MSTRG.136.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.136.1.p1
Unique NameMSTRG.136.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000001_pilon:2660240..2663480+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.136.1.p1 ID=MSTRG.136.1.p1|Name=MSTRG.136.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3241bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:2660240..2663480+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gcatttcccgggcggtcatatacgatatcaccataatcaagatgaggcct
atATTCATGTTTGAGAATGACAATCTTTCATATAACCTACAATATTTCCC
CCTTTTAGCAATGATTAAACTATCAGATGACAAACAATTTAATAACACTA
CTAATAACATTGGTTTGTTTCATTTGCTTCTACAACTCGTTGGAAAATGG
ATTCGTTCATGATGACATATTCGCCATTGTCAACAATAAAGACATCCTAC
CAAATACCTCTGTTTGGAATATCTTTTACAATGATTTCTGGGGACGTACC
CTGATTGATTCCAAAAGTCACAAATCCTTCAGACCAATATGTACTCTGAC
ATTCAGATTTGATTATATGGTATTTGGATTGAACCCATTTGGTTATCACT
TGGTCAATGTTTTGCTCCACATATTTGTCTGCAATGTGCTTTTTCAAGTG
TTACGAGATATTATTCTATTTGACACAAAATTATCGTTGATGGCAACTAT
ACTGTTTGCAACACACCCTGTTCATGTAGAAGCtgtgagttttttatttt
tttacctttttattcAACGTAGtcaaaaaacgtttttaaaaccCTCTAAA
AGTTAGCAATCACTGTCTAAAATCTTTCACAAAAGTTTTGACGTTCGGAA
ACCCAACCACCCTATTTGGACCCGTCCTTTTAGAAGACTGTTTTATGACT
CATATTGATGATTTTTAACCATATTCTAGGTAACAGGTGTTGTTGGAAGA
GCTGATATGTTGTCTTGTCTATTCGTACTACTTGCATTCAAGGCTTACCA
CAagtaaaatatatattcattaaaattttataaaactcTTCAGTGATTGC
ATTTCTATAATTAAAACTTAAACATTTGGATGAGTCAcaggcaagaaaca
acaaaaatttatttattgatgATATTTATTGATACTCTATGGTAGAGCAT
CTTCAGATCTATCATAACTTGGCATATAACATCTAGCATTTACAAATTCA
GACATTTGattaaataatttaaatttatcgCGTTCATATATTTATATAAT
TCCTACCTGTTATGaaccaaaattaaaacataAGATAACTGGAATACATA
AATAAAACTCTAATCCTTTCTTTTTATAGATATCTTGTGACAACTCAACA
GGTAAATATACTCTTCctattcattttcagaaaaacaaaaacaaaaggtg
tttattcatttttttaattttatgaaatttgcaattaaaaatgaagataa
aacttGCCGTTTCAAAATTACCCAAAAAGCCAAACAGTTATATTTATTCT
TAACTAATATATTGATTACATTTCAGGATGtttttttCACTAGCGACCTT
TTGGTAGTTGTTGCATATGGTACATCCACATTCTTCATCAAAGAGCATTC
TGTCATGATATTCTTTGTATTGATTGGTTACGATGCTCTATGTAATAAAC
AATACATTGCAAGGTATTGCCATGATATTACTTTAATAGAGTTTTATATT
TGGGAAATAAATGTtagaaattttataattttgctCATTATTTTGAGCGT
TCTTTTCAGCATCGAgattccgcaaaatttaataccacaatttttaaatc
aatgGTCTGTCTGGTCCCTGTCTTATTTCCCTGGATGGTGGATGAGCATA
TTCGGGTGAAAGCGTGCTCACCCCTTGCAGGTCACTTCCCGTAAGCCCAG
GCAAATCGACCACATAATGACTCGTTCAACGGTAATCGTCAGTTGTACAA
AGTTTCTCGATTCTGGTTGGTTTAGAGTACCGTTACCTGCACTATTACCA
CTCTTTGCATTCTACGGCAGGGGTCACTTTTGTCAACTTGTCACTTTTGT
CACTTTGAAagacaaagaaattttgcaatgCAATATCTTCTCttgatgaa
aacaaagaaacatcGCACAGCAATGCCTTCTTTTagtcaaaagaacaaaa
agaggTTTTCGAATCGAATTTTTGCTAAGATATAAAAagataagaaatat
tttcatagacgattacctcggaatcgtatggtTTGGGGTGCAATTAACGA
TGAAtgactcgtaacaaaggagaaaataccttAATTTtctactcgtgatt
aatcgttaattgcacaccaaaccatacgattactagttcTAATTAAAATC
ACCCAAGATCACGGGTAGAACCAGCCCTATGGAATGATatgaatttcata
aaaactttttaaaaaacgataaaaaagttaaattttcgtAGGTTCTATCT
TCTGATTTCATTGAGAATAACAGAAGGGGACATCAGTCTAACTTATTCAG
CtatttaatgattttattttatattgatAGCATGTTAACTGATGGAATTC
ATAGCAGCACAAAACAAATGCAAACAAGGTTTTTCAAAAGAGTTGGATTT
CTATTGGTTTGGGTGAgattttagtttaaaaaaaaaactcatttaaAGCA
AATTTTTAGGGATTGACACCTTTAGCTATTATTTATGCTACTTTTAGACC
GTCAGGTTGGTTCAATGAGCATTGGTGAACTTCCTATAATTCTTTTTCAC
CTACCTCGAGGTTTACTTCATAAACACCAGCAATAAATAATCTTTATTAT
CATTTATTTAGTTTTTGGCGTTGTTTCGATACCGTATGTACCCGATGAAC
TACACTTTACCAAAGTTCAAACTAGAAGACAACCCTGCATCATTCTCACC
ACATCTCCAAACACGCATCTTAACTTATCTCTACTTACTCATCTTCAACC
TTAAACTTCTCTTATCACCCAATGTTCTGTGCTACGATTGGCAGATTGGA
AGTATACCACTGGTTGAGACACTATCGGATACAAGAAACTTGGAAACATT
GTTCGGcctttcattttttgttatCACTGGTGTTAATCTTTTGACTTGGG
TTTTTAAAAGGCCATCAAAAGACAGGCCAGTCTCACaaaaaaaCCCCTGA
CCCAAGAACTTTTGTAGTGACGAGTAAACAGTCTaactgacgagttaggc
taactgtctaGATCGCTATTTATCTGGTATtacgccatccacaaccccga
ccgttAAGTGTGTCCACCCCATGTCTGTAGAAATATGAAATCTACATATT
TAGTAGAATAATAATTCTACCCTATATACCCTTCTATACAATATAGACTC
TGTTGTGTAGCAATCTACTAATttgccgtaattctacagaCGTCTGTAGA
AATATAAATctacatattttgtagaataataATTCCACCCG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:2660240..2663480+

>MSTRG.136.1.p1 ID=MSTRG.136.1.p1|Name=MSTRG.136.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6372bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:2660240..2663480+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAAACAATTTAATAACACTACTAATAACATTGGTTTGTTTCATTTG
CTTCTACAACTCGTTGGAAAATGGATTCGTTCATGATGACATATTCGCCA
TTGTCAACAATAAAGACATCCTACCAAATACCTCTGTTTGGAATATCTTT
TACAATGATTTCTGGGGACGTACCCTGATTGATTCCAAAAGTCACAAATC
CTTCAGACCAATATGTACTCTGACATTCAGATTTGATTATATGGTATTTG
GATTGAACCCATTTGGTTATCACTTGGTCAATGTTTTGCTCCACATATTT
GTCTGCAATGTGCTTTTTCAAGTGTTACGAGATATTATTCTATTTGACAC
AAAATTATCGTTGATGGCAACTATACTGTTTGCAACACACCCTGTTCATG
TAGAAGCtGTAACAGGTGTTGTTGGAAGAGCTGATATGTTGTCTTGTCTA
TTCGTACTACTTGCATTCAAGGCTTACCACAaATATCTTGTGACAACTCA
ACAGGATGtttttttCACTAGCGACCTTTTGGTAGTTGTTGCATATGGTA
CATCCACATTCTTCATCAAAGAGCATTCTGTCATGATATTCTTTGTATTG
ATTGGTTACGATGCTCTATGTAATAAACAATACATTGCAAGCATGTTAAC
TGATGGAATTCATAGCAGCACAAAACAAATGCAAACAAGGTTTTTCAAAA
GAGTTGGATTTCTATTGGTTTGGTTTTTGGCGTTGTTTCGATACCGTATG
TACCCGATGAACTACACTTTACCAAAGTTCAAACTAGAAGACAACCCTGC
ATCATTCTCACCACATCTCCAAACACGCATCTTAACTTATCTCTACTTAC
TCATCTTCAACCTTAAACTTCTCTTATCACCCAATGTTCTGTGCTACGAT
TGGCAGATTGGAAGTATACCACTGGTTGAGACACTATCGGATACAAGAAA
CTTGGAAACATTGTTCGGcctttcattttttgttatCACTGGTGTTAATC
TTTTGACTTGGGTTTTTAAAAGGCCATCAAAAGACAGGCCAGTCTCACaa
aaaaaCCCCTGAATGACAAACAATTTAATAACACTACTAATAACATTGGT
TTGTTTCATTTGCTTCTACAACTCGTTGGAAAATGGATTCGTTCATGATG
ACATATTCGCCATTGTCAACAATAAAGACATCCTACCAAATACCTCTGTT
TGGAATATCTTTTACAATGATTTCTGGGGACGTACCCTGATTGATTCCAA
AAGTCACAAATCCTTCAGACCAATATGTACTCTGACATTCAGATTTGATT
ATATGGTATTTGGATTGAACCCATTTGGTTATCACTTGGTCAATGTTTTG
CTCCACATATTTGTCTGCAATGTGCTTTTTCAAGTGTTACGAGATATTAT
TCTATTTGACACAAAATTATCGTTGATGGCAACTATACTGTTTGCAACAC
ACCCTGTTCATGTAGAAGCtGTAACAGGTGTTGTTGGAAGAGCTGATATG
TTGTCTTGTCTATTCGTACTACTTGCATTCAAGGCTTACCACAaATATCT
TGTGACAACTCAACAGGATGtttttttCACTAGCGACCTTTTGGTAGTTG
TTGCATATGGTACATCCACATTCTTCATCAAAGAGCATTCTGTCATGATA
TTCTTTGTATTGATTGGTTACGATGCTCTATGTAATAAACAATACATTGC
AAGCATGTTAACTGATGGAATTCATAGCAGCACAAAACAAATGCAAACAA
GGTTTTTCAAAAGAGTTGGATTTCTATTGGTTTGGTTTTTGGCGTTGTTT
CGATACCGTATGTACCCGATGAACTACACTTTACCAAAGTTCAAACTAGA
AGACAACCCTGCATCATTCTCACCACATCTCCAAACACGCATCTTAACTT
ATCTCTACTTACTCATCTTCAACCTTAAACTTCTCTTATCACCCAATGTT
CTGTGCTACGATTGGCAGATTGGAAGTATACCACTGGTTGAGACACTATC
GGATACAAGAAACTTGGAAACATTGTTCGGcctttcattttttgttatCA
CTGGTGTTAATCTTTTGACTTGGGTTTTTAAAAGGCCATCAAAAGACAGG
CCAGTCTCACaaaaaaaCCCCTGAATGACAAACAATTTAATAACACTACT
AATAACATTGGTTTGTTTCATTTGCTTCTACAACTCGTTGGAAAATGGAT
TCGTTCATGATGACATATTCGCCATTGTCAACAATAAAGACATCCTACCA
AATACCTCTGTTTGGAATATCTTTTACAATGATTTCTGGGGACGTACCCT
GATTGATTCCAAAAGTCACAAATCCTTCAGACCAATATGTACTCTGACAT
TCAGATTTGATTATATGGTATTTGGATTGAACCCATTTGGTTATCACTTG
GTCAATGTTTTGCTCCACATATTTGTCTGCAATGTGCTTTTTCAAGTGTT
ACGAGATATTATTCTATTTGACACAAAATTATCGTTGATGGCAACTATAC
TGTTTGCAACACACCCTGTTCATGTAGAAGCtGTAACAGGTGTTGTTGGA
AGAGCTGATATGTTGTCTTGTCTATTCGTACTACTTGCATTCAAGGCTTA
CCACAaATATCTTGTGACAACTCAACAGGATGtttttttCACTAGCGACC
TTTTGGTAGTTGTTGCATATGGTACATCCACATTCTTCATCAAAGAGCAT
TCTGTCATGATATTCTTTGTATTGATTGGTTACGATGCTCTATGTAATAA
ACAATACATTGCAAGCATGTTAACTGATGGAATTCATAGCAGCACAAAAC
AAATGCAAACAAGGTTTTTCAAAAGAGTTGGATTTCTATTGGTTTGGTTT
TTGGCGTTGTTTCGATACCGTATGTACCCGATGAACTACACTTTACCAAA
GTTCAAACTAGAAGACAACCCTGCATCATTCTCACCACATCTCCAAACAC
GCATCTTAACTTATCTCTACTTACTCATCTTCAACCTTAAACTTCTCTTA
TCACCCAATGTTCTGTGCTACGATTGGCAGATTGGAAGTATACCACTGGT
TGAGACACTATCGGATACAAGAAACTTGGAAACATTGTTCGGcctttcat
tttttgttatCACTGGTGTTAATCTTTTGACTTGGGTTTTTAAAAGGCCA
TCAAAAGACAGGCCAGTCTCACaaaaaaaCCCCTGAATGACAAACAATTT
AATAACACTACTAATAACATTGGTTTGTTTCATTTGCTTCTACAACTCGT
TGGAAAATGGATTCGTTCATGATGACATATTCGCCATTGTCAACAATAAA
GACATCCTACCAAATACCTCTGTTTGGAATATCTTTTACAATGATTTCTG
GGGACGTACCCTGATTGATTCCAAAAGTCACAAATCCTTCAGACCAATAT
GTACTCTGACATTCAGATTTGATTATATGGTATTTGGATTGAACCCATTT
GGTTATCACTTGGTCAATGTTTTGCTCCACATATTTGTCTGCAATGTGCT
TTTTCAAGTGTTACGAGATATTATTCTATTTGACACAAAATTATCGTTGA
TGGCAACTATACTGTTTGCAACACACCCTGTTCATGTAGAAGCtGTAACA
GGTGTTGTTGGAAGAGCTGATATGTTGTCTTGTCTATTCGTACTACTTGC
ATTCAAGGCTTACCACAaATATCTTGTGACAACTCAACAGGATGtttttt
tCACTAGCGACCTTTTGGTAGTTGTTGCATATGGTACATCCACATTCTTC
ATCAAAGAGCATTCTGTCATGATATTCTTTGTATTGATTGGTTACGATGC
TCTATGTAATAAACAATACATTGCAAGCATGTTAACTGATGGAATTCATA
GCAGCACAAAACAAATGCAAACAAGGTTTTTCAAAAGAGTTGGATTTCTA
TTGGTTTGGTTTTTGGCGTTGTTTCGATACCGTATGTACCCGATGAACTA
CACTTTACCAAAGTTCAAACTAGAAGACAACCCTGCATCATTCTCACCAC
ATCTCCAAACACGCATCTTAACTTATCTCTACTTACTCATCTTCAACCTT
AAACTTCTCTTATCACCCAATGTTCTGTGCTACGATTGGCAGATTGGAAG
TATACCACTGGTTGAGACACTATCGGATACAAGAAACTTGGAAACATTGT
TCGGcctttcattttttgttatCACTGGTGTTAATCTTTTGACTTGGGTT
TTTAAAAGGCCATCAAAAGACAGGCCAGTCTCACaaaaaaaCCCCTGAAT
GACAAACAATTTAATAACACTACTAATAACATTGGTTTGTTTCATTTGCT
TCTACAACTCGTTGGAAAATGGATTCGTTCATGATGACATATTCGCCATT
GTCAACAATAAAGACATCCTACCAAATACCTCTGTTTGGAATATCTTTTA
CAATGATTTCTGGGGACGTACCCTGATTGATTCCAAAAGTCACAAATCCT
TCAGACCAATATGTACTCTGACATTCAGATTTGATTATATGGTATTTGGA
TTGAACCCATTTGGTTATCACTTGGTCAATGTTTTGCTCCACATATTTGT
CTGCAATGTGCTTTTTCAAGTGTTACGAGATATTATTCTATTTGACACAA
AATTATCGTTGATGGCAACTATACTGTTTGCAACACACCCTGTTCATGTA
GAAGCtGTAACAGGTGTTGTTGGAAGAGCTGATATGTTGTCTTGTCTATT
CGTACTACTTGCATTCAAGGCTTACCACAaATATCTTGTGACAACTCAAC
AGGATGtttttttCACTAGCGACCTTTTGGTAGTTGTTGCATATGGTACA
TCCACATTCTTCATCAAAGAGCATTCTGTCATGATATTCTTTGTATTGAT
TGGTTACGATGCTCTATGTAATAAACAATACATTGCAAGCATGTTAACTG
ATGGAATTCATAGCAGCACAAAACAAATGCAAACAAGGTTTTTCAAAAGA
GTTGGATTTCTATTGGTTTGGTTTTTGGCGTTGTTTCGATACCGTATGTA
CCCGATGAACTACACTTTACCAAAGTTCAAACTAGAAGACAACCCTGCAT
CATTCTCACCACATCTCCAAACACGCATCTTAACTTATCTCTACTTACTC
ATCTTCAACCTTAAACTTCTCTTATCACCCAATGTTCTGTGCTACGATTG
GCAGATTGGAAGTATACCACTGGTTGAGACACTATCGGATACAAGAAACT
TGGAAACATTGTTCGGcctttcattttttgttatCACTGGTGTTAATCTT
TTGACTTGGGTTTTTAAAAGGCCATCAAAAGACAGGCCAGTCTCACaaaa
aaaCCCCTGAATGACAAACAATTTAATAACACTACTAATAACATTGGTTT
GTTTCATTTGCTTCTACAACTCGTTGGAAAATGGATTCGTTCATGATGAC
ATATTCGCCATTGTCAACAATAAAGACATCCTACCAAATACCTCTGTTTG
GAATATCTTTTACAATGATTTCTGGGGACGTACCCTGATTGATTCCAAAA
GTCACAAATCCTTCAGACCAATATGTACTCTGACATTCAGATTTGATTAT
ATGGTATTTGGATTGAACCCATTTGGTTATCACTTGGTCAATGTTTTGCT
CCACATATTTGTCTGCAATGTGCTTTTTCAAGTGTTACGAGATATTATTC
TATTTGACACAAAATTATCGTTGATGGCAACTATACTGTTTGCAACACAC
CCTGTTCATGTAGAAGCtGTAACAGGTGTTGTTGGAAGAGCTGATATGTT
GTCTTGTCTATTCGTACTACTTGCATTCAAGGCTTACCACAaATATCTTG
TGACAACTCAACAGGATGtttttttCACTAGCGACCTTTTGGTAGTTGTT
GCATATGGTACATCCACATTCTTCATCAAAGAGCATTCTGTCATGATATT
CTTTGTATTGATTGGTTACGATGCTCTATGTAATAAACAATACATTGCAA
GCATGTTAACTGATGGAATTCATAGCAGCACAAAACAAATGCAAACAAGG
TTTTTCAAAAGAGTTGGATTTCTATTGGTTTGGTTTTTGGCGTTGTTTCG
ATACCGTATGTACCCGATGAACTACACTTTACCAAAGTTCAAACTAGAAG
ACAACCCTGCATCATTCTCACCACATCTCCAAACACGCATCTTAACTTAT
CTCTACTTACTCATCTTCAACCTTAAACTTCTCTTATCACCCAATGTTCT
GTGCTACGATTGGCAGATTGGAAGTATACCACTGGTTGAGACACTATCGG
ATACAAGAAACTTGGAAACATTGTTCGGcctttcattttttgttatCACT
GGTGTTAATCTTTTGACTTGGGTTTTTAAAAGGCCATCAAAAGACAGGCC
AGTCTCACaaaaaaaCCCCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.136MSTRG.136Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.136.1.p1MSTRG.136.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.136.1.p1.exon1MSTRG.136.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.136.1.p1.exon2MSTRG.136.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.136.1.p1.exon3MSTRG.136.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.136.1.p1.exon4MSTRG.136.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.136.1.p1.exon5MSTRG.136.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.136.1.p1.exon6MSTRG.136.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001_pilongenomesc0000001_pilon:2660240..2663480 +