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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000110_pilon:95219..102400+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13669.1.p1 ID=MSTRG.13669.1.p1|Name=MSTRG.13669.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7182bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000110_pilon:95219..102400+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGGACCAACTTGTATGATTATCTatgtctatttttttttttttactcatt
AGTTAAGAAAAAGATGAAATCTTTTAACATTACTATAATACATTGATGAA
AATATGGAATGAGTAATGGATATGAGCCAATTCAAGATCATCATTGCTTA
AACATTTTCCAGTAATCACCTGTACGATAGAGAAATGTCGGGTATGTATT
CTTGATAATAgtgtaaattttgaaattatgaagTCTTGCCCAAAACATTT
CCTTTCTATCGCTTTCAAGAGTTTTGAGATATTCTGCATGTAAATTCCTC
TGAATcaatttctacttttttttcCGAAATAAAGATCTTCAATCAAGTCA
AGCTATTATCTTTTAGCAAGAAAAGAAGTTAATAGGCAAGAACCTATTGG
ACCCAGAGAAGGGGGTTGGACCCAGAGaagggggtcagtactaaaatctc
agacttATATAATGAAGACTAAAAGAGCAAGTTTCCCTTTTAAACCAACG
TTTTGGTATTTTATTATCAAATGATACTAAAATACTTGCAAGACTAATTC
ACCACGTGACTAAACGTCATGAtatctgagattttagtactgacTCTACT
CCCCTGTTTAACATAATAAAATGAGAAATATCTACATGATTCTCTGGTAA
TATctaattcatattttttttactgtttaAAGGCTGGTTGTTAAAACAAT
TAGTACCAACGGATGAAAATCCCATAAGCCGTGATGTTAAAGATGTTGTC
GCGATGAATTTGAATGTTGACTGGAAGAAATTTGCATACGGAATTATGTC
AGATCAAGATATAGAAAGAATTGACCTTGACAATAGAACTGTATATGAGA
AATGCTTTGAAATGTTGAACAAATGGACTGAATCGAACCCTTATGAAATA
ACAAATGCCATATTGAAACTGAAATTAAATGAAATGCAGAGAAGAGACAT
TCTAATGGACATTGCTGACAGTAAGTGATAttattgagttttaagccctg
aaaggggctagagatgaatattcaacctttttcaagcatgaaaaagtgaa
aaccTTAAGATTTGCTCCGCATTtcgaaattttgtttgaaaaacacacgg
GTCACGTGTTTAGGATAGGAAATAAGTATCTTCATCTCCAGAACTTACAT
ATCACAATTAATCTGCAATGGGGAAAACTCTCTAAAAAGAGAGTAcgcgt
ttttttaagaaactagtttaccaagcagcctcaacgtttcttaagaaatc
ggccttttgagccttaaaaatgtttcttacatgtttctaaacttttttac
aTAATCAGCCtgtttttcatgcaaagaaaaaaaaaacatttgttttgatt
ggaaggttcttaaaaacaACCGAATTaagaaatgttattttctcattctc
agcctcagcatgtttcttattttttaggcattctgagcctcgtgtttctt
aaaagtgtgtttcttaaaaataaaaaaacgtgtaacgcCTCAATACCAAC
ATCACATTTATTATTACCCACTCTTGTGTTTCGgttctacaatcagtgac
aaaatacttggcacaaaagggaaattcaccggggtgttttgaaaccacaa
tcgatttgtaagtgctctaaagtaggttcgaagggtagagttttaactct
gagttttaacgctagacttaaggcttaggaccttaggatctgaggatcca
aaagttcaaaaatggtctagtagggcttgaaatatagcctagaaaccaat
aaatccctcccagatcgaaataatcgacgaaattaagttgaaggcctgaa
attgacattctcgctcgaacttcaattttcgaaaaatggtaaattagcca
aaagtgccaatatattatggcactgattgtagctcCTTCAGGGCTTTGAA
AACACTATTTACTCtactgttttattttgaatttaaagtctGTGGATACT
GTACACGTAAAAAtgtatacaccgttggaaagatttttttggaggcaaag
atttttgagaaattgaaaattggagATGAAATAAATGAAGATAGACAGGT
TCAGTCAGACTTAAGAAATACAATATGGCTCCCAATATTTGACAATAAGG
TTCTGCCCGTGAGGGAGTAGGAGTGACATTATTGCCAACCATTACAATCT
GTCTAACATTGACTTGCATTGACAGTTCAACAACACTGTAGTAACCATTT
TCTCAAAGGactatttccaaatttttcttaCAAATAGAACTATTGCTACA
CTCCTGATATTGGtatttataatctgatgtatacaggataCAGGATACAG
GACAAAGATACAGGATGTATACGGGTTTGATCCGCGAGTACAATTTTGGA
CTAAATTAAATAAcctggaaatttcgaatttagCGCTATCGTCACTTACT
AAGTtagaaaacaaatttcaaataacATAATTCCATTCATTTGTTTATGA
GAAAAGAAATTATAACATGGCTATGACCCTTCCTTCCCTGTGCACAGGCT
AAAATTGCTCCTTGATTTATATCTATATTTTAGTATCTTTTATTATCCAT
TGGAAACCACGATAGTCTAGTTTGCACAATAGACAACACAATAGACAGCT
ACAGatttttaggccttactcttgagtaggagttttacgctcgaaacgaa
ggaagatatgacgtagcctaagaTTGTCATATTATGTATGCTTCTTAGAA
TTTAATAGAGGAATGTTTACATACCGTTGGTTaaaaaaaTGTGATTATAA
TATTAGTTTTGTACTTGTGTTATGTCAATGTATAATAAGTTTGAACATGC
ATACACGGATGCTCTAActattttgtcaacttttttaattactcATGACA
TTCGGCTTTTTCTGAGAAATAGGAAagtcaaaaatgaaattcaataaTTC
AAAGGAATCtatatgatgaaaaaaatggtcGAAATACTTATCAATCATGG
AATGTAGGCCTTTATGTAGTGTTGTCTATTccttcatattttttttaaag
accaAGTATAAgttgtggtttgttgctgtttgtgtaaagtagtgcatttt
gttgttgttttgttgttggtgtttacttaggattttggtttaattaatgt
tgtttttCGAAGGGTGctatatgaaaaagaaaagttttagtTATAGAAAA
CTGTTAACTtcgtggcttcactttttttctgGCCATACATAAGGTATCAT
TCAGTAGCAAAAACACCATCaaataagaaatatacaaaCACAACACAATA
AACATAGACGGCCTAAGATCTTTTTATATCGTCCAATATATATAAGGTAT
CATTCCATACAGCACGCTTTTTTCTCACCATTTTAGAGGTTCCATCTTTT
GGGAGAGTGAAATTTCCAGACGAGCCTACCAGAAGTTATGAGGAGCCGAG
acaaccgcaacaaccacaacaaccgcaacaaccgcagcagccagcaaggc
aaGAGAACCTTTATGAGAGAGATGGAGGTAATAAAGGTAAAATATAATGT
GATATGGAAAATTGCATGTTAATTGCAAATATTAATTACATATTCTTAAG
GAGCGAtagccaagtggtcaaaggcgtcagcgtttCAAACTAGGGATTTG
TGTTTTGTCGccccttccaatgttccgttcagctcatagatagccgagcc
ggctagCCGTGGccccgtgaaaacaattgaaTAACTTCTGAAAGTtatag
attactgggctatccacgttaaATATCGACTCTGTCTATCTATCTATGTC
TCTATTTGTTTTATATAATGTTCTTTTCATATTTATTTATACTGTCGACC
CCTCATTTAATGCAGATAatacccggggggtactaggtttgcgaggtgac
gggtatgtccgagccgaaaatcgaaaatcgaccctttgagagacaaaatt
ttggtgattttgggaccctttgagagactttttcctaaattttggtccat
tttttcaaattttggtttgattttcaccaaattttagtcaaaattcttgg
aaatcgtgaccctttgagagagaaatttttgatttttgtgattttgggac
cctttcagagactaacttttgaatttgtacccctttgagagacttttgag
gaatgagaaaaggtacccttatggctcacacatacccggcacccattttg
cctaagtaccccccccccccgtgagATAATGTTAGTTAGAGGTGTCTTAA
AAGTTCAGGGGTAATTCTCAATCAATCTGTTCTATATCCgttactttttt
cttatttagttATACAGTGACCCCCCTCCCCTCTCTGAGCAGACAATTTT
GAAATTGACTAAAAAGTTCTGGAGTTATTCAATCCATGATCaatcatttt
tagaaatatatCTCAATCTAGttttttgtcaacatttttgtcaacatgat
ccaatttctttgcaaattgttgcatttgtttttCTACTCGATTCTTTCCA
GTATTAAAGTGTCATGGGCAaccctggaaaaaaatatcaggagttaaaat
caaaaagatatGTTGTAAATTATCATCTATAAGTTTCCCAAAGTTGACGT
TGTTAACTACAGTACAAATACATTGCCTTTGAACCATTGCCTTTTAATTA
ATGAACCCATTTCAATGTTGATTATTGTAAATAAGTTGTCTAGCCTAATA
GACTAATGAGTGGTTAAGCGATTATTAacataaaagaatttaaattcaAT
GCTTTTAGAAGTGTTTTAACATAATGATAAAGCTTACCGaaaaaaaTTAT
CATGCGTCGATTTTAAAGTACTGTACTACGTTGCTTTTTGCTTTCAATTT
TATGTAtgttgaaaaacttgaaatttaggAACATAATGTTGAAAATAGGC
AGTAGAGACTTTGTCAAACATTTCAGCTGAAAGAATTGGAATGTTTGTTG
TGGAAGGGGGTTGAAGTTTGAATGTATGAAATTTTAGTTTTCTAACTTTA
TAAAATGACTGTTCCATAAACTACTGTgttgttttctttgtttctttttc
ataaGAGTTTTACGTGACTGATCTGTCCTTAAGAGACACCGATGAACTGG
CAACCAAGCTAGATGTCACTTACGGTGCTGGTATATCAAACTGGAAGAAT
GTTGCTCACGAACTAATCGGCCGAGATTCAGAGCTattttatcaaatcaa
agaCTTAGACCTGCATTATTATGGAGGGGGAAATCCAgcattggaatttt
ttaaacagtTAGCTATGAAAGAACCTGATGTCACTATCCGGCAATTCCAA
AGTATTTGTAAAGAATTTCAGAGAATGGATATGTCGCTTTACATCGATCA
AAAATTAAGTAATAATCTGGACGGGTTTGTACGAGATTTGCAGAGTCAGC
ACAAAGAACGACTAGCGAGTTACATGAATTTAAATATACCAGGTGTTTAT
GACTGGGAAATGTTTGCTGACGAATACGGTTTCAATAGacaacaaattaa
tttgatGCGAGCAGCTCTTAAAGAAGGTGGCAGTTTTAGTCCGACCAAAA
AATTGGTTGAATTGTTACAACAATCAAGACCCTTGACAACTCTTGATGAA
ATCAAAAGAGCATGCGCTAAACTGGGTCGGAATGATGTCGTCCTTGTATT
GAATAAAGCGAttgagaaaaagaaacaaaggaTGACGTAATGTTTGTCCG
ATTTGCTTTAGTTAGAGGAGATTACTACGGGGTAGCGAGCACTCGCCAAC
GGAAAAGGATTATCTTCCCATAGGTAAGACACTTGAACCTCCACTGTTAG
AGACCACCTTATCAACGGTTACCTTTAACTGCGAAGAGTTTCAAAGCGTG
CTAACTGCAAATGAGTatgaataattttgatttttcattgtCAAACCATG
CGATACTTAACATTAGATTTTGACCATTATAAACTTCTATATCTTTTCTG
TTACACATTTATGCACAATCAGCCTTTTGGTAACCTATCGTACATTAAAA
GACTGTTGTACTGCAAGAAATTGCTTAAGTTTTGCTTAGGTTTTACTTTC
GAAGAGGGCCATTtaaaggcctgtttccatcgatcgcgcgagGGTGCACG
CTAGgataaaatttcctaaaatagccTATTGACGTCacgaattaaatttt
cttgtacacaaaaagtgtacgctcttgtacgcttttgtgctcttttctac
gctgaaaattttcaacttttttgagcgtACAGGAGCGCACATctcaattg
acaattttttaaccaatcaagaAAGCGAAAAActgctgagtaaacaaaaa
aatgtaaacatacagattgtgtatgttttttatggaaatcaaacattgat
cGCGCGGAGTGTGCGGCCAaatctattttaagaattttggcctagcgtgc
acgctcgcgcgatcgatggaaacaggccttaaagcgtgtccggaaaaaaa
aagAGGAACAGATTTATGTATTATAAGTATTTATCTttatatataaagta
aaatctttatgtaatagttatcggacagttgcgagtacaatatgagaaat
attttacgagttcccagattttccgtacaatattttccgagcctttaggc
gaggaaaatatacggaaaatccggaacgaataaaatatttctcatattgt
acgagcgtcaatttatatttaatttaatatttaaaggttttgtttttaaa
taagagttgTTTACTCatcaagctttttcacattggattgacagggatgt
ggagcaagattggtcagaaaaaggaaaagaaactgCTTATaccagcataa
tataacaataggcagacactttcctgatatgaaatatgtttctgatatga
aacgggaacatttatgtaaaaataaaacctttaatcaaATATCTACTGAT
TGAAcgaaacaaaatttcattttattatgaTAAATTCAAACTCCAATGAT
TttgataattgtttttttattttgttccaCATTTTTCCGGACACAACTCa
tagaaaaacatcaaaaagcttacattctttttataagcatttcaCTTATA
TGCATCGCACTTTTGTGTATATCTAGGCTCAGAAATTCAAGCTTATGTGA
AGCATTTACCCGAGcctaaatttttcgattttggctattttttgctggaa
ttttacggattttttcgaattttcctaagattttgcttaatatttAAACA
TCCTTCTAGTATTTTTTAGCCTTGTCCGGTTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000110_pilon:95219..102400+ >MSTRG.13669.1.p1 ID=MSTRG.13669.1.p1|Name=MSTRG.13669.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4320bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000110_pilon:95219..102400+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCGGGCTGGTTGTTAAAACAATTAGTACCAACGGATGAAAATCCCAT
AAGCCGTGATGTTAAAGATGTTGTCGCGATGAATTTGAATGTTGACTGGA
AGAAATTTGCATACGGAATTATGTCAGATCAAGATATAGAAAGAATTGAC
CTTGACAATAGAACTGTATATGAGAAATGCTTTGAAATGTTGAACAAATG
GACTGAATCGAACCCTTATGAAATAACAAATGCCATATTGAAACTGAAAT
TAAATGAAATGCAGAGAAGAGACATTCTAATGGACATTGCTGACAAGGTT
CCATCTTTTGGGAGAGTGAAATTTCCAGACGAGCCTACCAGAAGTTATGA
GGAGCCGAGacaaccgcaacaaccacaacaaccgcaacaaccgcagcagc
cagcaaggcaaGAGAACCTTTATGAGAGAGATGGAGGTAATAAAGAGTTT
TACGTGACTGATCTGTCCTTAAGAGACACCGATGAACTGGCAACCAAGCT
AGATGTCACTTACGGTGCTGGTATATCAAACTGGAAGAATGTTGCTCACG
AACTAATCGGCCGAGATTCAGAGCTattttatcaaatcaaagaCTTAGAC
CTGCATTATTATGGAGGGGGAAATCCAgcattggaattttttaaacagtT
AGCTATGAAAGAACCTGATGTCACTATCCGGCAATTCCAAAGTATTTGTA
AAGAATTTCAGAGAATGGATATGTCGCTTTACATCGATCAAAAATTAAGT
AATAATCTGGACGGGTTTGTACGAGATTTGCAGAGTCAGCACAAAGAACG
ACTAGCGAGTTACATGAATTTAAATATACCAGGTGTTTATGACTGGGAAA
TGTTTGCTGACGAATACGGTTTCAATAGacaacaaattaatttgatGCGA
GCAGCTCTTAAAGAAGGTGGCAGTTTTAGTCCGACCAAAAAATTGGTTGA
ATTGTTACAACAATCAAGACCCTTGACAACTCTTGATGAAATCAAAAGAG
CATGCGCTAAACTGGGTCGGAATGATGTCGTCCTTGTATTGAATAAAGCG
AttgagaaaaagaaacaaaggaTGACGTAAATGTCGGGCTGGTTGTTAAA
ACAATTAGTACCAACGGATGAAAATCCCATAAGCCGTGATGTTAAAGATG
TTGTCGCGATGAATTTGAATGTTGACTGGAAGAAATTTGCATACGGAATT
ATGTCAGATCAAGATATAGAAAGAATTGACCTTGACAATAGAACTGTATA
TGAGAAATGCTTTGAAATGTTGAACAAATGGACTGAATCGAACCCTTATG
AAATAACAAATGCCATATTGAAACTGAAATTAAATGAAATGCAGAGAAGA
GACATTCTAATGGACATTGCTGACAAGGTTCCATCTTTTGGGAGAGTGAA
ATTTCCAGACGAGCCTACCAGAAGTTATGAGGAGCCGAGacaaccgcaac
aaccacaacaaccgcaacaaccgcagcagccagcaaggcaaGAGAACCTT
TATGAGAGAGATGGAGGTAATAAAGAGTTTTACGTGACTGATCTGTCCTT
AAGAGACACCGATGAACTGGCAACCAAGCTAGATGTCACTTACGGTGCTG
GTATATCAAACTGGAAGAATGTTGCTCACGAACTAATCGGCCGAGATTCA
GAGCTattttatcaaatcaaagaCTTAGACCTGCATTATTATGGAGGGGG
AAATCCAgcattggaattttttaaacagtTAGCTATGAAAGAACCTGATG
TCACTATCCGGCAATTCCAAAGTATTTGTAAAGAATTTCAGAGAATGGAT
ATGTCGCTTTACATCGATCAAAAATTAAGTAATAATCTGGACGGGTTTGT
ACGAGATTTGCAGAGTCAGCACAAAGAACGACTAGCGAGTTACATGAATT
TAAATATACCAGGTGTTTATGACTGGGAAATGTTTGCTGACGAATACGGT
TTCAATAGacaacaaattaatttgatGCGAGCAGCTCTTAAAGAAGGTGG
CAGTTTTAGTCCGACCAAAAAATTGGTTGAATTGTTACAACAATCAAGAC
CCTTGACAACTCTTGATGAAATCAAAAGAGCATGCGCTAAACTGGGTCGG
AATGATGTCGTCCTTGTATTGAATAAAGCGAttgagaaaaagaaacaaag
gaTGACGTAAATGTCGGGCTGGTTGTTAAAACAATTAGTACCAACGGATG
AAAATCCCATAAGCCGTGATGTTAAAGATGTTGTCGCGATGAATTTGAAT
GTTGACTGGAAGAAATTTGCATACGGAATTATGTCAGATCAAGATATAGA
AAGAATTGACCTTGACAATAGAACTGTATATGAGAAATGCTTTGAAATGT
TGAACAAATGGACTGAATCGAACCCTTATGAAATAACAAATGCCATATTG
AAACTGAAATTAAATGAAATGCAGAGAAGAGACATTCTAATGGACATTGC
TGACAAGGTTCCATCTTTTGGGAGAGTGAAATTTCCAGACGAGCCTACCA
GAAGTTATGAGGAGCCGAGacaaccgcaacaaccacaacaaccgcaacaa
ccgcagcagccagcaaggcaaGAGAACCTTTATGAGAGAGATGGAGGTAA
TAAAGAGTTTTACGTGACTGATCTGTCCTTAAGAGACACCGATGAACTGG
CAACCAAGCTAGATGTCACTTACGGTGCTGGTATATCAAACTGGAAGAAT
GTTGCTCACGAACTAATCGGCCGAGATTCAGAGCTattttatcaaatcaa
agaCTTAGACCTGCATTATTATGGAGGGGGAAATCCAgcattggaatttt
ttaaacagtTAGCTATGAAAGAACCTGATGTCACTATCCGGCAATTCCAA
AGTATTTGTAAAGAATTTCAGAGAATGGATATGTCGCTTTACATCGATCA
AAAATTAAGTAATAATCTGGACGGGTTTGTACGAGATTTGCAGAGTCAGC
ACAAAGAACGACTAGCGAGTTACATGAATTTAAATATACCAGGTGTTTAT
GACTGGGAAATGTTTGCTGACGAATACGGTTTCAATAGacaacaaattaa
tttgatGCGAGCAGCTCTTAAAGAAGGTGGCAGTTTTAGTCCGACCAAAA
AATTGGTTGAATTGTTACAACAATCAAGACCCTTGACAACTCTTGATGAA
ATCAAAAGAGCATGCGCTAAACTGGGTCGGAATGATGTCGTCCTTGTATT
GAATAAAGCGAttgagaaaaagaaacaaaggaTGACGTAAATGTCGGGCT
GGTTGTTAAAACAATTAGTACCAACGGATGAAAATCCCATAAGCCGTGAT
GTTAAAGATGTTGTCGCGATGAATTTGAATGTTGACTGGAAGAAATTTGC
ATACGGAATTATGTCAGATCAAGATATAGAAAGAATTGACCTTGACAATA
GAACTGTATATGAGAAATGCTTTGAAATGTTGAACAAATGGACTGAATCG
AACCCTTATGAAATAACAAATGCCATATTGAAACTGAAATTAAATGAAAT
GCAGAGAAGAGACATTCTAATGGACATTGCTGACAAGGTTCCATCTTTTG
GGAGAGTGAAATTTCCAGACGAGCCTACCAGAAGTTATGAGGAGCCGAGa
caaccgcaacaaccacaacaaccgcaacaaccgcagcagccagcaaggca
aGAGAACCTTTATGAGAGAGATGGAGGTAATAAAGAGTTTTACGTGACTG
ATCTGTCCTTAAGAGACACCGATGAACTGGCAACCAAGCTAGATGTCACT
TACGGTGCTGGTATATCAAACTGGAAGAATGTTGCTCACGAACTAATCGG
CCGAGATTCAGAGCTattttatcaaatcaaagaCTTAGACCTGCATTATT
ATGGAGGGGGAAATCCAgcattggaattttttaaacagtTAGCTATGAAA
GAACCTGATGTCACTATCCGGCAATTCCAAAGTATTTGTAAAGAATTTCA
GAGAATGGATATGTCGCTTTACATCGATCAAAAATTAAGTAATAATCTGG
ACGGGTTTGTACGAGATTTGCAGAGTCAGCACAAAGAACGACTAGCGAGT
TACATGAATTTAAATATACCAGGTGTTTATGACTGGGAAATGTTTGCTGA
CGAATACGGTTTCAATAGacaacaaattaatttgatGCGAGCAGCTCTTA
AAGAAGGTGGCAGTTTTAGTCCGACCAAAAAATTGGTTGAATTGTTACAA
CAATCAAGACCCTTGACAACTCTTGATGAAATCAAAAGAGCATGCGCTAA
ACTGGGTCGGAATGATGTCGTCCTTGTATTGAATAAAGCGAttgagaaaa
agaaacaaaggaTGACGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000110_pilon | genome | sc0000110_pilon:95219..102400 + |
|
