MSTRG.13683.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13683.4.p1
Unique NameMSTRG.13683.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000110_pilon:423975..439769-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13683.4.p1 ID=MSTRG.13683.4.p1|Name=MSTRG.13683.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15795bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000110_pilon:423975..439769- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTCTTATTCTCTTATTGCGAAATTTCCAGGAAGATGTTTATAATGTTTA ATAAGGGAAATTCAGGAAAGTCAGGCTAAGTTTTTTTTCTTAAAAAAAGT ATTTTTATAAGTTCGACTCCGTGCTTTTCTTCGCTGAGAACACAAAAGCT GTGTTAATTTTCAAGTTAATTGATGTACTCTCCTAGAATTTTTAACCTAT TTTAGTTAAATAAATAAGTTAATCAGAAAACTTGAAAGACAAGACTTTGA TAGTGTAGATGTATGGATAGAACATAAATGATAGCGGAATCAAATATCTT TTCACCAAAGAAGGAAATTTCACATTAGATGATTGTATAAAAACCTAACC TGATCATAACCTGGTCATAATTTGCTTACGGGCACGGTAAAGCCCTGAAG GCTAGAAAATTATACAACGAGAATCTTATTGTGCGCCGGAAAGTCAAAAA CTAAATTTGCCTGATACGGTGCCCTATTTTTAACACAATCGCACATCTTT GTTGTCATTCCCAGTCCTTTTAAACGAGCGCGGTCCTTACAAATTCGAGA TTGCATAATCGTCAGATGGTTTTGTTTTCACCCATCCCTTTAGAGCTTCA GCGTGGTGGGCAGAAAACAATTGCATTCTGATCTCAGGTTGTAAAGAACC TTTTAAAAGGTTTTCTACGGGAATAAAAGGATCTTGTTTTAGGCAGTGTC TTCATGCTGAGTCAGATAAATTAAAGCTACTTTTTAACGCAACGATATCC TATGAAAAAATTGAAAGATCGAAAGTTGTCTCGAAATGTGACCTCACATT CTATTGCTTTTGTAAACAAAAAAATAGCAAAGTTGATTTCGAGCAAAATT ACAATCGAATGTTTTGATTATAAGATAGAAAACGTTCTATTTATTATAAA CATAAAACATTCGAAAGAGTATCAGTAAAATTCCCTTTGTTTGAGGAATG TTCTTTTGTTCAAAATGTATTTCCATTTTTTCAAAACCTTTTTCTAATCT TGTCGCACTTGTTTTTACTACATCAGCATCATCAGACCTTTCAATCAAAA AGAAACCTTTAAACTAACACTAACACTATTTTAACCTTTTTAAGAAATTC TAAGATAAAATGCAGAAAAGGTCTCCATTTTTTATAGCGCGAATTTGTCA AATTGTTAGTTCCTGTCTGTCCCGCTACTTCCTTCCGTTGAGAAGCCATG TACATCACGACGTCAACCTGTCGGCACGTGTCTACGTCATCTGTCTTTTA TGTGTACCAACGCACACGTCATTGCGTTAACCGCAAACTTTGACGGCTTT TCCATAGAGTGAGACATTACTCTACTTATCAAAAATCCTTTTTAGCCTAG TTAAGACAAAACACGTTTTTTATAAGAACATCCAAAGTTATTGAAGCTTA CGGATGTTCTTAACTTTTTAAAATTTAAAATGTTCTTAAAATGTTCTATT TTCACCATTTTCTGAGTTTTCTTTGTGTAATTTCTTTTAAGAAATTGTGT GTTTTAGATCCCACAAAACCTTAGAATGTTGTTAAAAACTTATTCTTATA AATAAGACGTGTAAACAAGCGTGAGTCGGTTCTAACAACCATCCAAATTA AGTTATGCGACCCTCTGGAAGTCTTTTCAAGTTGGAAGCTTCAAAAAAGT TTACTCTTAAGCGGGCAAATATTGACTAGAGTCAATCGGATTAAACGATG GATTAGTTAATTAAAAATCGGGATAACTTTATTTTCCTTTCGCAAATCAT TTTGGTGTGAACCGAGCTTATTTTTAGAATTTTTCGCGGTTTTGATTTAT TTGTTTGAACGTGTCTTAGTTAAACCATTGTATTACGTCCTCTTCGAGTC AATTTTGAAACAATTTAATCTCTGTCTTTTCTCATGCTCAAATTCTTATA TCCGAATCTTTATTTCATGTTGCTGTCAGGACTTCTTCATTAATTGAAAA ATTATTTGATGTGTTCTTAATTATTGGATCGTTTCGAAAATACCTTATGC AATCTTTGGGGTCAGCGCTGATTTGAATTAATTGCCAAAGATTTTAACTC AAAAATATATTTGCCTGTTTTATTTAAAGAAAGGATAAATTGTTCTCTTT TTCACTGTTTATAAATTATTGAGTTTTTGGAAGGATTGAAGATAATATTG CGCCACAGCCCATTCTCCGCCTATAAAGTACGATCTTAAGAATATAAGAT AAGAATATAAGAATATATTGTGTTGTTGCTCCGAAAAAGACAGGAAATTA TTTTGGTACTGGGTGGGTATGTGTACGTGTGTGCACGTGAAATGTCATCG CGTCCCTTCATGAAGTTGTCAAACAAAGGCATTCTTGACAAATAGTGTCT GGTTAAAATTCTTTATTGAAGGTTTAATATTTCAAGTCTCAAAGTTTATG TAGGACCACAAGAAAAATGTTTATTTTTGCTTTTGAACTTTTCTTGACCC CGATGTATGATCACCACATAGAAATTATTTTGTGGAGTCGCAAAAAAATA ATAGAAGCGGTCTTCTTTATAGTGGACATTTAGGGATGGACCTAGCGGTT TTCATGATCAAAATGATATCGAAATATTTTCTTTTCAATGTTTTGTATTG TTGAATTTTTTTGATTGTTTTTCGAAGTTGTTTTGACGGGAGAAATTGGG GAACGGCCTTAAAGATATCGCTTAAGACTTACCATGAAAAATTAACAGGT CATTTACTTAGATACCATTAGTTACCCTGTTAGTACAATCATTGACAAAA CCTATGGCATTAAGCCCAAAAATGAGTTCCCTCCCCCTCTCTCCCCCAAA CAATGTTGCCGGAGGGGGCTAAAGACCGGCCAAGCAATATTTCTTTCCCA 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GAGGCTAAAACTTTGGGGCAGGCTGGAGACTTCAAAAATGATCGGGTTTG GTTGAAATTTGGCACACTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGGGGTGTTTTT TCTCATTTTTCGAAAATTTTCATTTTTAAGGGCGTGGTCACGAGGTTTTG CCAAAACGAGGCTAAAACTTTGGGGCAGGCTGGAGACTTCAAAAATGATC AGATTTGGCCGAAATTTTGCACACTTGATACTTGGGCGAATCCCTGGTGG CGATTTTTTCATTTTTTCAAAATTTCCATTTTCAAGGGCGTGGTCACAAG TTTTCGCGAAAACGAGGCTAAAACTTTTAGGCAGGCTGGAGACTTCAAGA GCTAATCCCTGTGGATGGTTTTCATTATTTTATAATTTCCATTTTAAGGG GGTGGTCATGAGTTTTTAGTTAAAATTGGTTACAATTTTACAATTGGGCC TACGAATGATTTAAAAACACTGAAGTTGAGCCCAGTGCGGTTAGCACGTT CGACAGTATGACATTGATAATTAATAAAAACACCTTTGAAAGTAATCTTT GTTTAAAACAAGACTAGTTTTTATAAAAATTGGCGCTTTCATAGATTTTT TTCAAAAACTGTATATCAAAAACGTCTAAAAATACCAAATTTGATACCCC TTTTTTACGTGTTTTTTACACTTTCCGCAAAGTGAATTTTGACTTTAAAA GCTCATAAGCAGAGAACAATTTGGTCAAATTTAAAAAGTGATAGCTCAAA TTTTAAGTAAGGTGTCTACTTTCTAAATATCAAAACTCCAAGCACTTTGG GACATTTGTTCGGCCTCAAGACGTCGGGAAACGTCTGAACTTTTTCGTGG GTCACCCGGTAGGTTTCTTTCGTTGTCGCTATAAAAAATCTGCATAATTA GCGTGTTGTGACAAAATTCTTTTGTTTCAAGCCTGATTATGCGCAAACTT TTAGGGCTTATATTTTGGGTACACCTCTCCTATACGAAAAGGTACCTATA TCTTCTTGCTCAGAATTTCCTAGTGATTCTACTGATATAACCGCATCTTG ACTGCATCATTATATGGAAAGCTAGAGCGCGAGAAAATTATAACTTCATC TTGATTTTACTCGACTTCTGACTGTTTTACAAGAACCAATTTAATATCAT TGCGTTAAGAATTTCTTTTGCTATACATTGGTAAAAATATTGCTCCTTAT TCTTAAAAATTGAACTAGTAATCAGCGAAAAAGGAAAAACATTTTATCGT CGAATCATGTAGAAACCGTCCGATTTGTATGGCGAGCCGTCTTTTCTGGA CTTTCATTTAATGACCTAATCAACGTTTTTACAATAGAATTTTCAATAGA AGTGATCGTTGAACTTTGAGTAATCAGAAAAGCTGTTTTTCCATCTCTTT ACATTCCTCTGGTATGCCCCAAGTGAAGTCTTAGCCACAATGCAGTGTAA ATAGAACCTGTAGTTACCCTTGCAGCTTTTCCATGACCTTCTAAATAGAT TAAGAACGCCATGTGCTTTTCCCAAATGTACAAATATAGACATTTTTTTA AAAAGTGTCATGCCAATAAGGAAAAACAAAGGATATTTTCAAGTTCCTCG GTCACCCTTTGTAAACGATTTCAAGTGAAATATTTATGATAAATAAAAAC ATGTCTCATCTGTGGTCTAAGCTCGCTGCATTTCTTGACCACTAAAACCA CTTGTGAAGTTTGACCGTTAAAACACTCTTTTCCGCTCATCCACTCTCCT TAAATCCTCGCTGTTGTCAACAATGTTTTGAGCATAAATAGAATCTTCAA CAATCTGATGCCAAATTATTCGGCAAACTTCTTACACATTTTCTAACTGT TGGTAGCTCTTTTTGAAGTTCCTTGTCCATGTCGCCAGATCTCACCAGTT TTTGCTGCTCTCGTCTGACACCTGTCCAGCTCTTCCTATTTTTGTAACTT CAGATGTAAAAGACCGCGCAAACATTTGCGTCATACTGAAGTTTCCGTCT TGCGTATGGAAGACCACTATAAACTCGAGATTTAAGAACAGGATTAGGAT AAGACAATGATTTCTGCTGGTTAGAGAATTTCTCACACCTAAACTTAGCG ATAATAAATTACTTCCTTTTTAATTTAGGAATTATGTATCGATAAATTCA TTAGTGAGTCTTGCGCTTTAGGTTCGATGATTTATTTTATATCCTGAAAC AAAGTGTAAACGCTTTAAAAGTGTTTAATGTGAAGCTCTATTATCCTGTC GATCTGACAGTAGTAGTGCAGGAGCCCCTGTGGCCGATTCTTAAAATGTC TTAAAGTTTCCTGAAATTCCAGCCCGCAGCTATTTTCAGGAAATTTTCAG GTGTAGTCCCCCCCTAGGGCAGGGTGCTGGAGCTATGTAAACAATACCGG ACTGCTTATTTTCTTATTGTACGCTGCATACTAGCCTTATCATGGCATTT CAAACAGACAAAGGTTGTTGATAAGTTAGCAATTAGCATCAGTTAGGTTA GAAAAAACAGGCATACAGGAATAATTTAGTCTTAGCTACAATTTGTTTCC ATAACTAACTGAATTCCGGATTCAATAAATATTCGAACTTCCTGAAAATA TATATTTATGTTTGTTCTATTTAACGAATCTTAATGTATGATTCAACCAT AGGCTGAAGTGTCCGTACTGCCCGAAAGAGATGGACCCTCGTGATGCTAA ACGTATATATTTCTGATGGTCGATATGAAAATATCTACTAAAGATTGCTC AGCCACCTGTTGATCATTATTCGCCTCTTCAAATATATAATGATCAACTC TCAACGCAGGAAAAACGTAGACCTTTTTACGTTCACGAAAAAATTGTTTC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000110_pilon:423975..439769-

>MSTRG.13683.4.p1 ID=MSTRG.13683.4.p1|Name=MSTRG.13683.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=9600bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000110_pilon:423975..439769- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTGAAGTGTCCGTACTGCCCGAAAGAGATGGACCCTCGTGATGCTAAAC
GTATATATTTCTGAGTCGAGATAGACCTTGACAACGAATTTCGTTTCCAC
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ACCAATGAGATTAGTTTGTGGTCACGTGATCAGCAAAGATGCATTGCAGA
GGTTGTCCAATAGCAATAAAAATCCAATCTCTCATGGCATGTTTTGCCTT
CATGAAAACTGGTATGGAAAAATCTCCATACGCAGACCTCTTTGATGACT
CGTTATGGGTGGAAACCAGTGACCTGTTAGCTAAGGACGCATGCGCACTT
CTCGGTCTGCCCAAATGCAGTCCACTCGAAGTGAGTGTATCAGTTGGGTG
CACAGCGCTACCATCTTTACTACAGATCAGACAAGTCATGCAACAGAGAC
AGGTGGAGGGGATGTGGAGTGCCAAAGAAGAATTACCGCTGGGCAGTCAG
TCATCACGAAGAGCTAAAATCCATGCATAGCGAGTTGGAATTCAAACTAC
ACAAACTGAAATTTCTTACACTACTCCGCAGTGGATTTTTCAAAGAAGCG
CTGTATTACTCAAGGAAACTTTCGGCGTTCGATGGCCATTTAAAAGGAGT
CGGAACTATCGTTGCCACCGAACAGTGAATATGCTTTCAATGAAATCAAC
ACAATACTTAATGCATTCAGAGAGAAAAATATTGAACCAGCACTGAGAAT
TTCACATCAGAGTTTGGTGGGACAACACAAGAAGATATTTTCAGTGGCGA
TGCCAGGGACCTTTTAAATGAGGCTATTGTTGAGCACTTGATGAGACAGG
GACAGGAAGAAACGGCTAACAAATTGATAGAGAAAATGGTATGGAGGATA
CGTTGCAAGGGCTTCCACTCCACTCTCTTGCTGCTGCTTCCAAACGAGTG
AAAGAGGAAACCAACAAGGTTGCATTGGAACATAAAGAATTACATGCCTA
CGTCTCTAAAGTTGGAAAATCGATCGATAGAATGATTGAAAGAATATTAA
AAGGAATTAAAACAATGGATGCTTTGCAAGCTGTGGACAAAGAAGAGAAA
CGCTTGAGAACAAAGATTGAAAGTTGCCAGAAAAATCTAAACAAATATTT
AGATGGTTTAATTGAACATGTTCAAACTCTACGGAACGACTTTGCTGAGG
GCTGAAGTGTCCGTACTGCCCGAAAGAGATGGACCCTCGTGATGCTAAAC
GTATATATTTCTGAGTCGAGATAGACCTTGACAACGAATTTCGTTTCCAC
TCCATTTTCGCATGTCCCATATTACGTCAGCAATGCGGTCGCACCAATCC
ACCAATGAGATTAGTTTGTGGTCACGTGATCAGCAAAGATGCATTGCAGA
GGTTGTCCAATAGCAATAAAAATCCAATCTCTCATGGCATGTTTTGCCTT
CATGAAAACTGGTATGGAAAAATCTCCATACGCAGACCTCTTTGATGACT
CGTTATGGGTGGAAACCAGTGACCTGTTAGCTAAGGACGCATGCGCACTT
CTCGGTCTGCCCAAATGCAGTCCACTCGAAGTGAGTGTATCAGTTGGGTG
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AGGTGGAGGGGATGTGGAGTGCCAAAGAAGAATTACCGCTGGGCAGTCAG
TCATCACGAAGAGCTAAAATCCATGCATAGCGAGTTGGAATTCAAACTAC
ACAAACTGAAATTTCTTACACTACTCCGCAGTGGATTTTTCAAAGAAGCG
CTGTATTACTCAAGGAAACTTTCGGCGTTCGATGGCCATTTAAAAGGAGT
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ACAATACTTAATGCATTCAGAGAGAAAAATATTGAACCAGCACTGAGAAT
TTCACATCAGAGTTTGGTGGGACAACACAAGAAGATATTTTCAGTGGCGA
TGCCAGGGACCTTTTAAATGAGGCTATTGTTGAGCACTTGATGAGACAGG
GACAGGAAGAAACGGCTAACAAATTGATAGAGAAAATGGTATGGAGGATA
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AAAGAGGAAACCAACAAGGTTGCATTGGAACATAAAGAATTACATGCCTA
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AAAGAGGAAACCAACAAGGTTGCATTGGAACATAAAGAATTACATGCCTA
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AAGGAATTAAAACAATGGATGCTTTGCAAGCTGTGGACAAAGAAGAGAAA
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AGATGGTTTAATTGAACATGTTCAAACTCTACGGAACGACTTTGCTGAGG
GCTGAAGTGTCCGTACTGCCCGAAAGAGATGGACCCTCGTGATGCTAAAC
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13683MSTRG.13683Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13683.4.p1MSTRG.13683.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13683.4.p1.exon8MSTRG.13683.4.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.13683.4.p1.exon6MSTRG.13683.4.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13683.4.p1.exon5MSTRG.13683.4.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.13683.4.p1.exon2MSTRG.13683.4.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13683.4.p1.exon1MSTRG.13683.4.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000110_pilongenomesc0000110_pilon:423975..439769 -