MSTRG.13585.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13585.1.p1
Unique NameMSTRG.13585.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000108_pilon:1100967..1122348-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13585.1.p1 ID=MSTRG.13585.1.p1|Name=MSTRG.13585.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21382bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:1100967..1122348- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATATTGTATTAAGTCAGTAAATTTAATGTTTTGATTTCGAGTTTTCTCAC CATGTGTAAAGCACGTGTGTTGTGTGATTGTAGTATAAGTTCCGTGTGGT GAATACAGCCAAACGGATGAAGAACAGTAAGCAGTAAGTATTTGCATCAA CTTCTGTCTTGAAATCAATTTAGACTGTACAGTAATTTAAGGTATTAGTG TGCCTTCATTTCAGTCCTGTGTTGCTTATGTTCTTGGTGTATAATAAAGT GCATCATGGAACCTTTTGTCTAAATTTCTAGAACCACAAATCCAAAATTT GAGGTCAATAGTAATAGATTGCACCTGTACTTCGAGCGCTGTTCTTAATA TAGGGTTTCGTGGAAATAAGGTTTTCTGTGGTTGTGGGGTCTCTGAAAAA AACTGCGAAGGAGAGTAGTTCATATTTTTACAAGGGGGTTTGCTTCATTT TTGCGAAATATATCATCTACCTTATTATTGGAACTAATTTTCGCGGGAAC TAATTTTTGCGGTCGAAAAAAAATATCCAAAAAATTGCATTTTGCGGTTT TTAATTTTCGCGGTTTTTATCATTCTGGAATTTTTGCTGGTTTTAATTTT GACGGTTTTGCCTTTTTTTGGACAAATTTCTTTTATTTTCCTAGGGATTT TCCAAATTTTTCAATAAAATTGGAAAAAAATTGTGTTTTGCGGGAATTAA TTTTCGCGGTTTTCTACTCTCAAAATTTTTTGCGGGATCAAACTTTCGCA ATTTTGACGAAAAACCGCGAAAAACGCAAAAAGTAGTTCCAATAAGGTAT ATTACTAAACGTAGAATTCTGAATGAGCCGTGAGGGAGCCATTATGGTTT TTTGAGATGGGGGTTCGAGAGAAAACGAAAGCAAAAGTGGTCAAGGGAAT AGTGTGGAAATTAGCGCTTTTTTTAAAGCAGTCGTTGCAGTGCAAATCTT 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GTTTTCAACTTTTGTTTCTTATAAGGCTCGCACAAAGGAACTGGGATATC ACCTTTGAAATGGACTGTTCCAGAAAACAAAGTACAACGTTTATTTCAAA TTTGCAACTGTAAGTACACAAAAGCTCCACCATTTTGTGATGCAACTCAT GTTTATTTACCTTTGGCCGTGAAAAAGAAGCAAGAAGAATGTTCAGCTGA TCATTCGAAACAAGTGAAATTATGCACAGGGTGTGGAAAGGTTCCAGATT GGTAGTTAGTTCTGCCTTAGTTTACTGGCTACACAACATTTAGTTACTGG CTACACAACATTTAAGATCTATTCAGCCTGATTACAACAAATCTTTTGCA GATTTTATTGCTGTATTCATCCAGAATCTTGCATACAATATGTCCATAAA AAAGCAAAATATGTAATATATATTCAGTGTGTACCAAAATAAGAGGAGCG GGCGGGTTTATTATACAAATTCAAATCATTCTTGCGGCTTTTGATGACTC AATTGTTTAATTTCTTTTTCAAAAACCCACTTTCATTACCTTGGGAATCT AAGTCTATTGAACATACAAAGAACTTCCTTTTCAAAATTATATAATGCAG CCCATTAATATAGAATGCTTTGAAATTGATTAAATTGATTGAATAAGAAT TAAAACGAATGGTCTACATTTGTGATGGATCAAGTAAACTATATGCATTG ACTTCATATGAATTACTAGGATTTTCATATAAAATCTATTAAGCTTTATT GCTTGGGAAATAGTTAATTGAAAAATACATTAGAGAATGAGATATATTTT CATTGAATTGGGATATTTGTATCCCAATTTTACAGTAATGAACTCTAAAG GACCTTTATCTTTGCGATTTAATTTATCTCTCTGTTTGTTATCTCATGTA TAGATTTTTTGGACCTACCTCCGGGTGCCCCGGTGGAGGTCCTATGAATT AACCCATGTCCGTTCGTTCGTTCGTTTGTTCGTTTGTTCGTTCGTCCGTC CGTCTGTTACCAGCTTTTCTCAGGATTGGCTCATTAAATTTTTTTGATTT TTGGCACAATGATGCAAAATGGTAATGCCCAAAATGTGACGGAGCCCGAT TTTCGAAAAAAAATCATTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAA AACCGGTTTTTTGGCATTTTCTCAAGATTTCATCATTAGTTTTTTCTGTT TTTTTGCAAAAAGATGTGTATTATCAATGCCCAAAATTTGGCCGAGTCCG ATTTTTGAGAAAAAATCTTTTCCGGTCGAAAATGTCGGAAATATGCCGGA AATCGCCACTTTTGCTGATTTTCATCGGACTTTTTCCTTATATTTCGTTG TTTTTTTACACAAAAACATTATTAATAGCAATGCCCACCATGAAGCATGG TTAAATCGTCAATAGAACTGAGTTTTGAAGCCGGAACTTTCTAAAAATCG CCGGAGCAGCCCATTTTCGCCGGAAAAAACGGAATTTCTTGATTTTCTCG AGCTGTACTTTATATTTTTTTATGAAATTTTGCACGCTGATGCAAAATGA TAATACCTAAAATGTATCGAAGCCCGATTTTCGAAAAACATTTTTTTCCG GACGAAAAAGCCGGAAATATGCCGGAAATACTGTTTTTTTGGCATTTTCT CGAGATTTTGTCATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATGCGTATT AACAATGCCCAAAACATGGCCGAGTCCGATTTTTGAGAAAATTTTTTTCC GGCGGAAAATGCCTGAAATATGCCGGAAATCGCCGTTTTCTGGGTTTTCA TTGGGCCTTTTCCTTTTAAATGGTTGTTTTTTCATTCAAACACATTATTA ATAGCAATGCCCACCATCAAGCATGTTTCAATTTTCAATAAAATTGAATC TTGAAGCCAGAACTATTTAAATATCTCCGGAACAACCTATTTTCGCTGGA AAGACAGTATTTCTTGAATTTCTCGAGCTGTACTTTATATTTTTTTATGA AACTTTTCACACTGATGCAAAATGACAATACCTAAAATGTGACGGAGCTC GATTTTCGAAAAACATTTTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATGTGCCGG AAAAACCGGTTTTTTGACATTTCCTCGAATTTTTATCTTTTATTTTTCTG ATTTTTTGCAGAGAGATGCGTATTCACAATGCTCAAAACATGGCCGAGTT CGATTTTTGAGAAAAATTTCTTCCGGTGGAAAATGGCGGAAATCTCCGTT TTTGCAGATTTTCATTGGATTTTTTCCTTATATTTCCAATTTTTTTTCAC ACAAAAACATTATTGATAACAATGCTCACCATCAAGCATGATTCAATTGT CAATAAAACTGATTTTTGCGACCAGAACTTTCTATTTATTTTTTCCTTAC ATCCCTTTCCTCTCCCTCCATCAACAATCAATGATGAATTTTTTGCTTTA TGCATTTTCGCCAAACGCTATATTTTCTGACTGATTTGCTATCTAACTTT CATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATCTAGCTTGTTTATTTCGACTTTAT TAGATTTTACAGTTTGTATAGTAATTTGTTACAAAGAGAACATGGAACAA ATCTGAATCAATACAGCATTACTTTTTTATACTGACCTTTTAGTAATTCT AAAGACTGGTTTCCCAGATTTGAATCATGATTGCCACTATAAGCAATCCA TCAATAATACATATTTTTATTCTAGTAGATTAGAGAAAAAAACAAAATGA AGCTTCATCTAATATTGATGCAATGTATTATTATGGTCATTGCCACAGAC ATCAACATCATTGATTTAACACATGAATTTGAAAATGGTACATCCCCCTA TTGGAAAATGGAAAATTCTTTTCATTTCACCTCCAGTTTTTCTGGTCAAA CAGCAAATTACTTCTACAGCAGTAACTCTTTTTGTGCATCAGAACATGGT GGTACCCATTTGGACGCACCAATTCATTTCGCCAAAGGGAAACATACAGC TGGTGAAATCTCCTTAAAGAATTTGATTGCCACACCTTTCATTGTGGATG TATCGAGTCATGTGAACAATGATCCAGATTTCCAAGTTGATGAGCAACAT TTAATGGAAGCAGAAAAGAAAAATGGGAAGATTCCGGATGGGGCAATACT ACTATTATATACTGGTGAATTTTCAATTTTTGGGACCTCGGACAGCCTTG GTCTTCTCTTTTCATTAGTTTCAATCGCATAAACAGTGATCTGTATTAAT TTGCAGAGTCCAAAGACTCTCTCACATTTCAACATCTTTGGCTATTCTTT CTATTTCGTGTTTCTTTGGAAGAACAGTTATGGTTATTTGCTTCTACAAT GACAATTTTCCCGTTTCAGGTTTGAGTTTGAAATATGACGATTTATCAGC TTATTTTGGAGGCGAACCACAAAATTCTTCAACTTATCATTTTCCTGGTT TGCACCCAAATGGCGCCCGATGGATTGTTGACAATCGAAATGTAGGGAAA TAATTTTTTTATTGCTTTAGGTTAAATTTCAGGCTGATGGAGGATATTTT TCAATTTTACTCTCTTACTCAGTATTTTGTAGTCTAAATATAACTTGCAA ACCTTTTCAAACTCTTTGTCCTTTTACATCCACATGAGCATGATTCGATG GTTTTTTCTGTAATTATTTCGATCAGTAAAGTTGTTGTTTCTACTTTCAC TAGGTGAGCGCAGTAGGCATCGACACTCCATCTCTGGATTTCGGACAAAG TACACTCTTCCAATCTCATGTCATTCTATTCACTCATAATATACCAGGAT TCGAAAATGTTGATCTCACTCAGATCGAAAAAATACAATCAATGAAAAAT CCATTAATTATCGCGCTCCCGATGAAAATTAAAAATGGTTCAGGAGGACC GTTAAGAATTGTTGCCATGGAAACTCCGACAGCTCCTTCGGCTTCCATGA GAAACGTCATTTCATTGTTCATGGTTTTAGCATGTTTCAGCTTTGCTGGG CAGTTTGTCGTTTGAGACTGATATATTGAGAATTGAATTGCAGGCCTTCT TTAATTGCTGATGAAAATGATAAACTAACTTTTTTTTATTATGTCCGGGA TTTTATTTATCAACACGACTTGACTCAATTTCTTTACCGATTTTTGTAGA ATTTTTGTAAATAATCAATTTTTAGACTCGTATATTTTATATCTCACAAA ATTTGTTAAAAATTTAATACTTGGAGCAAGAAACGATATTTTCGCTTAAA TGACCAATTCTCATAATTTTTTACGGATGGGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000108_pilon:1100967..1122348-

>MSTRG.13585.1.p1 ID=MSTRG.13585.1.p1|Name=MSTRG.13585.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2556bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:1100967..1122348- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGAGCGCAGTAGGCATCGACACTCCATCTCTGGATTTCGGACAAAGTAC
ACTCTTCCAATCTCATGTCATTCTATTCACTCATAATATACCAGGATTCG
AAAATGTTGATCTCACTCAGATCGAAAAAATACAATCAATGAAAAATCCA
TTAATTATCGCGCTCCCGATGAAAATTAAAAATGGTTCAGGAGGACCGTT
AAGAATTGTTGCCATGGAAACTCCGACAGCTCCTTCGGCTTCCATGAGAA
ACGTCATTTCATTGTTCATGGTTTTAGCATGTTTCAGCTTTGCTGGGCAG
TTTGTCGTTTGAGTTTGAGTTTGAAATATGACGATTTATCAGCTTATTTT
GGAGGCGAACCACAAAATTCTTCAACTTATCATTTTCCTGGTTTGCACCC
AAATGGCGCCCGATGGATTGTTGACAATCGAAATATGAAGCTTCATCTAA
TATTGATGCAATGTATTATTATGGTCATTGCCACAGACATCAACATCATT
GATTTAACACATGAATTTGAAAATGGTACATCCCCCTATTGGAAAATGGA
AAATTCTTTTCATTTCACCTCCAGTTTTTCTGGTCAAACAGCAAATTACT
TCTACAGCAGTAACTCTTTTTGTGCATCAGAACATGGTGGTACCCATTTG
GACGCACCAATTCATTTCGCCAAAGGGAAACATACAGCTGGTGAAATCTC
CTTAAAGAATTTGATTGCCACACCTTTCATTGTGGATGTATCGAGTCATG
TGAACAATGATCCAGATTTCCAAGTTGATGAGCAACATTTAATGGAAGCA
GAAAAGAAAAATGGGAAGATTCCGGATGGGGCAATACTACTATTATATAC
TGGTGAGCGCAGTAGGCATCGACACTCCATCTCTGGATTTCGGACAAAGT
ACACTCTTCCAATCTCATGTCATTCTATTCACTCATAATATACCAGGATT
CGAAAATGTTGATCTCACTCAGATCGAAAAAATACAATCAATGAAAAATC
CATTAATTATCGCGCTCCCGATGAAAATTAAAAATGGTTCAGGAGGACCG
TTAAGAATTGTTGCCATGGAAACTCCGACAGCTCCTTCGGCTTCCATGAG
AAACGTCATTTCATTGTTCATGGTTTTAGCATGTTTCAGCTTTGCTGGGC
AGTTTGTCGTTTGAGTTTGAGTTTGAAATATGACGATTTATCAGCTTATT
TTGGAGGCGAACCACAAAATTCTTCAACTTATCATTTTCCTGGTTTGCAC
CCAAATGGCGCCCGATGGATTGTTGACAATCGAAATATGAAGCTTCATCT
AATATTGATGCAATGTATTATTATGGTCATTGCCACAGACATCAACATCA
TTGATTTAACACATGAATTTGAAAATGGTACATCCCCCTATTGGAAAATG
GAAAATTCTTTTCATTTCACCTCCAGTTTTTCTGGTCAAACAGCAAATTA
CTTCTACAGCAGTAACTCTTTTTGTGCATCAGAACATGGTGGTACCCATT
TGGACGCACCAATTCATTTCGCCAAAGGGAAACATACAGCTGGTGAAATC
TCCTTAAAGAATTTGATTGCCACACCTTTCATTGTGGATGTATCGAGTCA
TGTGAACAATGATCCAGATTTCCAAGTTGATGAGCAACATTTAATGGAAG
CAGAAAAGAAAAATGGGAAGATTCCGGATGGGGCAATACTACTATTATAT
ACTGGTGAGCGCAGTAGGCATCGACACTCCATCTCTGGATTTCGGACAAA
GTACACTCTTCCAATCTCATGTCATTCTATTCACTCATAATATACCAGGA
TTCGAAAATGTTGATCTCACTCAGATCGAAAAAATACAATCAATGAAAAA
TCCATTAATTATCGCGCTCCCGATGAAAATTAAAAATGGTTCAGGAGGAC
CGTTAAGAATTGTTGCCATGGAAACTCCGACAGCTCCTTCGGCTTCCATG
AGAAACGTCATTTCATTGTTCATGGTTTTAGCATGTTTCAGCTTTGCTGG
GCAGTTTGTCGTTTGAGTTTGAGTTTGAAATATGACGATTTATCAGCTTA
TTTTGGAGGCGAACCACAAAATTCTTCAACTTATCATTTTCCTGGTTTGC
ACCCAAATGGCGCCCGATGGATTGTTGACAATCGAAATATGAAGCTTCAT
CTAATATTGATGCAATGTATTATTATGGTCATTGCCACAGACATCAACAT
CATTGATTTAACACATGAATTTGAAAATGGTACATCCCCCTATTGGAAAA
TGGAAAATTCTTTTCATTTCACCTCCAGTTTTTCTGGTCAAACAGCAAAT
TACTTCTACAGCAGTAACTCTTTTTGTGCATCAGAACATGGTGGTACCCA
TTTGGACGCACCAATTCATTTCGCCAAAGGGAAACATACAGCTGGTGAAA
TCTCCTTAAAGAATTTGATTGCCACACCTTTCATTGTGGATGTATCGAGT
CATGTGAACAATGATCCAGATTTCCAAGTTGATGAGCAACATTTAATGGA
AGCAGAAAAGAAAAATGGGAAGATTCCGGATGGGGCAATACTACTATTAT
ATACTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13585MSTRG.13585Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13585.1.p1MSTRG.13585.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13585.1.p1.exon4MSTRG.13585.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13585.1.p1.exon3MSTRG.13585.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13585.1.p1.exon2MSTRG.13585.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13585.1.p1.exon1MSTRG.13585.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000108_pilongenomesc0000108_pilon:1100967..1122348 -