MSTRG.13668.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13668.3.p1
Unique NameMSTRG.13668.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000110_pilon:85400..107229+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13668.3.p1 ID=MSTRG.13668.3.p1|Name=MSTRG.13668.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21830bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000110_pilon:85400..107229+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
attatctccataatattTTTAGCCTCTGCTCACCTTTTAGACAGCCTAGG TTAGGGGATTTCCCAAATGGACCTTCCCtgcattataattttttttgaat ttttcatggGCCAAGCACCGGACAGATATAAACAGGTTTGTTTACTTCAG TATATTTCTGGCTTTGAGATTTTACATAGTATTCATTACTACTTGGTCTA TCAGCTATTTTTTACCAAACTCATTGTTGTACTAAACTCTTTCTTTATAA AACTGCAAGAGGATCCCTAAACTGTCGTCAAATTTTTCTGGAAGCTTGTG AAAAGGAGTTGCCCTGAGTGCCTGGCCATTAGCAATAAAATGAATGTTCA TGGGTATTATGCTGTTATGAAGGACAACAACAAATAATGATTACTTATAA ATTATTTGTTGTTATGGACAAGGCAGGGTCAACGTGTGCGATCTCTTCCG Aaagctgtcgagatttctttcaagctgtcgcgttcccagaaactgtcgcg ttcccaaaaactgTTGCGTTCCCATAAAATTGTCTCATTCTCAAAAACTG TTGCGTGATTTCAGATGTTACTCAGGGAATTCTCTTTTGTAGCCTTGTGG CACGAATTCAATGGGTGAATGAATTTAATATGTAAATTTACGTAACAATG GTACTAGATGTCAGGAATTACAATTCATTTGGCTTCCAAACTCCTGTGTT CAATGGTATAGTCCAGGcttccgcgctcgataggatcgatcatcggaacg gctcgatgacggatcgatatgtgatcgatggattacttatcgatccggat aggagatcgatggaagattcagccattaaaaagtcttgagtatcgatcct tcgttgatccattatcgagctagtatttcaatcgagtatatcgattcgtc atcgatcgttaatcgattcgtcatcgatcgttaatcgattcgtcatcgat 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000110_pilon:85400..107229+

>MSTRG.13668.3.p1 ID=MSTRG.13668.3.p1|Name=MSTRG.13668.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1440bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000110_pilon:85400..107229+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCACTCTCACCTGAAATGAAATACTGGTTCTCCTCACATTACATTTT
AAACACAATAGCTTGTACCATTTATATGCTGACAAAAACTATTCATCCTG
TGTGTATTTCTTTGTTTGAACTTGATGAAAATGGAAATTGCCAGTTAGAT
TATCGGGATACTGAGGTGCTCTTTTTCCTGGCTATGGTCATTGTATTGAA
GAATCGCAAATGGAAACCTTTGACTGCTGTAGAATACGTATCTAACATTT
ATCTTTTTGCTAAGCTGGCCAATTTGTTATTATTCTTTCGACAAGATTTG
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AAGCTCTAGATGAGCAGCTACTGCATCATCCAGAGGAAACTTGGATTATA
GAATTTTTTGCGCCCTGGTCACCACCCTGCAATCGATTTGCGTCAACCTT
TGCTAACCTATCATTGAAATATGATCATCCTTTATTGAAATTTGGTAAAC
TAGATGTAAACAAGTATGAAAAAGTTGGTAAAAAACATCGTGTTGATGTA
TCAGTCTCATCCAAGAATCTTCCCACTatcattgtttttgaaaatgggaA
AGAAATTTCACGGCAACCAACTGTCAATCCTGGTGGTTCCATTAAACTAG
CTATACTAATAACATACTAAATGTCACTCTCACCTGAAATGAAATACTGG
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ATGGAAATTGCCAGTTAGATTATCGGGATACTGAGGTGCTCTTTTTCCTG
GCTATGGTCATTGTATTGAAGAATCGCAAATGGAAACCTTTGACTGCTGT
AGAATACGTATCTAACATTTATCTTTTTGCTAAGCTGGCCAATTTGTTAT
TATTCTTTCGACAAGATTTGAGATGGGGTGCTTTATATGCTATTGTATGT
CTTctgcttttcattgcatttccTGAGCCAAGTTATACTGGTCCAGAGAA
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AATCGATTTGCGTCAACCTTTGCTAACCTATCATTGAAATATGATCATCC
TTTATTGAAATTTGGTAAACTAGATGTAAACAAGTATGAAAAAGTTGGTA
AAAAACATCGTGTTGATGTATCAGTCTCATCCAAGAATCTTCCCACTatc
attgtttttgaaaatgggaAAGAAATTTCACGGCAACCAACTGTCAATCC
TGGTGGTTCCATTAAACTAGCTATACTAATAACATACTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13668MSTRG.13668Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13668.3.p1MSTRG.13668.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13668.3.p1.exon1MSTRG.13668.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13668.3.p1.exon2MSTRG.13668.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13668.3.p1.exon3MSTRG.13668.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000110_pilongenomesc0000110_pilon:85400..107229 +