MSTRG.13496.19.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13496.19.p1
Unique NameMSTRG.13496.19.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000107_pilon:674863..722129-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13496.19.p1 ID=MSTRG.13496.19.p1|Name=MSTRG.13496.19.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=47267bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:674863..722129- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGCGCGGGAAAGTTTTTTTTTATGATGTAGATAGGGCTTTACATGTATCC TATCACATGATTTTGTTGCTATTGCTCCACATTTTGACAAGAAAAATCTC CCAGATTTGTCGATGATTTCAGACAGCCAGACAGGCAAAGCAAAAGGGAG AAAAAGTAATCAAAAATCATAATCCATACAAATCAAAGGCCAATGTTCAG TTCTGCTTGAAAGGTAAGACTTCTTTATGCTTTTTACCTATCATTCACTA AACTTTTTTTGGGGTTAAAACGAAGTGAAATCATGAAACATGATTTGATC AACTTTGATCATTGATTTTCCTCTAGGCCGATGGTACAAAATGCCTAAAG CTTGAGAATTTTTAGAATTTTTAGAAAAGCCCAAAATTATCAAACATTTT GATGATGCCATAGTAGTTTTTCTGTAAATTTTGTCTGAGGGTTTACAAAC AAACTGCTGAACCACCAAAGTAATTCTAAGCATGATTACAAAAGCGATTT CTTAATGCTAGAGGGAAAAAGTTTGTTACAAAATTGGATTCAGAGTTAAT TCGTTCAGGGTAGGAGTGGTATTTTAATACTTTAATAAATGATATAAACT AAAATGGTCCTCCTTATCAAATAAAATATTGTCCTCAGGGAAATTAAGGC ATGTCCAAATTTTTACCACGACCCACGGCATGGCCCGAACATGTTCGGGC CTGTTCGGACCATGCTCGGGCCACAAAAAAGTATTATTGAATCGGCCCGA ACATTTTGTTCGGACCATGTTCGGGCCATGTATTTACAATTGATACGGAT TTGCTCGGGCCATGTTAATTTTATTTACCTTTCCTGGTTTATCATCATCC ATTGTTAAATATTTTCATTAGACAAATTCAAAGTTCCAAATACCAGTTTG ATTCACAAAGTTGTATAACAGTACAAAAAACGATCCAGAAAAATTCTGCT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:674863..722129-

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AAAAACAAACCAATTTGGCCTTTTCACCTGAAAGCTATTGATCATTGAAC
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GCCATAACATGTGGTGGACAAACATCCTATACATCAATAATATCTACCCT
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GATTATCCATTTGACAAGCTCAGTGTTATTTCATCCATCATTTTTGCATT
GTGTGTTATCGGAACTACATTGGAGCTTATTTTAACGCTTATCCAATCCA
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GATTCTACACAAAAACAAACCAATTTGGCCTTTTCACCTGAAAGCTATTG
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CAAACCCAGTACAACCCGTCCAAACAAACTCACTTTGTTATTCAGATGAA
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GCATATTGATTTTTCTATGCTTATTTGGGATTTCAACATGTGCTAATCAA
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TGTTATTCAGATGAAACTTATTCCAAATTCTCAAATGGTGCTATTGCAAT
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TGATGTAACAAATCTTTTGAATTCTTCTGTGAATTATTTAGAACATCAAC
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CAAACAAACTCACTTTGTTATTCAGATGAAACTTATTCCAAATTCTCAAA
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GGTCTTTTTGATGGAAATACTGCTTGGATAGGAAATTATGAGGAGTGCAT
GTCTATTCCCGATTCCCATTATTGTGACATGAAAAATGTTGCTCTTAACC
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TTATTTGGGATTTCAACATGTGCTAATCAAGATATACCAATCAATCATCG
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TGCATCATCTGAAATATTTGGAAGATTTTCAATTTGACTTCTCAGGGATG
TCAGATCAAAGCTTATTCCAAACTCTAAAGCCAAGCTGTTTGCTAGAATT
AATGAAAATTTCCCAAGGGCCTGATGTTGGAAAATTCCGCAATTTAGTTT
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CCTTACATTCTTGGTATTGTTCTTGGATACATTATGTTTTATAAATTCAA
GATTGTAGGAGTGTTATTAACGACCGGTGTTTTCTTGTTCGAATATTTGT
TGGCGAACGGGTTACTAATCCACTTGAAGAAAGGCACGCCTGTCATCGGA
GGCTTCTTTGATCCGAATGTTATGGAGTGAGTTGGTATTTGGCAAACGAC
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TACCGCATCATACCTTTACTTGATCTTTTTCGTGGTCTATTTATATCCTT
TGTTGGGGAACGGTGTTCGTTGGATCGGAACTCCAGAAAAGAATTGCCAT
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TGCTTCTAAAGCGTGGATTATTGGTTGGATATTTGAGTTTCAAACGATTT
GAAACACATGGCAAATTACCTTTACTGAGATATTATTTACATCGTTATAT
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CAAGCTATTGGTAATGCGCCTGTTTCTGTTGATTCATTCTTTGTGCTCAG
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TGGAATTAGAACCCTCTCTATTTGGTGGGTCATTCTTGGTCATCTGATTA
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ATGGAGACTATGGGATACATGGATGATTTGAATTCATTACCAGTTGATTC
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TGAACTTCATCATGATCTTTCCAGCCAATCAGAGCATTTCACCTACAAAC
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GGAAAGCCATCAGCGGGTCTTTTTGATGGAAATACTGCTTGGATAGGAAA
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TTGATTTTTCTATGCTTATTTGGGATTTCAACATGTGCTAATCAAGATAT
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GACTTCTCAGGGATGTCAGATCAAAGCTTATTCCAAACTCTAAAGCCAAG
CTGTTTGCTAGAATTAATGAAAATTTCCCAAGGGCCTGATGTTGGAAAAT
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GGCTATGTACAGGCTTACCGCATCATACCTTTACTTGATCTTTTTCGTGG
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GAAAAGAATTGCCATAACATGTGGTGGACAAACATCCTATACATCAATAA
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TTTACATCGTTATATCAGATAATCCAGTGATATTTTTGAATGACTGGTTG
AAGCGCTTTTCATTTCAAGCTATTGGTAATGCGCCTGTTTCTGTTGATTC
ATTCTTTGTGCTCAGCCAACATATTCCTTCGGTTCTTCCTATGTTTTTCT
ATTATCCGAAATTCGAAAGCCATATTTAACACTGATGTTCCATCAAGTGC
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TTGGTCATCTGATTATCCATTTGACAAGCTCAGTGTTATTTCATCCATCA
TTTTTGCATTGTGTGTTATCGGAACTACATTGGAGCTTATTTTAACGCTT
ATCCAATCCATGATGATGGAGACTATGGGATACATGGATGATTTGAATTC
ATTACCAGTTGATTCTACACAAAAACAAACCAATTTGGCCTTTTCACCTG
AAAGCTATTGATCATTGAACTTCATCATGATCTTTCCAGCCAATCAGAGC
ATTTCACCTACAAACCCAGTACAACCCGTCCAAACAAACTCACTTTGTTA
TTCAGATGAAACTTATTCCAAATTCTCAAATGGTGCTATTGCAATGATCT
GTTGTCAAATTATGGTGTTTGTGCGCCAAAAGAGTGTGATATATTTGATG
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ATTGTGACATGAAAAATGTTGCTCTTAACCTAGTGAATAGAGTTACAATG
GATCATAAATGCATATTGATTTTTCTATGCTTATTTGGGATTTCAACATG
TGCTAATCAAGATATACCAATCAATCATCGACCTATTGCTGACAGAGTCA
TGCATCACATTCTCCAGAATCAAAACTTTATGCATCATCTGAAATATTTG
GAAGATTTTCAATTTGACTTCTCAGGGATGTCAGATCAAAGCTTATTCCA
AACTCTAAAGCCAAGCTGTTTGCTAGAATTAATGAAAATTTCCCAAGGGC
CTGATGTTGGAAAATTCCGCAATTTAGTTTTCCAAGAATATTTCAAGTGG
GTATACTTCAAACCATGGACAAGAATCGGACCTTACATTCTTGGTATTGT
TCTTGGATACATTATGTTTTATAAATTCAAGATTGTAGGAGTGTTATTAA
CGACCGGTGTTTTCTTGTTCGAATATTTGTTGGCGAACGGGTTACTAATC
CACTTGAAGAAAGGCACGCCTGTCATCGGAGGCTTCTTTGATCCGAATGT
TATGGAGTGAGTTGGTATTTGGCAAACGACATGCAATTCTACATCATTTC
ACCGTTGATCATGTGGGCTATGTACAGGCTTACCGCATCATACCTTTACT
TGATCTTTTTCGTGGTCTATTTATATCCTTTGTTGGGGAACGGTGTTCGT
TGGATCGGAACTCCAGAAAAGAATTGCCATAACATGTGGTGGACAAACAT
CCTATACATCAATAATATCTACCCTACTGATGCTTCTAAAGCGTGGATTA
TTGGTTGGATATTTGAGTTTCAAACGATTTGAAACACATGGCAAATTACC
TTTACTGAGATATTATTTACATCGTTATATCAGATAATCCAGTGATATTT
TTGAATGACTGGTTGAAGCGCTTTTCATTTCAAGCTATTGGTAATGCGCC
TGTTTCTGTTGATTCATTCTTTGTGCTCAGCCAACATATTCCTTCGGTTC
TTCCTATGTTTTTCTATTATCCGAAATTCGAAAGCCATATTTAACACTGA
TGTTCCATCAAGTGCAATATTATCAATCAATGGAATTAGAACCCTCTCTA
TTTGGTGGGTCATTCTTGGTCATCTGATTATCCATTTGACAAGCTCAGTG
TTATTTCATCCATCATTTTTGCATTGTGTGTTATCGGAACTACATTGGAG
CTTATTTTAACGCTTATCCAATCCATGATGATGGAGACTATGGGATACAT
GGATGATTTGAATTCATTACCAGTTGATTCTACACAAAAACAAACCAATT
TGGCCTTTTCACCTGAAAGCTATTGATCATTGAACTTCATCATGATCTTT
CCAGCCAATCAGAGCATTTCACCTACAAACCCAGTACAACCCGTCCAAAC
AAACTCACTTTGTTATTCAGATGAAACTTATTCCAAATTCTCAAATGGTG
CTATTGCAATGATCTGTTGTCAAATTATGGTGTTTGTGCGCCAAAAGAGT
GTGATATATTTGATGTAACAAATCTTTTGAATTCTTCTGTGAATTATTTA
GAACATCAACTAAACAACTTGGACGCATTAGGAAAGCCATCAGCGGGTCT
TTTTGATGGAAATACTGCTTGGATAGGAAATTATGAGGAGTGCATGTCTA
TTCCCGATTCCCATTATTGTGACATGAAAAATGTTGCTCTTAACCTAGTG
AATAGAGTTACAATGGATCATAAATGCATATTGATTTTTCTATGCTTATT
TGGGATTTCAACATGTGCTAATCAAGATATACCAATCAATCATCGACCTA
TTGCTGACAGAGTCATGCATCACATTCTCCAGAATCAAAACTTTATGCAT
CATCTGAAATATTTGGAAGATTTTCAATTTGACTTCTCAGGGATGTCAGA
TCAAAGCTTATTCCAAACTCTAAAGCCAAGCTGTTTGCTAGAATTAATGA
AAATTTCCCAAGGGCCTGATGTTGGAAAAT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13496MSTRG.13496Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13496.19.p1MSTRG.13496.19.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13496.19.p1.exon13MSTRG.13496.19.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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