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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000111_pilon:53332..60195- Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13718.2.p1 ID=MSTRG.13718.2.p1|Name=MSTRG.13718.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6864bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:53332..60195- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGAAATTTTGGAATAAGAAAACAAAAATTGATCAAATGTTCCTTCTGAGA
AGAATCACAAACCTTTTGAAGTTTTCGAACACAAATTTATTGATAAAACA
ACAGTGTTTTAGAAGAACTGCACTCCCTCAGCAAATCTCTAAAGATGTAT
CATCGTTATTGGGGAAAACATCAGTTGGACATTTTCATACCACAACAAAG
AAACTATTTAAAGATGAGTAAGGATTGTCTTTTTTATTGTGACTTGCCCA
TGATTATGTTTCCCTGTGGAAAAGATGTTACTGACCACAATCAATTTCTA
GTTTGCCATAAAACCTTGCAAAGGGTATTTCATTTTGAAAACATAGAACC
CTATGTAATTTTTTTCACATCTACTAGACACTTGAACACTGGAGAAATTA
ATTTTTTGTTTTAGAGTGACATTACACTTTGTGGATCGAAATGGGACTAA
ATTGACGATTGAGGCAGAAGTAGGTGATAATCTGTTGGATGTGGCAAAGG
ATGCTGACATTGATGGCGTTGAAGGTTTGTCTTTCTGTCTCCCTGTTTAT
TATTGGAAGACTGAGCTTGTCTTAGTGTAAATAGAATTTAAATTCCCACT
CCTTTCCATAAGTGAGTTTACGGCACTCTTTCGACCTATTCATTATTCCC
TTTTGCAAACATTCGCATTCCATCATTGGATTAGGACAAACAAAATTTTC
CATTTTAATTCTAGTTAAATTCTTAAAGCCAATCACAGGGCTCAGACGTC
CAATATTAATTTTGTTCTCCCTCTTCCTTTCGCATTTAGGAGCATGTGGT
GGAACACTGGCTTGTTCTACATGTCATTGTATTTTTCAAGAAGAAGATTT
TGAGAGACTGGGTCTCGAAGACATTGACGAAGATGAATTGGATATGTTAG
ATCTTGCTTTTGGTCTCACTGATACGTATGTATATAATTTTTTAGATTGA
ATATATCTTGCTAAAGGCATAATCGGGTGGTCTGGGATGTTTGGCATGTA
AAATCCTTCCTTCCTTGTTCTGAGCAAAACCTCAAAATATTTTTTGCCTA
AATATTTTCCAAAATTGATATAATTAAGAACCGTGTGAGAACCCACTTTC
ACAAATTCTAACTTGTGATTTGTATCTCGACTTTAGAATATAGTTAGACA
AAAATACTTGGTGACTTTACTCAAAACCACAGAGGGTTTCTTCAGGCAAA
AAATCTCAAACCAATTGATTATCCCTTTAAGGTTAAAAGGATTTAGGATG
TTATCTGTCGTCAGGGTCAGGTGGAATGAAACTGGTGATGAAGTAGTTTT
TCTTTGCATTCTTAGCAATTAAATTCAGGATTAAGGGTAGGGAAAAACCT
ACCTCAAAAGAACTTTCTTTTTTTTCCTAAACGACAAACATTTCGGGTAA
TAAGGCTATTGGTCAACTTTTTGATTAAGCTGTTTATACCCCATAGCTTG
CATTGAGAGCATAGACTTTGATATCCTACCACTATTTTTAATATTTTTTG
ACATGACTTGGGTCCATCAAGATTTGTTACTTAAACCAAAATATCATCTT
TCAGGCATACATCAGGACCAGAGGGCTGTTTTAAATTTAATAATATCGAA
ACATTCCTTAAATTTTTGTTTTAATTTGATTATCAAAGGTGTATCTGGAA
AAACTATTCCTTTCTGATCCAATCTAATGGTTTGTTATAGGGCTTTGATT
TTTCTTCCTTTGTAAAATAATATCCGTTTCGCAAATACTTGCCAGTTTCC
TATCAGCTCTGATAACTGAGAGTGTATTCTTTCCCCTAAACTTTGGTTGT
CTCCGTTTTTAACGAAGCTCTCCAAGGGGACTAAAAAATAAAACAGACTG
CTTGGGGACTTCTTTCGTGAACTCGGTGAGATCTTGGAACTCAATTTCCT
AAGGTTGGGTTGCCATGTAAAAGAGCATAATTACATAGGAAAGGTTGGTT
AAATGTATGAGCGTCTTGACCCCTGTGAAAACCATATGCAAATTTATCGA
CAAATAAACAAAGTCATAGACATAGCAAATACAACACTGGTGCGTTTTAA
GCCGCCCGACGAGCGTGCGTTCTCAATTATATGAATGGGAATTCTGTAGT
AGACACGTTTCTAATCTTTTTTTGATTTAGAAAAGGCTACTTTTTTTTAA
GAAGTCAAATCGACCAAAAATTTTAAATCTTACCAGATCCCGAACGATTG
TTCTGGCCCTTCGCGAGTGTTTATTCGCCGATTACTGACCCCCGTTGACA
TCCACTTTTTTAGGTCCAATCATACTTTCCCTGATACAGTGAACTCTGGG
TAATTCGAATTTCTATAATCCAAATTTTTCTATAATTACTACAAATTAAT
TTTGAGTCCCTATCGTGGAGAAACCTTCGTGAAATGTTTTCCATAATTCG
ATTCTTTTTGTCATTCGAACGCGAACAAAATTAGATCTTCCTTTTGAGTA
TGAATGGGCTTTTCCATAAATAGTCCGTGCCCCCCCCCCTCCCCCCTGTT
GAGGATATCGGATATCCAGGGGTTAAACAGTTTTTGTTCAAAAGTGTCTT
TTCAAGTGAAAATTACGACATCCAGGGGTAAGCATCTTTATTAGAGAGGA
TATCCAGGGGGTTGAGCATATTTTTAAGAGTGGATATCAGGGGATCTTTA
CTAATATGTCTAATAAAGTAAATCTAGATGTTCGATACTTCGAAAAATCA
ATATCCTCAACAGTGGGGGTAAAATGTTTTTCTGGAAAAGCCTAATCGTA
ACGAATCTCAACTGTAGTATTTCTTCTTTTATAGGTCACGTCTAGTATGT
GCTATTGAAGTCACTGAAGGAATGGACGGTATCGAAATTAAAGTTCCCAT
AGCAACCAATGATGCACGTGGTGCCTGATTCCATAGCAGCTAGAGTGAAG
TAAGTATGTTAGTTTACTGTCATTTGTTCTGATTTGTTTGGTATCCTGAA
AATAATAATTCCTTAAACTACCAAAGTGGCCTTATTCTATGGGTCATTTT
TAACAATTCTTTTTCAAACTTGAACTGGATTATTTTAATCATAGTTTTCA
AAAAATTTCTGTTTTGGAAGCAAGTAGACGTTTTTTTTAAGAACAAACTA
TATAAGGACATCAGACTTCGATGGCCAAAACGTTAAGAACAAGTTAAGAA
CATTTTAAAGCTGCGGGGACTCCAAAACACCCGATTTCTTAGAAAAATGG
ACAAAAATACCCATAAAATGGAGAAAAATAAGAACATGTTAAAAACATTT
TAAGGGTTAGAACTTGAAAAGTTAAGAACATCTCAAGGCTTCAAAAAATT
TGGAGCTTCTTATAAAAAAACGTGTAGCCGCCTTTAGAGTCTTTTAAAAA
CGATTATAATATAATAATAAAGGCCCCATTACACCTAAGAATAAGGGGGA
AGAATATATCTCTGCAGCTGTTACGATTCGTAAATTCTTGTTCTAGATAC
ACGTAAAAATATTCAAAAATGGAAAATCTCAGAGTTTTTCCAAATTTGCC
ATATGTTAATTTTTGTAAATTCTGCCGTAAAATTACACGGAAGAATGTAA
AATTTTTATCAGATTAATTTTATTGCAAAGGGCAAAACGGAAGTTCTTTA
ATTCGATATTTTTCCCTTTTTTCGAAACCCCCCAACTTTCGAGAGGGAAA
ATCCTTTGTAAAGTTTGTTTGCACAGTCTACACTATAGCCAAAATTCCAC
ACTAATCCCCACTTTCAATAGGCTGCTATTGTTGAATATTTTTCATAATT
TTCCATTCCTTTGGACACCTCCAAAGGAATAGAAAATTATGAATTAATTA
AACAATAGAAACTGAGATTAGGGAGATAATTTTTCAGCGAATTCTTTATA
CTATTCTTTCAACTGATTACACAGGAGAATTTAATAAAATTGCTCACAAG
TGTCAGGTGTGCAGTAAATTTCACATTATTCTTCCTTTATATTCTTAGGT
GTAATGGGGCCTTAAGAAGGTGTTTGTAGCAAGAAATTCAGGCTCCATGC
AACACATTATGCAATAAGCATTTGTTCCGGTTTCTAGCCTAGATCCTTAT
AAAAAGCCCAGCATGTACAAGTAGTCAAGGGCGTATTTTATAAATCAATT
TCGAACATATCCCATGACGAAAAGCAAAAAAAAAAACGATTAACTTTGTT
GTTTATTCAAGTCAAGTAATATAATTACTGCTGCTTGAGTTAATTGCTTA
ACCTCATTTTATCATTAATGATTGCATTTTGAATATTGAACTGCCTTAGG
TTTCTCATGATATACATTCATAACAATACAACTTTAAAGCATTTTCTAAC
CCCGATAAAAAGTCCGAAATAGGTTTTTATTAGGTTGGGAATTGGCCTTG
AATTAAATTCCATTGGTTCTTAAAGCCTTGTAGTTCTCGGACAAAATACA
CGATAGTATATTTATATAAATCATTCGGAATTATTCAAAAAACATTGAAA
CAAAAGAAATTGCAACCGAGTCTAAATTATGCCCCTGATTCGATAAAAAA
AGCTTGATACCTGCTTTGTTTTACTTAAATTGATTATGAAAAACAAACAG
TGATATTACTTAATTAAAAGTAAGGAGGAAATTTGATTTTAACATACTCA
ACATAACTAGAGTGATGCCTCAAAATTGATTAATTTGTAAGGAATAATCT
TGCGATCAGCCGTACAGATTAAAAAATGTTTCTTATCAATACCTTACTTT
AGATAAAATGTCTTTCAAGACGACAAAAGAAATTGAAATATACTATACCG
CTTTTTAAACTAAACAATGTTCCAACTTTAAACTAACAACGCCAATTTGC
TTTGAAGCTTTTATTTTGTACAAAAGGAGCCATCCAGTCTCCCTACAATT
GATTTAGCTCCAAGTCCTATAAGAAACATGTTTAAAAAATCTCTGAAAAT
TTGCCACTGCAACCAGAAATCAGCAATTCCTTTAATTTATCGGGGGGATA
TACTGTCAGTGTTCTTGTAAAAAGCATTTATGATTTTAAAGACCTCTATT
AATGACATTTCGTGTCATGGTATGATAAGTAAATGTTAATCTTTTTGTGT
GTAATGGTTTACTTATTTTAAACTCATCACGTTATGTCAAAATCATGCAC
GAGATGGCGTGATATGAACCATAGCTGAACTAAACTTCACTGAACAAGTT
TTGAATTGAGCCTATTCCAACACGAGAAAATGTAGAGTGTGTTAGGTTTG
GACCCTAAGAATGGCTAAAATGCACACACAAAACTAAAACCGTTCAACTA
TACAAGGGAAAAATCTACAGGCGTAGGACATGATTTTAAGGAAACATACT
AGTTGTTTCAAAAAAGCGTACATGTTTTATCGAGATTCTTCGAAAAACTA
GAAAATATATAAATGTAAAACTTTCAGCGTTGTAAAGAGGAAAGCAAAAC
TAAATTTTGAAAAATACTTAAATGAGCTCTAGCCGTTCAAAACCTTTGAA
GAAGAAGAAATGTCTCGCCCCTCTGTAGCTATTGCTCTACTTGACTCGAA
GAACATTCGCTTGACTATGATGCACGTTAGACAAGTCTGAGATACGTTTA
TTCATGTTTGAAATATACTTAAAGTTACTACTGTAGTTGTTTTTTTCCTG
TTTATAGGCGGTGTTTCCCAAAGAACAAGCAAGAGAATCAAGTTGCAGAA
AACAAAATATGATGTATTGCAAGCTGTAAGAGTAGATAGAGTGAGTAAGG
TTTTACTAATACTATGAAACACGAATATATGCTCGTTCTGGCTTGTTTTA
AGAGGAGGATGTTCAATGACAAGGCGAAAACATGAAAGGAGAGAATTCTA
GTGACACGACATATATAAACACGTTGATAACATGACGAGCACGTGATCTC
ACCTGACAATATGGTAATCCACGTATGTGTAATTTGATGGTATCAATGAA
CTTTGAACCTCGCTTTTTCTCCTCCTTTTCTTAACTTTGCTTGTTACAAT
AACACACATACACATATCTATTAGAACATTATACTATATTCAATTGACCA
AGATTATTTGACCTATTTTTGAATGAATTTGATTTTTGGAATGCTAATTT
TCTCCATATAATGATACTGCTGATGAAAATTAGGATCAATAAACAGCAAA
GCTTCCCTTATTCTCTCTTGTTTATCATGTATTGAAATATGCTTATGAAA
AATGGTCATTTGAATAGTACTTAAGACATTTAATAGCAATTTCTACTGCG
TATACAAATCTCATTCACAAGGTAATTACACAAAAGATGATTGTGGCCGT
TTGACGGTTTGTTAAAGAAAGAAACCTTGCTCATTACTTCATAATTAAAT
ATCTCTTTCCGCTTTTCACTGTGCTTTTCCTATTTTTTCAGCACAGTCAA
TGACCAGCTTGCAGTATATTTTTATAACATTTCTTGGTGTCATTTAATGA
CTTTTGAAACTATATTAAAATTACACGTATGCAACTTGAAATGTTTATTG
AAAAATTTGCCCCGTGAAAAAGACTAATGCATATTTACTGAGCCATGCCT
AAAGGGTCTGGATTATATCGTTCCGATTTCTGAATTAGGTGTGTCAAGGA
GACTCTGTCACACTTCGTATACATACGCCAATCCTATTACAAAATGCGGT
ATTTCAATTCTCAAATCCAAGTATTCTCCAAGAAACTGCCTCCCCACAGA
AAAATGGGATTTCCCGGGGATTTATCAGGAAAATAACATTTCATTATCTT
TTTTAAGATCGTATTATTTGAATTTCATGAGTTCTTAGAATATATTTTTT
CTCAACTTAACCATACTAGTAGTAGAAAGTGTGGTTTCATCCAAGACTGT
TAAAAAGATGTAATAAGGTATTAAGAAGCTATTAAGTCAATATTACTTTT
CTAAATGATTGTGC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:53332..60195- >MSTRG.13718.2.p1 ID=MSTRG.13718.2.p1|Name=MSTRG.13718.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2220bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:53332..60195- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTCACGTCTAGTATGTGCTATTGAAGTCACTGAAGGAATGGACGGTATCG
AAATTAAAGTTCCCATAGCAACCAATGATGCACGTGGTGCCTGAGAGCAT
GTGGTGGAACACTGGCTTGTTCTACATGTCATTGTATTTTTCAAGAAGAA
GATTTTGAGAGACTGGGTCTCGAAGACATTGACGAAGATGAATTGGATAT
GTTAGATCTTGCTTTTGGTCTCACTGATACAGTGACATTACACTTTGTGG
ATCGAAATGGGACTAAATTGACGATTGAGGCAGAAGTAGGTGATAATCTG
TTGGATGTGGCAAAGGATGCTGACATTGATGGCGTTGAAGAAATTTTGGA
ATAAGAAAACAAAAATTGATCAAATGTTCCTTCTGAGAAGAATCACAAAC
CTTTTGAAGTTTTCGAACACAAATTTATTGATAAAACAACAGTGTTTTAG
AAGAACTGCACTCCCTCAGCAAATCTCTAAAGATGTATCATCGTTATTGG
GGAAAACATCAGTTGGACATTTTCATACCACAACAAAGAAACTATTTAAA
GATGAGTCACGTCTAGTATGTGCTATTGAAGTCACTGAAGGAATGGACGG
TATCGAAATTAAAGTTCCCATAGCAACCAATGATGCACGTGGTGCCTGAG
AGCATGTGGTGGAACACTGGCTTGTTCTACATGTCATTGTATTTTTCAAG
AAGAAGATTTTGAGAGACTGGGTCTCGAAGACATTGACGAAGATGAATTG
GATATGTTAGATCTTGCTTTTGGTCTCACTGATACAGTGACATTACACTT
TGTGGATCGAAATGGGACTAAATTGACGATTGAGGCAGAAGTAGGTGATA
ATCTGTTGGATGTGGCAAAGGATGCTGACATTGATGGCGTTGAAGAAATT
TTGGAATAAGAAAACAAAAATTGATCAAATGTTCCTTCTGAGAAGAATCA
CAAACCTTTTGAAGTTTTCGAACACAAATTTATTGATAAAACAACAGTGT
TTTAGAAGAACTGCACTCCCTCAGCAAATCTCTAAAGATGTATCATCGTT
ATTGGGGAAAACATCAGTTGGACATTTTCATACCACAACAAAGAAACTAT
TTAAAGATGAGTCACGTCTAGTATGTGCTATTGAAGTCACTGAAGGAATG
GACGGTATCGAAATTAAAGTTCCCATAGCAACCAATGATGCACGTGGTGC
CTGAGAGCATGTGGTGGAACACTGGCTTGTTCTACATGTCATTGTATTTT
TCAAGAAGAAGATTTTGAGAGACTGGGTCTCGAAGACATTGACGAAGATG
AATTGGATATGTTAGATCTTGCTTTTGGTCTCACTGATACAGTGACATTA
CACTTTGTGGATCGAAATGGGACTAAATTGACGATTGAGGCAGAAGTAGG
TGATAATCTGTTGGATGTGGCAAAGGATGCTGACATTGATGGCGTTGAAG
AAATTTTGGAATAAGAAAACAAAAATTGATCAAATGTTCCTTCTGAGAAG
AATCACAAACCTTTTGAAGTTTTCGAACACAAATTTATTGATAAAACAAC
AGTGTTTTAGAAGAACTGCACTCCCTCAGCAAATCTCTAAAGATGTATCA
TCGTTATTGGGGAAAACATCAGTTGGACATTTTCATACCACAACAAAGAA
ACTATTTAAAGATGAGTCACGTCTAGTATGTGCTATTGAAGTCACTGAAG
GAATGGACGGTATCGAAATTAAAGTTCCCATAGCAACCAATGATGCACGT
GGTGCCTGAGAGCATGTGGTGGAACACTGGCTTGTTCTACATGTCATTGT
ATTTTTCAAGAAGAAGATTTTGAGAGACTGGGTCTCGAAGACATTGACGA
AGATGAATTGGATATGTTAGATCTTGCTTTTGGTCTCACTGATACAGTGA
CATTACACTTTGTGGATCGAAATGGGACTAAATTGACGATTGAGGCAGAA
GTAGGTGATAATCTGTTGGATGTGGCAAAGGATGCTGACATTGATGGCGT
TGAAGAAATTTTGGAATAAGAAAACAAAAATTGATCAAATGTTCCTTCTG
AGAAGAATCACAAACCTTTTGAAGTTTTCGAACACAAATTTATTGATAAA
ACAACAGTGTTTTAGAAGAACTGCACTCCCTCAGCAAATCTCTAAAGATG
TATCATCGTTATTGGGGAAAACATCAGTTGGACATTTTCATACCACAACA
AAGAAACTATTTAAAGATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000111_pilon | genome | sc0000111_pilon:53332..60195 - |
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