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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000108_pilon:966507..983854+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13578.5.p1 ID=MSTRG.13578.5.p1|Name=MSTRG.13578.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17348bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:966507..983854+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAATTGAGCAACAAAGTTGACCAGCTATCAATGGAATCAAAATCTCTAAA
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AATCGTACTAAggggggggCTGCTTCTGTTTGGAGGTCAAATTAATGGTA
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gaaaagccccccctagTTTTGGActgcccctaaaagcctagtatgaatag
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CCAAAGGATCGCTGGTTGTATTGGATGACGTCACTGATGTTACAAAAGAT
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ATTTATGGTACATTCATGTTTTTCGTTTGATCATGAGTGGTGCACTCAAT
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GACACCGTATCGGCGTTTGCGGCGATGGACACCGTCTAGTTTTACctata
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AGCGAGTCAAACGAACAAGAAAGGTCGACACTGGCAACTACCCCATaata
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aaagaagatatcGATTTCGTTACTGAGCTTCTTCTGAATGACGTTAATTT
AAAGACTCAACCAACCTACGTCTCTCGTGTTGGAAAAGAATCTAAGGTTA
TGCGcccaatcaaagttgtattcaaaagacagtcataacaaatacagatt
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GTATCACCGACGACTTGACAAAAATGGAGAGGGAACAAATCAAAGAGTGG
AAAAAGAGAGCAGACGAGATGAATAAAGCCAGATCGAATGACGATTTTAA
ATGGAGGGTACGAGGAAGCCCtcgtgaaaaattatattttaaaaagattt
tttgtacaagaacggtttagaggcccttgtGCCTCAactgtaatcacctt
acaaattgtaaagtagcgttgacttttattagcctttgttgctacctgtt
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CCTTGGTTTATTATGTACGAGAAGTTAGTTACTTCATCAATCCACACCCT
TCTGATGTGAAAGTGACctttataaaaactttgaagTCATTCAAAAAAGC
TGACATGTTgattttcattcttcttttttatctaGAATTGTCCACAGTGA
TGGATTCGAAATTGACGTTGAAAGCTGACAAATTCCAAATTGATGGTAAA
GTTTATGGCCAAAAACCTTGCTGTATTTATCAATCTTTCGAAATGGGGCT
ATTcgatgaaaaaatgtttcaagtgtTCCAAGATCTTTACCAATGATTAG
TCTTcacaaagtttgttttttatccTTTTAAAGGAATGTTGCTGAATAAA
AAGGCCTTTTTAGATAAATATCTTCTTGTTTTAACAGAATTGTTCAACAA
AGTTGACCAGCTATCAATGGAATCGAAATCTGTAAAGGGTAAAGCTTTAG
TTGTGATTTTATTTTCTCTACCcatgcttaaccctattcatactaggggG
GTGCTTGCTTCTGTTTGGAGGTCAAATTgatggtaatagctcctgaaata
atagagcttttgccatgaaattttctgttaacttttatttagcttcaaaa
tTTCGACACCTAATGTATTCCAATATAAATATATTTTTGCTTTTGTTAGA
ATACAATCGCTATATATAAGAACAAAGTAAATTTTCGGTTTTTGCTCACT
TTAGGCATGATAAGTGACGTCATTATAAAgattttttgtcaaaagttgcc
ttatgtgacaaggatcttgtgtgccaaatttcatctaaaaagacccacta
gatcaaaagttaggagtggtacaggaaaagccccccccccctagttttga
accgcccctaaaagcctagtatgaatagggttaaacctgaatttattcaa
agaaactttatttattttttgtcacCTTCTTTTGTGTTCCTTCTAGACAC
AACAAAGACACATTGGAATTTACCAGAGCCTGTTTCCATCTTCTTTGGAC
GAGAAAGAATGATTGAATCCATTCACTTGAAACTTCAACAAAATCAAGCG
GTTGCTTTGAGTGAAATGGGAGGTGTGGGGAAAACACAAACTGCTGCAAA
GTTCGTTCAAATACACAAGGATGAATATCGGAAGATATTTTGGATTTCTG
CTGTCAGCCTCAAGAGATCTCTGAACGAGATTTTGTGCGCATTTGGTTGT
AAACAACTAATTCCTGATGAACCTTCGATGGAAACTCTTGCTTTCATTTT
CCTCTCTAAGATTTGTGAAGGCTCCAAAAAATCGCTGGTTGTATTGGATG
ACGTCACCGAGGTCACAAAAGACGTCACTTCATTCATTCGaaatgtgaaa
gaaaaaatcagctTATTGTTGACATCTCAATTGAGGGATTGGGAAGATTA
TGGTTTGATTCAAATTGCTGTTCCATGTTTCCAAGAACAAGAATCCATTG
GGTTCTTACAGAATGAACTTTCTTCAGCAAGCCAACAAGAAATCTCCATT
TTAGCGAATCGTTTACAATCATTACCTTTAGCCCTTCACCAAGCCATTTG
TTACATCAAAAAACATAAAGTTCCTCTACACAAATACATTGAACAATTTG
AAGCAtgcagaaaaagtgttttgggAATGAAAATTAATTCCTTTACTGAA
TATGACAAAACATTGTTGACAGTTTGGGATATGGCTTTTGCGAAGATTCG
GGTCGAATCAAATAATGCTCTTTTGATCTTGGGAATGATGGCTTTCATGG
ACAAtcgaaaaatcaacaaaaagacATTCAGCTATTTTGATAAAGTTGAC
GAATTTGAATTAAATGAAATAATCAATCTTCTTTGTCAATATTCATTGGT
CAACGAGCGGAACGAATGTTTAGAAATTCACAGTCTTGTGCAAAAAGTTA
TCCGATATCGTATTGAACAAAAACAATTTGTTGAGGATGAAAGTCCGTTG
ACACTGCTTGAAGttgttcttttgaaaatcgAGGTTTCTATTAAAGATTT
GGAATTAAATGCTGACTATGAGGATTTATGGTACATTCATGTTTTTCGTA
TGATCATGAGTGGTGCATTCAAAACTATCAACTTTGATGTTTCCCGGGTG
TTGAATATCGCTGTAGGCAGACTGGAGATGGAGAACTTATACCAACTTTC
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TGGAAACTTTTCACACGTTGTTGGTTGTTCATCGTTGTTTCATAGGCGCG
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AGCTACAGGAAGCTGAGACATATAATGTACATGGAAGAATGTCGTTATGC
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TGATAATATTAAATTAAGATTGGCGAGGTTTTTTACTGTAAAGGAGGTTG
AAGTTTTGTTGAATTCCGTTGACACAAATAATCTCAGTGACATGAACTTT
CTGCTGTATTATGATACAAAATGTTCTTTATACATCATGAACGGTTGCTT
TGATTTGGCTGAACAAGTCATGAAGAATTGGAAAGAACATTTACACAGAA
AACAATATTCTCGATCGTCTCAGTTTAACTTCCCAAAAAGGAATTGcttt
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GATGGCTTTAACCTACGTAATAATGGAATTATCATTCAAATTAGTTCATA
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gaaaataaaaattttcatgaggATAAAATTTCGGCGAatttaaagatgaa
aaaaacaacTTGTTTTTGCTTAAGGTTGCTCAGAAACGATTTTGGCTCAT
AGATTTTGATACCTCCGAAACAAAATCCGTTTAGTGTAAAATTTTACTGA
TGATTAGTTTTCAAATTTGTAGtttaaaacaacaacaaaaaaaaatgt Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000108_pilon:966507..983854+ >MSTRG.13578.5.p1 ID=MSTRG.13578.5.p1|Name=MSTRG.13578.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4110bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:966507..983854+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGAGGTGTGGGGAAAACACAAACTGCTGCAAAGTTCGTTCAAATACA
CAAGGATGAATATCGGAAGATATTTTGGATTTCTGCTGTCAGCCTCAAGA
GATCTCTGAACGAGATTTTGTGCGCATTTGGTTGTAAACAACTAATTCCT
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AAGttgttcttttgaaaatcgAGGTTTCTATTAAAGATTTGGAATTAAAT
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TCGATCGTCTCAGTTTAACTTCCCAAAAAGGAATTGctttttactttata
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CAAAAGCACGACTTTGAGGCAGTAGTAAAGCTCCTCGCAAATGTGGAAAA
TGAGCCTTtgtcaaatcttttgtttttggtAAAGGAATATGCGAAACTGC
ATCGACAGCTCGGAAATAATAAATCGAGAGAATTGGTTGAACGATGTTTA
CAAATGAACAAAATTGTAAATGAGTTATTTCAAGTACAATTGGAttcgat
taatttttga
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000108_pilon | genome | sc0000108_pilon:966507..983854 + |
|
