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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000107_pilon:659188..663136+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13495.3.p1 ID=MSTRG.13495.3.p1|Name=MSTRG.13495.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3949bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:659188..663136+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tttcagcaaaaagtaaacattgaaaatgaaaattatagtAAAACAGATTA
AAACATATTTATTAGCATTTTATGAACAGTTATGAGGTTAATCTGGTTGG
TTTGTCATGTATTATGAAATCTATGTTTAAAAGTGTAAGTAAAAGGTATT
CATAATGTGTATAAGCTTGCATTGTGAAAGTTGTAAGTGACAGcactttt
tcaagtttttctttgttattGTCTTTTTAGTGTCTGAAAGTTTCCATTAT
ATTCCTGTTTGATTTTACTAAAAGTTTTTCGTCTTTTAAAAATTAGGATA
CTCTTTGAacaattatttaattattttacagAATGATTACATTCAAATAA
TAGGGCTAGACCCATCAAATCGAAAAGTATTAGGTCTTGTAGTGATAACA
GTGAATTGATTGATATACACTCTTAACATTAACCTCCCTCGTTTTCTAAT
TTGACTGGTAATAATATaacattttgtttagaaatatgaAACCTTTTCCA
TCAACGTGTTGATGCGAGTTCAGAGAAAAATGTAACTCATTTTGTTGAAT
AGTTTCGTATTTTGATGAAGTTTCTCTTTTATACAAAAAGGGATACTGAC
TGGTTTTGTCAAGatgttttatttcaatattcTGGCTATTTTGTTGTTAC
TTTCCTTATTTAAAGGTAAGTAGGACTTTAACTATAATTATATTTACTAC
TTATTTCGTCCCCTACCTCGCATCAATTTTTATGTGAGCCTTTTGTCAta
agaaaagctaaagtaaagaaaagtttggattaaaaaagtcccactgaaaa
agttttaattgaaacTTATAATgttagcaatgtgccctcccggttattac
cataatggctttatggcaactcctgaacttgtgcacaggatgtacggttt
aATTGAAACTTATTGATTTTTAGGAGCCATCGGTCTTGATTGTTACATGT
GTAGTTATTACGAAGGATTTCAATTGCCTCATCCTGGTTGTAAAGCTTTG
GTGGACACGAAAAATTTGACCAAGAGTTGCAGTGATGATGAAGTTTGCCA
GTCTATGTTCGTATTCAAGAGAAGTGAAGCAAGTCAAACTGAAGAGGATT
TTTACAGCGGTTTTAATTCCGTCATGCGTGAATGTCGTCCAAGGGCAAAA
TTAGCATGTGGTGATAAAAAAGACGAGAGATGGTATAATTGTACACACCG
ACCTTTGACGGATGGAAAAGTAACTGAATGCTTTGCGTGTTGTGAGGAAG
GCAGGTGTGGAGCCAAGGTGGAGTTATTTAAAGATGAATGGTCACCTACC
GATAAAGATAAAGATAAAGGTGAAAGTGAAGGTGAAGGACCCTCTCCTGC
TACGGTTATCGCTCTATCAGTTGTGATTCCTGCTGtttttttGTTGGCAG
TTGCCGTTGCTTGGAAGATGAAACTTCACCAACGTGTATCTAATTGTAAT
AATTAACATCTTCATGTCAAATTGATGCACTTTTAAATCACATCTTGAAG
AATTTTCGATATGATCAATCTCGAATTCTGAATCTTGATAGTCATAACAT
GCAAAAATTATTGTTACCTTTGTTATACTATGGGTGTATGAAATGTTAAA
TATTGTGGAACATGTATTTTTGTTATCAATTTTTAAGTCcatttataaaa
tttataatatataaaactCCCTCCAAAGGGAGGATCAACTGGCGAAAATG
CTAGTTATCTAGGATTAAAGATTAGATTTAAAAGTATCTTGTAAATAAGG
TCTACTATACTAGGTGGTCCCTACATTTTATGGATATCCAGAGAAAGAAA
GCCGGTCAAAACAATatttaaaattggcaaaaatgttCAAGATGATTTTG
AATATAAGTCGAAAAGTGGGATCGAGTTAAGAGTTCAACCGGTGAAAAAG
TCATTGAGTTAAAAAAGCCCGGATTTTCCTTGCGTTCCATTCCAGGAAAC
TTTACAACtaatttttaagtattttttgtaagaaaattcTTTACAGGGGT
ATTGATTAAAGTTTTGTACAAAGTAGATGataaattatattttgtaaaga
gttttatttttaaatgacaTTCATCCCTTTTAACCCTTACCCAAGTATGG
AAAAGTAACATCCAAACCTGTTGGTGAGCTTTTCCAATCTGTAATgcgtt
gttttataagaactttttgagGCCTTCCGGtcttcttaacatgttcttat
tttcaccatttttagagtattttattccattttgccaagaaatcggctgt
tttagagtctgcgaagccttaaaatgttcttaacttgtacttaagatttt
ggccatgtttaatttttataaaaaaccgtgTTATTGGCAACTTATTATCA
CGAAAATTAATTTCACCGAAATCATTTTTCCTCAAAATAGAGTACTTTTG
TAGTTTTCTCACTTTACGAAATTGGTACATGCCAAAACTGGCCAAAATTA
GGAAAATTTAGGAGCTCTTCTGCTTATCatcctggagatccatgctatga
tttcttattctatatactgatggcgaaatataccgggtgcaccaaaaaaa
agtatacaactttgtcgagatattgtgagcgtcaggatttaaattttttg
ttcattctttttttatcgcatagaggatgctctaacttgaattttgagct
atcataccttaggtttgaaaaagtaattcgaaaattatttaaaaaaaact
gacttttttttaatgtcgaaatttcaaaaaatcatcaaaaacagcgagca
aacttttctcttggcaCTTACCTCCTTTAcataaaaaaataccaaaaaat
gcaactgtgttcatcaaaactcgttacggaatttaagaatatggtaaaac
aagctattcccatgtggaaaaatatttttggtaaagctgaaaattttttt
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ctgacgctcacaatatctcgacaaacctgtatacttttttttggtgcacc
cggtataagaTGGTATGGGCttagagtttgaatttcccagatcctaataa
cggttgaaaacatagccaatcaaattttgttattgttttactGGTCAcgc
gaaatttggtttttattttagtaagtgaggacagtgCTAAAATCGAATTT
CCcagtgtaaattttttgaggcagaaatctgcctcacaggtcatacccgt
tCTGTATACATCAGATCATAAAAATACAGGATGGTTCTCCTGTCTACTTC
TCATTATAAGTTGgagttaaaatattttatgataaaaattgaattttcta
gATTTAGTAATTATTTACATGTAGGAACtttaaaattactttaaaattga
tttttattttcaaaatatacatCTTTGTTTAATTGATTACATAAAAATTT
TGGAACAATTGAGTAATTGTTGCGTTTTGGGCGTTTCATCTTCTTTATTT
TGCCTCTTCATTTCGTTGCGATTTTTAATGGCTCCTCAAGATTTGAGTCT
GAAAATGACCGTTTCCTTTTTCGGTTCGATGATGTTGTTGAATTTAAAAA
GTGGGTCATAAAAGAACGTTCCCCTTAGACATCGAGAATTTACCTCCCC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:659188..663136+ >MSTRG.13495.3.p1 ID=MSTRG.13495.3.p1|Name=MSTRG.13495.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1170bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:659188..663136+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgttttatttcaatattcTGGCTATTTTGTTGTTACTTTCCTTATTTAA
AGGAGCCATCGGTCTTGATTGTTACATGTGTAGTTATTACGAAGGATTTC
AATTGCCTCATCCTGGTTGTAAAGCTTTGGTGGACACGAAAAATTTGACC
AAGAGTTGCAGTGATGATGAAGTTTGCCAGTCTATGTTCGTATTCAAGAG
AAGTGAAGCAAGTCAAACTGAAGAGGATTTTTACAGCGGTTTTAATTCCG
TCATGCGTGAATGTCGTCCAAGGGCAAAATTAGCATGTGGTGATAAAAAA
GACGAGAGATGGTATAATTGTACACACCGACCTTTGACGGATGGAAAAGT
AACTGAATGCTTTGCGTGTTGTGAGGAAGGCAGGTGTGGAGCCAAGGTGG
AGTTATTTAAAGATGAATGGTCACCTACCGATAAAGATAAAGATAAAGGT
GAAAGTGAAGGTGAAGGACCCTCTCCTGCTACGGTTATCGCTCTATCAGT
TGTGATTCCTGCTGtttttttGTTGGCAGTTGCCGTTGCTTGGAAGATGA
AACTTCACCAACGTGTATCTAATTGTAATAATTAAatgttttatttcaat
attcTGGCTATTTTGTTGTTACTTTCCTTATTTAAAGGAGCCATCGGTCT
TGATTGTTACATGTGTAGTTATTACGAAGGATTTCAATTGCCTCATCCTG
GTTGTAAAGCTTTGGTGGACACGAAAAATTTGACCAAGAGTTGCAGTGAT
GATGAAGTTTGCCAGTCTATGTTCGTATTCAAGAGAAGTGAAGCAAGTCA
AACTGAAGAGGATTTTTACAGCGGTTTTAATTCCGTCATGCGTGAATGTC
GTCCAAGGGCAAAATTAGCATGTGGTGATAAAAAAGACGAGAGATGGTAT
AATTGTACACACCGACCTTTGACGGATGGAAAAGTAACTGAATGCTTTGC
GTGTTGTGAGGAAGGCAGGTGTGGAGCCAAGGTGGAGTTATTTAAAGATG
AATGGTCACCTACCGATAAAGATAAAGATAAAGGTGAAAGTGAAGGTGAA
GGACCCTCTCCTGCTACGGTTATCGCTCTATCAGTTGTGATTCCTGCTGt
ttttttGTTGGCAGTTGCCGTTGCTTGGAAGATGAAACTTCACCAACGTG
TATCTAATTGTAATAATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000107_pilon | genome | sc0000107_pilon:659188..663136 + |
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