACTG
GGACATGTCACCAAAAAAACCGGACGAATGACTTTTAAGCCATTCACCTA
TGGAAATAAACAAAAGAATTTTGTCTTACAACCTTTCATCCAACCCAACG
GACAGAAATTATTGCCAGGCAACGCAGAAGTCATCGATGCATTGCGAACA
GCTTTCGACCAATCAAAGAGAGTCAGACGATCGGTTAATGTGAAAGAAGG
GACCATACTACTTATTGCAAGGAGCACCTTTGGGAAAAAACAATGGTAAT
GACGTGTTATCCAACCTCAAAGCTTTGAAACCTGATGTTAACATGCAAGA
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AAAGAAGGATTGGTTCAAGTTTTGAGAAATGTAGAGTGAAGCCACTTGCT
TCTGGGATCACAGATGTTATCAACATTGCTAAATCAGCTGGTTGCAACCT
CTTCTTGAAATACCTCGACAATCTGAATCTCTTGAAATCCATCATCAAAA
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CATTCACCTATGGAAATAAACAAAAGAATTTTGTCTTACAACCTTTCATC
CAACCCAACGGACAGAAATTATTGCCAGGCAACGCAGAAGTCATCGATGC
ATTGCGAACAGCTTTCGACCAATCAAAGAGAGTCAGACGATCGGTTAATG
TGAAAGAAGGGACCATACTACTTATTGCAAGGAGCACCTTTGGGAAAAAA
CAATGGTAATGACGTGTTATCCAACCTCAAAGCTTTGAAACCTGATGTTA
ACATGCAAGAGAAAATTGGTGAAAATAACGAAGAAGTTATCAAGAGAATG
GAGTTCCAAAATGCAGTCAATGTTGTCCAAAACAAAATGTCTACATCAAT
ATCTTCAAGTCTGGCGATCCCCAACAACTACAACCACAACAACGACCACC
CCTACTACAACTACCACTACGACCACCCCTACAACTACAACGACCACAGA
GCCACCAACAACGACCACTGAATGTCTGACAACCAAAGCACCATGTGGAG
CTACTACAACAACTACCACCACAACAACAACGACTAGAATTGACATTTTC
GCCATCGCTGTTGGAGACAAAGCATCCGAAGCCGATTTATCCGCCATCAC
ACGTGATCCAGAACGTGTCTTTACTTCAAAGGATGCCGCCTCTTTGAAAA
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ACAACTACGACGAGGCGAACGTGATGGAGTATCTAAGATTGTCTTCTTGA
TCACCGATGGTAATCAAAACCCCAAACAAAGCCCTGATGGAAAAGTCCAA
TACGACCCTGTCGTTGCATCACAACCAATGGTTGATAGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13754MSTRG.13754Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13754.4.p1MSTRG.13754.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13754.4.p1.exon9MSTRG.13754.4.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.13754.4.p1.exon1MSTRG.13754.4.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000111_pilongenomesc0000111_pilon:460485..490536 -