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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000111_pilon:433081..439998- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13752.2.p2 ID=MSTRG.13752.2.p2|Name=MSTRG.13752.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6918bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:433081..439998- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGGCGACGGGCGGTTGGAAATTAATTGTATTTGTTCGGTTCCGCAAATTA
CAAACAAAAATGGCTGCAAAGGACCCGTAAACTTGACCCGCAATTTCAGT
GATTCCTTTACAAACTTGTTCAAGAAATTTGGTTACTGGAATTATACCAT
GTAAGTTTATCGTCGAAATTCTGGATAATCTCATGATTTTGTATGCTGGA
TGAGTATCATATGCATTGTAGAATAGTTGAAGGTCCTTATGGATGAAAAA
TTTTGGCTTACTTAATGCTATTGGCATTGTTATGCAGCTTTGTTTACATC
ACATTGGAGTTGGCATATTTTCTGTAATGGAGACTGATAGTGTATAATTT
TGGTATATGAATGTTTGGTTTTGAAAGGAATGAATTTCAGCTTCGGTTTG
AGAAATTGCTCTTCTACTTCTCCAAGTAAATTGTTACTGAGCCTGTCAAA
GGCTGATTGAGTTGGTTGTTTGATCTTTAACAGCATTTTTTTTGTTGATT
GGGATTCTGTTCTCAGTGGTATTTTACTGTATTATTCTTGATGATCTATC
AACGAATTTAACAGATTGCTTGGGTTTTTTGTTTCATGTTCTCACTGTTA
AGTCAAAGATAAACAAGGCTAAAGGAGGGGGAAAAGCTCACTGTTGTAGT
CATTGGGTCATCCCAGAAAATTTTTGTTACCCCCCATTGGAAGACGTCCA
TTTAAAAATTTTTTTAGCCTCAAAAATAATTTTTCTTTTCCAGTGGTGGT
CCGAAATTCCGATGAAAATCCATGTATTTTTGCAAAATACATCGGAAATT
CGCTTTTAAAACATCAATTGATGTTTTTCTAACCTAAAATCAATTTGTGA
GAGACCCCTAAGAAAGTGGATGATTTAAGTTCGACCAAACATACAATGTT
CATCACATTCAGCAAAAACTATGTTCAACAGAGTTCAATTACAAATTCTA
TAATAAATTAAATGTTGGACAAAGTTGGACAACAAAGATTAAAGCTGGAA
ATTACGAAATAGAAAATTAGAAAGAAATTTGTGAATATCATTCAGTTTGT
TTTTTTCGTGTTAAATTATAAATATGAAATGTACATCCAAAATAATTAAA
ATAATCATGTGACAAAACAAAGCCAGGTTAAGGGGTTTTAGGTTTAAGAC
CTGTGTACATGTCCAGACAGTGTCAATCGAACAAAAATCGCAATCGAACC
AATCGAACGTAATCGAACGCGATCGAATAATTGCAATTCGATGGTCGAAC
GTAATCGAATCTCAATCGAACGGCCGAATCCTGGGTAATATTCGATTGTG
TTCGATTGCGTTTGAATAAGGTAGATTGGTTCGATTAATAGTTGAACTAT
TTTCGATTGTCATTTGCATTTGATTTCGATTGATTAGACTAGAGGATTCT
GTTTGATGAGTTTGATTGAATTAAATTGGATCACTCTGTTAGGGCTTTTT
AGGGTTTAGCGGGTGACCGAGTGCTAAAAGTACCGTAGCAAAGCGAATGA
AATCTAATATAATTGAATCAATCGAACGTAATCGAATACAATCGAACGTA
ATCGAAGCAATCGAAAAGCAAATCCTGGGTTATATTCGATTGCAATTCGA
TTGCGTTCAATTGATTCGACGTTCGATTCGTTGGATTGACACCGTCTGGA
CATGTGTAACATTTAGCCACAGATTTTAAAAACATCAAACATAAAACCCT
ATCCCATTAGGGAGGGGTCACCCACATATCAATGTTTCCTGCAACTAACG
TCATTGTGAGTGATGCGAGGGGACGGGGGGTCAGAGCCCATGACGCTAAG
AAATTTCAACAGAATATCGATTTGCAAACCTGTAACATTTTGTATTCCAT
CCTTCGCTACACCTGCCATCTTAATTCAAATGCATAAAATATAACAGATG
ATATCCAATACCCTTCCGTTACGTTTGTAGGAATATGTTATTATCTCCCT
AATCATAAAAACAGAGATACCGCAATAAAAAATAGATGGGCCGTATTTTG
ATATACAAGGGCCGCGCTGACAGACCATCTACATAGATATGACGAAACAA
CGAGCCCTTTGTCTGGGGACAAACAAATGTGAAAGTCACAAGTCAAAACC
ATTTGTTTTAAAACCGTGCGAAACAAAGCACAAAAATCAATGTGACTGGA
ATATCAATATCTGTAATAGAGAAGAAAAATTACTTTCATCGATTTTTGTT
ATATTTATGTAAATAATGCTAAGAAAGGGGGGTGGGGTTCTTCAGATAGC
GTCACAATGACGTTAATTGCAGGAAAAATCGATATGCGAGTGACCCCTTA
AATGTCAAATTGATGTTGTTGGTGTTTTTTGTGGTACAATGAGTATTGAT
GTCACTCCTTATCAGAATCTCTGGGAAAAGAACCAAATCAGTATAAGGTT
TCTTATTGTAACAAATGTGAATAAATTTTAGGAATAGTTTCAACTTTCCC
TTTCTGAATCGCACATGGTATTGCATCTCAATGCTCTACTGTGTTGAACC
GTGAAAGGAGATCAGTTGCACTCTCCCATTTTATTACACCTTTCTAATAG
GTGATATAAAAGTAAAGAGTTCAACAAAATTGTTTTTTTTTTCTTTCAAA
TTGAATGAAAATTAGTCTCAAGCTTTTTTATATTCAAGATTGTCAAGTTG
GTCGATTTTCTCTATGGGACGTCAGATATCTAGTAAAGCTAGTGCCTTGA
ATATGAGGGAATGTTGATTATTTTACAGACTTAATGCTTTGAACGGATTT
GAGGAAATTTACTAGATTTTAGATCCTTTAAGTTTAAGGCCTCCTTTGTT
CCATGAATTGCAGAATTGTTTTTGAATTTTTTCCGTGGCTTTTTTTAAGA
ACTGACAATGTAAAATGTAACTGCATTTTCTATATTTTTTTCAATCTTTC
TCTATTAGAAAAAGAGTGGAGGACCTCACAAGCTAACATTACCTTCACAA
TCAACGGTAACTTATTTTCTTTTGATATTCACTACGGGCTTGGTTGAACG
TTTAGTATTTATCAATATAACATGGCTCAAATGAGAATTCAACGTAAAGA
TTTTCTTCAAGAGTAACGAGAAGACAGCCTGTAATTTCAGATTGCATTTC
AGGATTTCTAGATGAATCTTTAGATGGATGTTGATACCATTTGATAGAAA
CATTTTTGACAACTTTGATTTGAATCTTTAAAATTCTCTCTATGATAGCT
ATGCTTGGATTATGTTTAAATTCGCATGCCAAATTATGTCAAAGTCTGTT
TAAGCTTGATGATTGATAGGTCTCCTTTCTGAATCGCACATGGTATTGCA
TCTCAATGCTCTACTGTGTTGAACCGTGAAAGGAGATCAGTTGCACTCTC
CCATTTTATTACACCTTCTTAATAGGTGATATAAAAGTAAAGAGTTTGAC
AAAAGATTTTTCCTCTCAAATGAAATTTAGATTGATTTTGAACTTAAAAT
CTGTAGTGCCCCTAATGTTGATCTCTGTCTTAATGACAGATGCGATAAAC
AGAGATTTAAATGAAATTAATGAGGCTCATATCTTCAGTTTACCTTAATT
TGTTAACCCGTCTGGAAAGCACCTTCTTTATGCAAGACTTGCAATTATAT
ACAAGGTCGTCAAATGAAGGAGATAAATTGCTTCATGGGTGTGGTCTGGC
TTACTATAGTAGCTATGAACAGCAATTATGGAGTAAACACTTATGACTTA
AGCTTTGCTGTCTTCCAAATTTTCTTTATTCAGCTTCCCTAAAAGCAGTG
CTGCAGATAAGGAATAGACCTTTTCAAAAATTACATCACAAACCTGCACG
AACATCACTTGCCTCGTATTCAAACAATTACCATGGTAATTATGTCCCTG
GGATAAACAGATTTAAATGAAATTAACGAGGCTCATATTTTCAGTCTACC
TCAGTTTTGTTAACCCTTCTGTAAAGCACCTTCTTTATGCAAGACTTGCA
ATTATATACAAGGTCGTCAAATGAAGGAGATAAATTGCTTCATGGGTGTG
GTCTGGCTTACTATAGTAGCTATGAACAGCAATTATGGAGTAAACACTTA
TGACTTAAGCTTTGCTGTCTTCCAAGTTTTCTTTATTCAGCTTCCCTAAA
AGCAGTGCTGCAGATAAGGAATAGACCTTTTCAAAAATTACGTCACAAAC
CTGCACGAACATCACTTGCCTCGTATTCAAACAATTACCATGGTAATTAT
GTCCCTGGGATAAATAGATTTAAATGAAATTAAAGAGGCTCATATTTTCA
GTTTACCTCAGTTTTGTTAACCCTTCTGTAAAGCACCTTCTTTATGCAAG
ACTTGCAATTATATACAAGGTCGTCAAATGAAGGAGATAAATTGCTTCAT
GGGTGTGGTCTGGCTTACTGTAGTAGCTATGAACAGCAATTATGGAGTAA
ACACTTATGACTTTGATGTCTTTTCTTTATTCAGCATCCGTAAAAGCAGA
TAAGGAATTGAGATAAGTGTAGTGAGAAAAAGCTCCTTATGATGATAGGA
AGATATAACAAATAATAAATAAAACAGAGCATGGACAAAAATTGATTCGT
TACATTTTTCGACAAGGAATCTCAAGCTTCAATGACAAAAGTAAAATTAG
ACCTTTAAAAATGATGGGTTGATTTGCAGCACAGCCTAAAATAGATAGAG
TTTTCAAAAGAAAAAACTAATTAAAATAGTCCATAGCCACATTCTTTTTC
ACCACTGTTCAGGTACTTTGCGTTTTCAAATTGAGAATCCGATTTATATT
TTGAAAGAGTAACGACGTGTTAAGCTGTAACGAAACTTAAAATCTAAACT
TGTTGATGTATTATAGGTTTTCTCTATTAATACATCAAACCCAGGTATAT
TTATTTTCCGATTTACTTCATTGCAGAGTCAACATGGTCGTTCCAACACA
AAAGAGGAAGCTCATCAAAAAGCGAACCAAAAGATTTATTCGTCATCAAT
CTGACCGATATGTTAAGGTCGCAGAAAGCTGGAGAAAACCAAAGGGTATT
GATAACAGAGTCAGACGACGATTCAAGGGGCAATATTTGATGCCAAACAT
CGGTTATGGAACTAACGCTAAAACCAGACATTGTATGCCTGATGGCTTCA
AGAAATTTGTCGTTCACAACCAAAAAGTAAGTTATTTATTGTAATTGTTT
CTGATTTGGCCAGCTGATTTTCTTTTCTCAACTTCAGTTGAGTTATAATC
TGAGAATGTCTGTATGTATGTATGTCCGTCCGAAAACTTTAGGGCAGGCT
GGACACTTCAAAAAAGGTCGGATTTGGCTGAAATTTGGCACACTTGTTCC
TTGGGTGAATATCTGGGGGTGTTTTTTTCATTTTTTGAAAATTTTGATTT
TTGGGGCCCGGGGACGAGTTTTTTGCCAAAACGAGGCTAAAACTTTGGGG
CAGCCTGGACACTTCAAAAAAGGTCGGATTTGGCTGAAATTTGGCACACT
TGTTCCTTGGGTGAATTTCTGGGGGTGTTTTTTTCATTTTTTGAAAATTT
TGATTTTTGGGGCCTGGGGACGAGTTTTTCACCAAAACGAGGCTGGCAGC
CTGGACACTTCAAAAAAGGTCGGATTTGGCTGAAATTTGGCACACTTGTT
CCTTGGGTGAATATCTGGGGGTGTTTTTTTCATTTTTTAAAAATTTTGAT
TTTTGGGGCCTGGGGATGAGTTTTTCACCAAAACGAGGCTGGCAGCTTGG
AGACTTTAAAAACGGTCCGATTTGGCTGAAACGAAACCACTTTCCGCTTG
TTCCTGCTTTTTCCTGCACTGCCCATAAGAGTCAAGGACAAACATTAAAC
AAAATAATAATTGATTTAATCCCTCCAAAAGGAATGAAAAGAATCAATTT
GAGTTTTGTTTATGTGCCATTGAGCAGAGTTCGGAGATTGGCTGATCTCA
CAATTGTCAGACCCTTTGATCGGGATATTTTAAACTTGTCTGTGGATAGT
GACTGTAAAGCTATGATGGTAGACTTTAAGAATAGGGATATATGTAAACA
TTTGTGAACCCAAGAAAACTTTAATATCTTGATAAATTTTAAAATCAATT
TTCGTATATGATAAATTGTGGGAAATTAATTTTTCAGAGCAACGTGTGAA
CAAAAGCCACAAAAGGTTTGAGGAACTTTCTCCTAAGTTATTTATTTTGA
AAGGCTCTTAGGACGAGGACACTATTCTAACGCACATAAAAAAATGAAAA
AATTAAGATAAAAGCACCCCCAGGTATTCACCCAAGGAACAAGTGTACCA
AATTTCAGCCAAAACGGACAAAGTATATTTGCTACCTAATACTAAATATT
TGAAATGTTACAATTGGGCCTTCTAATAACGGGAAAATCTGAAGTTGAGC
CCAGTGCAGTGCGCACGTTCGACCATGTTTTAATCTTCTGTAAATTCAAT
TTTTTTTTTCCGGTTTCAATGTCTTAGCAGGTCTTTTTACTTCTTAAACA
AAATTAGAAGGCAAATGTGATTGTGATCGTTTATCACACCCTTCTGTTAC
GATCAACATTGAGAGTTCCCCAAGTTTGAAACATGCAGTGAAAAGCAGTC
AGTTAAAACTTGCAAACAGAAAATTCCTAAACCTAATTGTTTTCTTTTCG
TTTCTTTCACTTTAGGAATTAGAACTCCTCCTCATGCTTAAAGGAACATA
CGCCGCAGAAATCGCCCACAACGTTTCCGCCCGTAAACGAAAAGACATTG
TTGAACGTGCCAATCAACTTTCAATTAAAGTAACCAACGCCACCGCCAGA
TTAAGGTCTGAGGAAAACGAATAAATTAATACAAAAAAATCTTGAACAAA
AATTGATTTGTCTCATTTTATTGAAGGGTGGTAGAACTGCTTTCAGAAAT
GCATGTTTCAATCTTGGGGAAAAAGGTTTGCATTTCCTGGCATTTCTACC
ATCCTTCAGTATTATCCA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:433081..439998- >MSTRG.13752.2.p2 ID=MSTRG.13752.2.p2|Name=MSTRG.13752.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=804bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:433081..439998- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAATTAGAACTCCTCCTCATGCTTAAAGGAACATACGCCGCAGAAATCGC
CCACAACGTTTCCGCCCGTAAACGAAAAGACATTGTTGAACGTGCCAATC
AACTTTCAATTAAAGTAACCAACGCCACCGCCAGATTAAGGTCTGAGGAA
AACGAATAAATGGTCGTTCCAACACAAAAGAGGAAGCTCATCAAAAAGCG
AACCAAAAGATTTATTCGTCATCAATCTGACCGATATGTTAAGGTCGCAG
AAAGCTGGAGAAAACCAAAGGGTATTGATAACAGAGTCAGACGACGATTC
AAGGGGCAATATTTGATGCCAAACATCGGTTATGGAACTAACGCTAAAAC
CAGACATTGTATGCCTGATGGCTTCAAGAAATTTGTCGTTCACAACCAAA
AAGAATTAGAACTCCTCCTCATGCTTAAAGGAACATACGCCGCAGAAATC
GCCCACAACGTTTCCGCCCGTAAACGAAAAGACATTGTTGAACGTGCCAA
TCAACTTTCAATTAAAGTAACCAACGCCACCGCCAGATTAAGGTCTGAGG
AAAACGAATAAATGGTCGTTCCAACACAAAAGAGGAAGCTCATCAAAAAG
CGAACCAAAAGATTTATTCGTCATCAATCTGACCGATATGTTAAGGTCGC
AGAAAGCTGGAGAAAACCAAAGGGTATTGATAACAGAGTCAGACGACGAT
TCAAGGGGCAATATTTGATGCCAAACATCGGTTATGGAACTAACGCTAAA
ACCAGACATTGTATGCCTGATGGCTTCAAGAAATTTGTCGTTCACAACCA
AAAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000111_pilon | genome | sc0000111_pilon:433081..439998 - |
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