MSTRG.13490.6.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.13490.6.p2
Unique NameMSTRG.13490.6.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000107_pilon:627954..645542-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.13490.6.p2 ID=MSTRG.13490.6.p2|Name=MSTRG.13490.6.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17589bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:627954..645542- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGGATGATTTTGAGTGGCACTCCAAAAAAAATCACAAAATGGCTTCATC
GGCGGTGCTTCGGTCTCTTCGTTTTCAAAAGCAACTTTTTAAGTTAAAAT
CTGTACAACAAATCGTCGCATGTGGCATTTCTTCATCTTCGGTTATCTGT
GACAAGATTACACATACAGGACAGGTGAGTTCTTTCTCTCAAAGCAGAAA
AACACTTTAGTTGGTGTCAATCCAAAACATTTGAATTTTTTCTATTTTTA
TGCTACAGGTGTTTCTGTTTTGAATTAGTTTTGTTATGTTCATTGCATAT
TCATATCAAATTTATCAGTTATATAGTGGAAGTAGTTGAATTTTTTATCT
GATCCTAATCAGTTTTTATCAGACACACAAACAATAAAAGAAATATATAA
AAAAGACTAAAGAAAATGTTTGTCATACATACAAATAGTCGATTGCGACG
GTCTTTTGACAGCTTGGTAAAAAACCCTGTATTTCCATTTCAAGAAATGA
GGCATGTGTCATCAATTACGCAAGCAATAAACAAAAGAGATGGGCGACAA
TCAATTTATATCTTCGTTTCGTGTCGCCCACCCGACTCTCGAAAATTGAG
TAGAATTGAGTCGATGAGTCGGTAAATTTGTCGGACTTTTTCTGTCAATG
ACCTTTCCTTCTTTTGCGATTTCTAGCGTAAGCGACCCGCGTGTTCAAAA
ACCTACCGCATCAAGTTGTCATTATTTGCCATTTCCAGACGGTGTCAATC
GAACGAATCGAACGCCGACGCAATCGAACGCAATTGAACGCAATGGAATA
ATTGCAATTCGATTGTCGAACGCAATTGAATCGCAATCGAATATTACCCA
GGATTTGCTGTTCGGCTCGCTGCTTTTTTTAGATTGTTAACAACCTGAAC
AGCTCTCTAGTAGTCTTTACCGTGTGAATTTAATTTTGTCATATTGTGGA
GATAACATGAGAGTTCCGGAGACACAAGAGGAGATTGTGTATCTATAAGG
AAAAACGAAAAATCTGGTAGAAATAAATGTTTATGGGAAAATAATGAATA
ATGAATAATGAAAACTTGGCCGCATCGAATTCTGAAAATCGTCATTACGG
TAAACATATCATTAATTTCCATCAGCCTTACATGCACCATTTTGGGGTTG
GAGGTCACAGTCTGTCAGTGTTCAAAGGTCATAATTTTAAACCATCCATT
ACACGCGGTTGTTTTGGCTGCTGGCTGGCTGGCAGTTTCCTCCAAGAATG
CACTCCAAAAATGGATGGAAAAATGAAAACCTAAAAACTTTTACGACTGA
CCGACCGACCGACTTTTTAGACCTAACGAGGACGCGAAATGAAGATATTT
GTGATTGATTGTGAAAGAAGAAAAAAATGTCATTTATGTAAATGAGAAAA
AACAGGGGCCCTAAACAGTAACCCCTGTAGATATGGGGAGTTCAGACTAT
TTTTTAGAAAGGCAGGGCAGCGTCTGTTGGTGGCCAAAAGGTTTTTCTCA
TGTTTTTCTGCTGAAAAGGCTGTTCAAGGACTTTGCAAAGTTGTTTACAG
TGGTTAGGAGTTGGTTTCGCATGATCAGTTCTTACAGAAACCATGCTGAT
TGTTGGATAATATTTTCTGTTCCTCCAGCTGATTTATGATATGACTATGT
AGAACATACTCTAGGAGTTTACACGAAATGGAAGTGAGAGTTCACTGGTC
GGTAGTTTTCTGCTTTTGATTTAGATTTGTTGTTACCTTTGTGTATGGGT
GTTATACGAGCCTGTTTCCATTCGTTTGGTACTGATGATTGTTTCAATAA
TGCATTAAACAGTAGAAACACAAGCAACTGCAACTTGTTCCGAGGATTCT
TTTAGTAGTTGTAATACAACATTGTCTGGTCCGCTTGCTTTTGTTGGGCC
AAGATTTTTAAGGAGTTTTACAATACTTATGATGATTCAAAAAATAATAA
GTTTTTCATTTTATTAATTACTTGTATATGCACTGATGATGGTTTTTAAT
CAAATGAAAAGCTTTTGCTGAAAATATTTGTCAAAATGTTTTTTTAATCA
TAATTTTTACTTTCTGGCTATTTTATTTTTACAATAGTGTTCCGTGTTAT
GATGATTTTGTTGATTTGGCAACCTTTTTTGTTGTTGATGGTGAAAAACG
CTACAATATTGTTTATTCATTCAGTATCTCAGCTATGACTCGAACGACCA
ATTGAAGATAGCCGTTCTCATTGACTAATGGTGCGATTCCAACAATGTCT
CTACGCTTTGATTTTATATTTAAAAAGGTTTTTCTTGTTTTTTTGCTTTG
TTTTATAATTTACTGCTCTTTTATATTTGTGAATGAACAAAGGTTGAGAA
AAGCAGAAAAGCGTTGTGAGGTTATTTTGGTTGGCACATATTCTTTTTGA
GTGTTCAGTATCACTGTCTTAAAATATCATTCAAGAGGTTGATGATTGGC
GTATCAATTGTGTGGTTTTGGCAGGCAGTAGTAGTCAAGCTCTTTTTGAT
GTTCGATTTTAAGGCTTCAAAATCTGCTCTCTTCCAACCATTGATAACTC
CTTATTTCACCGGTTTATGGCGTTTAGGGCAGCAGAATGTGCCAGCAAGG
ATTTCATTGTGGGCCAAATTGAAAAGTCCCGTTTCTGTCACGGAAGGAAA
TCAGAGCCTTTTTTGGTCTATTTTTGAAAAATGGTAAACTTAATGAAAAT
AGTATTAGTCCTGAATTAAAGCCTTCATAGTACTACTACTTCCAAACCAA
AATAAATTTCATAAAAGTTTTTCCTCGTTGAATAATTGAACTTTGAAGGT
TCTGTCACGGAAGGAACGCAGCAAAGACATTAAAAAAGACAAAAGTATGC
TGATTCAGATTCCTGTGAATTTAAAGAGAATTTTAAAACCAAAATACCAC
TAGAAGAAACTTATGTCTATCTGCTTGTCATTGAAAAAAGAACTGAGTCA
AAAAAATTAATTTCAATGGCTACAGGCCTTTGCAACTGAGAAAGGTCAGT
GTCACGGAAGGACACCGTCACGGAAGGAAAAAATTCCTATTTTTCAAAAT
CAGCAATAGCGTAAGAAATGTTGACTGAAACTAGTGAAGTGACACATCAT
ATCATGAATCATAGCCATTTTTACTATTCAGTTCATTTCAAAACCTTGGA
ACTGTATTTTTATTGTTCAACCATAATGGTGATAATAGTTAGGAAATTTT
ACAGTAAAGATTTTATATTTTAAGCAAAAAAACGTAAAAACGCGACCTTG
CAAGCCAGTGAGCTACTTCCAAAGGCTCTAATTAGCATATTTCCATGGTG
CTGAAGCGATTTAGAGTATTTAGAACCAGCTAGGAACAGTAGTTTTGCCA
GAAAACCGGTTTTTAGGCCTCCAGAGCCGCCTGGGCTTTACGCTGTAAGC
TTACAGCGCTGTACTGGAGCCTTAGTTAAGCTTATTCTGAGCTCCATACA
GGGTTGAGCTGGTTCCCAATGGTTCTAAACCATGTAGGACACTCTCCTGC
AATAAATTAGACCCATTGAAGTCCAAGATTTCTAAAAATAACAAGATATT
TTTAATCCGTCACGGAAGGACAAGGTGAAAGTGTCACGGAAGGACAATAA
TTTCAGACCTTGTAAGTGAATATGAAGGAGGTTGCTTTGGAATGTAATTT
CATTTTTTGTTAGGGGGTACCAATAGTTAGAACTTGCAATAATATCAAGA
ATAGTGTACTTGCACAAAACTGGTGAAAAAACTTTTTGTCTTGAAATTGT
CACGGAAGGAATTCGATATTTGAAAAAAGTTTCTGCTTGCAGTACTTTTT
TGTTGTTTGACTTATTTCCAAATGAACAAACCTATTAAACTAACTAGGGT
ATGTACTTTTTTTAAAACAACATTTCATTTTTGATTAATCATTTATTTTT
CAAAAGAAGGTCCATTATATTTTAACACTTGTCCTTCCGTGACAAACCTC
ACTAGTTGTGTTTCGATATAATCACCTGATTACAGAGACTAAAAGTGCGA
CTCAGTTGATTTAAAAGTTGAAATTGGAAAATTTAAGGGTTATTTTTAAA
AAAAATCACAGTTACTTATTTTGTTTGTAAGATTTTTGATTTTGTGTTTT
GGTTGACCACTTTTCAATTTTGCCCTTGTTGCGGTCCCCAAAACCCATAG
TAGGGTACTCTTAGGTTCCAAATAAACGCCCCCCCCCCCCGCTTGTTAAT
TTTTTCGAACCCCAAACCTTATTAAAAACCCTTCCGTTTATAATTTTTGA
AAATATTTTCAGCTGTCAAAGAGGTCCTTTATTTTGCTCTAATGATTTTG
ATGATATTGGTGGCTTGTGATGCTGCTATTTAACCAATCAATATCAGGAA
GGTTAAAAAGTCTCCTATCCATATGGGATTGTTCTTGTATTTTTTACATA
TTTGCTTGATTTCTGAGATCAATTGATTATTTTGAATGTCTGTGTTATAC
ATTGAACAGTAACATGCACAAATTATCATAGGTTTATCAAGAGTTTGTAT
TTTCATCCTAGGAAATAATCTTTGCAGTTTCATGTTTTATTTCATCAATA
ATAATTAGTTCCTCTTTATAAATTTTTATCACACCATCTTTGCCGTCAGG
TCGATCTTTGCGTGTTGCTGTATATTTATCAGGCACTATCTCAAATGTTT
CTTTTCTCATCGTAAGCTGCAAAACAGGATGAAAACAGGATGTATAATGG
GGCTATTTAGGGCTATCTTATTAAAAGGAATGTCTTTGGATGTCATTTCA
TTGGTTTGAATCAGCATGGTCATACTTTCTTGCTTCAAAAGCATTACATT
ATCAAAAAATAACAAGAATAAATTTTTGCTCATGTTTTCAAAAATCAGTC
CAAAATTGAACTACTTCCACTAACTGTTTATATAGTCCAGGAAAAAGGCC
TGTATTATTTATTTTCTAATTTGTTTTCTTCAGCAATTTGACAATGAAGA
TTGGAAAAAAATGCGTTTCACAGCAGCAGAAAAACATAAGTTGGTAAGTA
CTTGGTACTTTTCTTAGGGAGAACTTATTTCATGGTGAAAATCAGAATGA
ATATTTTGGCTAAGGTAAATAAACTGGTATTTTGAGCATTCTTCATAAAT
TTTTACCGGTTAAGTTAATTACTAGGTTAGTAATTAATTAGTAGGCAAGC
AAACATCAAATAAATATTTTATTTAAAAAAAAACATTATTATACTCAAAA
AATCTTCAAAAAACCACGCCTGAGAATTGATTACTTTCGGAATGTTTTTT
TACAGCAATCTATCATTGATCACAGGTCAAAGGCTTGTAATTTTAGATTT
CAGTGGAGATTTTGGCCATTTTACAGCATTTTGTGCAAAAAATTCCTACA
CTAAGATAGCCATTTAACCAGATTTAACAGGCCTTGGATTTTTCAAGTGT
AGAACAACCATTTCCAGGGTGGGTTTTTTTTTAAATAGAGGTCTGAAATC
CGCCCAAAAATGACAATAGTTTTTAAGGTTTTTTCCTGCGATACTTATAA
TGCAAGTTTAAGTCCTTTTTCAGCTAGGAACATTTTGCGAGTTCATGTAC
GCGGCCGAAATAAAAAAAATAACAGCACTCATAAAAAAATTAATTTCTCG
TCTTTATTTACCGTTTTTTGCCTAGACGATATAGCAAACAAAAGTATAAG
CAAACTGTGCCTTTAATTGGCTGTAAGTAATTTCTGCAACGGTATAATTC
TATCCAACTTTCAACAATGAAAAAACAAACCTATTTAAACAAAATTAACC
TGCGCATTTTTTATTTTTCTCCTTCTTCATCTTCAATGAAGCACTCAAAG
TCGTTTGAAGTTAAGCACATAAGATATTCTTATAATTTTTGGTCAGCCCC
GGTGACCCTTCAAATCTCTTTCGCGATTTTTTTCTTCGTTTAAGACTCAA
CTTATAATTCCGATTTCGGATTATTTTCGGAAAACAAGTTATCGGGAAAA
CTTTGGCGCGAGAAATATTTTTTCTTGGAAGAGAAAAGAAACACATAACT
TCATTAAAAGATTTGTGCATAGTAATAAAAAACACTATAATTAAAAAGAA
GAAAGTGAAAAATGATTTTTTTGTTTATTCAATAAATTGAAAGAAGCTAT
TGTATTGTAAATAAATAGAGAGTGTAAAAGAAAGTTTTTTATGATTGGTT
TTGAGGCTTTCTTGTCTGGAGAGTTTTTTTGTGTAAGAAAGGAACGTCAA
AGCAGTGTGGTGTAACATAAACTTAGAATCACCATAACTTTTGATTGAGT
TATCGAAACTGGACAGAATTTCGTAAGCAGCTTCCTCAATATAAAATGCC
CCTATTCATTCACATTATACTAGGTTCAACACGCCATTTAAATCAATCTG
AATCAATTGACTATTCTTTTCAGGTGATATAATGCTAAGAATATCACCAT
CATGGAATTTTGCTACTCAAGCTAAGAATGCCATTTTTATAGTTTTTAGA
GCATTTTCAAATATAAATTGTCAATTACCCCCAAGAAAGGCTCACTCCTT
TCACAAAAATGTCATTTTACGCTTGAGACGTATGTACGAAATGTTAAGTC
TAGTCCTAACCTAAGAATGCTATAAGAATATTTTAGGATGATTTTCCCAA
AAAAGTTAAGAATCGGGTTAAGAATATCCATGATGAAATGGATTTACATT
ACACCATTGTTATAAAAAAGAAGAAGCATGTACTAGACAGCTAACTGTGC
CCCGGGGGAGGCACTTAGGCAAAATTGGGTACCCGGACGTGCCGCTTGTC
AGGGTTCCTTTTTTAGGCTTTGAAGATATCTGACAGGTTCCCAAATTTAC
TAAATTTCAAGATGTGTATCTGACAGGGTCGATTTTTATTATTTTGGACA
ATTTTCAGGGTAGAAAACAGAAAATCTTTCAAATTTTCCTCTACTTTTAT
TTTCAGGGCGAAAATGGGAAAAATTTTCAATTTTTCGTTCTGACAGGGTC
CCAATTTTTCCAAAAATTCATATCTGACAGGGTCCACTTTTCAAACTCCA
GTGGCACGTCCCCATCGGTCGTCAAGGTCAATGCCCCCCCCCCCCCCCGA
GAACCGTGCACACACTCAACTATATACGAGGAGCGGCCTTGACTGGAGAA
AAAAATAAATAAATCAACATAAAAATGCCAAAAATGAACAAAAGTGACGA
AAGCCGCAGTGAACATATTATAAAGCGGCCGCCTGGGATACTTTCTCAGA
GAGTAAAGAACAGGTTTAAGACATTCTAACGAAAAGATTTATGTGAAATT
CCAAGGATGAAATAATCTATCACATCTCTGTCTGCTTTGGACAAATTCAA
CTTTGTGTTAAACTTTTTTTTTGTCTGAAGTTCAACCAAAATTAGCTTTT
CAACCTCTTTGGCTTTAAAACATCGAATTAGGTTTCTTGATTGTACTTCC
TTCTAATCGTTTAAGCTTATTGGGCTGACCTTCCAGCGCAGCTGGTTTAT
TTATATTAACTGACACATCGTTTGTTGCACACTGCGGTGGAGTGAATGAC
GTAAATCGCGTGGTAACTAACTTGCCTTCTGTTGGATGATTATTTTGGGC
ATTTTTGCGTTACCACCCCCGAAGCAGCGGGCGCCTTTGTTATTCTGCAT
CTCCGTCCACCATTTTAGGAGGGCGAGAAAGTGCCTACTTCGCAACATTA
AAAAAGAATGATACATTTTACCATCTACAACCCCAACTGAAAGTGACTGT
ACCACCCCTTTAACTTTGTTTTGAAAATGAGACAATAGATGTGAAGTAGA
CACTTTCTCTATGTGTTAGATGGCCTTGAAAATAGATCCAAAAGGCCGCC
CTCATCCTGGAATAATTTGTTTGGCTTTGGGAAGTAGTAATGTTTTTGCT
TGATTTCGATGGAAAATAGAATGGCAGGATCCTGGATGGCTTCCCTAACT
TTTTTTTTTGCGAAAGTAAATGTCTTTCAAAATGAGTTAATATTTATATA
AGATTTATGGCACTTTTTAGCCTGTCAAAGCCTAAGTCAAAAGTTAAAAG
TTTCAACCCAATTCAAAAACTATTTTGTTCCTCTAAGCTATTTTTTTTCA
TTTTAATGTCTTGATTTGTAAAAGCTTGTACGCCTAAAGTATTTTGCAAA
AGTTCATGCTAATTTTAATTCTTATTCTTACTTAAAATTTCAAAATTCTT
ATTAATTTTGGAAATTCCTAAAGCTTTGGAATAAAAATAAATATCTGGAG
TATACCAAGTTGTACGCCTAAAATTATTCCCAGATTTGCCCTTGTGTTAA
TTCAACAAAATGTTTCCTTTGCTTCAATTCAGGTGAGCGAAAATATTGCT
TTTGATATGGTTGCAGAGGAACCACCAACAGTTGTTAATGCAAGAATTGT
CGCTTGCGATGGAGGTATTTCATAGATCTTTCTCATTCATCACAATAATG
ACCTAAGTATTTTAGACTATTATATTCTTGATATGCACCATTGCAATGTC
TTCGACATTTCATCATGAACCCAACAGCTGATTGGTTTTAAGTGACGCAA
AACCAGTCAATACGTCACTTTCAACCAATCAGCTGTTGGGTCCGTGATGT
AATGCCTGAAGACATTACAATGGTGCATATCATGAATGGATGGCTGTTTT
GGTGTTGAAAGACAATATAATTAATATCTCCCTCAAAATTGAATTCAAAA
AGTTTTTTTAAATTTTATTATAATTTATAAATCTTCTTTATTCAAAAATA
TTATTACACTTCGTTTGCTTAAAGCTTTCTTCATTAAATTGCTTTGTAAT
GGTAACTGATGGTAATAAAAACATCTAAGATTGTGATGTCAATGACATTT
TACAATTTTTACATTTTTTCTCAGGTGGTGGTGCTTTAGGACATCCAAAA
GTTTTTATCAATTTGGTAAGAAAAGCTTGTACGCCTAAAGTATTTTGCAA
AAGTTCATGCTAATTTTAATTCTTATTCTTACTCAAAATTTCAAAATTCT
TATTAATTTATAATATATAATATTCCTTCTATCATATCAATTGAGTGAGT
TCTTTGGCAAATGATTTACCCTGAAGTAGTAAATCTTCCTTTTATATCAG
CCTCTTTTTTACCAAATTTCTTTCATTTTGCTAGGGGTTTCGATTCCGCA
AACATACTGATTTTAAGATTTTCAGCCTTATTTTGAAAACATTCCTCCTA
CGAATATTAATGACGCCAACTATCCTGAATGTCCGTTAATTTGAGCTACT
TTATTTAGTAAGGTGTAACTTTCTTAGCCTCTGCCCAGTTCTGCTCTACA
ATGTTATCTCATACCTATTTTTTGAAAAACAGGCTCAGTTATGCCTAGGT
AACATTTTGGATTCAGTAAGAAATCAGAAAATTCTCTAAATTTAATGTTC
TTGGTTTCTCTTAAAAAACTAATTTAACTGCTTTTGATTTTAATTTCAAT
TGATTATCTATTGAAAACATTAGACTGCCAGCTATTCGAACCTGCACTTA
TTCGAATAATTCGGTTATTCAAAATGGGATGGCGTTTACCTTGGAGCTTT
GAATAACCCTGAGTCTACTGTAGTGAATTACTTGAATAAATTTAGAATTT
AAATAGATCTGACGTTAGTTAATACTTACGTTCGGATCATCATTTCTTTT
GATCTTTTAGGATAAACCAGGAATTCATGTTTGTGGATATTGTGGTGATC
GCTACATCAAGGCTAAATCTGACGACGACCATTAAAATTTCTTTTTTAAT
TATTGTCATTTTAAAAATGAATTGTATATTTTTTATTAAAAAAAGTGCAA
AAGATGTGTTGCTTTATTGTATGTATTTTAATCGTAACGGCGTGGTAGCA
TGAATGTGACTTTATTCGAGGACTAACGCCGATACAGTGCTAACTTCTTC
TGTTTTGCACTCCAAAATTTACCTGTTTTTGTAATTCTACCGATTAACAC
TTTGTAATGATTATAAAAGTAGAAAAGCCTTTTTGTTGTCAGCTAGGAAC
TGAAAGAATTAAACAGCGTTGCAAGTTTTTCCGTTTGTAGACGGGGGAAC
ACTATCCAGTTAATATTTTTCACTACAATTTCTGTCCAAAATGTAAGCCT
TTTGAGAACGAAATTTCGTAAAACTCTCGTTTAGCTTTGAACTTTCCGTC
AAGAATCACCAAAGGGGTTTGCAACACTGATTTTAAGAGTTGTCGACGAC
ACTACCAATTAATCAGTCCTTCTGTTAATCTAAAGTTTTATGAACAACTA
ACAACAAACAACCAATAATATGTATTTATAACAACCGTTTCTTTCCAATA
GTGACAAATAAAATAAAGAAAAGAAATCAAAATGGCACAAAATATGTTTT
TATATTGGGGATCTGGTAGCACGCCATGTTGGAGGGCTATGATTGTTTTG
GAAGAAAAGCAGTTATCTGGTTATGGTCAAAAATTGGTTTCCTTCTCAGC
CAAAGAACATAAATCTGAAGAAATCATGAAAATCAATCCTAGAGGACAGG
TATTTATCAATTACATTTAGTAGTGTAGACAAGGGGGAGGGCGCAAAGTT
TGTGTAGAAGAGCAGATTTTTATGACATGGTAATTATCTTTTTGGACCTA
CCCCGTTGGAGGTCCTATAAATATTAACCTGTGTTCGTTCGTTCGTTCGT
TCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTC
GTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGT
TCGTCTGTTACCAACTTTTCTCAGGATTGAATTATAGGAATCTTTTGATT
TTTGGTACAAAGGTGCAAAATGTGACAGAGCCCGATTTTCGAAGAAAAAA
TTTTGGGGCAAATTTGGGCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGGTTTTTTGGA
CTTTGTGAAAAATTGGATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGCATGAAAGT
AGGGTACGTCATCATAGTTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGCAAAAA
AAATTTGTTGGCTCAAAAAACGCATTTTCATCTATAAGAATCACTATTAA
TAAGCATACATCAATGTTCTTTTTCAAATTACTCAATTTTTTTATGAGAT
AGATGTTTTTTTTTGCTCATGAGGGCTTACTTTTGAAGAATATGTGTGTT
TAGACATGAAATTTTGGTTGCTTGGCGTGTTTTTATAGAAAAACTGGCCA
AATTCGATATTTTTTTATAAGCACATTATCGCAATTACTTAGGTAATCAA
CTTACTTTTCTCGAGATTGGCTCTTTCATGCTTTATGATTTTTGGCACAA
AGATGCATAACTATAAACCCGTCGAATGTGACGGAGCTTGATTTTCGAAA
AAAAATGTTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAATAACGGCTAAACAACAGGTT
TTTTGGAGTTTGTGAAAAATTGGATCATTGTTTCTTTCTGATTTTTTGCA
TGAAAGTAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGGTTTTTTGAAAAAAAGGATTT
TTCATCCCAAAAAACGCATCTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAGCA
TACATCAATGTTCTTAGCCAAATTACTCAATTTTTTGATGAGATAGATGT
TTTTTTTGCTCACGAAGTCTTGAATATGAAAGAATATTTCAAGAGCATGG
CATGAAACTTTGGTTTCTAAACGTTTTTTTTATAAGAAACAAACGGAAAT
TTTAATAGATCATCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTAATGGTCACG
CTCACGTAGATATCAATTATAAATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTC
CATAAAAGTATCACTTGTTATATTTTGAATAGATAAATTACAGTGTCATG
AAAATCTCCACAAATTTTGCGCTCCTCCTGTCTACGCTACTGACGTTATC
GGATAAATCTTTGTGAGATTTAATTTCGCTAATCGGGGTTTAGAATAAAA
TTAGAAGAATCTTCTGTTTTAGTTTTGAACTAAAATTCCTATATTTGATT
TTTGACCTTTTGTAAAAACTAACTAATTTAAAAAATGAAGCTATACTTTA
CTATATTTTTGAAAAAACTTCTTTAACCAAGCAGAATTTTTGTTAATTTT
ATGTTATGTATCTCCATGTTTCAGGTGCCAACTTTCAAACACGGTGATAT
TGTTTTGAATGAGTCGATGGGAATTTGCCATTATTTGGAGGTACAACTAA
AGAACAAATTTTACAAGCATTATTCTTAGATTTTGTCCCAAGAAAAATTG
CTCAACATTTACCACCCCTCACTATATTTGCCATACAAGGAAGATTTGTA
TCTTGAAAAATTGAAAAGATAAAGCTAATTTGAAGAATTTCATTTTCTGA
TTTTGGCGTAAATTCATTACCCTTAAGTCTACCCCTAATCTATTTTCCAC
CATGTGGAAATCATGTCAATTTTAATAGACAAGTACTTTGAGGGTGGTTT
GTTTGTACATGGTAGAGTACACTCAAAGTTGATGGACTTTTATTAACTGA
TATAATCAAGAGTTAGTTGGATTTCAAACTCAGAACTTCATGATGCTTTC
ACGCCAATCTTGAGTTAAAATTATTGACTAATAAAAAATTATTATAAATT
CTGTGTAATTTTTAGAGTCAATTCAAGAATCAGGGAACGAAATTGATACC
GGATAATGCAGAGAAGCAGGCCCTTGTGTTACAACGAATGTATGAGGTGA
GAAAGTTCTTTTTGATTTTTTGAATGTCTAAATCAAAGTGGTTATTTGTA
CAATGCTTCGTGTGATGCATATTGAACGTTTTGTAAAAATGAACATGGGC
CCGTCGACAGAGCTCAATTAGATACATAGCGATAAGTATGTTTTAGGCTC
ACATACTTCAAATGGCTCGCCGAGGCCCATTATATAAAAAAGCTCGTGAG
ATGCCTATTTCACTTATCGCTTAAACAAATCGGATTTTTTACAATTTTCC
ATCCTTCAGGTTGAAAATATCATTGACAAAGCAAACCGTAAAATCATGTA
TTACATATGGTATAATAAAGAAAGCTTGGATGAGAATCTACTCACTGAAC
GACGACAAGCTCTAGGTACAGAGCTGAAAATCTGGGAAGAATTTCTGACA
AACAAGAAGTACATCACAGGGGATGAGTTCACAATGGCTGATGCATTCTT
TTTCCCACAAATCGCTATCTTGGTACGTGGAAGTCTATCTTTTGAGAACC
GACCCAATTTGAAACGTTACTATGAAGAGTTATCACAACGCCCTTCCATA
ATGGCTTCTTGGCCTCCACATTTTAAGGATACTCCACCTACGGAAATGTT
CACCAAAATCTAAGAAGGTTTTTCCCTCTTTTTTCTTAGGCTAGTTATTT
TTTCTTTACTTAGGGTATATTTTTGGTTGTGATTTTTAATTTTTTGTACT
TTTTTTACTTTCGTTTTGTTATAAGAACTACCTTGAAATTGAAACATTTT
TTCATGACTTTGTACAGTAACTGTACAGTTTTCTTCTTCATTTTCGCCTA
CCTAAACATTTTTCACTGAAGCTTCCTCTTACACGTCATCGAGATTTAAC
ACCAGAAGTCACAATGGTGTAAGATTAGGTAAATGTAGTATGAGGAGATT
ATCTTTACATTTTGTTGTGGTTTACTACAGATTTATATTTCTTTATCTTT
ATTCAGTCTAACCATTACTAGATTTTCTCATTAATAAAGGACAAGCCAAT
CTTTTCGTGTTTTTAAATCTCATCATTCTCATTGATATTATAATTTCGTT
AGCTTCTCTCTTGACTATTGTGTTTCTCTCTATAAAATACGTAGCAAACA
CTTATAAACCTTATTTGAAAAAAATGGTTTGCTCCTTGCATAAAGCTGTG
TATGTTGTTCAAATTTATTTTATGTGTTAAAAAGTTTCTTCTTATCTTTC
CTTGAATGAAAACATATTTTCTTTGCTAAAATATTAATGGAGAATCAAAG
AGGAGAATGTTAGAATAGTGAGTAGGGAACCCTAACAGCCAGATATTAGG
GTTGTTTGAAAGAGAAATCTTGAGAGTTTTCTGCTCGTGCTGTTTGATTT
TTCATGAAAGTTGTTTCCTTCTTTAGTAAAAGATTCAGATTTGATTTATG
TTCAAGAGTGGTGAAAGTTTGCATGGTGTAAATGAAAGGGCTGGAGGCTA
AATTTTCTAAGAGCTTCAGAGTGTTTTGTTGAATTTTATCGGTCTTTTGG
AAAAAAAGCCCATTCTTATGACTTGGGTTTCATTTCTATTATATTGATGA
TTTTAACTTGGAAGGAAAAATTTATACACATCACACACGATTATTCTTCT
TTACTAGCAAGAAAAACTTCATTCAGAAATTTGCTGACGGTGTTAAAAAT
TTAATCGTAAGGTTTTGTATAACGTCTAAAGATTATTAGAGCTTTTGAAA
TTCCCTTTCATTCATATAATCATACGAGTTTTTTAGAGGTTTTTTATAAG
AAGAGACAAAAGAAAGGTGTAAAAAAATATTTTTCGAATAGATACCTTAC
GATATTGCCCTGGTACTGCTTAATAGTAAATTTGAAAATTATTAGAATTA
ACAACAATTTCAGAACGTTTCAAAAAAAATATGTGTAATTTGATTTGGTG
TTTCCCAATTTTCTTAGGATATAAAGTTGAAGAATAAGAATGTCTGAAGC
ATACGATACAGGCCCCCCACCAGCAGCAGCCCAATCATCTGATGGAGGGA
TCAGGCTGAATCCTGGTTTCATTAGGACACCACCTGGTCTCTTACTGCTG
ATCAATCTAGTAAGTCAACATTTTTGGCTGGAACTGATAATCAACGTTTT
TAAAACCCAACAGAAATTTTGAGCTTTAATGACAATCAATAGAATTTGAA
ATCCCCACTTTATTTAAAACACTCTTATTATTCTATTTTCATTGGTACTT
AGCCCCTTCAAGTGTTCTCTATAAATGGTCCCGAGTCACTGAGACCATAG
TCCGTATAAAAAACCCTGGTCTGGAAGCCTTTTGTTTCTTTCCATTGTTT
CTTACTTGAACTTGTGTCGAGAAATTAGTTTGTTTTGCTCACTTTTTAAA
CATGTGATAAATCTTAAACCAATCACAAGAGGAGTACTTGGTAACGTGAT
CAAAAACTGAGCAAATCGATTTTTATCTTTGATATTAACAAAGGGAAAAG
CTAACAAAAAGTTACAACAATAAGCTTTCAGACCAGTGTTTTTTATAAGG
ACTATGCTGAGACAGGGATAAGGAATATTCAGGTTCTGTAAGCCCGTTTC
TGGTGCTGATAATTTTAAAGTTTTCCTGATCGCACAAACTCTTTCCTATG
CCCTTAGTTCGCCTTTTTATTAATGCGACAGCGAAGAGAGATTGTATCAT
ACACTTAAGTAAAATCAAAATAGTGGTGCAAGTGGCTCTTAGTACGAGAT
ATCGTAAAATATGCTTACTCAGCAAAATTTATTGATTTGAAAACCCAAAT
ATCTCATGATCTCGGGATCAGAACACAGTTAGCGTTTTAAAAACAATCCC
TTTATCTTTTTTTTTAAATACTGTTTGCAGGTTATTAGTCGTAAAAGTCC
TAGATGGTTTGCACAAATTGATTTATATACTGTAATGATAAAATTTTAAT
AAACGGGGGGTCCTAGTTACAGAGATCAGGAAATTTGAAAAATAGAGAAT
TCTTATAAGTTCCTGAGGAGAAGGGACTAAAAAGAATTACAAAATTTCAA
TTAATAACCCTTATGCCCATTATTACTTTAATTAAATTCATTTTCCCCAG
GTGTTATTATTTTTGTCATGGTGCATCATGGCAGGCTGGAGAGGGGAAGT
ACATTGGACTGTGGAAAATGATTTTGAAGGAGGAAGTGGATTTTATTTGG
CTACAACACTTATTCCATGGTTTATCCTTCTCGTAGTTTTTGTTCTCATG
TTGTTCAATATCCACAAGAAGATTCCAATCAATTTTCCTGTAACGGTGAG
TGTGTCGTACGTTTTTGCTTAGCAGACAAAGAGACAGAGAGAGAAAGCGT
AGAGGCATCCGGCTACAATCAACATCGAGAATTTTGCCTATTTCCTCGTT
TTTCGAAATTTTAAGTTCGTGCGAGAAAGTTGCTTTTGGGCTATCTGTTA
AATACAATCAAATATTTCCATTTGGAAGGAGTTTATAGACTTCCAGGTTA
TAATCTGAGCCTTATTGGACCATCTTTGAACTTTTGGATCCTCAGATCGT
TGGATTGTTAAATCTCAGAGTTAAAACTCAACCCTTCCAACCTTCCTAGA
ATTTTAAAGACTCGCGGTTTTTTTACACAAACAATCTCTAGAGACTCTAA
TGCTATGATTTTTCGAATCCTTTTATTTTCCTCCTTTCTTTAGCTAATGC
TTAACTGCGTTATATGGGCAGTATTACTGTTTATTGCTTCGTGTATTGTT
GGAGCGAAAGCTGATAAATGGAATGGTCATAGTTCCTTGTGTGAAGTTTA
TGCTTGTAATCATCTCGGAGCTGCTTGTGTAAGTCTGAACTGGATTTTAA
ATTTCATTACATCCACTACATCAATTCCCAGGGGGTGGGGTACTTACAGT
AAGCAAATGTAGGGTACGATATGTGTCGCCTAAGGGTGCCTTTTTTAGAA
GTCACAACCCTAGTAATCCCCTCCCCCCCCGGGGGCATCCATCTATTTTA
GACTCTAAGGGATCTTAGCTGTCCATTTTCTAACTATCTTTTATGTGGGG
ATTTTTCAATTGTTTAGCTCAAAGTATAGTAGAAAGTTATATTGTCTTTC
CCAATGCAATTCTAGGTAGAACGCAATGAAATAGTGACATTTCTCTTTTT
CACCGGGGCTGACCTATCTAACAATACAAATTCTATTTTAAATATTTCTG
AAATTTTCCCAGGTTTATGATGTTTAGACCCCTAGACCACAATATCAAAA
TATCCCTGAAACAGGCTGAATAACGCTCATAGATTTATAAAACTCAAAGG
GCTAATTGTCGGGCTTTAAGCCATCGCAGGCAAAAAAAAGTTAATATCGG
CAAAAATATTGTTGCTATTGTTTTCGAAAACCCACGAAAGCTTCTTATTG
GTCAACCGCTGAAATTCTATTGTAATGTCACGCGACTTAGGTAGAATTTC
CTACCTAACCACGGCACACTTTTCAGCAAAAGTACGCCATCTAGTCCTTC
GGGCATTATAAATCTATGGTTGGGCTTTTTGAGCAAACATGTTAAATTAT
GAATAACTTTTTCTTTTACAGGCTTTTGGAATTTTCTCGGTGGTTGGATT
AGGAGTTCAAGCATTTTTACACTTCCGAGAATGGAGAAGTCCTTGAGCAT
GAAAATCCAATACTAAAAATCAATCACCAGATTTTATGACAATACTATGA
GTTCATATTTTGAGAACAAAAATTGAATGAGAAGAAATAAAAAGAAGATG
GTGTTTGAAATTTAAAGACATTTTATAATCAGTAACACAAAAATCTTTAG
AAATGATTCAAATGGACATATTAGTCGTAGATTTTGTAAATTTAGGGCAC
ATTTTATTTAGGAAATCTTTTTGTTGTATTTATGCAGTCGTTGTGTTCGT
TCGAAAATTCACTTCAATCAATTAATATTGTATATTTAACAAATTATTGT
TAGGGAAATTGTAAACATGCAAGACGAGGCTAATCTTTC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000107_pilon:627954..645542-

>MSTRG.13490.6.p2 ID=MSTRG.13490.6.p2|Name=MSTRG.13490.6.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=684bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000107_pilon:627954..645542- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGTTATTATTTTTGTCATGGTGCATCATGGCAGGCTGGAGAGGGGAAGT
ACATTGGACTGTGGAAAATGATTTTGAAGGAGGAAGTGGATTTTATTTGG
CTACAACACTTATTCCATGGTTTATCCTTCTCGTAGTTTTTGTTCTCATG
TTGTTCAATATCCACAAGAAGATTCCAATCAATTTTCCTGTAACGGTGAG
TGTGTCGTACGTTTTTGCTTAGATGTCTGAAGCATACGATACAGGCCCCC
CACCAGCAGCAGCCCAATCATCTGATGGAGGGATCAGGCTGAATCCTGGT
TTCATTAGGACACCACCTGGTCTCTTACTGCTGATCAATCTAGTGTTATT
ATTTTTGTCATGGTGCATCATGGCAGGCTGGAGAGGGGAAGTACATTGGA
CTGTGGAAAATGATTTTGAAGGAGGAAGTGGATTTTATTTGGCTACAACA
CTTATTCCATGGTTTATCCTTCTCGTAGTTTTTGTTCTCATGTTGTTCAA
TATCCACAAGAAGATTCCAATCAATTTTCCTGTAACGGTGAGTGTGTCGT
ACGTTTTTGCTTAGATGTCTGAAGCATACGATACAGGCCCCCCACCAGCA
GCAGCCCAATCATCTGATGGAGGGATCAGGCTGAATCCTGGTTTCATTAG
GACACCACCTGGTCTCTTACTGCTGATCAATCTA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13490MSTRG.13490Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13490.6.p2MSTRG.13490.6.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.13490.6.p2.exon8MSTRG.13490.6.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13490.6.p2.exon7MSTRG.13490.6.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13490.6.p2.exon6MSTRG.13490.6.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13490.6.p2.exon5MSTRG.13490.6.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13490.6.p2.exon4MSTRG.13490.6.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13490.6.p2.exon3MSTRG.13490.6.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13490.6.p2.exon2MSTRG.13490.6.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.13490.6.p2.exon1MSTRG.13490.6.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000107_pilongenomesc0000107_pilon:627954..645542 -