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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:2437712..2449094+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1363.1.p1 ID=MSTRG.1363.1.p1|Name=MSTRG.1363.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11383bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2437712..2449094+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATATGAGGAGAACGTCAGCAGCTCAAAACAAGCAATGACAAAATCCTTAT
CCTTCATATGACTTATCTTTTATCAACAAAAAGAAGATTGCAGATGCTCT
TCATGTTGTAATAAGGTATCTATAcctacttttttcttttctagaatCAT
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CTGGCAATCTATGTGGCCTACCCTAGAAGCTGGcaataggttgttattct
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AATATATAGCAATGTATTAGATCTCAAGAttaaacgtcaatttttggACT
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TTTACCATATTTTACACCAGTTTACCCCATGTTTTAAATTAGTATATGTT
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CAAGATCCTTTAAATAGCAGTATCAAAAGCTTCCTTACTGTTGAACGGTG
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TCTGTATTGTATCTATTTCTGTATGACTCATCCGATGGGATGGTATTCCT
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GAATCAGCTAATCCTCCTAAGCCACCTGTCAATTCTGAAGAGTCGAGACC
ACCTGCTCCAGCTGAATCAAGACCAGTAGCTTCAGCTGAGTCATCTGCTG
CTCCAACTTCTTTGGATGAACCCATCAGTGAGCTAAGTGAAGCTGCATCG
AGACCTCCAGCTCCACCTAGGGAATCTTCACTAGCTGAATCTGTTGGTTT
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GTTGGCTTTCAGCTGTATTTGCATATGGGTCTGGTCCAGTACTGATATCA
GCATTTGAGAAATCAGAGCCAGAAACTTTACCTGATTTTAAGAGATCCAT
AACAGCTTCGGTGCTCATACTACCTGCTTTAGAAAGTGATTTGGCAATTC
CATCATCATCGCTAGTACCACCAGCTCCAGCTAATGCAGCTGTCGATTCT
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CGGCAGCAGATGCACTGTTTTCACTTTTAGATGCTAATGCAGCTGATAGA
TCTCCTGTAGAATCTGAGCTTGCCGAAGCTGCAGTAGTACCCTCTGAGGG
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TGTCTGCTTGGTCTTTCAATTTATCAACAGCAAACTCTTGAGCTTGTTTG
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CAAATCAAGATTTCCAGGTGAAAGATGCATGTTGACCATTTCAGTTTATA
ATCTCTTTCTTAAAGTTTCCTCTCTTAGAttatgttcagacgttacaaTT
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TATCTGTCAATCGATCCAATAGCCCTCCAACATCATGTTCACCAGCTAAA
GGTTTTGCATTCCTCATTGCTGGGTCTGATGCAGACCCACTGGAAGAAAC
TGGTTTCATCTCACCATTAGCCATCTTCATCACTGGATTTGAGTCTCCTG
CATCACTTTTAAGTTCTGGTATCTTTGGTCGATCTGGTCCCATAGCAATT
TCTGCATATGGATCTTTAGGTGCAGCCGGTGCAGCCATTTTCATTGGAGA
TGATGGTTTGGAATCTGATTTGGATGATTTGCTGCTATCACTACCAGATT
TGGTTCTTGAATCACCAGTTTTAATTAGATTTGCATTCTTATTTGCAAtg
actttttcaactttctcaaTAGCTTTGCTTAAGGTGGCCTTGATAGCTTT
AGCTGGATCTGCTGATGTCGCCatgtttgatttggttgatcCTTTCTCAA
TTTTCAATGATGTTTTCTGAGGAACAACGTTGGCTTTCTTCGCCCCCTTG
GCATCagtattttcaatcaattttgatAAACTCCATAAAGGTGAATGTTT
CTTATTAGGTTTCTCAAGTTtatcttttctctctttctcaACTACTGCTT
TCTTAGTTGGTAACACAAGATATTCATGAGAGTCTTTATTGACATTAGAT
TTCTTAGCATTCTTCTCGGATGTTATCACTGATTCCTCATTTTGACCAGG
GATAGCACTGACTGCAGCTTCTTTTATCTCTACGTTGCTTTTCTTTGCAT
TATCACAATCACTTTCACCGTTATCTTCGGGAATGGATCGTTTTACACCA
CGTTCTATCGCACTGATATCGAGATTCAACCTCCCATTGGAAATGATACT
TCGTTTTGTGTTGACTGATGCTTTTGCTGCACCACACCCTAAAATAGAAT
AATTTACTGTTCACACAATACTAGCTCGACAACAAATGTTAGAATCTTCG
AGGTACATCGAGGTTTTGAGTTGGAAGGTTCCTTTTGTAATAGCTTGTCC
ATCCGAAAATAAGAGAGGTCAACTATCCAAAGAGTGTACTATGTTTGATT
GTTAGTTTATGTTTATGGCAACTCTGTGCAAGAGCAACTTTTCAGTTTAA
CTGAACTTTAGTTTAAATTATTCGTACTTCTCTGGCTATTTTTCTTATCT
TACAAGGAAAGAATAGAAATGTAATATTACCCTTTTTGCTTTCCGCTGCa
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GTTCTATCTAACTCAAGCATTAGATTTGTTTGATCAGAATTTCAGGTAGC
TTTTGCTAGAGCAATGAAAtgtactaaaaataaaaagcgaGTTTATACAc
ccacttctcacagacccattgggaacccttcccactggaaaaattgtcca
ataTATCGTCGGCGCAAAAATTATCCTCCtttttttGTccacactgaaaa
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AATAATATGGGAACATCAATACCCATCGAgcttttttctgttatttttat
ccccaatgactgaaaaaattctactgggtctgtgagaaaggcaCGAGAAA
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TTTAAGCTAAAGGTCTAAACATTCAAACCAAGAAAGAAATCATAAGCTTG
AGGATTAAGGTCCCTCAACCCCGGGGTGAGGTTACTGATATTGACGGCCG
ACAGGGACGCTGGAATTGAACCTTTCAGTTATGAACCTAAACAAAAATCC
CCTGATTATAATACAGTACCTTGTGTGTTGCATGCAACAAGTACAACCAC
CAGGGTTAAGAAACAGTTGCACCGAACCATCTTTTTGTTCAATCAATGCC
ACATCGAATAATCAAGTACtataagaaatataataatACTACGATCTTAG
ATGAActatatttttaattaatgatatgcaccattgtaatgtcttccacG
GGCCCAACAGGTTGCAAGTAACGTATTGCGGACTGATATTACGTcgctta
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ATTTGAAAAGATCAGTGCTATGATGTTTTCTGCTTCAAAACCATATCCAC
TAGAAGCAAGAATAGAAGGTTTTCCAGGCCTGGACAGCTCAGCAATCAAA
CAAAGCTAACAGCATAAATTTTGTATAAAGTTTTCTTATGATTAACCGGA
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ATGTCAAGTAATGATACAATACCTGgtataaattttttaattcctAGTTA
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AGCTAACatcatttttgaaacaattaacCATAGAAACTTCTATTCATAAA
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tttttcttttgtatttttgattgcagctagattctttttttgatcacatg
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tcgagcgtaaaactcctacaaGAGTATGGTCTAAAAGCCTGGATATGTCT
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TCTACAAGCATTTTCTCTTGTAGATAGGgttgaatttaaaaacaaatttt
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GTTTTCGGCCCTTTAATTCAATAACTCCTCGTAGGGCCATGTAGTatcaa
tttgttgttttatagAGATACTACATCCTCAAAGctcaataatgttttta
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AATTGATGGTTTAATTGCATTTATTTTGGTTCTATCGTAGAGTAGTGGTG
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ATAATAATAGTATAGGAGGAAAAGTGACATCATCAAAATTGGGGGATGAA
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GAGAAATTCGATTTAAAGATGAATTTTTCATCAAtcacataaaaaatatt
ttcagaaaatagatttttttttccctAAAATCAAATCGGAGAAAATCATT
GAATCTTTAATGTTATGAGAATGAGCCCTTaaaaaaaTCGGTCAAGAATG
TATTCTTGATTAACATTAACATCAAGCGAAATCGAGTATTGactttttcg
taaatttttttgTCCGAAATTCATCATTCTTAAAATTAACTACAATATAA
TTTTACAACTATGTTGAAGTGTCTGAAATTTATAAACTTTGTGTTGCTGT
TAGctgctttgtttgcttcaatTGTTGGCCTTGTGACCAATTACATGATA
GAACATAGCACCACTCAGCATCAGGGTTTATGGTTTTATTGTAACGATGA
AGAAGTAGGATGTCTTCATTTTGACCAAGATCCAACCATCATTATCAATG
GTGGTGTACCAGGTTAGTGTTTTTATTAAAGTCATTTAGGTCATTGGAGT
AGGAAAACCTGCGTTTTTTCAGCTGCTTTTTCGCTTAAACGAGTAACCTT
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ggtaatttcaaatttaagtTTTACCTAATTTTAATACTGCTGGTATTTAA
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ttctctttcttgctTTCAGATTGGCATTACGCAGTATTTGGTTTATATGT
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tttgtaaacaaaagaatACTAAATGTTATCGATGGCATAACGTCTTCTCA
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CGAGGCTACCTGATAGATgtctgaattttcttttcaattcatTAGACGGG
GCTAAACGTATGTTGcaataagaatttttaagaTATCAGAAGACTTAGTG
AGGAGAAAGCTAAGAACCGGGGTATTACCGGAGAATTACTCTCGGGTTCT
TGGTGATCCTTTCTTTGTGAGATTCTTTCTTTTGCCCTGCAATAAGTTTT
TTCACTCAGAACAAATctttctactcagaatcatgttcgaacttgATCtt
tttttCGGGGAACCCTGTATGTTTTGACATTCTTTACAAGCTCACGAgta
ttttttctcctttattttaGGGATCGCTCTGGTTTGCGGTATGTCTTTGT
ATACCTACATGTTCTTGCAACGGATGGAGATTAACGGCTACAAATGGGGC
TACAGCTTTGGTTTTGGTTGGTTATCCGCCCTATTACATTTCCTATCCCT
CATTCTGTCTTTCATGCTGATTATGATGGATCATCGACGTAATGACCCTT
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AATGATAACAGCAAAGAGAACAGTTGCAAGTGGTGAatacaaccccttct
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tctcaacttcagttgagctagaatctgagaatgtctgtgtgtctgtctgt
ctgtgtgtgtgtgtctgtcaccaaaactttggggcaggctggagacttca
aaaatggtccgattgggctgaaattttgcacacttgatccttgggcaaat
ccctgggggtatttttttcattttttcaaaattttaatttttggggcctg
gggacgagtttttcgccaaaacgaggctaaaac Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:2437712..2449094+ >MSTRG.1363.1.p1 ID=MSTRG.1363.1.p1|Name=MSTRG.1363.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1377bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:2437712..2449094+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATAGAACATAGCACCACTCAGCATCAGGGTTTATGGTTTTATTGTAA
CGATGAAGAAGTAGGATGTCTTCATTTTGACCAAGATCCAACCATCATTA
TCAATGGTGGTGTACCAGATTGGCATTACGCAGTATTTGGTTTATATGTT
TGTGGTGTTGGTTTTCAGTTTTTCGCTTTTATGATTTTCTGGTTCatctt
ttgtaaacaaaagaatACTAAATGTTATCGATGGCATAACGTCTTCTCAT
TGGTCGGATGGATCGCTCTGGTTTGCGGTATGTCTTTGTATACCTACATG
TTCTTGCAACGGATGGAGATTAACGGCTACAAATGGGGCTACAGCTTTGG
TTTTGGTTGGTTATCCGCCCTATTACATTTCCTATCCCTCATTCTGTCTT
TCATGCTGATTATGATGGATCATCGACGTAATGACCCTTACAGTCAAAGC
TTTAATTGAATGATAGAACATAGCACCACTCAGCATCAGGGTTTATGGTT
TTATTGTAACGATGAAGAAGTAGGATGTCTTCATTTTGACCAAGATCCAA
CCATCATTATCAATGGTGGTGTACCAGATTGGCATTACGCAGTATTTGGT
TTATATGTTTGTGGTGTTGGTTTTCAGTTTTTCGCTTTTATGATTTTCTG
GTTCatcttttgtaaacaaaagaatACTAAATGTTATCGATGGCATAACG
TCTTCTCATTGGTCGGATGGATCGCTCTGGTTTGCGGTATGTCTTTGTAT
ACCTACATGTTCTTGCAACGGATGGAGATTAACGGCTACAAATGGGGCTA
CAGCTTTGGTTTTGGTTGGTTATCCGCCCTATTACATTTCCTATCCCTCA
TTCTGTCTTTCATGCTGATTATGATGGATCATCGACGTAATGACCCTTAC
AGTCAAAGCTTTAATTGAATGATAGAACATAGCACCACTCAGCATCAGGG
TTTATGGTTTTATTGTAACGATGAAGAAGTAGGATGTCTTCATTTTGACC
AAGATCCAACCATCATTATCAATGGTGGTGTACCAGATTGGCATTACGCA
GTATTTGGTTTATATGTTTGTGGTGTTGGTTTTCAGTTTTTCGCTTTTAT
GATTTTCTGGTTCatcttttgtaaacaaaagaatACTAAATGTTATCGAT
GGCATAACGTCTTCTCATTGGTCGGATGGATCGCTCTGGTTTGCGGTATG
TCTTTGTATACCTACATGTTCTTGCAACGGATGGAGATTAACGGCTACAA
ATGGGGCTACAGCTTTGGTTTTGGTTGGTTATCCGCCCTATTACATTTCC
TATCCCTCATTCTGTCTTTCATGCTGATTATGATGGATCATCGACGTAAT
GACCCTTACAGTCAAAGCTTTAATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:2437712..2449094 + |
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