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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000110_pilon:95219..102400+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13669.2.p1 ID=MSTRG.13669.2.p1|Name=MSTRG.13669.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7182bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000110_pilon:95219..102400+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGGACCAACTTGTATGATTATCTatgtctatttttttttttttactcatt
AGTTAAGAAAAAGATGAAATCTTTTAACATTACTATAATACATTGATGAA
AATATGGAATGAGTAATGGATATGAGCCAATTCAAGATCATCATTGCTTA
AACATTTTCCAGTAATCACCTGTACGATAGAGAAATGTCGGGTATGTATT
CTTGATAATAgtgtaaattttgaaattatgaagTCTTGCCCAAAACATTT
CCTTTCTATCGCTTTCAAGAGTTTTGAGATATTCTGCATGTAAATTCCTC
TGAATcaatttctacttttttttcCGAAATAAAGATCTTCAATCAAGTCA
AGCTATTATCTTTTAGCAAGAAAAGAAGTTAATAGGCAAGAACCTATTGG
ACCCAGAGAAGGGGGTTGGACCCAGAGaagggggtcagtactaaaatctc
agacttATATAATGAAGACTAAAAGAGCAAGTTTCCCTTTTAAACCAACG
TTTTGGTATTTTATTATCAAATGATACTAAAATACTTGCAAGACTAATTC
ACCACGTGACTAAACGTCATGAtatctgagattttagtactgacTCTACT
CCCCTGTTTAACATAATAAAATGAGAAATATCTACATGATTCTCTGGTAA
TATctaattcatattttttttactgtttaAAGGCTGGTTGTTAAAACAAT
TAGTACCAACGGATGAAAATCCCATAAGCCGTGATGTTAAAGATGTTGTC
GCGATGAATTTGAATGTTGACTGGAAGAAATTTGCATACGGAATTATGTC
AGATCAAGATATAGAAAGAATTGACCTTGACAATAGAACTGTATATGAGA
AATGCTTTGAAATGTTGAACAAATGGACTGAATCGAACCCTTATGAAATA
ACAAATGCCATATTGAAACTGAAATTAAATGAAATGCAGAGAAGAGACAT
TCTAATGGACATTGCTGACAGTAAGTGATAttattgagttttaagccctg
aaaggggctagagatgaatattcaacctttttcaagcatgaaaaagtgaa
aaccTTAAGATTTGCTCCGCATTtcgaaattttgtttgaaaaacacacgg
GTCACGTGTTTAGGATAGGAAATAAGTATCTTCATCTCCAGAACTTACAT
ATCACAATTAATCTGCAATGGGGAAAACTCTCTAAAAAGAGAGTAcgcgt
ttttttaagaaactagtttaccaagcagcctcaacgtttcttaagaaatc
ggccttttgagccttaaaaatgtttcttacatgtttctaaacttttttac
aTAATCAGCCtgtttttcatgcaaagaaaaaaaaaacatttgttttgatt
ggaaggttcttaaaaacaACCGAATTaagaaatgttattttctcattctc
agcctcagcatgtttcttattttttaggcattctgagcctcgtgtttctt
aaaagtgtgtttcttaaaaataaaaaaacgtgtaacgcCTCAATACCAAC
ATCACATTTATTATTACCCACTCTTGTGTTTCGgttctacaatcagtgac
aaaatacttggcacaaaagggaaattcaccggggtgttttgaaaccacaa
tcgatttgtaagtgctctaaagtaggttcgaagggtagagttttaactct
gagttttaacgctagacttaaggcttaggaccttaggatctgaggatcca
aaagttcaaaaatggtctagtagggcttgaaatatagcctagaaaccaat
aaatccctcccagatcgaaataatcgacgaaattaagttgaaggcctgaa
attgacattctcgctcgaacttcaattttcgaaaaatggtaaattagcca
aaagtgccaatatattatggcactgattgtagctcCTTCAGGGCTTTGAA
AACACTATTTACTCtactgttttattttgaatttaaagtctGTGGATACT
GTACACGTAAAAAtgtatacaccgttggaaagatttttttggaggcaaag
atttttgagaaattgaaaattggagATGAAATAAATGAAGATAGACAGGT
TCAGTCAGACTTAAGAAATACAATATGGCTCCCAATATTTGACAATAAGG
TTCTGCCCGTGAGGGAGTAGGAGTGACATTATTGCCAACCATTACAATCT
GTCTAACATTGACTTGCATTGACAGTTCAACAACACTGTAGTAACCATTT
TCTCAAAGGactatttccaaatttttcttaCAAATAGAACTATTGCTACA
CTCCTGATATTGGtatttataatctgatgtatacaggataCAGGATACAG
GACAAAGATACAGGATGTATACGGGTTTGATCCGCGAGTACAATTTTGGA
CTAAATTAAATAAcctggaaatttcgaatttagCGCTATCGTCACTTACT
AAGTtagaaaacaaatttcaaataacATAATTCCATTCATTTGTTTATGA
GAAAAGAAATTATAACATGGCTATGACCCTTCCTTCCCTGTGCACAGGCT
AAAATTGCTCCTTGATTTATATCTATATTTTAGTATCTTTTATTATCCAT
TGGAAACCACGATAGTCTAGTTTGCACAATAGACAACACAATAGACAGCT
ACAGatttttaggccttactcttgagtaggagttttacgctcgaaacgaa
ggaagatatgacgtagcctaagaTTGTCATATTATGTATGCTTCTTAGAA
TTTAATAGAGGAATGTTTACATACCGTTGGTTaaaaaaaTGTGATTATAA
TATTAGTTTTGTACTTGTGTTATGTCAATGTATAATAAGTTTGAACATGC
ATACACGGATGCTCTAActattttgtcaacttttttaattactcATGACA
TTCGGCTTTTTCTGAGAAATAGGAAagtcaaaaatgaaattcaataaTTC
AAAGGAATCtatatgatgaaaaaaatggtcGAAATACTTATCAATCATGG
AATGTAGGCCTTTATGTAGTGTTGTCTATTccttcatattttttttaaag
accaAGTATAAgttgtggtttgttgctgtttgtgtaaagtagtgcatttt
gttgttgttttgttgttggtgtttacttaggattttggtttaattaatgt
tgtttttCGAAGGGTGctatatgaaaaagaaaagttttagtTATAGAAAA
CTGTTAACTtcgtggcttcactttttttctgGCCATACATAAGGTATCAT
TCAGTAGCAAAAACACCATCaaataagaaatatacaaaCACAACACAATA
AACATAGACGGCCTAAGATCTTTTTATATCGTCCAATATATATAAGGTAT
CATTCCATACAGCACGCTTTTTTCTCACCATTTTAGAGGTTCCATCTTTT
GGGAGAGTGAAATTTCCAGACGAGCCTACCAGAAGTTATGAGGAGCCGAG
acaaccgcaacaaccacaacaaccgcaacaaccgcagcagccagcaaggc
aaGAGAACCTTTATGAGAGAGATGGAGGTAATAAAGGTAAAATATAATGT
GATATGGAAAATTGCATGTTAATTGCAAATATTAATTACATATTCTTAAG
GAGCGAtagccaagtggtcaaaggcgtcagcgtttCAAACTAGGGATTTG
TGTTTTGTCGccccttccaatgttccgttcagctcatagatagccgagcc
ggctagCCGTGGccccgtgaaaacaattgaaTAACTTCTGAAAGTtatag
attactgggctatccacgttaaATATCGACTCTGTCTATCTATCTATGTC
TCTATTTGTTTTATATAATGTTCTTTTCATATTTATTTATACTGTCGACC
CCTCATTTAATGCAGATAatacccggggggtactaggtttgcgaggtgac
gggtatgtccgagccgaaaatcgaaaatcgaccctttgagagacaaaatt
ttggtgattttgggaccctttgagagactttttcctaaattttggtccat
tttttcaaattttggtttgattttcaccaaattttagtcaaaattcttgg
aaatcgtgaccctttgagagagaaatttttgatttttgtgattttgggac
cctttcagagactaacttttgaatttgtacccctttgagagacttttgag
gaatgagaaaaggtacccttatggctcacacatacccggcacccattttg
cctaagtaccccccccccccgtgagATAATGTTAGTTAGAGGTGTCTTAA
AAGTTCAGGGGTAATTCTCAATCAATCTGTTCTATATCCgttactttttt
cttatttagttATACAGTGACCCCCCTCCCCTCTCTGAGCAGACAATTTT
GAAATTGACTAAAAAGTTCTGGAGTTATTCAATCCATGATCaatcatttt
tagaaatatatCTCAATCTAGttttttgtcaacatttttgtcaacatgat
ccaatttctttgcaaattgttgcatttgtttttCTACTCGATTCTTTCCA
GTATTAAAGTGTCATGGGCAaccctggaaaaaaatatcaggagttaaaat
caaaaagatatGTTGTAAATTATCATCTATAAGTTTCCCAAAGTTGACGT
TGTTAACTACAGTACAAATACATTGCCTTTGAACCATTGCCTTTTAATTA
ATGAACCCATTTCAATGTTGATTATTGTAAATAAGTTGTCTAGCCTAATA
GACTAATGAGTGGTTAAGCGATTATTAacataaaagaatttaaattcaAT
GCTTTTAGAAGTGTTTTAACATAATGATAAAGCTTACCGaaaaaaaTTAT
CATGCGTCGATTTTAAAGTACTGTACTACGTTGCTTTTTGCTTTCAATTT
TATGTAtgttgaaaaacttgaaatttaggAACATAATGTTGAAAATAGGC
AGTAGAGACTTTGTCAAACATTTCAGCTGAAAGAATTGGAATGTTTGTTG
TGGAAGGGGGTTGAAGTTTGAATGTATGAAATTTTAGTTTTCTAACTTTA
TAAAATGACTGTTCCATAAACTACTGTgttgttttctttgtttctttttc
ataaGAGTTTTACGTGACTGATCTGTCCTTAAGAGACACCGATGAACTGG
CAACCAAGCTAGATGTCACTTACGGTGCTGGTATATCAAACTGGAAGAAT
GTTGCTCACGAACTAATCGGCCGAGATTCAGAGCTattttatcaaatcaa
agaCTTAGACCTGCATTATTATGGAGGGGGAAATCCAgcattggaatttt
ttaaacagtTAGCTATGAAAGAACCTGATGTCACTATCCGGCAATTCCAA
AGTATTTGTAAAGAATTTCAGAGAATGGATATGTCGCTTTACATCGATCA
AAAATTAAGTAATAATCTGGACGGGTTTGTACGAGATTTGCAGAGTCAGC
ACAAAGAACGACTAGCGAGTTACATGAATTTAAATATACCAGGTGTTTAT
GACTGGGAAATGTTTGCTGACGAATACGGTTTCAATAGacaacaaattaa
tttgatGCGAGCAGCTCTTAAAGAAGGTGGCAGTTTTAGTCCGACCAAAA
AATTGGTTGAATTGTTACAACAATCAAGACCCTTGACAACTCTTGATGAA
ATCAAAAGAGCATGCGCTAAACTGGGTCGGAATGATGTCGTCCTTGTATT
GAATAAAGCGAttgagaaaaagaaacaaaggaTGACGTAATGTTTGTCCG
ATTTGCTTTAGTTAGAGGAGATTACTACGGGGTAGCGAGCACTCGCCAAC
GGAAAAGGATTATCTTCCCATAGGTAAGACACTTGAACCTCCACTGTTAG
AGACCACCTTATCAACGGTTACCTTTAACTGCGAAGAGTTTCAAAGCGTG
CTAACTGCAAATGAGTatgaataattttgatttttcattgtCAAACCATG
CGATACTTAACATTAGATTTTGACCATTATAAACTTCTATATCTTTTCTG
TTACACATTTATGCACAATCAGCCTTTTGGTAACCTATCGTACATTAAAA
GACTGTTGTACTGCAAGAAATTGCTTAAGTTTTGCTTAGGTTTTACTTTC
GAAGAGGGCCATTtaaaggcctgtttccatcgatcgcgcgagGGTGCACG
CTAGgataaaatttcctaaaatagccTATTGACGTCacgaattaaatttt
cttgtacacaaaaagtgtacgctcttgtacgcttttgtgctcttttctac
gctgaaaattttcaacttttttgagcgtACAGGAGCGCACATctcaattg
acaattttttaaccaatcaagaAAGCGAAAAActgctgagtaaacaaaaa
aatgtaaacatacagattgtgtatgttttttatggaaatcaaacattgat
cGCGCGGAGTGTGCGGCCAaatctattttaagaattttggcctagcgtgc
acgctcgcgcgatcgatggaaacaggccttaaagcgtgtccggaaaaaaa
aagAGGAACAGATTTATGTATTATAAGTATTTATCTttatatataaagta
aaatctttatgtaatagttatcggacagttgcgagtacaatatgagaaat
attttacgagttcccagattttccgtacaatattttccgagcctttaggc
gaggaaaatatacggaaaatccggaacgaataaaatatttctcatattgt
acgagcgtcaatttatatttaatttaatatttaaaggttttgtttttaaa
taagagttgTTTACTCatcaagctttttcacattggattgacagggatgt
ggagcaagattggtcagaaaaaggaaaagaaactgCTTATaccagcataa
tataacaataggcagacactttcctgatatgaaatatgtttctgatatga
aacgggaacatttatgtaaaaataaaacctttaatcaaATATCTACTGAT
TGAAcgaaacaaaatttcattttattatgaTAAATTCAAACTCCAATGAT
TttgataattgtttttttattttgttccaCATTTTTCCGGACACAACTCa
tagaaaaacatcaaaaagcttacattctttttataagcatttcaCTTATA
TGCATCGCACTTTTGTGTATATCTAGGCTCAGAAATTCAAGCTTATGTGA
AGCATTTACCCGAGcctaaatttttcgattttggctattttttgctggaa
ttttacggattttttcgaattttcctaagattttgcttaatatttAAACA
TCCTTCTAGTATTTTTTAGCCTTGTCCGGTTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000110_pilon:95219..102400+ >MSTRG.13669.2.p1 ID=MSTRG.13669.2.p1|Name=MSTRG.13669.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4284bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000110_pilon:95219..102400+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGGGCTGGTTGTTAAAACAATTAGTACCAACGGATGAAAATCCCAT
AAGCCGTGATGTTAAAGATGTTGTCGCGATGAATTTGAATGTTGACTGGA
AGAAATTTGCATACGGAATTATGTCAGATCAAGATATAGAAAGAATTGAC
CTTGACAATAGAACTGTATATGAGAAATGCTTTGAAATGTTGAACAAATG
GACTGAATCGAACCCTTATGAAATAACAAATGCCATATTGAAACTGAAAT
TAAATGAAATGCAGAGAAGAGACATTCTAATGGACATTGCTGACAAGGTT
CCATCTTTTGGGAGAGTGAAATTTCCAGACGAGCCTACCAGAAGTTATGA
GGAGCCGAGacaaccgcaacaaccacaacaaccgcaacaaccgcagcagc
cagcaaggcaaGAGAACCTTTATGAGAGAGATGGAGAGTTTTACGTGACT
GATCTGTCCTTAAGAGACACCGATGAACTGGCAACCAAGCTAGATGTCAC
TTACGGTGCTGGTATATCAAACTGGAAGAATGTTGCTCACGAACTAATCG
GCCGAGATTCAGAGCTattttatcaaatcaaagaCTTAGACCTGCATTAT
TATGGAGGGGGAAATCCAgcattggaattttttaaacagtTAGCTATGAA
AGAACCTGATGTCACTATCCGGCAATTCCAAAGTATTTGTAAAGAATTTC
AGAGAATGGATATGTCGCTTTACATCGATCAAAAATTAAGTAATAATCTG
GACGGGTTTGTACGAGATTTGCAGAGTCAGCACAAAGAACGACTAGCGAG
TTACATGAATTTAAATATACCAGGTGTTTATGACTGGGAAATGTTTGCTG
ACGAATACGGTTTCAATAGacaacaaattaatttgatGCGAGCAGCTCTT
AAAGAAGGTGGCAGTTTTAGTCCGACCAAAAAATTGGTTGAATTGTTACA
ACAATCAAGACCCTTGACAACTCTTGATGAAATCAAAAGAGCATGCGCTA
AACTGGGTCGGAATGATGTCGTCCTTGTATTGAATAAAGCGAttgagaaa
aagaaacaaaggaTGACGTAAATGTCGGGCTGGTTGTTAAAACAATTAGT
ACCAACGGATGAAAATCCCATAAGCCGTGATGTTAAAGATGTTGTCGCGA
TGAATTTGAATGTTGACTGGAAGAAATTTGCATACGGAATTATGTCAGAT
CAAGATATAGAAAGAATTGACCTTGACAATAGAACTGTATATGAGAAATG
CTTTGAAATGTTGAACAAATGGACTGAATCGAACCCTTATGAAATAACAA
ATGCCATATTGAAACTGAAATTAAATGAAATGCAGAGAAGAGACATTCTA
ATGGACATTGCTGACAAGGTTCCATCTTTTGGGAGAGTGAAATTTCCAGA
CGAGCCTACCAGAAGTTATGAGGAGCCGAGacaaccgcaacaaccacaac
aaccgcaacaaccgcagcagccagcaaggcaaGAGAACCTTTATGAGAGA
GATGGAGAGTTTTACGTGACTGATCTGTCCTTAAGAGACACCGATGAACT
GGCAACCAAGCTAGATGTCACTTACGGTGCTGGTATATCAAACTGGAAGA
ATGTTGCTCACGAACTAATCGGCCGAGATTCAGAGCTattttatcaaatc
aaagaCTTAGACCTGCATTATTATGGAGGGGGAAATCCAgcattggaatt
ttttaaacagtTAGCTATGAAAGAACCTGATGTCACTATCCGGCAATTCC
AAAGTATTTGTAAAGAATTTCAGAGAATGGATATGTCGCTTTACATCGAT
CAAAAATTAAGTAATAATCTGGACGGGTTTGTACGAGATTTGCAGAGTCA
GCACAAAGAACGACTAGCGAGTTACATGAATTTAAATATACCAGGTGTTT
ATGACTGGGAAATGTTTGCTGACGAATACGGTTTCAATAGacaacaaatt
aatttgatGCGAGCAGCTCTTAAAGAAGGTGGCAGTTTTAGTCCGACCAA
AAAATTGGTTGAATTGTTACAACAATCAAGACCCTTGACAACTCTTGATG
AAATCAAAAGAGCATGCGCTAAACTGGGTCGGAATGATGTCGTCCTTGTA
TTGAATAAAGCGAttgagaaaaagaaacaaaggaTGACGTAAATGTCGGG
CTGGTTGTTAAAACAATTAGTACCAACGGATGAAAATCCCATAAGCCGTG
ATGTTAAAGATGTTGTCGCGATGAATTTGAATGTTGACTGGAAGAAATTT
GCATACGGAATTATGTCAGATCAAGATATAGAAAGAATTGACCTTGACAA
TAGAACTGTATATGAGAAATGCTTTGAAATGTTGAACAAATGGACTGAAT
CGAACCCTTATGAAATAACAAATGCCATATTGAAACTGAAATTAAATGAA
ATGCAGAGAAGAGACATTCTAATGGACATTGCTGACAAGGTTCCATCTTT
TGGGAGAGTGAAATTTCCAGACGAGCCTACCAGAAGTTATGAGGAGCCGA
Gacaaccgcaacaaccacaacaaccgcaacaaccgcagcagccagcaagg
caaGAGAACCTTTATGAGAGAGATGGAGAGTTTTACGTGACTGATCTGTC
CTTAAGAGACACCGATGAACTGGCAACCAAGCTAGATGTCACTTACGGTG
CTGGTATATCAAACTGGAAGAATGTTGCTCACGAACTAATCGGCCGAGAT
TCAGAGCTattttatcaaatcaaagaCTTAGACCTGCATTATTATGGAGG
GGGAAATCCAgcattggaattttttaaacagtTAGCTATGAAAGAACCTG
ATGTCACTATCCGGCAATTCCAAAGTATTTGTAAAGAATTTCAGAGAATG
GATATGTCGCTTTACATCGATCAAAAATTAAGTAATAATCTGGACGGGTT
TGTACGAGATTTGCAGAGTCAGCACAAAGAACGACTAGCGAGTTACATGA
ATTTAAATATACCAGGTGTTTATGACTGGGAAATGTTTGCTGACGAATAC
GGTTTCAATAGacaacaaattaatttgatGCGAGCAGCTCTTAAAGAAGG
TGGCAGTTTTAGTCCGACCAAAAAATTGGTTGAATTGTTACAACAATCAA
GACCCTTGACAACTCTTGATGAAATCAAAAGAGCATGCGCTAAACTGGGT
CGGAATGATGTCGTCCTTGTATTGAATAAAGCGAttgagaaaaagaaaca
aaggaTGACGTAAATGTCGGGCTGGTTGTTAAAACAATTAGTACCAACGG
ATGAAAATCCCATAAGCCGTGATGTTAAAGATGTTGTCGCGATGAATTTG
AATGTTGACTGGAAGAAATTTGCATACGGAATTATGTCAGATCAAGATAT
AGAAAGAATTGACCTTGACAATAGAACTGTATATGAGAAATGCTTTGAAA
TGTTGAACAAATGGACTGAATCGAACCCTTATGAAATAACAAATGCCATA
TTGAAACTGAAATTAAATGAAATGCAGAGAAGAGACATTCTAATGGACAT
TGCTGACAAGGTTCCATCTTTTGGGAGAGTGAAATTTCCAGACGAGCCTA
CCAGAAGTTATGAGGAGCCGAGacaaccgcaacaaccacaacaaccgcaa
caaccgcagcagccagcaaggcaaGAGAACCTTTATGAGAGAGATGGAGA
GTTTTACGTGACTGATCTGTCCTTAAGAGACACCGATGAACTGGCAACCA
AGCTAGATGTCACTTACGGTGCTGGTATATCAAACTGGAAGAATGTTGCT
CACGAACTAATCGGCCGAGATTCAGAGCTattttatcaaatcaaagaCTT
AGACCTGCATTATTATGGAGGGGGAAATCCAgcattggaattttttaaac
agtTAGCTATGAAAGAACCTGATGTCACTATCCGGCAATTCCAAAGTATT
TGTAAAGAATTTCAGAGAATGGATATGTCGCTTTACATCGATCAAAAATT
AAGTAATAATCTGGACGGGTTTGTACGAGATTTGCAGAGTCAGCACAAAG
AACGACTAGCGAGTTACATGAATTTAAATATACCAGGTGTTTATGACTGG
GAAATGTTTGCTGACGAATACGGTTTCAATAGacaacaaattaatttgat
GCGAGCAGCTCTTAAAGAAGGTGGCAGTTTTAGTCCGACCAAAAAATTGG
TTGAATTGTTACAACAATCAAGACCCTTGACAACTCTTGATGAAATCAAA
AGAGCATGCGCTAAACTGGGTCGGAATGATGTCGTCCTTGTATTGAATAA
AGCGAttgagaaaaagaaacaaaggaTGACGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000110_pilon | genome | sc0000110_pilon:95219..102400 + |
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