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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000107_pilon:659120..665043+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.13495.1.p2 ID=MSTRG.13495.1.p2|Name=MSTRG.13495.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5924bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:659120..665043+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAAAATGTAGGTTCtttgtttgcattttttgatAAACTTCAGATtactt
aatatattttttttcttttttcagcaaaaagtaaacattgaaaatgaaaa
ttatagtAAAACAGATTAAAACATATTTATTAGCATTTTATGAACAGTTA
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TCTGAAAGTTTCCATTATATTCCTGTTTGATTTTACTAAAAGTTTTTCGT
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GTATAATTGTACACACCGACCTTTGACGGATGGAAAAGTAACTGAATGCT
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CTGtttttttGTTGGCAGTTGCCGTTGCTTGGAAGATGAAACTTCACCAA
CGTGTATCTAATTGTAATAATTAACATCTTCATGTCAAATTGATGCACTT
TTAAATCACATCTTGAAGAATTTTCGATATGATCAATCTCGAATTCTGAA
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TTAAGTCcatttataaaatttataatatataaaactCCCTCCAAAGGGAG
GATCAACTGGCGAAAATGCTAGTTATCTAGGATTAAAGATTAGATTTAAA
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GTTCAACCGGTGAAAAAGTCATTGAGTTAAAAAAGCCCGGATTTTCCTTG
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aattatattttgtaaagagttttatttttaaatgacaTTCATCCCTTTTA
ACCCTTACCCAAGTATGGAAAAGTAACATCCAAACCTGTTGGTGAGCTTT
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CAAAACTGGCCAAAATTAGGAAAATTTAGGAGCTCTTCTGCTTATCatcc
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TTGATTACATAAAAATTTTGGAACAATTGAGTAATTGTTGCGTTTTGGGC
GTTTCATCTTCTTTATTTTGCCTCTTCATTTCGTTGCGATTTTTAATGGC
TCCTCAAGATTTGAGTCTGAAAATGACCGTTTCCTTTTTCGGTTCGATGA
TGTTGTTGAATTTAAAAAGTGGGTCATAAAAGAACGTTCCCCTTAGACAT
CGAGAATTTACCTCCCCAACTTGGTTTATCTTGACGATTTTAACTACACA
TTTTATCTGCGCTTCTTTTTAGGTGATTaaaaaaaTCTAGATAAAAAGTT
CATTTGATAATTGATATGGATCGGTATATTGTGCAAGCTGTTTGCTTGGT
TTTATTTGTTTGCCAAGGTTTGTATTTATTACTTCAGCAAATTTCATTCG
CCTAAAAGAAGAGTGCTTACGAGAATCCGGTATTTAACGTTATTTGAATT
AGAAATTATCGATATTCCCGTGTTGAAATGCCAGTACGCCGATATTTCGT
GAAAAGGTTaccggtatttcgatattttgcaTCTGCGGAAGCCCCCGGTC
TTTTAAACAGGGGTAAAAGTTTGCCTTGAAGATGTGGCCATAAGAttttt
ttAACCCTGTCAGATGTTGTTCTCGAGcatgtgtctgtctgtctgtctgt
ctctttgtcATTAAAACAGACAGGGTAGCCTTGAGACTTcgaaaatggtc
ggatttgacAGAGATTCGGCATTTTTACATTTTCGACTATTTTGGAAACA
TATTTCGGAATTTGGCGGAGTTTTGAACCCTCTCAGAGATGTTCTTAAAC
CCCTGTTGTATATATACATAGCCATTTCTCTATAAGTCATCTCTATGGTC
AATGGTTTGTAATTAAGAGAATTCTCTTTTTCAGGTGTTCACACTTTGGA
CTGTTACAAATGCATTGGCCAACAATGTCCAACTGATCTCTCAGCTGCAC
CAAACGAAACTTGCACTGGGGATCAAATATGCATCAATCAAGTCAATTAC
AGAAATAATACAGTCACGTTGGTAATAAGGCAATGTACTGATCGGGTAGA
GTGCACTAACAAATGTACCGATCCTGACCCTGATTTAAATGTGGATTGCC
CCTTTTGTTGTGAGACTGATCTTTGCAACATAAACTCACCATCTCCAGTT
CAACCGACCGGCTCACCCACCACACCAGGCGGTGGGTCGACAACCACTGT
CGCGTTAGCCGTTTTGATCCCCGCCATGGTTTTCGGGCAATTCCTTCAAA
AATGCGCAAATTAATTTGAAGACGCATAAAAACGGTGATGTGATGATTAC
GTTTTTTAACTGCACAACAAAGCAAAATCATGTTCAGTTTGGTATGATTA
AACATTCTTGATCTAATTTTACatacattttatattttaatacTATTTCA
ATTGTCATTTGGTAGATATCTGAACCACAAGGGTAGTAGGGTATGGTCGG
AACGGATCTCtgaatccaaaattttttgaaaaactaaatttaagTTAGAG
AACGATTGGTTTTAGTGCCTTAAGAAACCCtataataataaaattaaagG
ATTTCTCATGTAGAAGTCTTATGCGGATACAAGAATTATTTCGGATAGTA
TAGCGACATTAGTTGTTTTATGTAAGGTTAATATTTTTacctacactttt
ttttataattttacttaatcataaaaatattttaatcagCTGCTCGGTGA
GATCAGTCATTTATACTGGAATTCTTTGTATATTTTACCGAAGAGGGTAC
TTAATGTGTTTCCAACAAAAATAGACCATcataaaattaagtttttgtgg
tcattattattttttgagaaaataaaaaccccgaaataaaaaaagtattc
atttttgctcaaattttatcaaaacttttctggTTTGtgtgtaagggtgc
gattttcAAAGTTTAACTTCTGTTTTCAGTCGAACGTACTGGTTATTTCC
TGGTCGAGAACTGTATCTCCTCCTCGGTAAATACTGTTACTAGTTTATAC
TGATTTgtatttaatattttcttgtaaGAATAAACGCATCTTTTTGATTC
TAAAAACTTTATTACTTCATTAGTCAAGACAGTCAATTATCATtaatcaa
aaaaagaatcatAGCTTGTAACAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:659120..665043+ >MSTRG.13495.1.p2 ID=MSTRG.13495.1.p2|Name=MSTRG.13495.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=864bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:659120..665043+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATCGGTATATTGTGCAAGCTGTTTGCTTGGTTTTATTTGTTTGCCA
AGGTGTTCACACTTTGGACTGTTACAAATGCATTGGCCAACAATGTCCAA
CTGATCTCTCAGCTGCACCAAACGAAACTTGCACTGGGGATCAAATATGC
ATCAATCAAGTCAATTACAGAAATAATACAGTCACGTTGGTAATAAGGCA
ATGTACTGATCGGGTAGAGTGCACTAACAAATGTACCGATCCTGACCCTG
ATTTAAATGTGGATTGCCCCTTTTGTTGTGAGACTGATCTTTGCAACATA
AACTCACCATCTCCAGTTCAACCGACCGGCTCACCCACCACACCAGGCGG
TGGGTCGACAACCACTGTCGCGTTAGCCGTTTTGATCCCCGCCATGGTTT
TCGGGCAATTCCTTCAAAAATGCGCAAATTAAATGGATCGGTATATTGTG
CAAGCTGTTTGCTTGGTTTTATTTGTTTGCCAAGGTGTTCACACTTTGGA
CTGTTACAAATGCATTGGCCAACAATGTCCAACTGATCTCTCAGCTGCAC
CAAACGAAACTTGCACTGGGGATCAAATATGCATCAATCAAGTCAATTAC
AGAAATAATACAGTCACGTTGGTAATAAGGCAATGTACTGATCGGGTAGA
GTGCACTAACAAATGTACCGATCCTGACCCTGATTTAAATGTGGATTGCC
CCTTTTGTTGTGAGACTGATCTTTGCAACATAAACTCACCATCTCCAGTT
CAACCGACCGGCTCACCCACCACACCAGGCGGTGGGTCGACAACCACTGT
CGCGTTAGCCGTTTTGATCCCCGCCATGGTTTTCGGGCAATTCCTTCAAA
AATGCGCAAATTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000107_pilon | genome | sc0000107_pilon:659120..665043 + |
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