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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000108_pilon:276037..299985+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13534.1.p1 ID=MSTRG.13534.1.p1|Name=MSTRG.13534.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23949bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000108_pilon:276037..299985+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGCTTTTATAGCCGCCCATCGAGAAATTATTGaacaggtttgttttgatt
ttgcttcacattcgaaattcaagatggcggatgaaAACAAGATGAGCGTG
GTCAAAGATGTTCGGCCAGGaaccaaaaatttgaatttagtcTTCATTGT
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ttttttaatttgttcttggATATGTTTCTCATAAGTCAACTGAGTGTCTA
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gttttaCCCCCTCTTTTTcccccccTCACCcatccaaaattggaaaattg
gtttcctCTCCcttttataaaggggggggggcactatgTATATATACGGA
TTGTTTTCTTCTAAATGATTCTGTATCTTGGCTCgtacaatcttttcaaa
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GTCCTTGATTCCCTTTCTTGTAAACTGGGGATATATGTCCagttggtgac
taaaattagagccgactaaaaatttgggccgatcTAATGCAATCTGATGG
GCTAAAAATGCGGACGTAAATGCTgtattacattttttattttcataccg
ggtgtgccagaaataagttaccctctttgatttgatattgcagGCAGTCG
TAAACTGATCTTTCAAAAGCTGTTTCGGAATCATTAAGCCTAACTTTGGT
AGGCATTGGTAAGATTTGgtatattactttttaattttgcttcaTTGGTT
CAAACGTTCAAAAGGTATGTACTaaaaactaaaacgtcaatttaaaaaaa
aatatcgaaaaaggcaaaaaacgAGAGTATTGAATTAATTTGGGTCacca
tagtgtccttcagggtctcttccccccatgcctagaatgaaaatttttcc
attccccccccccctcatttttccccaccctgcctccaaaaatttctcaa
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ggatgattgtttttaaaccataatattaataaaaccaagcattatgctat
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ATCAAGCTCACAATATTGTGTATGGCGTTATATTACTTTTATACTTTGGA
GTGTTTGATCTTTGAATGGatgctttaaaacaaaaatctttctcCCCGTG
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ATATGGTGAATATGGtctgaaattatgaaaaaactaTAGAGTTCTTTAGA
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AATGGCTTTCCTTTATCATCTCATCTGCTCtttttttAACATGTATAATT
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caattttttaacttgttttctCCTATTTATTATTTCTTCAGGTAAACCCA
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TCTGGTTCCATCAATATGTCAGTATGGAATGATTATGGAGCTGCTATACA
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ttgaaaatatttcccggtttttggacctaccccggtggaggtcctataaa
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taaaaacggggtttttggactttgtgaaaaattggatcattaattttttc
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TGTATTGATTAGCAATTGCTCAGTTATTCAAAGTTAGACGCCATTATTGT
AGATTTTGACCCGTTGAACTGCACTGTCTGtcataatataaaaatcaaat
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TGATCTTTCTTATTAGATTTTTGTTGAAGTAAGTAAGTTTTCAACTGCAG
TCTAGGGCaacccaataatttttttaagtcagCTACGGCCGTAGTTCCTA
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tttttttCTGGTCAAAGATCTCCACTACGATTCAGATATATCGAGCTCTC
TTACAACATCTCCAGATAGCGCAGTACTTTATTAAGAGTCTcgattattt
tcaatatttattttagtttttctcGACAATTAGTTCCCCTTTTTGCCCAT
TTCTAACTACTATATTCATAGTTATATTCATTCTTGTAGGTTCTGTTTGC
TATTTTCGGAAGTTCCAAATCTGAGTGATCCAAACCAAGACTTTATTCAA
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AAAATTGTTGGAAATAAGGATATTGACGGAGAAGAGTCCAATGGCAGCCA
AAAGTGgcacttttcaaagtctttttcattaaaaaaggcTGTTTTAAGCA
CAATTTAGGTGATTTCATGAGGGACAGCGTCCGATAACCGGGCACTTAAA
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TGAAATTGTTGGCTGGTGACTGTGTATATACTTTCTATTCTTCTTTGATC
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TATCTTCGACGGTCAGAAGTATCTTCGACGGTCAGAAGTATCATCTTTGA
CGGcccattttccctttcctatctttcacctTATCTGTCTTTTctacttt
ctgagacttagtttctcatttctgacttagttttcatacctgtcaatcat
ttgtccatcaatttcggcctttctaattttcgcaccgagtgggattcgaa
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ttttggtttttagtTAGCGGATCTTGAGAGGTTAAAAAGCTGCAAAGCTT
TCTGCAAAGCTAAGAACGAAATGTTGCAATTTTAGCTACTTAAAATTAGA
GGTCTTAGCTTCCAATGTTGATTTGTAAAATCAGAATCTGCTGTTTCGTT
ATTCAGGGCCATACATAGTACCAGAAATCACGTGTCGTTGTTTTGACTTA
TCTTGAGAGGTTTAAAATGTTATGACTATTGCAATTACTGATTAAGATTG
GAGGCCAATTATAGGGCCACACAGAATATACAAAATCACGTGGAAATCAC
CATTttcttgtttatgtttttttgtactTGTCCTCTCACAAGTGTCTCCT
TTGTGGTGTTGCACTTTATTTCAAGAGCCACTTTCATGCACTTGAAAGGT
CTACGTGCTCCCATGCttgtgttcttttttgtcagAGTGCATTTGAATAT
AGTACTGTGATTCATACAGTTACATTCCCTAATTTGATTTAATTCCagct
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atttttcaaaagatttcccTGTAACTTTTCCCTTTAGAAGTTCGAATTAC
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TTGATGTTGTTTTAAAGGTCTATTTTCATCTGTTtcggaaactaattact
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TGATGTAAATGCATGTAGATTGGTATTCTTTGACGTAGACTACAAATAAG
AATATCAGGCTTATTGTATACACTTTGTATATAAGAAACAGTAACTTCAG
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TATATAAACCCTATAAACTATACCTACTCTGCTTCGAATCGTGTCTTCTG
AAAgtagttttttgtcaaaaattgtctcaatattgctgacgtcagcatct
GCCTTTTGAAGACATATCGTCCATTTCCGAGGACTTTATCGACAAAATTG
GAGAAATGGCCTTATTTTACTCTTCAACAAGCTCTACCGCATGGTCAAAT
CAGCAAATTgacttttcaagaatttctagGCCAAAATGACGTTAACCCCT
TCAATGATCCGTAGAAAGTTTCCCCAGCTTTTCCCAGCttggaaaaactg
gttttgaagTCTTAAGGGACCATATAGTATCTGTGAAGATCTAACCCCTG
ATCAAaggaaagaattcaaaaatcttGTAATTGAAGCTAAAAGAAAGAAT
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CCACATTTGATCCCAATTTGTCAAGTTAAGTCAAAGGTTGGTGCACTGAG
AGAACCTCATGAATACGAATTTGAAGAGTATAAGCTGGTGAACCattaga
ctagcaagcgtctgtctttccttggacacaggaacgcgggaatagtgctt
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TAATCTCAGGCAACGTTCCCTCGAAAAAGAGGGAAGATAAAATGAATGGA
CAcggcttattttttcttctattctcATCGCAATATTTGAGTTTCTCGGA
GTTAtggatgagaaaaaaattataaacacaaaaacagaaaaacgtGGCGA
GGACTTCTCCAACTTTTTTGCTAAACTGAGAAGAGAAGTTTTTGCTTTTA
AATGTATATAAACACAGATTTAAACTGTCTTGGCATTATCTATCTGAGAT
ACTTTATTCATACATTGTTTCTGGCTTGGTTGGGACGTTGATTTATTCAC
AAAAACAAACTAACTCATATATGGATTATACTTTTTCATGTGATTGTtgt
gattgaaagattttttgattgtGTATGGTTATAAACATTCATGACATGTT
CTAACACTGGgatcttttaaattttgttggctTGGTACGCTGGTAAATCT
CTAGTACAAGTGCAATATTTATGACATTATGACACAGCTGAGCTTCCATG
ACTACATGCAGGATACTTTTTGCAGGGAATGTTCAATATGTTAATATGCT
CACATTCATTGGGTAACAGATCACTGCTTTTTTCTATGGGTACAAGTTAA
ACCTGATAACCTTATCCCAGAGAATGTAACTCCAAAATGGCTAcagaaat
cctcaaaaattatAATGGAAAGTATGGTATTTATATAACATTTTGGTGGT
GCAATACTGCGCAATATGTTGcaacaaatgatgaaaagtgaagtggtaat
ttggaatttaaaaattgaCTGCTTTTTATGCGGAAACAATATTCTGACAA
GCTGACCACTGAGACACATCTTGGTTCTATTTGtgaatgaaaataacaac
attttacaTTGAGATGACTGGTTTCCTGGGCTTTCGGATGCCCGTCGTTT
AGCTGGAATTCACTACCTTTGACTCTAAATGTTAGATGTACGAGGATGTT
TAGGGTTTTCACTACTGGCAGACTTCCAGGgtgggggcacttaggcaaaa
ttaagTACGGGGACATACCGCtgatcagggtccctttttcagacTCTAGA
GATATCTGATAGGGTCCCAAAATTTACCGTGCGAtttggtaacttgcatc
agtggaggctaacatgcatagctctcaaatgaaagacctgactggtcatt
aaaatacaaagttaaatcaaaacaaaaatggtagagtagagctgcgagcg
gagctgcgtagttgtattttaatgaccagccaggtctttcatttgagggc
tatgcatgttagcctccactgatgcaagttaccaaaTCTCACggtactaa
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cttttgtctactttaaaaagtcacTTTTGCCAATTTACAGGGTTGAagtg
ggaaaatattttgattttttcgatcaaatcatttttcgttctgaatgggt
cccaaatttaccaaacattcacatctcacagggtccacttttcaaactcc
agcggcacgtcagttaccaaggtcagtgccccccggCAGACTTCTACCTT
GTCATTTTGTGTTGTCCCCTGGTGTTGTTGAACAAGTTCAGACTGAAATT
TATacgtcaaagtttttcaaacttacagttttaaagtttatgaaaatttt
gattggatttttgccaattaaaaaaaaaatctacttggaTTTAGAAGTAA
TTTTATGTAGATACTATATATAtcatttttatagcaaaattgaAGGTCAA
TATGAACAAATACgtataattttatgttttgtaaaAGCTGTTGctcattt
gaaaacatttttctttttggcttctacAaaaaaaaaaaaagttttcttat
gcCTACAGTGGCCtgatcttttatatttttgatgtcgtttttctgaaaaa
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tggggTACCTATAGCGGGTAGGTACAGTCCAGTTCATATTCTTTTCATTC
AgacaaaaatatcatattttttgtgAATAACTCCTTGTCTTGTTGTTGGT
ATCTTGTTAGTGCATTTATGCATGATAATTATGGgagaaacaattttttc
aaaaaaaaagctcCTAAATTGACTGATATTCCATTGtactcaccttcttt
tataatattaaattcaaaaaataatcaggatgtgaaaaaaaaaataataa
taataataataaagcataaaaagtaccgagttttgtttacttttttattc
taaTCTGTGAGAGTGAGTGCGCTGTTTTTTGTGAGCACTCCGCCGCGGTA
TGAAAAGCACTCCACCGTTTATTTAGTAAATAGCGCCATTTGGAACTAGT
cgttgtattcagtgaacatataaaaaaatagatcccattgaaagtttaat
ctgcagcgaaatacaacgacgtggtttactagtctagtgaACCATGAAAA
TATAACATCaaaaaaaGGACGCGGGATCATTATATTAGCTCACAACTCGA
TCAAGCATCTAatagttggtgtaaaatcggcGACAGAATTTGATGAATCA
TGCATAATCGAAATTCGACTTTGCGGCAGGGATGTGTTAGTTTTTGGATG
CCTTTACCGTagtccaacaaacaacaatcattCAGAAGAAAACAACGATA
AACTGAACGAGCTGATCAAATCTATTGCTTCCGAGAAGAGACACACTCAT
AAATGTCTCTTAGGTGATATGAACTATCCAACCATAAACTGGGATAACTG
GACAACGTCACACTCTGAGGAAAGTaaggaagaaaagtttttggACGCTC
TCAGAGACGCGTTTTTCTATCAACTTGTTGATGAACCAACGCGATACAGA
GGAACAGACGAACCTTCAACGATAGACTTAATACTTACTCATGAACAAAA
TCAAGTAAGCGACCTTCAGTACCTGAGCCCCCTTGGGAAGAGCGACCATA
GCATATTGGTGTTTACGTTTGATTGCTACACTCAACGCAAACCCAATTCG
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GAATGATGGAGAATGGTCGAAAAATTTGATCAACGAATTGAGAGGAAAAT
TAGTAACAGATATGTGGACAATCTTTAAAGGAAAAGTTCTTGATCTGAGA
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GGGAGCTATACCAATCAAAAAAGAGGTCCAGAATGAGATAAAACAAAAAC
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AGGAACCGTACAAACTAAGTAACATCACGGAACAGAGTGAACCGAAAGAT
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GTAAACCAAAGATCTTGGGGTTTCATCCCTGCTCGAAACACCAAATGACA
TTTCATCTTTAAGACATGAAGACCATGAAAAAGCAGACATCCTGCAGAAA
CAATTCTGTAGTGTTTTCACAAAAGAACCCGAAGGAGAACTACCGGAATT
CCAGTCCCGCACAGATCGCGTCATCAAAAGAATACCAATAACAAAAGATC
TTGTTTACAAATCTATACTGAAACTTGATGACAACAAATCGTTTGGTCCC
GATGAAATGcatccaaaaatgttaaaagaactTGTAGATTATATCGCAGA
ACCCCTTGCACTTTTAATGATCGAATCGTTATCGACAGGAGTCCTACCGG
AAGAATGGAAATTATCATATGTAACTCCAATTTATAAGAAAGGAGCACAA
AATTTGACTGTTAACTACCGACCTGTAAGTTTGACATCGATCGTTTGTAA
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CCTGCGACGTCAAAATAGTGACAATAACGTCAAACAAATGCCAACGGACC
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GGACGAAGTGGTAGCATGGAAAAAATTGGAGAGTTCTGTTTGCTATTTTC
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GCCAACGGACCCTCGACAAAGGGGAAATCCTGCTGCGGCATCGGCTCCTA
AACCCGCTCAAGTAAATACGAGTAGAGACCCACGGCGACGTTGAatggcg
gatgaaAACAAGATGAGCGTGGTCAAAGATGTTCGGCCAGGaaccaaaaa
tttgaatttagtcTTCATTGTCATTGATGTTGGTAAACCCAACAAAACCA
AAGACGGGAATGACATTCGAACGGTCAAAGTTGCTGACAAATCTGGTTCC
ATCAATATGTCAGTATGGAATGATTATGGAGCTGCTATACAACCTGGTGA
TATCATCAGATTCACTAAAGGATATGCACAAATCTTCAAGAACCAATTGA
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GTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000108_pilon | genome | sc0000108_pilon:276037..299985 + |
|
