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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000109_pilon:374534..377848+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13609.9.p1 ID=MSTRG.13609.9.p1|Name=MSTRG.13609.9.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3315bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000109_pilon:374534..377848+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTGTTACAAATGGATATCAAAGTAGTGTaagcaacggattagaataggt
ggattaacttctctcgttgctcccaagagagatccattgtcttctcattg
ttacaagaaaaatctgtaaatgactctgcgcactcctcgtttagtttttt
cattgtttttataagaacaattttccaatttatacagtttcgaaaacgaa
tttgtcctatgattcgatcaattttgatgattttgcaaatattttaaatc
ctgcacttaagttttagcatcaacaaacgctagaccagttttaatgtaaa
tttttaatcttttgtcaatggcaatcttcagataagtgaaaattaacgta
tggtctataactaagaaactatcgatgggtcacgaatgggttgcatactg
gtgaaagaagactgtatttagaattaggaaaataaatttcaaattatttg
gctaatttctgcattggatagaaagggctaaaaaagtgcattttcttatt
taaaatgtaccacgtgatacgtaatgaccaatgaaaatgttgaaagtaat
gattttttacaacttttttacaacttatcaagttttaattgctagcaaac
tcgtaaaaaagtttgataacctaacgaggagtgttttctatgagttctta
atccacctattctaatccgttggtgTAAGTAACTTATTTCAGGCGATCAA
TGTTTTTTCTTGGAAGGATTTTATCTTCTCCTCATCGTGTGCTCGATAAG
TTAATAGAGCAGTATTATATTCATATTAAGATTGTTCATTAAAGGTTTGC
GTGGAAGCGCCAAAAAAGTCCTGAGTTTTAAATCAGATTTTATGTCACCT
TATTATAGGGGTTTCTTCGAATTTGGATACCCCTATGGATAGCGGCAGCT
TTAGTTTTAATCTTTAGGTTTCCTTataaaagtttgtgtgtgtttgAGGA
ACTAGCTCGTTTTCTTTCCTATTCATTCTTTAAAAGCTAtggtttacacg
tttttttttttaagaaactagttttaccaagcagcctcaatgtttcttaa
gaaatcggccttttgagtcttaaatgtttcttacatgtttctaaactttt
tgacataatcagccttataaaaggctggattggaaggttcttaaaaaaac
gaattaaagaatgtttttttttccttctcagcctcagcatgtttcttaga
tgtttcttagtttttagacattctgagcctcatgtttcttaaaagtgtgt
ttcttaaaaaaaaaaacgtgtattctttaTGATTCTTCAGGTCGAAGGAG
GATTCCTTCAAATTCACCATGACGCAACTTCAACAACGTCATCCGTCCGT
CACTAAACCGTTCCAAGAAGAATTCGTCGACGTTAACATCAAAAATGGAT
TCTTTGACGCCGCCAACAAAATGAGACGACAAGgtatttgattctttttc
tctCCGTTCAGAGGGATTCAAACAtatttatagcaatgaaatcaaCTTTT
TACCCTGATCTAGGGTACgtcattattttcttttgtcgCGAGCGTAAAAC
ACCTTTAATAAGTACCTTTTAACTAAAGATCTTCTATATATGTTATCGCA
CTGCCCTTTGCTCTGTGCTCAAAATCTTTCGGCATCTGTTAGACCTAGAA
ATCTAGCTTCATTTCATACCCCAATGTTAAGTTTTCCAAGCGTTGAATAT
ATATATACTATAAGGGTATCTGAGCCAGTATTCTTACGATTTCTTCCCAT
TTCTTTCTCAGGTGTTTTGACAGACGTATCGCTAGTTGTTGATCAACAAA
CCTTTCACACTCATAAACTGATATTATGTTCATGCAGTGATTATTTTACT
AGCATGTTCAACGGTCCTTTGGCGCATCACGGCCAACAAGTCTTCATATC
GGGCGTCAGTGCCCAAAGCATGGAAGCCATTTTGAATTACGTTTATACGG
GATCAATAATCATCAACGAGGAGTTTATACAAGACATTTTAGAAGCAGCT
TgtttgtttctattgaaaaactTACGCGAACGATGCGCGCGATTTCTACG
CGACCGATTAGACGGTGGCAATTGTTTACAGATTTTCAGTATCGCTAAAA
GTTGTTCATTGTTGACTTTGATGGAGGATTCGTTGGAATTTATATCCGCA
ATTTTCCAAGATATTTCAGCGCTGAATGACTTTAAACAATTAAGTTTTGA
TGAACTTATTGATGTATTATCTCTTGAAGATTTAGCAGTACCAAGCGAAG
ATTACGTTTTAGAGGCAGCTTTTCGCTGGTTAAATCATGATTTATAcgga
cgtcagcaaaaatttgtaGAAGTCCTAAAAGCTATACATTTACCATACGT
TAGTGACGATATGTTAAAACAGGTCATGGAGAATGAAAAATCTTTACGTA
CATTTCCTGAGCTGGAAATTCTCTTCCGTTCCGCCTTACGTCTTACCGTT
GAAAACTGGACTCTCTCCAAAGACAGTGATTTTAATCTACTCCAACCAAA
ATCATGGATAAATCCACGAAAATGTATTCAATGTATACCGAGCCTTATCG
CTATGGGTGGGCCTACATTGAACTTATTTAACAGCGAACTTGGAAAATGG
TGTGAAATAACGAAATGCAAACCACGACATTGTCCAGGTATGGATGTTGT
TGGGTCCACTATCTACGTTGTAGGTGGTTCACTGGAATGGAAACGAAAAC
GTACTGGAGAGTATTACAACACTGAGAAAAATGAATGGATCCCAATGGCT
GATATGCACACACCACGAAGCAATTTCGGTCTCGTCAATTTGGAAGGGAA
ACTGTATGCTATCGGTGGTTATGATGGGAATTTCCCTTTAAAGTAAGCTT
GATAAAATCTCCTTTTTACTTCACTGTGCTATAAAACTTGAGCAAAATTT
TGGTTGTAAAATAATTCGGTCTACTAGGTAACTCTTGCAGTTCATTTTTT
ACCTGTTCTTGTATCAGTTCTTCTCCTAACAATCTTGCAATTGCAAATTG
GATTCTACAACAATTAGTATTTCCAATGAGCTGAACTTAGGCGAATTAAA
TTGAACAGTCATGATAAGCTCGCTTACTTTTGTGCCATCAGATCAGCGGA
GGTTTATGATCCACGTACCAATCAATGGACACAAATCTCCGACATGTCGA
CGGCAAGAGACGGCGCATGTAATGTGTCGGACGGCGAATCGATTTACGTG
ATTGGAGGATACGACGGCCATGAATACAGACTGACGACAGAAGTTTATAA
ACCAGAAACTGGTGTATGGGATATCAGCTGTAAGCTCcctgttttttcta
ttttaagtCAACTCA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000109_pilon:374534..377848+ >MSTRG.13609.9.p1 ID=MSTRG.13609.9.p1|Name=MSTRG.13609.9.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5892bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000109_pilon:374534..377848+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGTTACAAATGGATATCAAAGTAGTGTCGAAGGAGGATTCCTTCAAATT
CACCATGACGCAACTTCAACAACGTCATCCGTCCGTCACTAAACCGTTCC
AAGAAGAATTCGTCGACGTTAACATCAAAAATGGATTCTTTGACGCCGCC
AACAAAATGAGACGACAAGGTGTTTTGACAGACGTATCGCTAGTTGTTGA
TCAACAAACCTTTCACACTCATAAACTGATATTATGTTCATGCAGTGATT
ATTTTACTAGCATGTTCAACGGTCCTTTGGCGCATCACGGCCAACAAGTC
TTCATATCGGGCGTCAGTGCCCAAAGCATGGAAGCCATTTTGAATTACGT
TTATACGGGATCAATAATCATCAACGAGGAGTTTATACAAGACATTTTAG
AAGCAGCTTgtttgtttctattgaaaaactTACGCGAACGATGCGCGCGA
TTTCTACGCGACCGATTAGACGGTGGCAATTGTTTACAGATTTTCAGTAT
CGCTAAAAGTTGTTCATTGTTGACTTTGATGGAGGATTCGTTGGAATTTA
TATCCGCAATTTTCCAAGATATTTCAGCGCTGAATGACTTTAAACAATTA
AGTTTTGATGAACTTATTGATGTATTATCTCTTGAAGATTTAGCAGTACC
AAGCGAAGATTACGTTTTAGAGGCAGCTTTTCGCTGGTTAAATCATGATT
TATAcggacgtcagcaaaaatttgtaGAAGTCCTAAAAGCTATACATTTA
CCATACGTTAGTGACGATATGTTAAAACAGGTCATGGAGAATGAAAAATC
TTTACGTACATTTCCTGAGCTGGAAATTCTCTTCCGTTCCGCCTTACGTC
TTACCGTTGAAAACTGGACTCTCTCCAAAGACAGTGATTTTAATCTACTC
CAACCAAAATCATGGATAAATCCACGAAAATGTATTCAATGTATACCGAG
CCTTATCGCTATGGGTGGGCCTACATTGAACTTATTTAACAGCGAACTTG
GAAAATGGTGTGAAATAACGAAATGCAAACCACGACATTGTCCAGGTATG
GATGTTGTTGGGTCCACTATCTACGTTGTAGGTGGTTCACTGGAATGGAA
ACGAAAACGTACTGGAGAGTATTACAACACTGAGAAAAATGAATGGATCC
CAATGGCTGATATGCACACACCACGAAGCAATTTCGGTCTCGTCAATTTG
GAAGGGAAACTGTATGCTATCGGTGGTTATGATGGGAATTTCCCTTTAAA
ATCAGCGGAGGTTTATGATCCACGTACCAATCAATGGACACAAATCTCCG
ACATGTCGACGGCAAGAGACGGCGCATGTAATGTGTCGGACGGCGAATCG
ATTTACGTGATTGGAGGATACGACGGCCATGAATACAGACTGACGACAGA
AGTTTATAAACCAGAAACTGGTGTATGGGATATCAGCTGTAAGCTCcctg
ttttttctattttaagtCAACTCTTGTTACAAATGGATATCAAAGTAGTG
TCGAAGGAGGATTCCTTCAAATTCACCATGACGCAACTTCAACAACGTCA
TCCGTCCGTCACTAAACCGTTCCAAGAAGAATTCGTCGACGTTAACATCA
AAAATGGATTCTTTGACGCCGCCAACAAAATGAGACGACAAGGTGTTTTG
ACAGACGTATCGCTAGTTGTTGATCAACAAACCTTTCACACTCATAAACT
GATATTATGTTCATGCAGTGATTATTTTACTAGCATGTTCAACGGTCCTT
TGGCGCATCACGGCCAACAAGTCTTCATATCGGGCGTCAGTGCCCAAAGC
ATGGAAGCCATTTTGAATTACGTTTATACGGGATCAATAATCATCAACGA
GGAGTTTATACAAGACATTTTAGAAGCAGCTTgtttgtttctattgaaaa
actTACGCGAACGATGCGCGCGATTTCTACGCGACCGATTAGACGGTGGC
AATTGTTTACAGATTTTCAGTATCGCTAAAAGTTGTTCATTGTTGACTTT
GATGGAGGATTCGTTGGAATTTATATCCGCAATTTTCCAAGATATTTCAG
CGCTGAATGACTTTAAACAATTAAGTTTTGATGAACTTATTGATGTATTA
TCTCTTGAAGATTTAGCAGTACCAAGCGAAGATTACGTTTTAGAGGCAGC
TTTTCGCTGGTTAAATCATGATTTATAcggacgtcagcaaaaatttgtaG
AAGTCCTAAAAGCTATACATTTACCATACGTTAGTGACGATATGTTAAAA
CAGGTCATGGAGAATGAAAAATCTTTACGTACATTTCCTGAGCTGGAAAT
TCTCTTCCGTTCCGCCTTACGTCTTACCGTTGAAAACTGGACTCTCTCCA
AAGACAGTGATTTTAATCTACTCCAACCAAAATCATGGATAAATCCACGA
AAATGTATTCAATGTATACCGAGCCTTATCGCTATGGGTGGGCCTACATT
GAACTTATTTAACAGCGAACTTGGAAAATGGTGTGAAATAACGAAATGCA
AACCACGACATTGTCCAGGTATGGATGTTGTTGGGTCCACTATCTACGTT
GTAGGTGGTTCACTGGAATGGAAACGAAAACGTACTGGAGAGTATTACAA
CACTGAGAAAAATGAATGGATCCCAATGGCTGATATGCACACACCACGAA
GCAATTTCGGTCTCGTCAATTTGGAAGGGAAACTGTATGCTATCGGTGGT
TATGATGGGAATTTCCCTTTAAAATCAGCGGAGGTTTATGATCCACGTAC
CAATCAATGGACACAAATCTCCGACATGTCGACGGCAAGAGACGGCGCAT
GTAATGTGTCGGACGGCGAATCGATTTACGTGATTGGAGGATACGACGGC
CATGAATACAGACTGACGACAGAAGTTTATAAACCAGAAACTGGTGTATG
GGATATCAGCTGTAAGCTCcctgttttttctattttaagtCAACTCTTGT
TACAAATGGATATCAAAGTAGTGTCGAAGGAGGATTCCTTCAAATTCACC
ATGACGCAACTTCAACAACGTCATCCGTCCGTCACTAAACCGTTCCAAGA
AGAATTCGTCGACGTTAACATCAAAAATGGATTCTTTGACGCCGCCAACA
AAATGAGACGACAAGGTGTTTTGACAGACGTATCGCTAGTTGTTGATCAA
CAAACCTTTCACACTCATAAACTGATATTATGTTCATGCAGTGATTATTT
TACTAGCATGTTCAACGGTCCTTTGGCGCATCACGGCCAACAAGTCTTCA
TATCGGGCGTCAGTGCCCAAAGCATGGAAGCCATTTTGAATTACGTTTAT
ACGGGATCAATAATCATCAACGAGGAGTTTATACAAGACATTTTAGAAGC
AGCTTgtttgtttctattgaaaaactTACGCGAACGATGCGCGCGATTTC
TACGCGACCGATTAGACGGTGGCAATTGTTTACAGATTTTCAGTATCGCT
AAAAGTTGTTCATTGTTGACTTTGATGGAGGATTCGTTGGAATTTATATC
CGCAATTTTCCAAGATATTTCAGCGCTGAATGACTTTAAACAATTAAGTT
TTGATGAACTTATTGATGTATTATCTCTTGAAGATTTAGCAGTACCAAGC
GAAGATTACGTTTTAGAGGCAGCTTTTCGCTGGTTAAATCATGATTTATA
cggacgtcagcaaaaatttgtaGAAGTCCTAAAAGCTATACATTTACCAT
ACGTTAGTGACGATATGTTAAAACAGGTCATGGAGAATGAAAAATCTTTA
CGTACATTTCCTGAGCTGGAAATTCTCTTCCGTTCCGCCTTACGTCTTAC
CGTTGAAAACTGGACTCTCTCCAAAGACAGTGATTTTAATCTACTCCAAC
CAAAATCATGGATAAATCCACGAAAATGTATTCAATGTATACCGAGCCTT
ATCGCTATGGGTGGGCCTACATTGAACTTATTTAACAGCGAACTTGGAAA
ATGGTGTGAAATAACGAAATGCAAACCACGACATTGTCCAGGTATGGATG
TTGTTGGGTCCACTATCTACGTTGTAGGTGGTTCACTGGAATGGAAACGA
AAACGTACTGGAGAGTATTACAACACTGAGAAAAATGAATGGATCCCAAT
GGCTGATATGCACACACCACGAAGCAATTTCGGTCTCGTCAATTTGGAAG
GGAAACTGTATGCTATCGGTGGTTATGATGGGAATTTCCCTTTAAAATCA
GCGGAGGTTTATGATCCACGTACCAATCAATGGACACAAATCTCCGACAT
GTCGACGGCAAGAGACGGCGCATGTAATGTGTCGGACGGCGAATCGATTT
ACGTGATTGGAGGATACGACGGCCATGAATACAGACTGACGACAGAAGTT
TATAAACCAGAAACTGGTGTATGGGATATCAGCTGTAAGCTCcctgtttt
ttctattttaagtCAACTCTTGTTACAAATGGATATCAAAGTAGTGTCGA
AGGAGGATTCCTTCAAATTCACCATGACGCAACTTCAACAACGTCATCCG
TCCGTCACTAAACCGTTCCAAGAAGAATTCGTCGACGTTAACATCAAAAA
TGGATTCTTTGACGCCGCCAACAAAATGAGACGACAAGGTGTTTTGACAG
ACGTATCGCTAGTTGTTGATCAACAAACCTTTCACACTCATAAACTGATA
TTATGTTCATGCAGTGATTATTTTACTAGCATGTTCAACGGTCCTTTGGC
GCATCACGGCCAACAAGTCTTCATATCGGGCGTCAGTGCCCAAAGCATGG
AAGCCATTTTGAATTACGTTTATACGGGATCAATAATCATCAACGAGGAG
TTTATACAAGACATTTTAGAAGCAGCTTgtttgtttctattgaaaaactT
ACGCGAACGATGCGCGCGATTTCTACGCGACCGATTAGACGGTGGCAATT
GTTTACAGATTTTCAGTATCGCTAAAAGTTGTTCATTGTTGACTTTGATG
GAGGATTCGTTGGAATTTATATCCGCAATTTTCCAAGATATTTCAGCGCT
GAATGACTTTAAACAATTAAGTTTTGATGAACTTATTGATGTATTATCTC
TTGAAGATTTAGCAGTACCAAGCGAAGATTACGTTTTAGAGGCAGCTTTT
CGCTGGTTAAATCATGATTTATAcggacgtcagcaaaaatttgtaGAAGT
CCTAAAAGCTATACATTTACCATACGTTAGTGACGATATGTTAAAACAGG
TCATGGAGAATGAAAAATCTTTACGTACATTTCCTGAGCTGGAAATTCTC
TTCCGTTCCGCCTTACGTCTTACCGTTGAAAACTGGACTCTCTCCAAAGA
CAGTGATTTTAATCTACTCCAACCAAAATCATGGATAAATCCACGAAAAT
GTATTCAATGTATACCGAGCCTTATCGCTATGGGTGGGCCTACATTGAAC
TTATTTAACAGCGAACTTGGAAAATGGTGTGAAATAACGAAATGCAAACC
ACGACATTGTCCAGGTATGGATGTTGTTGGGTCCACTATCTACGTTGTAG
GTGGTTCACTGGAATGGAAACGAAAACGTACTGGAGAGTATTACAACACT
GAGAAAAATGAATGGATCCCAATGGCTGATATGCACACACCACGAAGCAA
TTTCGGTCTCGTCAATTTGGAAGGGAAACTGTATGCTATCGGTGGTTATG
ATGGGAATTTCCCTTTAAAATCAGCGGAGGTTTATGATCCACGTACCAAT
CAATGGACACAAATCTCCGACATGTCGACGGCAAGAGACGGCGCATGTAA
TGTGTCGGACGGCGAATCGATTTACGTGATTGGAGGATACGACGGCCATG
AATACAGACTGACGACAGAAGTTTATAAACCAGAAACTGGTGTATGGGAT
ATCAGCTGTAAGCTCcctgttttttctattttaagtCAACTC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000109_pilon | genome | sc0000109_pilon:374534..377848 + |
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