MSTRG.13496.21.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13496.21.p1
Unique NameMSTRG.13496.21.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000107_pilon:686015..708535-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13496.21.p1 ID=MSTRG.13496.21.p1|Name=MSTRG.13496.21.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=22521bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:686015..708535- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:686015..708535-

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TTATGGAGTGAGTTGGTATTTGGCAAACGACATGCAATTCTACATCATTT
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TTGGATCGGAACTCCAGAAAAGAATTGCCATAACATGTGGTGGACAAACA
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TGTCTGTTGATTCCTTCTTCGTGTTGAGCGAACAAGTTGTTGAGTTTCTT
GTTATGTTTTTCATTGGTGAAAAATTCAAAATCGATTTTCAACACAAATG
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TGGTTTACAATTAGTAACAAGTGTTGGAGCAGGGGGTGTTCAATATTCCG
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ATTAACGACTGGTGTTTTTCTGTTCGAATATTTGTTGGCTAACGGGCTTA
TAATTCATTTAAAGAAGGCATCTCCGATCGTTGCTCAAGCTATCGACCCC
AGTGTTATGGAGTGAGTTGGTATTTGGCAAACGACATGCAATTCTACATC
ATTTCACCGTTGATCATGTGGGCTATGTACAGGCTTACCGCATCATACCT
TTACTTGATCTTTTTCGTGGTCTATTTATATCCTTTGTTGGGGAACGGTG
TTCGTTGGATCGGAACTCCAGAAAAGAATTGCCATAACATGTGGTGGACA
AACATCCTATACATCAATAATATCTACCCTACTGATGCTTCTAAAGCGTG
GATTATTGGTTGGATATTTGAGTTTCAAACGATTTGAAACACATGGCAAA
TTACCTTTACTGAGATATTATTTACATCGTTATATCAGATAACCCTGTCT
CATTCCTGAAATGGGGACAAAGATTTTCATTTCAAGTCATCGCAAATGCT
TTCGTGTCTGTTGATTCCTTCTTCGTGTTGAGCGAACAAGTTGTTGAGTT
TCTTGTTATGTTTTTCATTGGTGAAAAATTCAAAATCGATTTTCAACACA
AATGTTCCACCAGGAGCAATCGCTTCCATCAATGGCATTCGAACTTTCTC
CATCACTTGGGTCATTCTGGGCCATTTGATTATTGAAGGAACTCAGTCGG
CGTGATTTCAATCATCATTCTGACATTGTGTATTTTGGGAACGATTGCCG
AGCTTGGTTTACAATTAGTAACAAGTGTTGGAGCAGGGGGTGTTCAATAT
TCCGATGAAATTTCTTCCTTCAATAAAACTGAGCAATCATTATCTTACAA
CGCTAGTGACGTCTCATCTAAAGAAATTGACATCACGATGTTTCGACAAA
TTACTGATACTAAAACCTCGTTTGATTTCCTTCAAATTAAACCAGCAGAT
AAACCAGCCATTGCCAACCCTTCATATCCTGTACCAGTGTATTCTAAATG
TTTTGATAACTCAACTGGTCATCAGTATACCTCTGGTGCTTACGTTATGA
TCCTCTATCAACATATGGAGTTTGTATCCAAAAGAAATGTGACATTTATG
ACGTGACGAAACTTTTGAATTCAACGGTCAATTGCTTGAACCAGTACTTG
AACAACTTGGACGCATTGGGAAAGCCACCAACTGGTCTGTTTGAAGGGAA
CGTCAATTGGATTGGAAATTATGAAGAGTGCATGTCTATTCCCAATACGC
ATTATTGTGACATGAAAAATGTGGCAGTCAAAGTACTCGGTAGAACCATT
ATGATAAGATTTTTATCCATTTTGTGTACATTACTCACTTTATCATCATG
TCAACACCAATATATCAATCATCGACCAATCGCTGATCGAATAGCATACC
ACGTGACCAAAAATCAAAATTTCATGCAACAATTGAAATATTTTAAAGAA
TTTCAATTCGATTTTTCACAAGTTGACTCCACTTGTATACAGTATCCAAA
ATTGAATTGTTTAAAAGAACTTTTGAAGATTTCCCAAGGACCAGATGTTG
GAAAATGCTTTCGCTTTCATTCCGATTATCGTGACGTCATATTTCTTATC
ATATATCGTGGCTGTGTGTATCGAATATCCTGTTTTCAATCTCGAAAAGT
TGCTCCTCAAAATGTAAGTATTATCAATGATTTTCTTGGATGGAAAGTAT
TCATCCCGTTGAGTCGCTTAACTTATGGAGTTTATTTGATCCATTTTTAT
GTTATCGATTATTATTTCGCAACATTGAATGTCAATTTTCATTTCACTGA
GGTCACTTTGTTGTTTTACTTTCTTGGTTGGTTGGTAGCTATCGGACTTG
GATTTGCTGTTGTTTATGGGCCGTTCAATGCAGTTACCAAATCTTGGAAC
GAAGCAGAAAATTTGATTTATGGAATGTCTTTCCGCCTTGTGTGGGCGAT
TGCGATATGTTGGGTTATCTATGCTTGTCATAATGGTTACGGCATGGTGG
CACTTTTAGCTTTGCTGCTTATCAGCAATATATTTACTTCAAACCATGGA
CAAGAATCGGACCTTACATTCTTGGTATTGTTCTTGGATATGTTTTGTTT
TATAAGAAGACCATCAAGGGAAGATTCGCTATTATTCAAGATTGTAGGAG
TGTTATTAACGACTGGTGTTTTTCTGTTCGAATATTTGTTGGCTAACGGG
CTTATAATTCATTTAAAGAAGGCATCTCCGATCGTTGCTCAAGCTATCGA
CCCCAGTGTTATGGAGTGAGTTGGTATTTGGCAAACGACATGCAATTCTA
CATCATTTCACCGTTGATCATGTGGGCTATGTACAGGCTTACCGCATCAT
ACCTTTACTTGATCTTTTTCGTGGTCTATTTATATCCTTTGTTGGGGAAC
GGTGTTCGTTGGATCGGAACTCCAGAAAAGAATTGCCATAACATGTGGTG
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CGTGGATTATTGGTTGGATATTTGAGTTTCAAACGATTTGAAACACATGG
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GTCTCATTCCTGAAATGGGGACAAAGATTTTCATTTCAAGTCATCGCAAA
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TCGGCGTGATTTCAATCATCATTCTGACATTGTGTATTTTGGGAACGATT
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ATATTCCGATGAAATTTCTTCCTTCAATAAAACTGAGCAATCATTATCTT
ACAACGCTAGTGACGTCTCATCTAAAGAAATTGACATCACGATGTTTCGA
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AGATAAACCAGCCATTGCCAACCCTTCATATCCTGTACCAGTGTATTCTA
AATGTTTTGATAACTCAACTGGTCATCAGTATACCTCTGGTGCTTACGTT
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TATGACGTGACGAAACTTTTGAATTCAACGGTCAATTGCTTGAACCAGTA
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GGAACGTCAATTGGATTGGAAATTATGAAGAGTGCATGTCTATTCCCAAT
ACGCATTATTGTGACATGAAAAATGTGGCAGTCAAAGTACTCGGTAGAAC
CATTATGATAAGATTTTTATCCATTTTGTGTACATTACTCACTTTATCAT
CATGTCAACACCAATATATCAATCATCGACCAATCGCTGATCGAATAGCA
TACCACGTGACCAAAAATCAAAATTTCATGCAACAATTGAAATATTTTAA
AGAATTTCAATTCGATTTTTCACAAGTTGACTCCACTTGTATACAGTATC
CAAAATTGAATTGTTTAAAAGAACTTTTGAAGATTTCCCAAGGACCAGAT
GTTGGAAAAT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13496MSTRG.13496Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13496.21.p1.exon15MSTRG.13496.21.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon14MSTRG.13496.21.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon13MSTRG.13496.21.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon12MSTRG.13496.21.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon11MSTRG.13496.21.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon10MSTRG.13496.21.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon9MSTRG.13496.21.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon8MSTRG.13496.21.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon7MSTRG.13496.21.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon6MSTRG.13496.21.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon5MSTRG.13496.21.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon4MSTRG.13496.21.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon3MSTRG.13496.21.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon2MSTRG.13496.21.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13496.21.p1.exon1MSTRG.13496.21.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13496.21.p1MSTRG.13496.21.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000107_pilongenomesc0000107_pilon:686015..708535 -