MSTRG.13714.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13714.1.p1
Unique NameMSTRG.13714.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000111_pilon:6138..36020-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13714.1.p1 ID=MSTRG.13714.1.p1|Name=MSTRG.13714.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=29883bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000111_pilon:6138..36020- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCAATATAATTTTAAGATACAATTTTAGAATTTACAAAAATGAAGAGCA AAAGTAAATTCAAATCAAAACAGTCTTCAAAATCATCAACCAACAATGCA AATGAGAACAATGATTCCAATTTTGACAGAATCGGGGAAATTCTTGTTAT AATTGTTGGTCTTGGTATTGCATTGTATTTGGGGTATCGTTATGCAATTT ACTCTAAAGAAATACATGAAAATGAGATGTGGTTTTCAAATATCAAGGTA AGATTATCGTCTAGTATTTTTATTTGATTTGCAAAGTGCTGGAATGATAT CCATTCAAAAGTTTTATGAAATTGAATATAACAAAACGCTATTCTTTGTG GGTGTTATGATTATTTATGCCCGCGATAAAATGTCCCCTGTTCATTAATG GGCAGCCTGTGTTATTTATGCTCAAGTTGGATCATCAGAACAGTTTTTGT GAACTTTGGAATTTTCGAAACACAGATTTTGACTTTTCAAAACCAAATAA CGATGTTAGAAAACAAAGTCTGAAGAAATTGTATTTAGCTTAATTTATAT ATGCCTGTAAAATTGATGTCAAATACACTACAATGCCCTCAGAGTGAGTT TTAATATTTTTTTACATAGTATTATAATGGATGGGTTTATTATTTTAGAG AAAAAGATGACAGTACAATTTTACAATTTTTATTTTAGCAAGTTGAGCGA GAGATTTCATTCCGCACAGAAAGTGGTCTTTATTTTTCATACTACAAGCA ATTAGTACTGGCTCCTTCCCTAAGTCAAGGTAAGTAAGATTTTTTTCTCT TTCCTGATTTTTAGCAATTTTGTCAAAAAAAATTCAAACCAAAATTTCTG AGTTGAAGCTTCTTTTCAACAACATTTCAATTATTGCTAATGTCAGTAAA TTTTGGTGACAATTGATTTGGTAATTTTAGCAATTTTGAGCAAACATTTG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000111_pilon:6138..36020-

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GAACGAACTCGAGAGGTATGTTTTATTTAAAAATTGGATGTTACACGCGA
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CTTACTGCTCAAATTATCACTGTATTTGTAATAACATTTGGTTTGAATTT
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GTTCGACAATCTATTCCGGTGCTCATTTTGTCAGTGCTGCTTTATAAGCG
GTACGGAAACACTACTTGACGATTACCCAGAAATCATTTTCAACGTTATT
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GAAAGGTTTAATATGACTAGATTGGCATTCACAGTTCCATTGCGAGAAAG
CTTTTCACTACCTTTCATCTACATTCAGATAGCTGCCATCACGTTTTTCT
TAAGGAAAAAGTGTTCAGCAAGGGAAGAGGATTCGTGGCAATATGTTTAC
TTTTACATTGATTCTGTTTTTGCCCTCCATGGACTGTATATGGTTGCCAT
TTTCATTACAACTTGGCAAATGAGCGGAACATTCCTCGCTGGAGTATTAT
CCGTTGGTTTTTTTGTTTTCAACAGGTCTGTATGAATTAACTCATGACAA
CAGAACAGAACATTTGAGAACCATCAACATTCTTGAAAGATTTAATATTT
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AAGCAAGTTGAGCGAGAGATTTCATTCCGCACAGAAAGTGGTCTTTATTT
TTCATACTACAAGCAATTAGTACTGGCTCCTTCCCTAAGTCAAGATGAAG
AGCAAAAGTAAATTCAAATCAAAACAGTCTTCAAAATCATCAACCAACAA
TGCAAATGAGAACAATGATTCCAATTTTGACAGAATCGGGGAAATTCTTG
TTATAATTGTTGGTCTTGGTATTGCATTGTATTTGGGGTATCGTTATGCA
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GGAAAGAAACACCAACGGACGCCGCGTTCACCGGTAGCATGCAACTGATG
GCAGGTGTCAAACTTTGCACGGACCGACCAATCACTAATCATCCGCATTA
CGAGAACAAATTCTTAAGGGAACGAACTCGAGAGGTATGTTTTATTTAAA
AATTGGATGTTACACGCGAAGAGTTGAAGCGGTTAAGTGAATTTCATGAC
CCTGATACTGTGCAACTGATGGAATGGATTAAAATTTTGCGGTTCGACAA
TCTATTCCGGTGCTCATTTTGTCAGTGCTGCTTTATAAGCGGTACGGAAA
CACTACTTGACGATTACCCAGAAATCATTTTCAACGTTATTTTGAATGTG
TTCTTTGGTGGTATGGCGCTAACAACAATTCGTATGAAATTCTTGTGGAT
GCCTCACATGTGTATTCTTGCTGCTGGTATCATATGCCACCAGAAAACAT
GGAAAACATGTCTTGAAAGTATACATTTCAAAGGGTTCTTGAGATTTTGA
TGCATTGATGTACCTCTGTGAGGGTGGATTTCAATTTATGCCAATGTCAA
CGTTTCAAGTATTGACTGATGGCGTTGTGTTCCCCGTCTACGCTATGTCT
GGAATCGTCATAATCCTTGTACTCGTTTTCTCTTATTTTCAAAAACTTCG
AAAATCACGAAAGTAGATTCGGATGAACATGTCTTTAAATTTGTTTCGTC
CAAACTTGGTCTTGGAGATGCAGCACTGAAAAAAAACCTGGTACCGGATT
TTTTTGGAAATTGTTTCTTCTTACTGCTCAAATTATCACTGTATTTGTAA
TAACATTTGGTTTGAATTTTGCCATAAAGGTTAAGCCATTATATTGTATC
ATGTTGGGTAGTTTGGCAAGTGTTTGTTTTGTTCAATTTGGGAATGATAT
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TTAACCTTGTTTTGGCAATTCGCACAATTTGTCCTGCTGCTCGAAGCTTT
TGCCTTGTTTGGCTTGTATGCTATGGAATTCACTGAATCAAGAAAGGTTT
AATATGACTAGATTGGCATTCACAGTTCCATTGCGAGAAAGCTTTTCACT
ACCTTTCATCTACATTCAGATAGCTGCCATCACGTTTTTCTTAAGGAAAA
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GATTCTGTTTTTGCCCTCCATGGACTGTATATGGTTGCCATTTTCATTAC
AACTTGGCAAATGAGCGGAACATTCCTCGCTGGAGTATTATCCGTTGGTT
TTTTTGTTTTCAACAGGTCTGTATGAATTAACTCATGACAACAGAACAGA
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GAGCGAGAGATTTCATTCCGCACAGAAAGTGGTCTTTATTTTTCATACTA
CAAGCAATTAGTACTGGCTCCTTCCCTAAGTCAAGATGAAGAGCAAAAGT
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TTGGTCTTGGTATTGCATTGTATTTGGGGTATCGTTATGCAATTTACTCT
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TTACACGCGAAGAGTTGAAGCGGTTAAGTGAATTTCATGACCCTGATACT
GTGCAACTGATGGAATGGATTAAAATTTTGCGGTTCGACAATCTATTCCG
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GTCTTGAAAGTATACATTTCAAAGGGTTCTTGAGATTTTGATGCATTGAT
GTACCTCTGTGAGGGTGGATTTCAATTTATGCCAATGTCAACGTTTCAAG
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TCTTGGAGATGCAGCACTGAAAAAAAACCTGGTACCGGATTTTTTTGGAA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13714MSTRG.13714Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13714.1.p1MSTRG.13714.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13714.1.p1.exon14MSTRG.13714.1.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon13MSTRG.13714.1.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon12MSTRG.13714.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon11MSTRG.13714.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon10MSTRG.13714.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon9MSTRG.13714.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon8MSTRG.13714.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon7MSTRG.13714.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon6MSTRG.13714.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon5MSTRG.13714.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon4MSTRG.13714.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon3MSTRG.13714.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon2MSTRG.13714.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13714.1.p1.exon1MSTRG.13714.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000111_pilongenomesc0000111_pilon:6138..36020 -