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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:2508494..2522482+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1369.1.p1 ID=MSTRG.1369.1.p1|Name=MSTRG.1369.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13989bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2508494..2522482+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GACCCCCTAAATTTCATCTATTGTTTACGAAAATCAAACAATAGACACAC
TGCCCAATTTTTTCGCATCTGATATAAGGAGAGCTTCTAGTACCAGCATT
CACTTTTTAATATACTCCACTTCTCTAAGCTGCTCTTCGtttttttCGGA
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gagacaggggtgttttaaaaagTCCCAACAAGGTgtacactacacgtttt
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ttaacttgttcttaacattttggccagtgaagacttatgttcttatatag
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tcaaaaactttccttttgataatgttttctaTCTCTCATCAGCGGGtgtt
taatttaatttagaatcaatgaaaaattaaactttaacaATAGGATTAAT
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aatataatttctatccccattgggatttgaATAGAAATTTATAACCCCAC
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TATCATAATCATGAACGATGTTTGACCATCTTGCGATTGTTCCTGTTGGT
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TTCACTTATTCTAAAAGCTGCATTGCCCTTAGTTACTAAAAGCAATTAAA
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gggttcaacccccagccgggtcataccaaagattcccaaaatggtactag
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TTAAATTGGCCACTCaattgaaattatgaaaaatcgtTCAAATATGATCT
AAACTAAACTGAGTTGTACTGAAACttaaatttttggatatttttttcaa
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GAAAAAGGGGATCCAAACTCAGCTGATCTATTTGCAGCCTTGAATAAAGA
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CAATTACGAGAAAACACCAGAGATGACTTCTCCATTTAGTGTTGGAATAT
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aaagatatCCCACATTTTGAATTGCCGTTGAATACCAATACAGATGTGGC
TGGACGCTATGTCTACTCCTTAACGAGTTGTGGTAAGAATTATTGGTCAA
ATCTATTTAGACCTTTCTTAGTTTGTTGAacagtgaaaaagaatgcggct
attatattttaatttttcccacCTTTTCTTAGTTTTAAGTCTCATGGTTA
GGGGCCtgttaaaacatttttcatcaaatagaaacatttaaaaactgaaa
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TATTTACTATTTACTTCGTTATATCCCCATTGGCTAAATATTGTCACCGG
GTCAGAGTGTTCGAAATCAGTGTTTTAAAAGGGTAATACTAAAACACACA
CTGGCTGGTTGTGCCTTTTTTCTgcctggttgtggctggttgtgcctttt
ttctgcctggttgtggctggctgtgactggtggtggctggttgtggctag
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AGTATACCATAACTTTTCATTCTTGACCATagattttgctgatttctgtg
AGGTCGATCCTTGTCAAAATAATGGTGTTTGTAAGAGTTTCGATAATGGA
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TAAGTTCTAATATCGATATTTGTTTGGCCTGCTATTAAAATTATATGATG
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tcccactcggtgctgcgattcacttggcaagtgaatgtaccttggcccgg
atcaacccataccatgttaggggaatagggtaccatcactctgatacaag
agtatggggagatatACTGGACATTGAATGTGGTGTTGTGGTGGTACTCA
TATGTTCAGTACCTGCGAGAACGCaaggttctcccgtactgttcgagtat
catcatcgatacagcacggctctgatgtgtctcgagcacagagtacaatg
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ATAGGACCCGGTCCGACGATATCTGAGGGTCAGtttctctctttctcttc
tctcATGTTGGATGCCTAAAAGCTATCTAGTACAGATTCATCTTTAACAA
ACTCGAAATATGCAATCCCAAAAAGTTGGCTGGACTCTTTTTTCtctata
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accctaaaaccatcccagtatttttttcgcgcctgaagacaatagaaaaa
aagtgtaaaaaaaggattggatcgagtttagggtggtaaaaaatgcccgt
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CTAGTACACATTAGTCAGCTCCACAACTGCTATCATTTATTTTtacgaaa
gaaacaaaagagaTAAGGGTGatcttttcatattttttaatttaatataG
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CAAATGAGTTCCCAAATGTATTCATCCATGGCTATGAGCTCAGCAATGTC
ATCAATTGCATCTAGTGAAATGAGTTCCTCTATGAGTGCATCCATTGAAA
TGTCAATGAGCTCTTCTATGCCAATGAGCTCTTCCATGTCGATTGGTCAA
TCAATGTCTTCCAGCAGCTCTATGAGCCTCTATGCATCTATGGATATGAG
CTCCACAATGCTCCAGTCAATGGCTATGAGCTCTTCTATGAGTCCAAGTG
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TCGAAGAGTCCAGACATGTCCATGGAAATATCAAGCTCGATGAGTCCAAG
TGCTTCTATGTATATGTCAAGCTCAATGAGTCCAAGTGCTTCCTTAGAGA
TGAGTAGCTCAATGTCAATGATTCCAAGCGTATCATCAATGGCTCCAACA
GAGTCTCTAGGAATGTCTTCATCCATGAAAATGAGTTCTTCAGTATCGGT
TATGCAATCAATGGCGCCAAgctcttcaatgggaatcagcTCTTCAATGA
TTTCACCATCGCCAAGTAAGTCTCTATTTTTTCTACTCACGGCTGGCAAA
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GATGGACGTTTTTATGATGTTCTATGCCAGCGTAGTTGGTTAAATCGTCT
AACCTTTTGTGTACTTATAATAAGTTTTGTTCGTTACGAATATCCTCTTA
AAGAAACACGCTCCCTATACAACGTAAGGTTTCAAAACATatccttttca
tctttttaCTACGTATGATCATTTTGGGCTATTTCTGGTCAATGCATCAC
TTTTCAGAATATGCTTCTTTAAGTACTATAACTAGTCTTGGGTCACATTT
GGTCAATCTTAAAGAGTTAGTGAATGATTTCTTAAACTTGACCTATTTGT
TAGAATTTTGTAAAATGCAGACCATAAAGGTGGTCTGTATAATATGTCAC
AACATAAtccacaaatttctaaaagagtTAGCGAATGATTACTTAAACTT
GACCTATTTGTTAGAATTTTGTAAAATGCAGACCATGCAGGTCTGTATAA
TATGTCACAACATAAtccacaaatttctaaaagagtTAGCGAATGATTAC
TTAAACTTGACCTATTTGTTAGAATTTTGTAAAATGCAGACCATGCAGGT
CTGTATAATATGTCACAACATAAtccacaaatttctaaaagagtTAGCGA
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TGTATAATATGTCACAACATTAATCCACAACTTTCTTAAACGTTTTATTT
TCTAGGTCCATCTGTGTTACCAAAACCAACTGTCGTGTTATCAACCAAGC
TGAATGGCGAAAAAGTACCAATCGTCAACACAAGCAAAGCCTTTGAATCA
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TGAGGTTGAGTATAAGAAACATCCGGTACAAGTCTTCCTGACAAATCTTG
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TGGACATGCAGTAGCGGAAACAATGTTCTACTCATGGTTACGTAACGTTA
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TAACTCTAGCTTCGTTGAGAATTACCATATTGATATCCCAAAAGGTGATC
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TTAAGCGGTGATCACGGCTCCTCACACGTGACCTCCCCTAGTAAATGCCA
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TGCTGTCAGGAAATGCTCAACTCAAACGAGATGCTGAACTACCAGATGTC
TATTGTAACTACATAGAATTCCCTAAACATGCTTTCGTTCCATCCAAATC
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AAACTGCCAGAAAGCTATGTAAGATTTTCTATATTGTTTTCGTATCTATA
TGTCAGACTTCGATCGGAAATATCCAATGTTGAGAATGGCTCTCCAAGCT
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TTTTACATCGGACCACCCCCTGGACTGCTAAAGCTAAAGTGACTTATATC
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GTGGtacgtttttataaaagaaaaatgccGGCCTAAATCTAGAAATATTC
AGTTCTTTAATTGTCTATCACTAAAACAATACACTATAAAATTgcctcaa
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GCAACCGTTTGATTGTAACTCTTCACCAACAACCTcgattgtcaataaat
tttaacCTTTATCCTATCATTTTCAGCACTATATGCTTCAAGACGCAACA
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TGGAAAAAGACCCGAAAAACTAATTTCATACTTATCTTTTCACTTTACTA
CTTTTATAAATTTACTGGCAAAATTAGCTATCCTACGTTAAAACCTTTCT
AAAAGTAACACTATCAAATCTATCGACTCCCTACTTCACAGGGAGGTTGG
GTTTGAGTTTAAAAAGCTCGAATATGACAACAAAATGTAAATAATAGCAC
CACATTGCAACGACCTACCGAAATCCATTTCATCGTACAGTTTTGACTAG
GGATGATATATATGATGTATTATAACTTTATTCTAaaattacttttattt
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GAATCAAGTCCTTCGGTCAGATTCTCAAAGAGAGATCCTGTTTCATGGGT
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TGATTACACAGATCTGTAAATCCCGAAAAGCTAGATCCAcagcctttatc
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ATGAAAACCTGTAAACTCCagccagctggcacacaacgttgtttcaacgt
tcacctaacgttatatgaacacgttgtgaacgttagataaacgtcgaaaa
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TTTTCTTATCCCTCTTTTCTCCTTTATTTAGGATGTCAACGATTCTAACA
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caTGTGTCCTTCTTAACATTACCAAGTAAGTAACATACATTATCGGCCAA
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taaaaatttgggccatttctaaatatacaagcagatggaaaatagaagaa
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tttggagacatatCAACTTTGCTTGacaccgtccccctcgatttatctcg
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TTAATCCCCATAGGTAAACTAATCTGTAATCTCAATCCAAATTGgaataa
aattatttctttttcataactcctactagactggcacgccagtcgggctg
gaacggtatcacgcgggaaaagtgagcgtaggagctaggtaagcgtagga
agaaattttgtcggcggcaagggctgaaatcagcagcctctcaccaactt
ttgctcgttctcctacgcagctcctattttaGCAAACGCCCACTGCCTTT
ATGTTCCcaccctctgacatgattaattaacagattagtttgctagtcta
aacTCCTAAATGAAATGCAGAATCGGCAGAAATTCTTTTCGTAATtctaa
atgattttgattttcttctctttAGAATTGTGTGACGAGAAAGCTCATTA
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TCGAGGCTAGTCAATTATGTCCTTTTAATCACAATGCTGGCCATATGATG
GCTCTAGAAAGTGAGATAGAAGGATCCTACATGAAGTACAGACTTGGTGG
AAATAACCAAACCGTATGGAATGACTTGGGTGTAGATAACGGAGTTTGGT
CTTTCTCTAGGAGTAATTCACCGTACAGGAATTGGCTGAAGGATGAACCA
AAAtcagaaattcaaaataatggTGCAGCAGTGATTGTTTATGAGAATGA
TGGAGTGAACCCAATTGTCTATGGTTGGAAAGCCGACCAATTTGTAACTG
CAAAAGCTCAATTGATATGCGaaaaaaaGAGTCTTGCATGAACATATCAT
GAGATGtgtttaaagaacattttgaatCGAATCGAACACTAAAACAAGTT
CAGGGACATCAGTTTGAAATATTCtactcaatttctttaataagatcgga
ttttaatgaagaaaaaaaaacgatgAAAAGTGCTCTCTCTAGTAGGAGAC
GCAGGTTCTTATAAATGGAATGGATTTTTCCAGAAAAGAAACCGTatacc
cctgttgaggaggtccaacttTTTGAAACTGAAAACATCTTAACTTTCTA
GGATTCCAGGCACGTTTAGGTGTAAACACTTCCAGAGATTTCGCTTTTAA
TAAGATCTaaaataatacacgttttttttttattagaacacctaaaattt
ggctgagcctggatgtgcttatttttttagcaattttca Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:2508494..2522482+ >MSTRG.1369.1.p1 ID=MSTRG.1369.1.p1|Name=MSTRG.1369.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=55860bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2508494..2522482+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTATTTCGGACAGATATGTATTTTTTGGACACTCTTTGCAGTTGTTGC AGGACAGAACAACCCAACAAAAGACAACAATGAACTAGCAGAAGAAATTT GTAAAGGACGATGCATAGATTTGAAAGACAATTGTGGTATAATGCTTGGA TGTGGTGATGTTCAGTTTGACGTTTCAAAACATTGCCCTGAAACTTGTGA AACATTTTCACTGGgCTCACTTATTGAGGTATCGGGAGCAGAAACACTCC CACAAGAAGATGATGGAATGCCAGTTCGAACAATAAGAAAACCTTTCAAG TTATTCAACACTGTTGAAGACAAAATTTTTATTGCGACTAATGGATATAT CACATTCGGTGAAAGTGAAAATTCTCGTGACTGGACATGGCCATCTATCA TTTCCAAGAAAATTACCATGGTTGCTCCATACTTCCTTGATCTGTACAAT GTAAACCCATTAGAATCCAATATCCAATATCGGGAAATGGAAAAAGGGGA TCCAAACTCAGCTGATCTATTTGCAGCCTTGAATAAAGAGATTGGCAAAC GTCGATTGAATTTTGATATTCAAAATGTTATTGCTGTAACCTATAACAAT 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:2508494..2522482 + |
|