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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000107_pilon:659151..663136+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13495.2.p1 ID=MSTRG.13495.2.p1|Name=MSTRG.13495.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3986bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:659151..663136+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
gatAAACTTCAGATtacttaatatattttttttcttttttcagcaaaaag
taaacattgaaaatgaaaattatagtAAAACAGATTAAAACATATTTATT
AGCATTTTATGAACAGTTATGAGGTTAATCTGGTTGGTTTGTCATGTATT
ATGAAATCTATGTTTAAAAGTGTAAGTAAAAGGTATTCATAATGTGTATA
AGCTTGCATTGTGAAAGTTGTAAGTGACAGcactttttcaagtttttctt
tgttattGTCTTTTTAGTGTCTGAAAGTTTCCATTATATTCCTGTTTGAT
TTTACTAAAAGTTTTTCGTCTTTTAAAAATTAGGATACTCTTTGAacaat
tatttaattattttacagAATGATTACATTCAAATAATAGGGCTAGACCC
ATCAAATCGAAAAGTATTAGGTCTTGTAGTGATAACAGTGAATTGATTGA
TATACACTCTTAACATTAACCTCCCTCGTTTTCTAATTTGACTGGTAATA
ATATaacattttgtttagaaatatgaAACCTTTTCCATCAACGTGTTGAT
GCGAGTTCAGAGAAAAATGTAACTCATTTTGTTGAATAGTTTCGTATTTT
GATGAAGTTTCTCTTTTATACAAAAAGGGATACTGACTGGTTTTGTCAAG
atgttttatttcaatattcTGGCTATTTTGTTGTTACTTTCCTTATTTAA
AGGTAAGTAGGACTTTAACTATAATTATATTTACTACTTATTTCGTCCCC
TACCTCGCATCAATTTTTATGTGAGCCTTTTGTCAtaagaaaagctaaag
taaagaaaagtttggattaaaaaagtcccactgaaaaagttttaattgaa
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tggcaactcctgaacttgtgcacaggatgtacggtttaATTGAAACTTAT
TGATTTTTAGGAGCCATCGGTCTTGATTGTTACATGTGTAGTTATTACGA
AGGATTTCAATTGCCTCATCCTGGTTGTAAAGCTTTGGTGGACACGAAAA
ATTTGACCAAGAGTTGCAGTGATGATGAAGTTTGCCAGTCTATGTTCGTA
TTCAAGAGAAGTGAAGCAAGTCAAACTGAAGAGGATTTTTACAGCGGTTT
TAATTCCGTCATGCGTGAATGTCGTCCAAGGGCAAAATTAGCATGTGGTG
ATAAAAAAGACGAGAGATGGTATAATTGTACACACCGACCTTTGACGGAT
GGAAAAGTAACTGAATGCTTTGCGTGTTGTGAGGAAGGCAGGTGTGGAGC
CAAGGTGGAGTTATTTAAAGATGAATGGTCACCTACCGATAAAGATAAAG
ATAAAGGTGAAAGTGAAGGTGAAGGACCCTCTCCTGCTACGGTTATCGCT
CTATCAGTTGTGATTCCTGCTGtttttttGTTGGCAGTTGCCGTTGCTTG
GAAGATGAAACTTCACCAACGTGTATCTAATTGTAATAATTAACATCTTC
ATGTCAAATTGATGCACTTTTAAATCACATCTTGAAGAATTTTCGATATG
ATCAATCTCGAATTCTGAATCTTGATAGTCATAACATGCAAAAATTATTG
TTACCTTTGTTATACTATGGGTGTATGAAATGTTAAATATTGTGGAACAT
GTATTTTTGTTATCAATTTTTAAGTCcatttataaaatttataatatata
aaactCCCTCCAAAGGGAGGATCAACTGGCGAAAATGCTAGTTATCTAGG
ATTAAAGATTAGATTTAAAAGTATCTTGTAAATAAGGTCTACTATACTAG
GTGGTCCCTACATTTTATGGATATCCAGAGAAAGAAAGCCGGTCAAAACA
ATatttaaaattggcaaaaatgttCAAGATGATTTTGAATATAAGTCGAA
AAGTGGGATCGAGTTAAGAGTTCAACCGGTGAAAAAGTCATTGAGTTAAA
AAAGCCCGGATTTTCCTTGCGTTCCATTCCAGGAAACTTTACAACtaatt
tttaagtattttttgtaagaaaattcTTTACAGGGGTATTGATTAAAGTT
TTGTACAAAGTAGATGataaattatattttgtaaagagttttatttttaa
atgacaTTCATCCCTTTTAACCCTTACCCAAGTATGGAAAAGTAACATCC
AAACCTGTTGGTGAGCTTTTCCAATCTGTAATgcgttgttttataagaac
tttttgagGCCTTCCGGtcttcttaacatgttcttattttcaccattttt
agagtattttattccattttgccaagaaatcggctgttttagagtctgcg
aagccttaaaatgttcttaacttgtacttaagattttggccatgtttaat
ttttataaaaaaccgtgTTATTGGCAACTTATTATCACGAAAATTAATTT
CACCGAAATCATTTTTCCTCAAAATAGAGTACTTTTGTAGTTTTCTCACT
TTACGAAATTGGTACATGCCAAAACTGGCCAAAATTAGGAAAATTTAGGA
GCTCTTCTGCTTATCatcctggagatccatgctatgatttcttattctat
atactgatggcgaaatataccgggtgcaccaaaaaaaagtatacaacttt
gtcgagatattgtgagcgtcaggatttaaattttttgttcattctttttt
tatcgcatagaggatgctctaacttgaattttgagctatcataccttagg
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TATGGGCttagagtttgaatttcccagatcctaataacggttgaaaacat
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tattttagtaagtgaggacagtgCTAAAATCGAATTTCCcagtgtaaatt
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GATCATAAAAATACAGGATGGTTCTCCTGTCTACTTCTCATTATAAGTTG
gagttaaaatattttatgataaaaattgaattttctagATTTAGTAATTA
TTTACATGTAGGAACtttaaaattactttaaaattgatttttattttcaa
aatatacatCTTTGTTTAATTGATTACATAAAAATTTTGGAACAATTGAG
TAATTGTTGCGTTTTGGGCGTTTCATCTTCTTTATTTTGCCTCTTCATTT
CGTTGCGATTTTTAATGGCTCCTCAAGATTTGAGTCTGAAAATGACCGTT
TCCTTTTTCGGTTCGATGATGTTGTTGAATTTAAAAAGTGGGTCATAAAA
GAACGTTCCCCTTAGACATCGAGAATTTACCTCCCC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:659151..663136+ >MSTRG.13495.2.p1 ID=MSTRG.13495.2.p1|Name=MSTRG.13495.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1170bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:659151..663136+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgttttatttcaatattcTGGCTATTTTGTTGTTACTTTCCTTATTTAA
AGGAGCCATCGGTCTTGATTGTTACATGTGTAGTTATTACGAAGGATTTC
AATTGCCTCATCCTGGTTGTAAAGCTTTGGTGGACACGAAAAATTTGACC
AAGAGTTGCAGTGATGATGAAGTTTGCCAGTCTATGTTCGTATTCAAGAG
AAGTGAAGCAAGTCAAACTGAAGAGGATTTTTACAGCGGTTTTAATTCCG
TCATGCGTGAATGTCGTCCAAGGGCAAAATTAGCATGTGGTGATAAAAAA
GACGAGAGATGGTATAATTGTACACACCGACCTTTGACGGATGGAAAAGT
AACTGAATGCTTTGCGTGTTGTGAGGAAGGCAGGTGTGGAGCCAAGGTGG
AGTTATTTAAAGATGAATGGTCACCTACCGATAAAGATAAAGATAAAGGT
GAAAGTGAAGGTGAAGGACCCTCTCCTGCTACGGTTATCGCTCTATCAGT
TGTGATTCCTGCTGtttttttGTTGGCAGTTGCCGTTGCTTGGAAGATGA
AACTTCACCAACGTGTATCTAATTGTAATAATTAAatgttttatttcaat
attcTGGCTATTTTGTTGTTACTTTCCTTATTTAAAGGAGCCATCGGTCT
TGATTGTTACATGTGTAGTTATTACGAAGGATTTCAATTGCCTCATCCTG
GTTGTAAAGCTTTGGTGGACACGAAAAATTTGACCAAGAGTTGCAGTGAT
GATGAAGTTTGCCAGTCTATGTTCGTATTCAAGAGAAGTGAAGCAAGTCA
AACTGAAGAGGATTTTTACAGCGGTTTTAATTCCGTCATGCGTGAATGTC
GTCCAAGGGCAAAATTAGCATGTGGTGATAAAAAAGACGAGAGATGGTAT
AATTGTACACACCGACCTTTGACGGATGGAAAAGTAACTGAATGCTTTGC
GTGTTGTGAGGAAGGCAGGTGTGGAGCCAAGGTGGAGTTATTTAAAGATG
AATGGTCACCTACCGATAAAGATAAAGATAAAGGTGAAAGTGAAGGTGAA
GGACCCTCTCCTGCTACGGTTATCGCTCTATCAGTTGTGATTCCTGCTGt
ttttttGTTGGCAGTTGCCGTTGCTTGGAAGATGAAACTTCACCAACGTG
TATCTAATTGTAATAATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000107_pilon | genome | sc0000107_pilon:659151..663136 + |
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